RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484684.1

SRPRB-204, Transcript of SRP receptor subunit beta, humanhuman

TSL 2

Gene SRPRB, Length 512 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPRB-204ENST00000484684 PREX1Q8TCU6 1659 aa26.77■■□□□ 1.88
SRPRB-204ENST00000484684 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP26.75■■□□□ 1.87
SRPRB-204ENST00000484684 HECW1Q76N89 1606 aa26.74■■□□□ 1.87
SRPRB-204ENST00000484684 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa26.7■■□□□ 1.87
SRPRB-204ENST00000484684 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP26.7■■□□□ 1.86
SRPRB-204ENST00000484684 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP26.7■■□□□ 1.86
SRPRB-204ENST00000484684 SCAPERQ9BY12 1400 aa26.67■■□□□ 1.86
SRPRB-204ENST00000484684 STRCQ7RTU9 1775 aa26.67■■□□□ 1.86
SRPRB-204ENST00000484684 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa26.66■■□□□ 1.86
SRPRB-204ENST00000484684 ATP10AO60312 1499 aa26.66■■□□□ 1.86
SRPRB-204ENST00000484684 C9orf84Q5VXU9 1444 aa26.65■■□□□ 1.86
SRPRB-204ENST00000484684 PTPRTO14522 1441 aa26.57■■□□□ 1.84
SRPRB-204ENST00000484684 PLCH2O75038 1416 aa26.57■■□□□ 1.84
SRPRB-204ENST00000484684 CSRNP3Q8WYN3 585 aa26.56■■□□□ 1.84
SRPRB-204ENST00000484684 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa26.51■■□□□ 1.83
SRPRB-204ENST00000484684 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP26.51■■□□□ 1.83
SRPRB-204ENST00000484684 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP26.5■■□□□ 1.83
SRPRB-204ENST00000484684 MYT1LQ9UL68 1186 aa26.5■■□□□ 1.83
SRPRB-204ENST00000484684 LTBP4Q8N2S1 1624 aa26.49■■□□□ 1.83
SRPRB-204ENST00000484684 IQSEC2Q5JU85 1478 aa26.49■■□□□ 1.83
SRPRB-204ENST00000484684 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa26.47■■□□□ 1.83
SRPRB-204ENST00000484684 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP26.45■■□□□ 1.82
SRPRB-204ENST00000484684 MYO5CQ9NQX4 1742 aa26.44■■□□□ 1.82
SRPRB-204ENST00000484684 C3P01024 1663 aa26.42■■□□□ 1.82
SRPRB-204ENST00000484684 AFAP1Q8N556 730 aa26.41■■□□□ 1.82
SRPRB-204ENST00000484684 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP26.39■■□□□ 1.82
SRPRB-204ENST00000484684 NCOA1Q15788 1441 aa26.39■■□□□ 1.81
SRPRB-204ENST00000484684 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa26.39■■□□□ 1.81
SRPRB-204ENST00000484684 KDM5CP41229 1560 aa26.38■■□□□ 1.81
SRPRB-204ENST00000484684 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa26.38■■□□□ 1.81
SRPRB-204ENST00000484684 ARHGAP5Q13017 1502 aa26.36■■□□□ 1.81
SRPRB-204ENST00000484684 REREQ9P2R6 1566 aa26.35■■□□□ 1.81
SRPRB-204ENST00000484684 UBAP1LF5GYI3 381 aa26.34■■□□□ 1.81
SRPRB-204ENST00000484684 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP26.34■■□□□ 1.81
SRPRB-204ENST00000484684 KIF14Q15058 1648 aa26.31■■□□□ 1.8
SRPRB-204ENST00000484684 ABCA6Q8N139 1617 aa26.31■■□□□ 1.8
SRPRB-204ENST00000484684 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa26.29■■□□□ 1.8
SRPRB-204ENST00000484684 AGLP35573 1532 aa26.29■■□□□ 1.8
SRPRB-204ENST00000484684 EEA1Q15075 1411 aa26.28■■□□□ 1.8
SRPRB-204ENST00000484684 CNTLNQ9NXG0 1405 aa26.28■■□□□ 1.8
SRPRB-204ENST00000484684 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP26.27■■□□□ 1.8
SRPRB-204ENST00000484684 MLH3Q9UHC1 1453 aa26.27■■□□□ 1.8
SRPRB-204ENST00000484684 CLIP1P30622 1438 aa26.23■■□□□ 1.79
SRPRB-204ENST00000484684 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa26.23■■□□□ 1.79
SRPRB-204ENST00000484684 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP26.22■■□□□ 1.79
SRPRB-204ENST00000484684 FMN1Q68DA7 1419 aa26.22■■□□□ 1.79
SRPRB-204ENST00000484684 NPATQ14207 1427 aa26.21■■□□□ 1.79
SRPRB-204ENST00000484684 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP26.15■■□□□ 1.78
SRPRB-204ENST00000484684 ABCC1P33527 1531 aa26.14■■□□□ 1.78
SRPRB-204ENST00000484684 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa26.14■■□□□ 1.78
SRPRB-204ENST00000484684 PKD2Q13563 968 aa26.14■■□□□ 1.78
SRPRB-204ENST00000484684 MROH2AA6NES4 1674 aa26.13■■□□□ 1.77
SRPRB-204ENST00000484684 ZMYM3Q14202 1370 aa26.13■■□□□ 1.77
SRPRB-204ENST00000484684 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP26.12■■□□□ 1.77
SRPRB-204ENST00000484684 ITSN2Q9NZM3 1697 aa26.12■■□□□ 1.77
SRPRB-204ENST00000484684 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa26.11■■□□□ 1.77
SRPRB-204ENST00000484684 PLA2R1Q13018 1463 aa26.11■■□□□ 1.77
SRPRB-204ENST00000484684 PREX2Q70Z35 1606 aa26.1■■□□□ 1.77
SRPRB-204ENST00000484684 HSPA1LP34931 641 aa26.09■■□□□ 1.77
SRPRB-204ENST00000484684 PIP4K2BP78356 416 aa26.08■■□□□ 1.77
SRPRB-204ENST00000484684 PPP6R1Q9UPN7 881 aa26.08■■□□□ 1.77
SRPRB-204ENST00000484684 MYO3AQ8NEV4 1616 aa26.06■■□□□ 1.76
SRPRB-204ENST00000484684 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP26.06■■□□□ 1.76
SRPRB-204ENST00000484684 EHMT2Q96KQ7 1210 aa26.06■■□□□ 1.76
SRPRB-204ENST00000484684 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP26.06■■□□□ 1.76
SRPRB-204ENST00000484684 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP26.05■■□□□ 1.76
SRPRB-204ENST00000484684 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa26.05■■□□□ 1.76
SRPRB-204ENST00000484684 UBTFP17480 764 aaKnown RBP26.05■■□□□ 1.76
SRPRB-204ENST00000484684 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP26.04■■□□□ 1.76
SRPRB-204ENST00000484684 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP26.03■■□□□ 1.76
SRPRB-204ENST00000484684 TOM1O60784 492 aa26.01■■□□□ 1.75
SRPRB-204ENST00000484684 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP26.01■■□□□ 1.75
SRPRB-204ENST00000484684 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa26■■□□□ 1.75
SRPRB-204ENST00000484684 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa25.99■■□□□ 1.75
SRPRB-204ENST00000484684 PTPRKQ15262 1439 aa25.98■■□□□ 1.75
SRPRB-204ENST00000484684 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP25.98■■□□□ 1.75
SRPRB-204ENST00000484684 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP25.98■■□□□ 1.75
SRPRB-204ENST00000484684 GGT6Q6P531 493 aa25.94■■□□□ 1.74
SRPRB-204ENST00000484684 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa25.93■■□□□ 1.74
SRPRB-204ENST00000484684 CPS1P31327 1500 aa25.93■■□□□ 1.74
SRPRB-204ENST00000484684 SYCP2Q9BX26 1530 aa25.92■■□□□ 1.74
SRPRB-204ENST00000484684 CCDC18Q5T9S5 1454 aa25.91■■□□□ 1.74
SRPRB-204ENST00000484684 A2MP01023 1474 aa25.9■■□□□ 1.74
SRPRB-204ENST00000484684 ATP7AQ04656 1500 aa25.89■■□□□ 1.74
SRPRB-204ENST00000484684 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP25.89■■□□□ 1.74
SRPRB-204ENST00000484684 A2ML1A8K2U0 1454 aa25.89■■□□□ 1.73
SRPRB-204ENST00000484684 PLXNC1O60486 1568 aa25.88■■□□□ 1.73
SRPRB-204ENST00000484684 SHANK2Q9UPX8 1470 aa25.87■■□□□ 1.73
SRPRB-204ENST00000484684 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP25.86■■□□□ 1.73
SRPRB-204ENST00000484684 CHIC1Q5VXU3 224 aa25.84■■□□□ 1.73
SRPRB-204ENST00000484684 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP25.83■■□□□ 1.73
SRPRB-204ENST00000484684 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP25.82■■□□□ 1.72
SRPRB-204ENST00000484684 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa25.82■■□□□ 1.72
SRPRB-204ENST00000484684 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP25.8■■□□□ 1.72
SRPRB-204ENST00000484684 NEURL4Q96JN8 1562 aa25.8■■□□□ 1.72
SRPRB-204ENST00000484684 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP25.79■■□□□ 1.72
SRPRB-204ENST00000484684 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa25.79■■□□□ 1.72
SRPRB-204ENST00000484684 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa25.78■■□□□ 1.72
SRPRB-204ENST00000484684 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP25.76■■□□□ 1.71
SRPRB-204ENST00000484684 TNRQ92752 1358 aa25.75■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.3 ms