RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468454.1

PTPRN-212, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type N, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRN, Length 504 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRN-212ENST00000468454 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP24.86■■□□□ 1.57
PTPRN-212ENST00000468454 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa24.85■■□□□ 1.57
PTPRN-212ENST00000468454 PLEKHD1A6NEE1 506 aa24.84■■□□□ 1.57
PTPRN-212ENST00000468454 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP24.84■■□□□ 1.57
PTPRN-212ENST00000468454 DMRT2Q9Y5R5 561 aa24.84■■□□□ 1.57
PTPRN-212ENST00000468454 CFAP74Q9C0B2 1584 aa24.82■■□□□ 1.56
PTPRN-212ENST00000468454 MAGI2Q86UL8 1455 aa24.81■■□□□ 1.56
PTPRN-212ENST00000468454 SCAPERQ9BY12 1400 aa24.78■■□□□ 1.56
PTPRN-212ENST00000468454 ATP10AO60312 1499 aa24.77■■□□□ 1.56
PTPRN-212ENST00000468454 LTBP4Q8N2S1 1624 aa24.76■■□□□ 1.55
PTPRN-212ENST00000468454 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa24.75■■□□□ 1.55
PTPRN-212ENST00000468454 PTPRTO14522 1441 aa24.72■■□□□ 1.55
PTPRN-212ENST00000468454 C9orf84Q5VXU9 1444 aa24.72■■□□□ 1.55
PTPRN-212ENST00000468454 PLCH2O75038 1416 aa24.66■■□□□ 1.54
PTPRN-212ENST00000468454 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP24.64■■□□□ 1.53
PTPRN-212ENST00000468454 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP24.62■■□□□ 1.53
PTPRN-212ENST00000468454 AFAP1Q8N556 730 aa24.61■■□□□ 1.53
PTPRN-212ENST00000468454 C3P01024 1663 aa24.61■■□□□ 1.53
PTPRN-212ENST00000468454 IQSEC2Q5JU85 1478 aa24.59■■□□□ 1.53
PTPRN-212ENST00000468454 UBAP1LF5GYI3 381 aa24.58■■□□□ 1.53
PTPRN-212ENST00000468454 CSRNP3Q8WYN3 585 aa24.58■■□□□ 1.53
PTPRN-212ENST00000468454 NCOA1Q15788 1441 aa24.57■■□□□ 1.52
PTPRN-212ENST00000468454 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa24.56■■□□□ 1.52
PTPRN-212ENST00000468454 MYT1LQ9UL68 1186 aa24.55■■□□□ 1.52
PTPRN-212ENST00000468454 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP24.55■■□□□ 1.52
PTPRN-212ENST00000468454 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa24.53■■□□□ 1.52
PTPRN-212ENST00000468454 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa24.52■■□□□ 1.52
PTPRN-212ENST00000468454 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa24.52■■□□□ 1.52
PTPRN-212ENST00000468454 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa24.5■■□□□ 1.51
PTPRN-212ENST00000468454 KDM5CP41229 1560 aa24.49■■□□□ 1.51
PTPRN-212ENST00000468454 MYO5CQ9NQX4 1742 aa24.49■■□□□ 1.51
PTPRN-212ENST00000468454 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa24.48■■□□□ 1.51
PTPRN-212ENST00000468454 ABCA6Q8N139 1617 aa24.47■■□□□ 1.51
PTPRN-212ENST00000468454 KIF14Q15058 1648 aa24.46■■□□□ 1.51
PTPRN-212ENST00000468454 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP24.46■■□□□ 1.51
PTPRN-212ENST00000468454 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP24.46■■□□□ 1.51
PTPRN-212ENST00000468454 REREQ9P2R6 1566 aa24.42■■□□□ 1.5
PTPRN-212ENST00000468454 ARHGAP5Q13017 1502 aa24.42■■□□□ 1.5
PTPRN-212ENST00000468454 HSPA1LP34931 641 aa24.41■■□□□ 1.5
PTPRN-212ENST00000468454 EEA1Q15075 1411 aa24.41■■□□□ 1.5
PTPRN-212ENST00000468454 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP24.4■■□□□ 1.5
PTPRN-212ENST00000468454 AGLP35573 1532 aa24.37■■□□□ 1.49
PTPRN-212ENST00000468454 MLH3Q9UHC1 1453 aa24.37■■□□□ 1.49
PTPRN-212ENST00000468454 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP24.36■■□□□ 1.49
PTPRN-212ENST00000468454 PIP4K2BP78356 416 aa24.36■■□□□ 1.49
PTPRN-212ENST00000468454 ZMYM3Q14202 1370 aa24.31■■□□□ 1.48
PTPRN-212ENST00000468454 CNTLNQ9NXG0 1405 aa24.31■■□□□ 1.48
PTPRN-212ENST00000468454 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa24.31■■□□□ 1.48
PTPRN-212ENST00000468454 NPATQ14207 1427 aa24.29■■□□□ 1.48
PTPRN-212ENST00000468454 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa24.29■■□□□ 1.48
PTPRN-212ENST00000468454 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP24.28■■□□□ 1.48
PTPRN-212ENST00000468454 EHMT2Q96KQ7 1210 aa24.27■■□□□ 1.48
PTPRN-212ENST00000468454 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP24.27■■□□□ 1.48
PTPRN-212ENST00000468454 PKD2Q13563 968 aa24.26■■□□□ 1.47
PTPRN-212ENST00000468454 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP24.26■■□□□ 1.47
PTPRN-212ENST00000468454 ABCC1P33527 1531 aa24.25■■□□□ 1.47
PTPRN-212ENST00000468454 PPP6R1Q9UPN7 881 aa24.24■■□□□ 1.47
PTPRN-212ENST00000468454 MYO3AQ8NEV4 1616 aa24.24■■□□□ 1.47
PTPRN-212ENST00000468454 MROH2AA6NES4 1674 aa24.24■■□□□ 1.47
PTPRN-212ENST00000468454 ITSN2Q9NZM3 1697 aa24.24■■□□□ 1.47
PTPRN-212ENST00000468454 PLA2R1Q13018 1463 aa24.22■■□□□ 1.47
PTPRN-212ENST00000468454 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP24.21■■□□□ 1.47
PTPRN-212ENST00000468454 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa24.21■■□□□ 1.47
PTPRN-212ENST00000468454 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP24.21■■□□□ 1.47
PTPRN-212ENST00000468454 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP24.21■■□□□ 1.47
PTPRN-212ENST00000468454 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP24.2■■□□□ 1.47
PTPRN-212ENST00000468454 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP24.2■■□□□ 1.46
PTPRN-212ENST00000468454 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP24.19■■□□□ 1.46
PTPRN-212ENST00000468454 CLIP1P30622 1438 aa24.18■■□□□ 1.46
PTPRN-212ENST00000468454 PTPRKQ15262 1439 aa24.18■■□□□ 1.46
PTPRN-212ENST00000468454 FMN1Q68DA7 1419 aa24.18■■□□□ 1.46
PTPRN-212ENST00000468454 PREX2Q70Z35 1606 aa24.17■■□□□ 1.46
PTPRN-212ENST00000468454 TOM1O60784 492 aa24.16■■□□□ 1.46
PTPRN-212ENST00000468454 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa24.15■■□□□ 1.46
PTPRN-212ENST00000468454 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa24.14■■□□□ 1.45
PTPRN-212ENST00000468454 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP24.12■■□□□ 1.45
PTPRN-212ENST00000468454 ALKQ9UM73 1620 aa24.11■■□□□ 1.45
PTPRN-212ENST00000468454 GGT6Q6P531 493 aa24.11■■□□□ 1.45
PTPRN-212ENST00000468454 SHANK2Q9UPX8 1470 aa24.09■■□□□ 1.45
PTPRN-212ENST00000468454 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP24.09■■□□□ 1.45
PTPRN-212ENST00000468454 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP24.08■■□□□ 1.44
PTPRN-212ENST00000468454 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa24.07■■□□□ 1.44
PTPRN-212ENST00000468454 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP24.07■■□□□ 1.44
PTPRN-212ENST00000468454 UBTFP17480 764 aaKnown RBP24.07■■□□□ 1.44
PTPRN-212ENST00000468454 NEURL4Q96JN8 1562 aa24.07■■□□□ 1.44
PTPRN-212ENST00000468454 CPS1P31327 1500 aa24.06■■□□□ 1.44
PTPRN-212ENST00000468454 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP24.05■■□□□ 1.44
PTPRN-212ENST00000468454 SYCP2Q9BX26 1530 aa24.05■■□□□ 1.44
PTPRN-212ENST00000468454 A2ML1A8K2U0 1454 aa24.04■■□□□ 1.44
PTPRN-212ENST00000468454 PLXNC1O60486 1568 aa24.03■■□□□ 1.44
PTPRN-212ENST00000468454 A2MP01023 1474 aa24.01■■□□□ 1.43
PTPRN-212ENST00000468454 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP24.01■■□□□ 1.43
PTPRN-212ENST00000468454 ATP7AQ04656 1500 aa24■■□□□ 1.43
PTPRN-212ENST00000468454 VWDEQ8N2E2 1590 aa24■■□□□ 1.43
PTPRN-212ENST00000468454 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP24■■□□□ 1.43
PTPRN-212ENST00000468454 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP23.95■■□□□ 1.43
PTPRN-212ENST00000468454 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP23.94■■□□□ 1.42
PTPRN-212ENST00000468454 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP23.94■■□□□ 1.42
PTPRN-212ENST00000468454 TNRQ92752 1358 aa23.91■■□□□ 1.42
PTPRN-212ENST00000468454 ANKLE2Q86XL3 938 aa23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.3 ms