RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000413409.6

PTPRC-206, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 1,338 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-206ENST00000413409 SAMD9Q5K651 1589 aa27.26■■□□□ 1.95
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PTPRC-206ENST00000413409 PREX1Q8TCU6 1659 aa27.24■■□□□ 1.95
PTPRC-206ENST00000413409 MAGI2Q86UL8 1455 aa27.23■■□□□ 1.95
PTPRC-206ENST00000413409 HECW1Q76N89 1606 aa27.23■■□□□ 1.95
PTPRC-206ENST00000413409 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa27.22■■□□□ 1.95
PTPRC-206ENST00000413409 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP27.22■■□□□ 1.95
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PTPRC-206ENST00000413409 CFAP74Q9C0B2 1584 aa27.19■■□□□ 1.94
PTPRC-206ENST00000413409 ATP10AO60312 1499 aa27.14■■□□□ 1.94
PTPRC-206ENST00000413409 SCAPERQ9BY12 1400 aa27.14■■□□□ 1.93
PTPRC-206ENST00000413409 LTBP4Q8N2S1 1624 aa27.11■■□□□ 1.93
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PTPRC-206ENST00000413409 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa27.1■■□□□ 1.93
PTPRC-206ENST00000413409 C9orf84Q5VXU9 1444 aa27.09■■□□□ 1.93
PTPRC-206ENST00000413409 CSRNP3Q8WYN3 585 aa27.09■■□□□ 1.93
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PTPRC-206ENST00000413409 C3P01024 1663 aa26.91■■□□□ 1.9
PTPRC-206ENST00000413409 CEP162Q5TB80 1403 aa26.91■■□□□ 1.9
PTPRC-206ENST00000413409 EHMT2Q96KQ7 1210 aa26.89■■□□□ 1.89
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PTPRC-206ENST00000413409 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa26.86■■□□□ 1.89
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PTPRC-206ENST00000413409 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa26.85■■□□□ 1.89
PTPRC-206ENST00000413409 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP26.83■■□□□ 1.89
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PTPRC-206ENST00000413409 MYT1LQ9UL68 1186 aa26.8■■□□□ 1.88
PTPRC-206ENST00000413409 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa26.8■■□□□ 1.88
PTPRC-206ENST00000413409 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa26.78■■□□□ 1.88
PTPRC-206ENST00000413409 ABCA6Q8N139 1617 aa26.77■■□□□ 1.88
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PTPRC-206ENST00000413409 KIF14Q15058 1648 aa26.74■■□□□ 1.87
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PTPRC-206ENST00000413409 MLH3Q9UHC1 1453 aa26.73■■□□□ 1.87
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PTPRC-206ENST00000413409 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP26.68■■□□□ 1.86
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PTPRC-206ENST00000413409 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP26.64■■□□□ 1.85
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PTPRC-206ENST00000413409 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa26.6■■□□□ 1.85
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PTPRC-206ENST00000413409 PIP4K2BP78356 416 aa26.58■■□□□ 1.85
PTPRC-206ENST00000413409 PLA2R1Q13018 1463 aa26.58■■□□□ 1.84
PTPRC-206ENST00000413409 MROH2AA6NES4 1674 aa26.57■■□□□ 1.84
PTPRC-206ENST00000413409 ABCC1P33527 1531 aa26.56■■□□□ 1.84
PTPRC-206ENST00000413409 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP26.56■■□□□ 1.84
PTPRC-206ENST00000413409 PPP6R1Q9UPN7 881 aa26.53■■□□□ 1.84
PTPRC-206ENST00000413409 FMN1Q68DA7 1419 aa26.53■■□□□ 1.84
PTPRC-206ENST00000413409 ITSN2Q9NZM3 1697 aa26.52■■□□□ 1.84
PTPRC-206ENST00000413409 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP26.52■■□□□ 1.84
PTPRC-206ENST00000413409 MYO3AQ8NEV4 1616 aa26.51■■□□□ 1.83
PTPRC-206ENST00000413409 PTPRKQ15262 1439 aa26.5■■□□□ 1.83
PTPRC-206ENST00000413409 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP26.49■■□□□ 1.83
PTPRC-206ENST00000413409 TOM1O60784 492 aa26.47■■□□□ 1.83
PTPRC-206ENST00000413409 PREX2Q70Z35 1606 aa26.47■■□□□ 1.83
PTPRC-206ENST00000413409 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa26.47■■□□□ 1.83
PTPRC-206ENST00000413409 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa26.46■■□□□ 1.83
PTPRC-206ENST00000413409 VPS8Q8N3P4 1428 aa26.46■■□□□ 1.83
PTPRC-206ENST00000413409 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP26.45■■□□□ 1.82
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PTPRC-206ENST00000413409 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa26.44■■□□□ 1.82
PTPRC-206ENST00000413409 HRCP23327 699 aa26.43■■□□□ 1.82
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PTPRC-206ENST00000413409 SHANK2Q9UPX8 1470 aa26.38■■□□□ 1.81
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PTPRC-206ENST00000413409 A2ML1A8K2U0 1454 aa26.35■■□□□ 1.81
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PTPRC-206ENST00000413409 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP26.35■■□□□ 1.81
PTPRC-206ENST00000413409 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP26.35■■□□□ 1.81
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PTPRC-206ENST00000413409 NEURL4Q96JN8 1562 aa26.34■■□□□ 1.81
PTPRC-206ENST00000413409 A2MP01023 1474 aa26.31■■□□□ 1.8
PTPRC-206ENST00000413409 SYCP2Q9BX26 1530 aa26.31■■□□□ 1.8
PTPRC-206ENST00000413409 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP26.3■■□□□ 1.8
PTPRC-206ENST00000413409 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP26.29■■□□□ 1.8
PTPRC-206ENST00000413409 ATP7AQ04656 1500 aa26.28■■□□□ 1.8
PTPRC-206ENST00000413409 VWDEQ8N2E2 1590 aa26.27■■□□□ 1.8
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