RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000404141.5

PAXIP1-202, Transcript of PAX interacting protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene PAXIP1, Length 3,827 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAXIP1-202ENST00000404141 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP27.28■■□□□ 1.96
PAXIP1-202ENST00000404141 CCDC7Q96M83 1385 aa27.27■■□□□ 1.96
PAXIP1-202ENST00000404141 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP27.27■■□□□ 1.96
PAXIP1-202ENST00000404141 NAIPQ13075 1403 aa27.26■■□□□ 1.95
PAXIP1-202ENST00000404141 CNTLNQ9NXG0 1405 aa27.25■■□□□ 1.95
PAXIP1-202ENST00000404141 NEFMP07197 916 aa27.24■■□□□ 1.95
PAXIP1-202ENST00000404141 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa27.24■■□□□ 1.95
PAXIP1-202ENST00000404141 FMN1Q68DA7 1419 aa27.24■■□□□ 1.95
PAXIP1-202ENST00000404141 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa27.22■■□□□ 1.95
PAXIP1-202ENST00000404141 NUDCQ9Y266 331 aa27.21■■□□□ 1.95
PAXIP1-202ENST00000404141 HFM1A2PYH4 1435 aa27.2■■□□□ 1.94
PAXIP1-202ENST00000404141 EXOC6Q8TAG9 804 aa27.18■■□□□ 1.94
PAXIP1-202ENST00000404141 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP27.18■■□□□ 1.94
PAXIP1-202ENST00000404141 SLC4A3P48751 1232 aa27.14■■□□□ 1.93
PAXIP1-202ENST00000404141 MAP3K1Q13233 1512 aa27.12■■□□□ 1.93
PAXIP1-202ENST00000404141 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa27.11■■□□□ 1.93
PAXIP1-202ENST00000404141 PLIN1O60240 522 aa27.11■■□□□ 1.93
PAXIP1-202ENST00000404141 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP27.11■■□□□ 1.93
PAXIP1-202ENST00000404141 NCOA2Q15596 1464 aa27.1■■□□□ 1.93
PAXIP1-202ENST00000404141 IFT140Q96RY7 1462 aa27.08■■□□□ 1.93
PAXIP1-202ENST00000404141 MYOM3Q5VTT5 1437 aa27.05■■□□□ 1.92
PAXIP1-202ENST00000404141 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP27.05■■□□□ 1.92
PAXIP1-202ENST00000404141 WDR62O43379 1518 aa27.05■■□□□ 1.92
PAXIP1-202ENST00000404141 PTPN23Q9H3S7 1636 aa27.04■■□□□ 1.92
PAXIP1-202ENST00000404141 FYCO1Q9BQS8 1478 aa27.02■■□□□ 1.92
PAXIP1-202ENST00000404141 PDE4AP27815 886 aa27.02■■□□□ 1.92
PAXIP1-202ENST00000404141 NCOA1Q15788 1441 aa26.98■■□□□ 1.91
PAXIP1-202ENST00000404141 GRIN2BQ13224 1484 aa26.98■■□□□ 1.91
PAXIP1-202ENST00000404141 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP26.98■■□□□ 1.91
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PAXIP1-202ENST00000404141 CDCA7LQ96GN5 454 aa26.97■■□□□ 1.91
PAXIP1-202ENST00000404141 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP26.97■■□□□ 1.91
PAXIP1-202ENST00000404141 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa26.96■■□□□ 1.91
PAXIP1-202ENST00000404141 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP26.96■■□□□ 1.91
PAXIP1-202ENST00000404141 CARD11Q9BXL7 1154 aa26.95■■□□□ 1.91
PAXIP1-202ENST00000404141 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP26.95■■□□□ 1.9
PAXIP1-202ENST00000404141 RCAN3Q9UKA8 241 aa26.95■■□□□ 1.9
PAXIP1-202ENST00000404141 BRPF3Q9ULD4 1205 aa26.94■■□□□ 1.9
PAXIP1-202ENST00000404141 KDM5BQ9UGL1 1544 aa26.93■■□□□ 1.9
PAXIP1-202ENST00000404141 RRP1P56182 461 aaKnown RBP26.92■■□□□ 1.9
PAXIP1-202ENST00000404141 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP26.91■■□□□ 1.9
PAXIP1-202ENST00000404141 PKD2Q13563 968 aa26.9■■□□□ 1.9
PAXIP1-202ENST00000404141 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP26.88■■□□□ 1.89
PAXIP1-202ENST00000404141 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa26.88■■□□□ 1.89
PAXIP1-202ENST00000404141 USP47Q96K76 1375 aa26.87■■□□□ 1.89
PAXIP1-202ENST00000404141 CFAP43Q8NDM7 1665 aa26.87■■□□□ 1.89
PAXIP1-202ENST00000404141 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa26.85■■□□□ 1.89
PAXIP1-202ENST00000404141 RGL3Q3MIN7 710 aa26.85■■□□□ 1.89
PAXIP1-202ENST00000404141 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP26.84■■□□□ 1.89
PAXIP1-202ENST00000404141 ARXQ96QS3 562 aa26.83■■□□□ 1.89
PAXIP1-202ENST00000404141 KDM6BO15054 1643 aa26.82■■□□□ 1.88
PAXIP1-202ENST00000404141 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP26.82■■□□□ 1.88
PAXIP1-202ENST00000404141 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP26.81■■□□□ 1.88
PAXIP1-202ENST00000404141 DCAF11Q8TEB1 546 aa26.81■■□□□ 1.88
PAXIP1-202ENST00000404141 RGS3P49796 1198 aa26.8■■□□□ 1.88
PAXIP1-202ENST00000404141 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa26.8■■□□□ 1.88
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PAXIP1-202ENST00000404141 CRBNQ96SW2 442 aa26.78■■□□□ 1.88
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PAXIP1-202ENST00000404141 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP26.73■■□□□ 1.87
PAXIP1-202ENST00000404141 PBRM1Q86U86 1689 aa26.72■■□□□ 1.87
PAXIP1-202ENST00000404141 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP26.72■■□□□ 1.87
PAXIP1-202ENST00000404141 C20orf194Q5TEA3 1177 aa26.71■■□□□ 1.87
PAXIP1-202ENST00000404141 RNF123Q5XPI4 1314 aa26.7■■□□□ 1.86
PAXIP1-202ENST00000404141 NFKBIBQ15653 356 aa26.68■■□□□ 1.86
PAXIP1-202ENST00000404141 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP26.68■■□□□ 1.86
PAXIP1-202ENST00000404141 EFCAB5A4FU69 1503 aa26.67■■□□□ 1.86
PAXIP1-202ENST00000404141 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP26.66■■□□□ 1.86
PAXIP1-202ENST00000404141 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa26.65■■□□□ 1.86
PAXIP1-202ENST00000404141 GRIN2AQ12879 1464 aa26.64■■□□□ 1.86
PAXIP1-202ENST00000404141 GSE1Q14687 1217 aa26.64■■□□□ 1.86
PAXIP1-202ENST00000404141 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP26.64■■□□□ 1.85
PAXIP1-202ENST00000404141 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP26.63■■□□□ 1.85
PAXIP1-202ENST00000404141 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa26.63■■□□□ 1.85
PAXIP1-202ENST00000404141 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP26.63■■□□□ 1.857e-7■□□□□ 9.1
PAXIP1-202ENST00000404141 ADAMTS12P58397 1594 aa26.63■■□□□ 1.85
PAXIP1-202ENST00000404141 SYNJ2O15056 1496 aa26.61■■□□□ 1.85
PAXIP1-202ENST00000404141 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP26.59■■□□□ 1.85
PAXIP1-202ENST00000404141 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP26.58■■□□□ 1.85
PAXIP1-202ENST00000404141 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP26.58■■□□□ 1.85
PAXIP1-202ENST00000404141 KIF15Q9NS87 1388 aa26.58■■□□□ 1.84
PAXIP1-202ENST00000404141 NLRP13Q86W25 1043 aa26.56■■□□□ 1.84
PAXIP1-202ENST00000404141 DDRGK1Q96HY6 314 aa26.55■■□□□ 1.84
PAXIP1-202ENST00000404141 NUP155O75694 1391 aa26.55■■□□□ 1.84
PAXIP1-202ENST00000404141 USP35Q9P2H5 1018 aa26.55■■□□□ 1.84
PAXIP1-202ENST00000404141 NBPF1Q3BBV0 1214 aa26.54■■□□□ 1.84
PAXIP1-202ENST00000404141 RALBP1Q15311 655 aa26.54■■□□□ 1.84
PAXIP1-202ENST00000404141 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa26.54■■□□□ 1.84
PAXIP1-202ENST00000404141 TEX14Q8IWB6 1497 aa26.53■■□□□ 1.84
PAXIP1-202ENST00000404141 UGGT2Q9NYU1 1516 aa26.53■■□□□ 1.84
PAXIP1-202ENST00000404141 ABCC5O15440 1437 aa26.51■■□□□ 1.83
PAXIP1-202ENST00000404141 DAPK1P53355 1430 aa26.51■■□□□ 1.83
PAXIP1-202ENST00000404141 MS4A1P11836 297 aa26.5■■□□□ 1.83
PAXIP1-202ENST00000404141 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP26.49■■□□□ 1.83
PAXIP1-202ENST00000404141 IQGAP2Q13576 1575 aa26.49■■□□□ 1.83
PAXIP1-202ENST00000404141 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP26.48■■□□□ 1.83
PAXIP1-202ENST00000404141 PANK3Q9H999 370 aa26.48■■□□□ 1.83
PAXIP1-202ENST00000404141 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP26.48■■□□□ 1.83
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