RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000398073.6

CTDSP2-201, Transcript of CTD small phosphatase 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDSP2, Length 4,795 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2-201ENST00000398073 PDE3BQ13370 1112 aa21.15■□□□□ 0.98
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CTDSP2-201ENST00000398073 FANCIQ9NVI1 1328 aa21.1■□□□□ 0.97
CTDSP2-201ENST00000398073 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP21.1■□□□□ 0.97
CTDSP2-201ENST00000398073 ERICH3Q5RHP9 1530 aa21.09■□□□□ 0.97
CTDSP2-201ENST00000398073 PHLDB1Q86UU1 1377 aa21.09■□□□□ 0.97
CTDSP2-201ENST00000398073 ERCC6Q03468 1493 aa21.08■□□□□ 0.97
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CTDSP2-201ENST00000398073 FGD6Q6ZV73 1430 aa21.06■□□□□ 0.96
CTDSP2-201ENST00000398073 UACAQ9BZF9 1416 aa21.05■□□□□ 0.96
CTDSP2-201ENST00000398073 ARAP1Q96P48 1450 aa21.05■□□□□ 0.96
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CTDSP2-201ENST00000398073 FGD5Q6ZNL6 1462 aa21■□□□□ 0.95
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CTDSP2-201ENST00000398073 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa20.92■□□□□ 0.94
CTDSP2-201ENST00000398073 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP20.92■□□□□ 0.94
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CTDSP2-201ENST00000398073 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa20.91■□□□□ 0.94
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CTDSP2-201ENST00000398073 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP20.9■□□□□ 0.94
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CTDSP2-201ENST00000398073 KIF7Q2M1P5 1343 aa20.88■□□□□ 0.93
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CTDSP2-201ENST00000398073 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP20.84■□□□□ 0.93
CTDSP2-201ENST00000398073 PANK3Q9H999 370 aa20.84■□□□□ 0.93
CTDSP2-201ENST00000398073 TOP2BQ02880 1626 aa20.84■□□□□ 0.93
CTDSP2-201ENST00000398073 FYCO1Q9BQS8 1478 aa20.84■□□□□ 0.93
CTDSP2-201ENST00000398073 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP20.84■□□□□ 0.93
CTDSP2-201ENST00000398073 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP20.84■□□□□ 0.93
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CTDSP2-201ENST00000398073 JPH4Q96JJ6 628 aa20.82■□□□□ 0.92
CTDSP2-201ENST00000398073 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa20.82■□□□□ 0.92
CTDSP2-201ENST00000398073 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa20.82■□□□□ 0.92
CTDSP2-201ENST00000398073 GAPVD1Q14C86 1478 aa20.82■□□□□ 0.92
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CTDSP2-201ENST00000398073 CCDC146Q8IYE0 955 aa20.8■□□□□ 0.92
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CTDSP2-201ENST00000398073 FAM161AQ3B820 660 aa20.78■□□□□ 0.92
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CTDSP2-201ENST00000398073 SMC4Q9NTJ3 1288 aa20.72■□□□□ 0.91
CTDSP2-201ENST00000398073 EFCAB5A4FU69 1503 aa20.71■□□□□ 0.91
CTDSP2-201ENST00000398073 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP20.71■□□□□ 0.91
CTDSP2-201ENST00000398073 E9PSI1 815 aa20.71■□□□□ 0.91
CTDSP2-201ENST00000398073 CLUAP1Q96AJ1 413 aa20.71■□□□□ 0.91
CTDSP2-201ENST00000398073 WDR97A6NE52 1622 aa20.71■□□□□ 0.91
CTDSP2-201ENST00000398073 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP20.7■□□□□ 0.96e-9■■■■■ 82.2
CTDSP2-201ENST00000398073 MIA2Q96PC5 1412 aa20.7■□□□□ 0.9
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