RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462996.1

PTPN18-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 18, human

TSL 4

Gene PTPN18, Length 759 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPN18-208	ENST00000462996	CDK13	Q14004	1512 aa	Known RBP	33.99	■■■■□ 3.03
PTPN18-208	ENST00000462996	PLCH2	O75038	1416 aa		33.99	■■■■□ 3.03
PTPN18-208	ENST00000462996	ARHGEF12	Q9NZN5	1544 aa		33.96	■■■■□ 3.03
PTPN18-208	ENST00000462996	EEA1	Q15075	1411 aa		33.95	■■■■□ 3.02
PTPN18-208	ENST00000462996	ATP10A	O60312	1499 aa		33.95	■■■■□ 3.02
PTPN18-208	ENST00000462996	CEBPA	P49715	358 aa	Predicted RBP	33.92	■■■■□ 3.02
PTPN18-208	ENST00000462996	PREX1	Q8TCU6	1659 aa		33.9	■■■■□ 3.02
PTPN18-208	ENST00000462996	C9orf84	Q5VXU9	1444 aa		33.9	■■■■□ 3.02
PTPN18-208	ENST00000462996	EFCAB2	Q5VUJ9	269 aa		33.85	■■■■□ 3.01
PTPN18-208	ENST00000462996	STRC	Q7RTU9	1775 aa		33.85	■■■■□ 3.01
PTPN18-208	ENST00000462996	MYO5C	Q9NQX4	1742 aa		33.82	■■■■□ 3
PTPN18-208	ENST00000462996	ILDR2	Q71H61	639 aa		33.81	■■■■□ 3
PTPN18-208	ENST00000462996	DMRT2	Q9Y5R5	561 aa		33.78	■■■■□ 3
PTPN18-208	ENST00000462996	DISP3	Q9P2K9	1392 aa		33.77	■■■■□ 3
PTPN18-208	ENST00000462996	ATP1B4	Q9UN42	357 aa	Predicted RBP	33.77	■■■■□ 3
PTPN18-208	ENST00000462996	SETD1B	Q9UPS6	1966 aa	Known RBP	33.76	■■■□□ 2.99
PTPN18-208	ENST00000462996	AFAP1	Q8N556	730 aa		33.75	■■■□□ 2.99
PTPN18-208	ENST00000462996	ZNF518A	Q6AHZ1	1483 aa		33.75	■■■□□ 2.99
PTPN18-208	ENST00000462996	KIF14	Q15058	1648 aa		33.74	■■■□□ 2.99
PTPN18-208	ENST00000462996	UHRF1BP1	Q6BDS2	1440 aa		33.73	■■■□□ 2.99
PTPN18-208	ENST00000462996	KDM5C	P41229	1560 aa		33.71	■■■□□ 2.99
PTPN18-208	ENST00000462996	CDK11A	Q9UQ88	783 aa	Predicted RBP	33.69	■■■□□ 2.98
PTPN18-208	ENST00000462996	FMN1	Q68DA7	1419 aa		33.68	■■■□□ 2.98
PTPN18-208	ENST00000462996	ARHGAP5	Q13017	1502 aa		33.67	■■■□□ 2.98
PTPN18-208	ENST00000462996	SOCS7	O14512	581 aa		33.66	■■■□□ 2.98
PTPN18-208	ENST00000462996	DIP2C	Q9Y2E4	1556 aa		33.66	■■■□□ 2.98
PTPN18-208	ENST00000462996	MYT1L	Q9UL68	1186 aa		33.64	■■■□□ 2.98
PTPN18-208	ENST00000462996	TRO	Q12816	1431 aa	Predicted RBP	33.63	■■■□□ 2.97
PTPN18-208	ENST00000462996	C3	P01024	1663 aa		33.62	■■■□□ 2.97
PTPN18-208	ENST00000462996	EHMT2	Q96KQ7	1210 aa		33.62	■■■□□ 2.97
PTPN18-208	ENST00000462996	RERE	Q9P2R6	1566 aa		33.62	■■■□□ 2.97
PTPN18-208	ENST00000462996	ARHGAP35	Q9NRY4	1499 aa		33.62	■■■□□ 2.97
PTPN18-208	ENST00000462996	PTPRT	O14522	1441 aa		33.62	■■■□□ 2.97
PTPN18-208	ENST00000462996	ABCA6	Q8N139	1617 aa		33.59	■■■□□ 2.97
PTPN18-208	ENST00000462996	UBTF	P17480	764 aa	Known RBP	33.58	■■■□□ 2.97
PTPN18-208	ENST00000462996	MLH3	Q9UHC1	1453 aa		33.56	■■■□□ 2.96
PTPN18-208	ENST00000462996	CDC42BPB	Q9Y5S2	1711 aa		33.56	■■■□□ 2.96
PTPN18-208	ENST00000462996	CLIP1	P30622	1438 aa		33.54	■■■□□ 2.96
PTPN18-208	ENST00000462996	LRRIQ1	Q96JM4	1722 aa		33.54	■■■□□ 2.96
PTPN18-208	ENST00000462996	LTBP4	Q8N2S1	1624 aa		33.53	■■■□□ 2.96
PTPN18-208	ENST00000462996	AGL	P35573	1532 aa		33.53	■■■□□ 2.96
PTPN18-208	ENST00000462996	TRAPPC8	Q9Y2L5	1435 aa		33.52	■■■□□ 2.96
PTPN18-208	ENST00000462996	SPATA31D1	Q6ZQQ2	1576 aa		33.49	■■■□□ 2.95
PTPN18-208	ENST00000462996	ESF1	Q9H501	851 aa	Known RBP	33.49	■■■□□ 2.95
PTPN18-208	ENST00000462996	ABCC1	P33527	1531 aa		33.46	■■■□□ 2.95
PTPN18-208	ENST00000462996	NCOA1	Q15788	1441 aa		33.45	■■■□□ 2.94
PTPN18-208	ENST00000462996	PREX2	Q70Z35	1606 aa		33.44	■■■□□ 2.94
PTPN18-208	ENST00000462996	KIDINS220	Q9ULH0	1771 aa		33.43	■■■□□ 2.94
PTPN18-208	ENST00000462996	ITSN2	Q9NZM3	1697 aa		33.42	■■■□□ 2.94
PTPN18-208	ENST00000462996	IQSEC2	Q5JU85	1478 aa		33.4	■■■□□ 2.94
PTPN18-208	ENST00000462996	CNTLN	Q9NXG0	1405 aa		33.39	■■■□□ 2.94
PTPN18-208	ENST00000462996	CAMSAP1	Q5T5Y3	1602 aa		33.34	■■■□□ 2.93
PTPN18-208	ENST00000462996	CDC42BPA	Q5VT25	1732 aa		33.32	■■■□□ 2.92
PTPN18-208	ENST00000462996	NPAT	Q14207	1427 aa		33.31	■■■□□ 2.92
PTPN18-208	ENST00000462996	MROH2A	A6NES4	1674 aa		33.29	■■■□□ 2.92
PTPN18-208	ENST00000462996	ZMYM3	Q14202	1370 aa		33.29	■■■□□ 2.92
PTPN18-208	ENST00000462996	NCKAP5L	Q9HCH0	1330 aa		33.28	■■■□□ 2.92
PTPN18-208	ENST00000462996	SAMD9L	Q8IVG5	1584 aa		33.28	■■■□□ 2.92
PTPN18-208	ENST00000462996	CASKIN1	Q8WXD9	1431 aa		33.27	■■■□□ 2.92
PTPN18-208	ENST00000462996	CCDC18	Q5T9S5	1454 aa		33.26	■■■□□ 2.92
PTPN18-208	ENST00000462996	ZNF335	Q9H4Z2	1342 aa	Predicted RBP	33.25	■■■□□ 2.91
PTPN18-208	ENST00000462996	ZNF777	Q9ULD5	760 aa	Predicted RBP	33.23	■■■□□ 2.91
PTPN18-208	ENST00000462996	SUPT6H	Q7KZ85	1726 aa	Known RBP	33.22	■■■□□ 2.91
PTPN18-208	ENST00000462996	SPAG9	O60271	1321 aa	Known RBP	33.2	■■■□□ 2.91
PTPN18-208	ENST00000462996	UBAP1L	F5GYI3	381 aa		33.19	■■■□□ 2.9
PTPN18-208	ENST00000462996	SYCP2	Q9BX26	1530 aa		33.18	■■■□□ 2.9
PTPN18-208	ENST00000462996	HNRNPM	P52272	730 aa	Known RBP eCLIP	33.18	■■■□□ 2.9
PTPN18-208	ENST00000462996	CLTC	Q00610	1675 aa	Known RBP	33.17	■■■□□ 2.9
PTPN18-208	ENST00000462996	GPATCH8	Q9UKJ3	1502 aa	Known RBP	33.14	■■■□□ 2.9
PTPN18-208	ENST00000462996	ZNF142	P52746	1687 aa	Predicted RBP	33.13	■■■□□ 2.89
PTPN18-208	ENST00000462996	MYO3A	Q8NEV4	1616 aa		33.13	■■■□□ 2.89
PTPN18-208	ENST00000462996	PLA2R1	Q13018	1463 aa		33.13	■■■□□ 2.89
PTPN18-208	ENST00000462996	PKD2	Q13563	968 aa		33.13	■■■□□ 2.89
PTPN18-208	ENST00000462996	PTPRK	Q15262	1439 aa		33.12	■■■□□ 2.89
PTPN18-208	ENST00000462996	PLXNC1	O60486	1568 aa		33.11	■■■□□ 2.89
PTPN18-208	ENST00000462996	ATP7A	Q04656	1500 aa		33.11	■■■□□ 2.89
PTPN18-208	ENST00000462996	TCOF1	Q13428	1488 aa	Known RBP	33.11	■■■□□ 2.89
PTPN18-208	ENST00000462996	CEP170B	Q9Y4F5	1589 aa	Predicted RBP	33.09	■■■□□ 2.89
PTPN18-208	ENST00000462996	A2M	P01023	1474 aa		33.08	■■■□□ 2.89
PTPN18-208	ENST00000462996	INO80	Q9ULG1	1556 aa	Predicted RBP	33.07	■■■□□ 2.88
PTPN18-208	ENST00000462996	FYCO1	Q9BQS8	1478 aa		33.06	■■■□□ 2.88
PTPN18-208	ENST00000462996	KIAA1107	Q9UPP5	1409 aa		33.06	■■■□□ 2.88
PTPN18-208	ENST00000462996	GGT6	Q6P531	493 aa		33.06	■■■□□ 2.88
PTPN18-208	ENST00000462996	CHIC1	Q5VXU3	224 aa		33.05	■■■□□ 2.88
PTPN18-208	ENST00000462996	CFDP1	Q9UEE9	299 aa	Predicted RBP	33.01	■■■□□ 2.87
PTPN18-208	ENST00000462996	PPP6R1	Q9UPN7	881 aa		33.01	■■■□□ 2.87
PTPN18-208	ENST00000462996	PLEKHH2	Q8IVE3	1493 aa		32.99	■■■□□ 2.87
PTPN18-208	ENST00000462996	DNMT1	P26358	1616 aa	Known RBP	32.94	■■■□□ 2.86
PTPN18-208	ENST00000462996	CCNB3	Q8WWL7	1395 aa		32.94	■■■□□ 2.86
PTPN18-208	ENST00000462996	A2ML1	A8K2U0	1454 aa		32.93	■■■□□ 2.86
PTPN18-208	ENST00000462996	ADGB	Q8N7X0	1667 aa		32.92	■■■□□ 2.86
PTPN18-208	ENST00000462996	HSPA1L	P34931	641 aa		32.91	■■■□□ 2.86
PTPN18-208	ENST00000462996	ZNF644	Q9H582	1327 aa	Predicted RBP	32.89	■■■□□ 2.86
PTPN18-208	ENST00000462996	PIP4K2B	P78356	416 aa		32.87	■■■□□ 2.85
PTPN18-208	ENST00000462996	SCAF1	Q9H7N4	1312 aa	Known RBP	32.86	■■■□□ 2.85
PTPN18-208	ENST00000462996	MED1	Q15648	1581 aa	Predicted RBP	32.84	■■■□□ 2.85
PTPN18-208	ENST00000462996	FBXO31	Q5XUX0	539 aa	Predicted RBP	32.84	■■■□□ 2.85
PTPN18-208	ENST00000462996	NEURL4	Q96JN8	1562 aa		32.83	■■■□□ 2.85
PTPN18-208	ENST00000462996	MBD5	Q9P267	1494 aa		32.83	■■■□□ 2.85
PTPN18-208	ENST00000462996	POLR1A	O95602	1720 aa	Predicted RBP	32.82	■■■□□ 2.85

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