RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436289.6

NELFE-204, Transcript of negative elongation factor complex member E, humanhuman

TSL 5

Gene NELFE, Length 906 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFE-204ENST00000436289 SCAPERQ9BY12 1400 aa25.36■■□□□ 1.65
NELFE-204ENST00000436289 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa25.35■■□□□ 1.65
NELFE-204ENST00000436289 PLCH2O75038 1416 aa25.34■■□□□ 1.65
NELFE-204ENST00000436289 HECW1Q76N89 1606 aa25.34■■□□□ 1.65
NELFE-204ENST00000436289 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa25.32■■□□□ 1.64
NELFE-204ENST00000436289 C9orf84Q5VXU9 1444 aa25.31■■□□□ 1.64
NELFE-204ENST00000436289 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa25.31■■□□□ 1.64
NELFE-204ENST00000436289 PREX1Q8TCU6 1659 aa25.31■■□□□ 1.64
NELFE-204ENST00000436289 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP25.3■■□□□ 1.64
NELFE-204ENST00000436289 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa25.29■■□□□ 1.64
NELFE-204ENST00000436289 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP25.29■■□□□ 1.64
NELFE-204ENST00000436289 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa25.28■■□□□ 1.64
NELFE-204ENST00000436289 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP25.27■■□□□ 1.64
NELFE-204ENST00000436289 PTPRTO14522 1441 aa25.24■■□□□ 1.63
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NELFE-204ENST00000436289 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP25.23■■□□□ 1.63
NELFE-204ENST00000436289 STRCQ7RTU9 1775 aa25.2■■□□□ 1.62
NELFE-204ENST00000436289 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa25.18■■□□□ 1.62
NELFE-204ENST00000436289 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
NELFE-204ENST00000436289 IQSEC2Q5JU85 1478 aa25.16■■□□□ 1.62
NELFE-204ENST00000436289 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa25.14■■□□□ 1.62
NELFE-204ENST00000436289 MYT1LQ9UL68 1186 aa25.14■■□□□ 1.62
NELFE-204ENST00000436289 AFAP1Q8N556 730 aa25.13■■□□□ 1.61
NELFE-204ENST00000436289 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP25.12■■□□□ 1.61
NELFE-204ENST00000436289 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa25.11■■□□□ 1.61
NELFE-204ENST00000436289 FMN1Q68DA7 1419 aa25.08■■□□□ 1.61
NELFE-204ENST00000436289 REREQ9P2R6 1566 aa25.08■■□□□ 1.61
NELFE-204ENST00000436289 MYO5CQ9NQX4 1742 aa25.08■■□□□ 1.61
NELFE-204ENST00000436289 KDM5CP41229 1560 aa25.07■■□□□ 1.6
NELFE-204ENST00000436289 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP25.07■■□□□ 1.6
NELFE-204ENST00000436289 MLH3Q9UHC1 1453 aa25.05■■□□□ 1.6
NELFE-204ENST00000436289 LTBP4Q8N2S1 1624 aa25.04■■□□□ 1.6
NELFE-204ENST00000436289 CNTLNQ9NXG0 1405 aa25.03■■□□□ 1.6
NELFE-204ENST00000436289 AGLP35573 1532 aa25.03■■□□□ 1.6
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NELFE-204ENST00000436289 CLIP1P30622 1438 aa25.02■■□□□ 1.6
NELFE-204ENST00000436289 NCOA1Q15788 1441 aa25.02■■□□□ 1.6
NELFE-204ENST00000436289 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP25.01■■□□□ 1.59
NELFE-204ENST00000436289 C3P01024 1663 aa24.99■■□□□ 1.59
NELFE-204ENST00000436289 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa24.99■■□□□ 1.59
NELFE-204ENST00000436289 KIF14Q15058 1648 aa24.98■■□□□ 1.59
NELFE-204ENST00000436289 NPATQ14207 1427 aa24.95■■□□□ 1.59
NELFE-204ENST00000436289 UBAP1LF5GYI3 381 aa24.92■■□□□ 1.58
NELFE-204ENST00000436289 PKD2Q13563 968 aa24.92■■□□□ 1.58
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NELFE-204ENST00000436289 ZMYM3Q14202 1370 aa24.88■■□□□ 1.57
NELFE-204ENST00000436289 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa24.87■■□□□ 1.57
NELFE-204ENST00000436289 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP24.84■■□□□ 1.57
NELFE-204ENST00000436289 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa24.84■■□□□ 1.57
NELFE-204ENST00000436289 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa24.83■■□□□ 1.56
NELFE-204ENST00000436289 ABCC1P33527 1531 aa24.82■■□□□ 1.56
NELFE-204ENST00000436289 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa24.82■■□□□ 1.56
NELFE-204ENST00000436289 PLA2R1Q13018 1463 aa24.82■■□□□ 1.56
NELFE-204ENST00000436289 MROH2AA6NES4 1674 aa24.81■■□□□ 1.56
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NELFE-204ENST00000436289 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa24.78■■□□□ 1.56
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NELFE-204ENST00000436289 CCDC18Q5T9S5 1454 aa24.74■■□□□ 1.55
NELFE-204ENST00000436289 TOM1O60784 492 aa24.73■■□□□ 1.55
NELFE-204ENST00000436289 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa24.69■■□□□ 1.54
NELFE-204ENST00000436289 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP24.69■■□□□ 1.54
NELFE-204ENST00000436289 PTPRKQ15262 1439 aa24.69■■□□□ 1.54
NELFE-204ENST00000436289 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa24.68■■□□□ 1.54
NELFE-204ENST00000436289 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP24.67■■□□□ 1.54
NELFE-204ENST00000436289 HSPA1LP34931 641 aa24.66■■□□□ 1.54
NELFE-204ENST00000436289 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa24.66■■□□□ 1.54
NELFE-204ENST00000436289 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP24.66■■□□□ 1.54
NELFE-204ENST00000436289 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP24.65■■□□□ 1.54
NELFE-204ENST00000436289 GGT6Q6P531 493 aa24.65■■□□□ 1.54
NELFE-204ENST00000436289 EHMT2Q96KQ7 1210 aa24.65■■□□□ 1.54
NELFE-204ENST00000436289 MYO3AQ8NEV4 1616 aa24.64■■□□□ 1.53
NELFE-204ENST00000436289 A2MP01023 1474 aa24.64■■□□□ 1.53
NELFE-204ENST00000436289 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa24.64■■□□□ 1.53
NELFE-204ENST00000436289 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa24.64■■□□□ 1.53
NELFE-204ENST00000436289 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP24.63■■□□□ 1.53
NELFE-204ENST00000436289 CPS1P31327 1500 aa24.61■■□□□ 1.53
NELFE-204ENST00000436289 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa24.61■■□□□ 1.53
NELFE-204ENST00000436289 PIP4K2BP78356 416 aa24.61■■□□□ 1.53
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NELFE-204ENST00000436289 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP24.6■■□□□ 1.53
NELFE-204ENST00000436289 ATP7AQ04656 1500 aa24.6■■□□□ 1.53
NELFE-204ENST00000436289 A2ML1A8K2U0 1454 aa24.59■■□□□ 1.53
NELFE-204ENST00000436289 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP24.59■■□□□ 1.53
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NELFE-204ENST00000436289 SYCP2Q9BX26 1530 aa24.58■■□□□ 1.53
NELFE-204ENST00000436289 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP24.58■■□□□ 1.52
NELFE-204ENST00000436289 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP24.57■■□□□ 1.52
NELFE-204ENST00000436289 SHANK2Q9UPX8 1470 aa24.54■■□□□ 1.52
NELFE-204ENST00000436289 ANKLE2Q86XL3 938 aa24.54■■□□□ 1.52
NELFE-204ENST00000436289 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP24.51■■□□□ 1.51
NELFE-204ENST00000436289 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP24.51■■□□□ 1.51
NELFE-204ENST00000436289 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP24.51■■□□□ 1.51
NELFE-204ENST00000436289 FYCO1Q9BQS8 1478 aa24.51■■□□□ 1.51
NELFE-204ENST00000436289 CCNB3Q8WWL7 1395 aa24.5■■□□□ 1.51
NELFE-204ENST00000436289 TNRQ92752 1358 aa24.47■■□□□ 1.51
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