RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000399336.8

NOMO3-202, Transcript of NODAL modulator 3, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene NOMO3, Length 4,356 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOMO3-202ENST00000399336 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP24.03■■□□□ 1.44
NOMO3-202ENST00000399336 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP24.02■■□□□ 1.44
NOMO3-202ENST00000399336 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP24.02■■□□□ 1.44
NOMO3-202ENST00000399336 TOP2BQ02880 1626 aa24.02■■□□□ 1.44
NOMO3-202ENST00000399336 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP24.01■■□□□ 1.43
NOMO3-202ENST00000399336 CFAP53Q96M91 514 aa23.98■■□□□ 1.43
NOMO3-202ENST00000399336 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP23.98■■□□□ 1.43
NOMO3-202ENST00000399336 MYOM3Q5VTT5 1437 aa23.97■■□□□ 1.43
NOMO3-202ENST00000399336 RCAN3Q9UKA8 241 aa23.96■■□□□ 1.43
NOMO3-202ENST00000399336 NUDCQ9Y266 331 aa23.96■■□□□ 1.43
NOMO3-202ENST00000399336 UACAQ9BZF9 1416 aa23.95■■□□□ 1.42
NOMO3-202ENST00000399336 ERICH6BQ5W0A0 696 aa23.94■■□□□ 1.42
NOMO3-202ENST00000399336 RALBP1Q15311 655 aa23.94■■□□□ 1.42
NOMO3-202ENST00000399336 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa23.93■■□□□ 1.42
NOMO3-202ENST00000399336 NESP48681 1621 aa23.93■■□□□ 1.42
NOMO3-202ENST00000399336 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP23.93■■□□□ 1.42
NOMO3-202ENST00000399336 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP23.93■■□□□ 1.42
NOMO3-202ENST00000399336 GGT6Q6P531 493 aa23.93■■□□□ 1.42
NOMO3-202ENST00000399336 BICRAQ9NZM4 1560 aa23.92■■□□□ 1.42
NOMO3-202ENST00000399336 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa23.92■■□□□ 1.42
NOMO3-202ENST00000399336 DDRGK1Q96HY6 314 aa23.91■■□□□ 1.42
NOMO3-202ENST00000399336 PLEKHG5O94827 1062 aa23.9■■□□□ 1.42
NOMO3-202ENST00000399336 WASHC2AQ641Q2 1341 aa23.9■■□□□ 1.42
NOMO3-202ENST00000399336 NCOA2Q15596 1464 aa23.9■■□□□ 1.42
NOMO3-202ENST00000399336 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP23.88■■□□□ 1.41
NOMO3-202ENST00000399336 NLRP13Q86W25 1043 aa23.88■■□□□ 1.41
NOMO3-202ENST00000399336 DEKP35659 375 aaKnown RBP23.87■■□□□ 1.41
NOMO3-202ENST00000399336 USP47Q96K76 1375 aa23.87■■□□□ 1.41
NOMO3-202ENST00000399336 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP23.86■■□□□ 1.41
NOMO3-202ENST00000399336 POGKQ9P215 609 aa23.85■■□□□ 1.41
NOMO3-202ENST00000399336 KIF3BO15066 747 aa23.84■■□□□ 1.41
NOMO3-202ENST00000399336 KIF7Q2M1P5 1343 aa23.84■■□□□ 1.41
NOMO3-202ENST00000399336 KANK1Q14678 1352 aa23.82■■□□□ 1.4
NOMO3-202ENST00000399336 MORC1Q86VD1 984 aa23.82■■□□□ 1.4
NOMO3-202ENST00000399336 ZBED9Q6R2W3 1325 aa23.8■■□□□ 1.4
NOMO3-202ENST00000399336 CCDC7Q96M83 1385 aa23.8■■□□□ 1.4
NOMO3-202ENST00000399336 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa23.79■■□□□ 1.4
NOMO3-202ENST00000399336 PANK3Q9H999 370 aa23.79■■□□□ 1.4
NOMO3-202ENST00000399336 RSPH4AQ5TD94 716 aa23.78■■□□□ 1.4
NOMO3-202ENST00000399336 FYCO1Q9BQS8 1478 aa23.78■■□□□ 1.4
NOMO3-202ENST00000399336 BECN1Q14457 450 aa23.78■■□□□ 1.4
NOMO3-202ENST00000399336 STK26Q9P289 416 aa23.78■■□□□ 1.4
NOMO3-202ENST00000399336 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP23.78■■□□□ 1.4
NOMO3-202ENST00000399336 TIAM1Q13009 1591 aa23.76■■□□□ 1.39
NOMO3-202ENST00000399336 HMGXB3Q12766 1538 aa23.76■■□□□ 1.39
NOMO3-202ENST00000399336 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP23.76■■□□□ 1.39
NOMO3-202ENST00000399336 CCDC146Q8IYE0 955 aa23.76■■□□□ 1.39
NOMO3-202ENST00000399336 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP23.75■■□□□ 1.39
NOMO3-202ENST00000399336 MYH16Q9H6N6 1097 aa23.75■■□□□ 1.39
NOMO3-202ENST00000399336 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP23.74■■□□□ 1.39
NOMO3-202ENST00000399336 NBPF8Q3BBV2 869 aa23.74■■□□□ 1.39
NOMO3-202ENST00000399336 CCDC144AA2RUR9 1427 aa23.74■■□□□ 1.39
NOMO3-202ENST00000399336 KIF15Q9NS87 1388 aa23.74■■□□□ 1.39
NOMO3-202ENST00000399336 PTPRGP23470 1445 aa23.73■■□□□ 1.39
NOMO3-202ENST00000399336 PLIN1O60240 522 aa23.73■■□□□ 1.39
NOMO3-202ENST00000399336 WDR97A6NE52 1622 aa23.73■■□□□ 1.39
NOMO3-202ENST00000399336 TOPBP1Q92547 1522 aa23.73■■□□□ 1.39
NOMO3-202ENST00000399336 DNAJC5BQ9UF47 199 aa23.72■■□□□ 1.39
NOMO3-202ENST00000399336 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP23.7■■□□□ 1.39
NOMO3-202ENST00000399336 CCDC184Q52MB2 194 aa23.7■■□□□ 1.38
NOMO3-202ENST00000399336 MLECQ14165 292 aa23.69■■□□□ 1.38
NOMO3-202ENST00000399336 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa23.68■■□□□ 1.38
NOMO3-202ENST00000399336 EXOC6Q8TAG9 804 aa23.68■■□□□ 1.38
NOMO3-202ENST00000399336 C14orf37Q86TY3 774 aa23.68■■□□□ 1.38
NOMO3-202ENST00000399336 ZBTB7CA1YPR0 619 aa23.67■■□□□ 1.38
NOMO3-202ENST00000399336 HFM1A2PYH4 1435 aa23.67■■□□□ 1.38
NOMO3-202ENST00000399336 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP23.67■■□□□ 1.38
NOMO3-202ENST00000399336 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP23.66■■□□□ 1.38
NOMO3-202ENST00000399336 GOLGA2Q08379 1002 aa23.66■■□□□ 1.38
NOMO3-202ENST00000399336 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP23.66■■□□□ 1.38
NOMO3-202ENST00000399336 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP23.66■■□□□ 1.38
NOMO3-202ENST00000399336 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP23.66■■□□□ 1.38
NOMO3-202ENST00000399336 CNTLNQ9NXG0 1405 aa23.66■■□□□ 1.38
NOMO3-202ENST00000399336 PDE3BQ13370 1112 aa23.64■■□□□ 1.38
NOMO3-202ENST00000399336 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa23.63■■□□□ 1.37
NOMO3-202ENST00000399336 TRAK1Q9UPV9 953 aa23.63■■□□□ 1.37
NOMO3-202ENST00000399336 SOX12O15370 315 aa23.6■■□□□ 1.37
NOMO3-202ENST00000399336 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP23.6■■□□□ 1.37
NOMO3-202ENST00000399336 NAIPQ13075 1403 aa23.6■■□□□ 1.37
NOMO3-202ENST00000399336 CLUAP1Q96AJ1 413 aa23.59■■□□□ 1.37
NOMO3-202ENST00000399336 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa23.59■■□□□ 1.37
NOMO3-202ENST00000399336 RRP1P56182 461 aaKnown RBP23.59■■□□□ 1.37
NOMO3-202ENST00000399336 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP23.58■■□□□ 1.37
NOMO3-202ENST00000399336 EFCAB5A4FU69 1503 aa23.58■■□□□ 1.37
NOMO3-202ENST00000399336 PEG3Q9GZU2 1588 aa23.58■■□□□ 1.36
NOMO3-202ENST00000399336 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP23.57■■□□□ 1.36
NOMO3-202ENST00000399336 GRIN2BQ13224 1484 aa23.55■■□□□ 1.36
NOMO3-202ENST00000399336 PRDM2Q13029 1718 aa23.55■■□□□ 1.36
NOMO3-202ENST00000399336 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa23.55■■□□□ 1.36
NOMO3-202ENST00000399336 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP23.54■■□□□ 1.36
NOMO3-202ENST00000399336 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP23.52■■□□□ 1.36
NOMO3-202ENST00000399336 NBPF1Q3BBV0 1214 aa23.52■■□□□ 1.36
NOMO3-202ENST00000399336 CRBNQ96SW2 442 aa23.52■■□□□ 1.35
NOMO3-202ENST00000399336 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
NOMO3-202ENST00000399336 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa23.51■■□□□ 1.35
NOMO3-202ENST00000399336 APAF1O14727 1248 aa23.51■■□□□ 1.35
NOMO3-202ENST00000399336 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
NOMO3-202ENST00000399336 MS4A1P11836 297 aa23.49■■□□□ 1.35
NOMO3-202ENST00000399336 PDE4AP27815 886 aa23.49■■□□□ 1.35
NOMO3-202ENST00000399336 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP23.49■■□□□ 1.35
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