RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495350.5

CBX1-205, Transcript of chromobox 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CBX1, Length 550 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1-205ENST00000495350 PREX1Q8TCU6 1659 aa10.44□□□□□ -0.74
CBX1-205ENST00000495350 C9orf84Q5VXU9 1444 aa10.43□□□□□ -0.74
CBX1-205ENST00000495350 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa10.43□□□□□ -0.74
CBX1-205ENST00000495350 HECW1Q76N89 1606 aa10.43□□□□□ -0.74
CBX1-205ENST00000495350 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP10.43□□□□□ -0.741e-6■□□□□ 10.3
CBX1-205ENST00000495350 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa10.42□□□□□ -0.74
CBX1-205ENST00000495350 SCAPERQ9BY12 1400 aa10.41□□□□□ -0.74
CBX1-205ENST00000495350 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP10.41□□□□□ -0.74
CBX1-205ENST00000495350 MYT1LQ9UL68 1186 aa10.41□□□□□ -0.74
CBX1-205ENST00000495350 ATP10AO60312 1499 aa10.41□□□□□ -0.74
CBX1-205ENST00000495350 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa10.41□□□□□ -0.74
CBX1-205ENST00000495350 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP10.4□□□□□ -0.74
CBX1-205ENST00000495350 CSRNP3Q8WYN3 585 aa10.39□□□□□ -0.75
CBX1-205ENST00000495350 PTPRTO14522 1441 aa10.38□□□□□ -0.75
CBX1-205ENST00000495350 PLCH2O75038 1416 aa10.38□□□□□ -0.75
CBX1-205ENST00000495350 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa10.37□□□□□ -0.75
CBX1-205ENST00000495350 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP10.37□□□□□ -0.75
CBX1-205ENST00000495350 STRCQ7RTU9 1775 aa10.37□□□□□ -0.75
CBX1-205ENST00000495350 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa10.36□□□□□ -0.75
CBX1-205ENST00000495350 IQSEC2Q5JU85 1478 aa10.35□□□□□ -0.75
CBX1-205ENST00000495350 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP10.34□□□□□ -0.75
CBX1-205ENST00000495350 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP10.34□□□□□ -0.75
CBX1-205ENST00000495350 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP10.34□□□□□ -0.75
CBX1-205ENST00000495350 MYO5CQ9NQX4 1742 aa10.32□□□□□ -0.76
CBX1-205ENST00000495350 ARHGAP5Q13017 1502 aa10.32□□□□□ -0.76
CBX1-205ENST00000495350 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa10.32□□□□□ -0.76
CBX1-205ENST00000495350 EEA1Q15075 1411 aa10.31□□□□□ -0.76
CBX1-205ENST00000495350 NCOA1Q15788 1441 aa10.31□□□□□ -0.76
CBX1-205ENST00000495350 LTBP4Q8N2S1 1624 aa10.3□□□□□ -0.76
CBX1-205ENST00000495350 UBAP1LF5GYI3 381 aa10.3□□□□□ -0.76
CBX1-205ENST00000495350 AFAP1Q8N556 730 aa10.3□□□□□ -0.76
CBX1-205ENST00000495350 CLIP1P30622 1438 aa10.3□□□□□ -0.76
CBX1-205ENST00000495350 KDM5CP41229 1560 aa10.3□□□□□ -0.76
CBX1-205ENST00000495350 KIF14Q15058 1648 aa10.29□□□□□ -0.76
CBX1-205ENST00000495350 C3P01024 1663 aa10.29□□□□□ -0.76
CBX1-205ENST00000495350 CNTLNQ9NXG0 1405 aa10.29□□□□□ -0.76
CBX1-205ENST00000495350 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa10.29□□□□□ -0.76
CBX1-205ENST00000495350 REREQ9P2R6 1566 aa10.28□□□□□ -0.76
CBX1-205ENST00000495350 FMN1Q68DA7 1419 aa10.28□□□□□ -0.76
CBX1-205ENST00000495350 AGLP35573 1532 aa10.27□□□□□ -0.77
CBX1-205ENST00000495350 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP10.26□□□□□ -0.77
CBX1-205ENST00000495350 MLH3Q9UHC1 1453 aa10.26□□□□□ -0.77
CBX1-205ENST00000495350 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP10.26□□□□□ -0.77
CBX1-205ENST00000495350 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa10.25□□□□□ -0.77
CBX1-205ENST00000495350 ABCA6Q8N139 1617 aa10.25□□□□□ -0.77
CBX1-205ENST00000495350 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP10.25□□□□□ -0.77
CBX1-205ENST00000495350 NPATQ14207 1427 aa10.24□□□□□ -0.77
CBX1-205ENST00000495350 PKD2Q13563 968 aa10.24□□□□□ -0.77
CBX1-205ENST00000495350 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa10.23□□□□□ -0.77
CBX1-205ENST00000495350 UBTFP17480 764 aaKnown RBP10.22□□□□□ -0.77
CBX1-205ENST00000495350 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP10.21□□□□□ -0.77
CBX1-205ENST00000495350 PLA2R1Q13018 1463 aa10.21□□□□□ -0.78
CBX1-205ENST00000495350 ABCC1P33527 1531 aa10.21□□□□□ -0.78
CBX1-205ENST00000495350 PIP4K2BP78356 416 aa10.2□□□□□ -0.78
CBX1-205ENST00000495350 ZMYM3Q14202 1370 aa10.2□□□□□ -0.78
CBX1-205ENST00000495350 PPP6R1Q9UPN7 881 aa10.2□□□□□ -0.78
CBX1-205ENST00000495350 MROH2AA6NES4 1674 aa10.19□□□□□ -0.78
CBX1-205ENST00000495350 TOM1O60784 492 aa10.19□□□□□ -0.78
CBX1-205ENST00000495350 EHMT2Q96KQ7 1210 aa10.19□□□□□ -0.78
CBX1-205ENST00000495350 ITSN2Q9NZM3 1697 aa10.18□□□□□ -0.78
CBX1-205ENST00000495350 PREX2Q70Z35 1606 aa10.18□□□□□ -0.78
CBX1-205ENST00000495350 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP10.18□□□□□ -0.78
CBX1-205ENST00000495350 HSPA1LP34931 641 aa10.18□□□□□ -0.78
CBX1-205ENST00000495350 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa10.18□□□□□ -0.78
CBX1-205ENST00000495350 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa10.17□□□□□ -0.78
CBX1-205ENST00000495350 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP10.17□□□□□ -0.78
CBX1-205ENST00000495350 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP10.17□□□□□ -0.78
CBX1-205ENST00000495350 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP10.17□□□□□ -0.78
CBX1-205ENST00000495350 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP10.17□□□□□ -0.78
CBX1-205ENST00000495350 MYO3AQ8NEV4 1616 aa10.17□□□□□ -0.78
CBX1-205ENST00000495350 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP10.17□□□□□ -0.78
CBX1-205ENST00000495350 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP10.17□□□□□ -0.78
CBX1-205ENST00000495350 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa10.17□□□□□ -0.78
CBX1-205ENST00000495350 CCDC18Q5T9S5 1454 aa10.16□□□□□ -0.78
CBX1-205ENST00000495350 GGT6Q6P531 493 aa10.15□□□□□ -0.78
CBX1-205ENST00000495350 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa10.14□□□□□ -0.79
CBX1-205ENST00000495350 CPS1P31327 1500 aa10.14□□□□□ -0.79
CBX1-205ENST00000495350 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP10.14□□□□□ -0.79
CBX1-205ENST00000495350 PTPRKQ15262 1439 aa10.14□□□□□ -0.79
CBX1-205ENST00000495350 SYCP2Q9BX26 1530 aa10.13□□□□□ -0.79
CBX1-205ENST00000495350 ATP7AQ04656 1500 aa10.12□□□□□ -0.79
CBX1-205ENST00000495350 A2ML1A8K2U0 1454 aa10.12□□□□□ -0.79
CBX1-205ENST00000495350 A2MP01023 1474 aa10.12□□□□□ -0.79
CBX1-205ENST00000495350 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP10.11□□□□□ -0.79
CBX1-205ENST00000495350 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa10.1□□□□□ -0.79
CBX1-205ENST00000495350 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa10.1□□□□□ -0.79
CBX1-205ENST00000495350 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa10.1□□□□□ -0.79
CBX1-205ENST00000495350 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa10.1□□□□□ -0.79
CBX1-205ENST00000495350 SHANK2Q9UPX8 1470 aa10.1□□□□□ -0.79
CBX1-205ENST00000495350 PLXNC1O60486 1568 aa10.09□□□□□ -0.79
CBX1-205ENST00000495350 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP10.09□□□□□ -0.79
CBX1-205ENST00000495350 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa10.08□□□□□ -0.8
CBX1-205ENST00000495350 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP10.08□□□□□ -0.8
CBX1-205ENST00000495350 ANKLE2Q86XL3 938 aa10.08□□□□□ -0.8
CBX1-205ENST00000495350 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP10.08□□□□□ -0.8
CBX1-205ENST00000495350 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP10.07□□□□□ -0.8
CBX1-205ENST00000495350 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP10.07□□□□□ -0.8
CBX1-205ENST00000495350 TNRQ92752 1358 aa10.07□□□□□ -0.8
CBX1-205ENST00000495350 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP10.07□□□□□ -0.8
CBX1-205ENST00000495350 CCNB3Q8WWL7 1395 aa10.06□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.9 ms