RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000404162.2

HOXD12-201, Transcript of homeobox D12, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD12, Length 841 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12-201ENST00000404162 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP32.56■■■□□ 2.8
HOXD12-201ENST00000404162 PLCH2O75038 1416 aa32.54■■■□□ 2.8
HOXD12-201ENST00000404162 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa32.53■■■□□ 2.8
HOXD12-201ENST00000404162 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP32.52■■■□□ 2.8
HOXD12-201ENST00000404162 ATP10AO60312 1499 aa32.51■■■□□ 2.79
HOXD12-201ENST00000404162 PREX1Q8TCU6 1659 aa32.5■■■□□ 2.79
HOXD12-201ENST00000404162 EEA1Q15075 1411 aa32.47■■■□□ 2.79
HOXD12-201ENST00000404162 C9orf84Q5VXU9 1444 aa32.47■■■□□ 2.79
HOXD12-201ENST00000404162 ILDR2Q71H61 639 aa32.45■■■□□ 2.79
HOXD12-201ENST00000404162 STRCQ7RTU9 1775 aa32.43■■■□□ 2.78
HOXD12-201ENST00000404162 DISP3Q9P2K9 1392 aa32.42■■■□□ 2.78
HOXD12-201ENST00000404162 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa32.41■■■□□ 2.78
HOXD12-201ENST00000404162 MYO5CQ9NQX4 1742 aa32.38■■■□□ 2.77
HOXD12-201ENST00000404162 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP32.37■■■□□ 2.77
HOXD12-201ENST00000404162 DMRT2Q9Y5R5 561 aa32.37■■■□□ 2.77
HOXD12-201ENST00000404162 AFAP1Q8N556 730 aa32.33■■■□□ 2.77
HOXD12-201ENST00000404162 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa32.33■■■□□ 2.77
HOXD12-201ENST00000404162 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa32.3■■■□□ 2.76
HOXD12-201ENST00000404162 KIF14Q15058 1648 aa32.3■■■□□ 2.76
HOXD12-201ENST00000404162 SOCS7O14512 581 aa32.3■■■□□ 2.76
HOXD12-201ENST00000404162 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP32.28■■■□□ 2.76
HOXD12-201ENST00000404162 MYT1LQ9UL68 1186 aa32.27■■■□□ 2.76
HOXD12-201ENST00000404162 KDM5CP41229 1560 aa32.27■■■□□ 2.76
HOXD12-201ENST00000404162 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP32.25■■■□□ 2.75
HOXD12-201ENST00000404162 ARHGAP5Q13017 1502 aa32.25■■■□□ 2.75
HOXD12-201ENST00000404162 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa32.24■■■□□ 2.75
HOXD12-201ENST00000404162 FMN1Q68DA7 1419 aa32.23■■■□□ 2.75
HOXD12-201ENST00000404162 PTPRTO14522 1441 aa32.22■■■□□ 2.75
HOXD12-201ENST00000404162 C3P01024 1663 aa32.21■■■□□ 2.75
HOXD12-201ENST00000404162 EHMT2Q96KQ7 1210 aa32.21■■■□□ 2.75
HOXD12-201ENST00000404162 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP32.19■■■□□ 2.74
HOXD12-201ENST00000404162 REREQ9P2R6 1566 aa32.19■■■□□ 2.74
HOXD12-201ENST00000404162 ABCA6Q8N139 1617 aa32.18■■■□□ 2.74
HOXD12-201ENST00000404162 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa32.17■■■□□ 2.74
HOXD12-201ENST00000404162 UBTFP17480 764 aaKnown RBP32.15■■■□□ 2.74
HOXD12-201ENST00000404162 MLH3Q9UHC1 1453 aa32.14■■■□□ 2.74
HOXD12-201ENST00000404162 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa32.14■■■□□ 2.74
HOXD12-201ENST00000404162 LTBP4Q8N2S1 1624 aa32.14■■■□□ 2.74
HOXD12-201ENST00000404162 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa32.14■■■□□ 2.74
HOXD12-201ENST00000404162 CLIP1P30622 1438 aa32.11■■■□□ 2.73
HOXD12-201ENST00000404162 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP32.11■■■□□ 2.73
HOXD12-201ENST00000404162 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa32.11■■■□□ 2.73
HOXD12-201ENST00000404162 AGLP35573 1532 aa32.1■■■□□ 2.73
HOXD12-201ENST00000404162 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa32.1■■■□□ 2.73
HOXD12-201ENST00000404162 NCOA1Q15788 1441 aa32.04■■■□□ 2.72
HOXD12-201ENST00000404162 ABCC1P33527 1531 aa32.04■■■□□ 2.72
HOXD12-201ENST00000404162 ITSN2Q9NZM3 1697 aa32.02■■■□□ 2.72
HOXD12-201ENST00000404162 PREX2Q70Z35 1606 aa32.01■■■□□ 2.72
HOXD12-201ENST00000404162 IQSEC2Q5JU85 1478 aa32.01■■■□□ 2.71
HOXD12-201ENST00000404162 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa32.01■■■□□ 2.71
HOXD12-201ENST00000404162 CNTLNQ9NXG0 1405 aa31.98■■■□□ 2.71
HOXD12-201ENST00000404162 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa31.96■■■□□ 2.71
HOXD12-201ENST00000404162 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa31.91■■■□□ 2.7
HOXD12-201ENST00000404162 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa31.89■■■□□ 2.7
HOXD12-201ENST00000404162 ZMYM3Q14202 1370 aa31.89■■■□□ 2.7
HOXD12-201ENST00000404162 NPATQ14207 1427 aa31.89■■■□□ 2.7
HOXD12-201ENST00000404162 MROH2AA6NES4 1674 aa31.89■■■□□ 2.7
HOXD12-201ENST00000404162 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP31.87■■■□□ 2.69
HOXD12-201ENST00000404162 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa31.86■■■□□ 2.69
HOXD12-201ENST00000404162 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP31.84■■■□□ 2.69
HOXD12-201ENST00000404162 CCDC18Q5T9S5 1454 aa31.84■■■□□ 2.69
HOXD12-201ENST00000404162 UBAP1LF5GYI3 381 aa31.83■■■□□ 2.69
HOXD12-201ENST00000404162 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa31.83■■■□□ 2.69
HOXD12-201ENST00000404162 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP31.82■■■□□ 2.68
HOXD12-201ENST00000404162 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP31.78■■■□□ 2.68
HOXD12-201ENST00000404162 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP31.78■■■□□ 2.68
HOXD12-201ENST00000404162 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP31.78■■■□□ 2.68
HOXD12-201ENST00000404162 SYCP2Q9BX26 1530 aa31.77■■■□□ 2.68
HOXD12-201ENST00000404162 MYO3AQ8NEV4 1616 aa31.75■■■□□ 2.67
HOXD12-201ENST00000404162 PKD2Q13563 968 aa31.74■■■□□ 2.67
HOXD12-201ENST00000404162 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP31.73■■■□□ 2.67
HOXD12-201ENST00000404162 PLA2R1Q13018 1463 aa31.73■■■□□ 2.67
HOXD12-201ENST00000404162 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP31.72■■■□□ 2.67
HOXD12-201ENST00000404162 PTPRKQ15262 1439 aa31.72■■■□□ 2.67
HOXD12-201ENST00000404162 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP31.71■■■□□ 2.67
HOXD12-201ENST00000404162 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP31.71■■■□□ 2.67
HOXD12-201ENST00000404162 ATP7AQ04656 1500 aa31.7■■■□□ 2.67
HOXD12-201ENST00000404162 GGT6Q6P531 493 aa31.69■■■□□ 2.66
HOXD12-201ENST00000404162 A2MP01023 1474 aa31.69■■■□□ 2.66
HOXD12-201ENST00000404162 PLXNC1O60486 1568 aa31.68■■■□□ 2.66
HOXD12-201ENST00000404162 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP31.66■■■□□ 2.66
HOXD12-201ENST00000404162 PPP6R1Q9UPN7 881 aa31.64■■■□□ 2.66
HOXD12-201ENST00000404162 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa31.63■■■□□ 2.65
HOXD12-201ENST00000404162 FYCO1Q9BQS8 1478 aa31.63■■■□□ 2.65
HOXD12-201ENST00000404162 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP31.6■■■□□ 2.65
HOXD12-201ENST00000404162 CHIC1Q5VXU3 224 aa31.59■■■□□ 2.65
HOXD12-201ENST00000404162 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa31.58■■■□□ 2.65
HOXD12-201ENST00000404162 HSPA1LP34931 641 aa31.55■■■□□ 2.64
HOXD12-201ENST00000404162 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP31.55■■■□□ 2.64
HOXD12-201ENST00000404162 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP31.54■■■□□ 2.64
HOXD12-201ENST00000404162 A2ML1A8K2U0 1454 aa31.54■■■□□ 2.64
HOXD12-201ENST00000404162 CCNB3Q8WWL7 1395 aa31.54■■■□□ 2.64
HOXD12-201ENST00000404162 PIP4K2BP78356 416 aa31.53■■■□□ 2.64
HOXD12-201ENST00000404162 ADGBQ8N7X0 1667 aa31.52■■■□□ 2.64
HOXD12-201ENST00000404162 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP31.5■■■□□ 2.63
HOXD12-201ENST00000404162 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP31.49■■■□□ 2.63
HOXD12-201ENST00000404162 TOM1O60784 492 aa31.46■■■□□ 2.63
HOXD12-201ENST00000404162 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP31.46■■■□□ 2.63
HOXD12-201ENST00000404162 NEURL4Q96JN8 1562 aa31.46■■■□□ 2.63
HOXD12-201ENST00000404162 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP31.45■■■□□ 2.63
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