RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460567.5

SUCLG2-202, Transcript of succinate-CoA ligase GDP-forming beta subunit, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SUCLG2, Length 1,596 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUCLG2-202ENST00000460567 ADGBQ8N7X0 1667 aa22.25■■□□□ 1.15
SUCLG2-202ENST00000460567 ABCA8O94911 1581 aa22.23■■□□□ 1.15
SUCLG2-202ENST00000460567 CCER2I3L3R5 266 aa22.21■■□□□ 1.15
SUCLG2-202ENST00000460567 TRIM52Q96A61 297 aa22.21■■□□□ 1.15
SUCLG2-202ENST00000460567 ADGRL2O95490 1459 aa22.21■■□□□ 1.15
SUCLG2-202ENST00000460567 MPHOSPH9Q99550 1183 aa22.21■■□□□ 1.15
SUCLG2-202ENST00000460567 CHIC2Q9UKJ5 165 aa22.21■■□□□ 1.15
SUCLG2-202ENST00000460567 KDM5BQ9UGL1 1544 aa22.2■■□□□ 1.14
SUCLG2-202ENST00000460567 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa22.2■■□□□ 1.14
SUCLG2-202ENST00000460567 PLB1Q6P1J6 1458 aa22.19■■□□□ 1.14
SUCLG2-202ENST00000460567 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
SUCLG2-202ENST00000460567 CROCC2H7BZ55 1655 aa22.18■■□□□ 1.14
SUCLG2-202ENST00000460567 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
SUCLG2-202ENST00000460567 KDM6BO15054 1643 aa22.17■■□□□ 1.14
SUCLG2-202ENST00000460567 KIF14Q15058 1648 aa22.17■■□□□ 1.14
SUCLG2-202ENST00000460567 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
SUCLG2-202ENST00000460567 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
SUCLG2-202ENST00000460567 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
SUCLG2-202ENST00000460567 SHANK2Q9UPX8 1470 aa22.15■■□□□ 1.14
SUCLG2-202ENST00000460567 ANP32CO43423 234 aa22.14■■□□□ 1.13
SUCLG2-202ENST00000460567 PLEKHD1A6NEE1 506 aa22.13■■□□□ 1.13
SUCLG2-202ENST00000460567 FBLN2P98095 1184 aa22.13■■□□□ 1.13
SUCLG2-202ENST00000460567 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
SUCLG2-202ENST00000460567 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa22.11■■□□□ 1.13
SUCLG2-202ENST00000460567 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa22.11■■□□□ 1.13
SUCLG2-202ENST00000460567 NCOA1Q15788 1441 aa22.11■■□□□ 1.13
SUCLG2-202ENST00000460567 ARID3CA6NKF2 412 aa22.09■■□□□ 1.13
SUCLG2-202ENST00000460567 ABCC10Q5T3U5 1492 aa22.08■■□□□ 1.12
SUCLG2-202ENST00000460567 ATP10BO94823 1461 aa22.07■■□□□ 1.12
SUCLG2-202ENST00000460567 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa22.06■■□□□ 1.12
SUCLG2-202ENST00000460567 ARHGEF5Q12774 1597 aa22.05■■□□□ 1.12
SUCLG2-202ENST00000460567 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP22.04■■□□□ 1.12
SUCLG2-202ENST00000460567 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
SUCLG2-202ENST00000460567 PTPRGP23470 1445 aa22.03■■□□□ 1.12
SUCLG2-202ENST00000460567 RSPH4AQ5TD94 716 aa22.02■■□□□ 1.12
SUCLG2-202ENST00000460567 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
SUCLG2-202ENST00000460567 SHROOM2Q13796 1616 aa22.01■■□□□ 1.11
SUCLG2-202ENST00000460567 PZPP20742 1482 aa22■■□□□ 1.11
SUCLG2-202ENST00000460567 TEX14Q8IWB6 1497 aa22■■□□□ 1.11
SUCLG2-202ENST00000460567 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa21.99■■□□□ 1.11
SUCLG2-202ENST00000460567 KDM5DQ9BY66 1539 aa21.98■■□□□ 1.11
SUCLG2-202ENST00000460567 L3MBTL2Q969R5 705 aa21.98■■□□□ 1.11
SUCLG2-202ENST00000460567 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa21.97■■□□□ 1.11
SUCLG2-202ENST00000460567 C9orf84Q5VXU9 1444 aa21.95■■□□□ 1.11
SUCLG2-202ENST00000460567 CHD1O14646 1710 aa21.95■■□□□ 1.1
SUCLG2-202ENST00000460567 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.1
SUCLG2-202ENST00000460567 TSPY4P0CV99 314 aa21.94■■□□□ 1.1
SUCLG2-202ENST00000460567 TSPY10P0CW01 314 aa21.94■■□□□ 1.1
SUCLG2-202ENST00000460567 PREX2Q70Z35 1606 aa21.93■■□□□ 1.1
SUCLG2-202ENST00000460567 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP21.93■■□□□ 1.1
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SUCLG2-202ENST00000460567 CNTLNQ9NXG0 1405 aa21.89■■□□□ 1.09
SUCLG2-202ENST00000460567 CCDC141Q6ZP82 1450 aa21.89■■□□□ 1.09
SUCLG2-202ENST00000460567 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa21.89■■□□□ 1.09
SUCLG2-202ENST00000460567 MBD5Q9P267 1494 aa21.88■■□□□ 1.09
SUCLG2-202ENST00000460567 MAST1Q9Y2H9 1570 aa21.88■■□□□ 1.09
SUCLG2-202ENST00000460567 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa21.87■■□□□ 1.09
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SUCLG2-202ENST00000460567 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa21.85■■□□□ 1.09
SUCLG2-202ENST00000460567 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
SUCLG2-202ENST00000460567 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa21.83■■□□□ 1.09
SUCLG2-202ENST00000460567 KCNH8Q96L42 1107 aa21.83■■□□□ 1.09
SUCLG2-202ENST00000460567 CCDC7Q96M83 1385 aa21.83■■□□□ 1.08
SUCLG2-202ENST00000460567 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa21.82■■□□□ 1.08
SUCLG2-202ENST00000460567 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa21.82■■□□□ 1.08
SUCLG2-202ENST00000460567 KIF15Q9NS87 1388 aa21.81■■□□□ 1.08
SUCLG2-202ENST00000460567 PKD2Q13563 968 aa21.8■■□□□ 1.08
SUCLG2-202ENST00000460567 NUP155O75694 1391 aa21.8■■□□□ 1.08
SUCLG2-202ENST00000460567 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa21.8■■□□□ 1.08
SUCLG2-202ENST00000460567 NBPF8Q3BBV2 869 aa21.78■■□□□ 1.08
SUCLG2-202ENST00000460567 MYO5CQ9NQX4 1742 aa21.77■■□□□ 1.08
SUCLG2-202ENST00000460567 PLXNC1O60486 1568 aa21.76■■□□□ 1.07
SUCLG2-202ENST00000460567 RALGAPBQ86X10 1494 aa21.74■■□□□ 1.07
SUCLG2-202ENST00000460567 ARHGAP5Q13017 1502 aa21.74■■□□□ 1.07
SUCLG2-202ENST00000460567 CLASP1Q7Z460 1538 aa21.74■■□□□ 1.07
SUCLG2-202ENST00000460567 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP21.74■■□□□ 1.07
SUCLG2-202ENST00000460567 UNC13BO14795 1591 aa21.73■■□□□ 1.07
SUCLG2-202ENST00000460567 NEFLP07196 543 aa21.73■■□□□ 1.07
SUCLG2-202ENST00000460567 PPP6R1Q9UPN7 881 aa21.72■■□□□ 1.07
SUCLG2-202ENST00000460567 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP21.72■■□□□ 1.07
SUCLG2-202ENST00000460567 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP21.7■■□□□ 1.068e-19■■■■■ 71.8
SUCLG2-202ENST00000460567 TTC37Q6PGP7 1564 aa21.7■■□□□ 1.06
SUCLG2-202ENST00000460567 FAM135AQ9P2D6 1515 aa21.69■■□□□ 1.06
SUCLG2-202ENST00000460567 ADRA2BP18089 450 aa21.69■■□□□ 1.06
SUCLG2-202ENST00000460567 ARAP3Q8WWN8 1544 aa21.69■■□□□ 1.06
SUCLG2-202ENST00000460567 KDM5CP41229 1560 aa21.68■■□□□ 1.06
SUCLG2-202ENST00000460567 SYCP2Q9BX26 1530 aa21.68■■□□□ 1.06
SUCLG2-202ENST00000460567 DUOX2Q9NRD8 1548 aa21.67■■□□□ 1.06
SUCLG2-202ENST00000460567 KIF7Q2M1P5 1343 aa21.67■■□□□ 1.06
SUCLG2-202ENST00000460567 USP47Q96K76 1375 aa21.66■■□□□ 1.06
SUCLG2-202ENST00000460567 PLCH2O75038 1416 aa21.66■■□□□ 1.06
SUCLG2-202ENST00000460567 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP21.65■■□□□ 1.06
SUCLG2-202ENST00000460567 ERBINQ96RT1 1412 aa21.65■■□□□ 1.06
SUCLG2-202ENST00000460567 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP21.64■■□□□ 1.05
SUCLG2-202ENST00000460567 IQGAP3Q86VI3 1631 aa21.64■■□□□ 1.05
SUCLG2-202ENST00000460567 MAGI2Q86UL8 1455 aa21.61■■□□□ 1.05
SUCLG2-202ENST00000460567 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP21.61■■□□□ 1.05
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