RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366672.4

GALNT2-201, Transcript of polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GALNT2, Length 4,454 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GALNT2-201ENST00000366672 ZBTB7CA1YPR0 619 aa24.23■■□□□ 1.47
GALNT2-201ENST00000366672 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP24.21■■□□□ 1.47
GALNT2-201ENST00000366672 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP24.21■■□□□ 1.473e-6■■■■□ 20.2
GALNT2-201ENST00000366672 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP24.21■■□□□ 1.47
GALNT2-201ENST00000366672 DDRGK1Q96HY6 314 aa24.2■■□□□ 1.46
GALNT2-201ENST00000366672 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP24.2■■□□□ 1.46
GALNT2-201ENST00000366672 PLEKHG5O94827 1062 aa24.19■■□□□ 1.46
GALNT2-201ENST00000366672 RALBP1Q15311 655 aa24.18■■□□□ 1.46
GALNT2-201ENST00000366672 MORC1Q86VD1 984 aa24.18■■□□□ 1.46
GALNT2-201ENST00000366672 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP24.17■■□□□ 1.46
GALNT2-201ENST00000366672 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP24.17■■□□□ 1.46
GALNT2-201ENST00000366672 PRXQ9BXM0 1461 aa24.16■■□□□ 1.46
GALNT2-201ENST00000366672 FGD6Q6ZV73 1430 aa24.16■■□□□ 1.46
GALNT2-201ENST00000366672 TRHP20396 242 aaPredicted RBP24.15■■□□□ 1.46
GALNT2-201ENST00000366672 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP24.15■■□□□ 1.46
GALNT2-201ENST00000366672 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP24.15■■□□□ 1.46
GALNT2-201ENST00000366672 MYOM3Q5VTT5 1437 aa24.14■■□□□ 1.45
GALNT2-201ENST00000366672 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa24.14■■□□□ 1.45
GALNT2-201ENST00000366672 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa24.14■■□□□ 1.45
GALNT2-201ENST00000366672 GRIN2BQ13224 1484 aa24.13■■□□□ 1.45
GALNT2-201ENST00000366672 PHLDB1Q86UU1 1377 aa24.12■■□□□ 1.45
GALNT2-201ENST00000366672 TOP2BQ02880 1626 aa24.12■■□□□ 1.45
GALNT2-201ENST00000366672 STK26Q9P289 416 aa24.12■■□□□ 1.45
GALNT2-201ENST00000366672 ARAP1Q96P48 1450 aa24.11■■□□□ 1.45
GALNT2-201ENST00000366672 NESP48681 1621 aa24.11■■□□□ 1.45
GALNT2-201ENST00000366672 ANP32EQ9BTT0 268 aa24.11■■□□□ 1.45
GALNT2-201ENST00000366672 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa24.1■■□□□ 1.45
GALNT2-201ENST00000366672 BECN1Q14457 450 aa24.09■■□□□ 1.45
GALNT2-201ENST00000366672 ERICH6BQ5W0A0 696 aa24.09■■□□□ 1.45
GALNT2-201ENST00000366672 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP24.09■■□□□ 1.45
GALNT2-201ENST00000366672 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa24.08■■□□□ 1.45
GALNT2-201ENST00000366672 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP24.07■■□□□ 1.44
GALNT2-201ENST00000366672 MS4A1P11836 297 aa24.07■■□□□ 1.44
GALNT2-201ENST00000366672 CCDC144AA2RUR9 1427 aa24.07■■□□□ 1.44
GALNT2-201ENST00000366672 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP24.07■■□□□ 1.44
GALNT2-201ENST00000366672 CUX1P39880 1505 aa24.07■■□□□ 1.44
GALNT2-201ENST00000366672 BICRAQ9NZM4 1560 aa24.06■■□□□ 1.44
GALNT2-201ENST00000366672 OSCARQ8IYS5 282 aa24.06■■□□□ 1.44
GALNT2-201ENST00000366672 TOPBP1Q92547 1522 aa24.05■■□□□ 1.44
GALNT2-201ENST00000366672 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP24.05■■□□□ 1.44
GALNT2-201ENST00000366672 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa24.05■■□□□ 1.44
GALNT2-201ENST00000366672 LMOD2Q6P5Q4 547 aa24.03■■□□□ 1.44
GALNT2-201ENST00000366672 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP24.02■■□□□ 1.44
GALNT2-201ENST00000366672 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP24.02■■□□□ 1.44
GALNT2-201ENST00000366672 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP24.02■■□□□ 1.43
GALNT2-201ENST00000366672 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP24.01■■□□□ 1.43
GALNT2-201ENST00000366672 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa24.01■■□□□ 1.43
GALNT2-201ENST00000366672 NLRP13Q86W25 1043 aa24■■□□□ 1.43
GALNT2-201ENST00000366672 FYCO1Q9BQS8 1478 aa23.99■■□□□ 1.43
GALNT2-201ENST00000366672 NCOA2Q15596 1464 aa23.98■■□□□ 1.43
GALNT2-201ENST00000366672 MRC2Q9UBG0 1479 aa23.98■■□□□ 1.43
GALNT2-201ENST00000366672 UACAQ9BZF9 1416 aa23.98■■□□□ 1.43
GALNT2-201ENST00000366672 A0A0G2JS52 829 aa23.96■■□□□ 1.43
GALNT2-201ENST00000366672 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP23.94■■□□□ 1.42
GALNT2-201ENST00000366672 IFT140Q96RY7 1462 aa23.94■■□□□ 1.42
GALNT2-201ENST00000366672 RGS3P49796 1198 aa23.93■■□□□ 1.42
GALNT2-201ENST00000366672 EFCAB5A4FU69 1503 aa23.93■■□□□ 1.42
GALNT2-201ENST00000366672 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP23.91■■□□□ 1.42
GALNT2-201ENST00000366672 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP23.91■■□□□ 1.42
GALNT2-201ENST00000366672 KIF15Q9NS87 1388 aa23.91■■□□□ 1.42
GALNT2-201ENST00000366672 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP23.91■■□□□ 1.42
GALNT2-201ENST00000366672 TERF2IPQ9NYB0 399 aa23.9■■□□□ 1.42
GALNT2-201ENST00000366672 CYB5RLQ6IPT4 315 aa23.9■■□□□ 1.42
GALNT2-201ENST00000366672 RCAN3Q9UKA8 241 aa23.9■■□□□ 1.42
GALNT2-201ENST00000366672 SOX12O15370 315 aa23.88■■□□□ 1.41
GALNT2-201ENST00000366672 DNMBPQ6XZF7 1577 aa23.88■■□□□ 1.41
GALNT2-201ENST00000366672 USP47Q96K76 1375 aa23.88■■□□□ 1.41
GALNT2-201ENST00000366672 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP23.88■■□□□ 1.41
GALNT2-201ENST00000366672 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP23.87■■□□□ 1.41
GALNT2-201ENST00000366672 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa23.86■■□□□ 1.41
GALNT2-201ENST00000366672 TRAK1Q9UPV9 953 aa23.86■■□□□ 1.41
GALNT2-201ENST00000366672 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP23.86■■□□□ 1.41
GALNT2-201ENST00000366672 VGFO15240 615 aaPredicted RBP23.85■■□□□ 1.41
GALNT2-201ENST00000366672 PDE3BQ13370 1112 aa23.84■■□□□ 1.41
GALNT2-201ENST00000366672 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP23.84■■□□□ 1.41
GALNT2-201ENST00000366672 PRDM2Q13029 1718 aa23.82■■□□□ 1.4
GALNT2-201ENST00000366672 STAC3Q96MF2 364 aa23.82■■□□□ 1.4
GALNT2-201ENST00000366672 PANK3Q9H999 370 aa23.82■■□□□ 1.4
GALNT2-201ENST00000366672 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP23.82■■□□□ 1.4
GALNT2-201ENST00000366672 CASC1Q6TDU7 716 aa23.82■■□□□ 1.4
GALNT2-201ENST00000366672 EID1Q9Y6B2 187 aa23.81■■□□□ 1.4
GALNT2-201ENST00000366672 PEG3Q9GZU2 1588 aa23.8■■□□□ 1.4
GALNT2-201ENST00000366672 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP23.8■■□□□ 1.4
GALNT2-201ENST00000366672 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP23.79■■□□□ 1.4
GALNT2-201ENST00000366672 SYNJ2O15056 1496 aa23.79■■□□□ 1.4
GALNT2-201ENST00000366672 ARXQ96QS3 562 aa23.79■■□□□ 1.4
GALNT2-201ENST00000366672 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa23.79■■□□□ 1.4
GALNT2-201ENST00000366672 GOLGA6L22H0YM25 854 aa23.78■■□□□ 1.4
GALNT2-201ENST00000366672 GOLGA2Q08379 1002 aa23.78■■□□□ 1.4
GALNT2-201ENST00000366672 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP23.78■■□□□ 1.4
GALNT2-201ENST00000366672 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP23.77■■□□□ 1.4
GALNT2-201ENST00000366672 MIA2Q96PC5 1412 aa23.76■■□□□ 1.39
GALNT2-201ENST00000366672 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP23.72■■□□□ 1.39
GALNT2-201ENST00000366672 TIAM1Q13009 1591 aa23.72■■□□□ 1.39
GALNT2-201ENST00000366672 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa23.71■■□□□ 1.39
GALNT2-201ENST00000366672 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa23.71■■□□□ 1.39
GALNT2-201ENST00000366672 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa23.71■■□□□ 1.39
GALNT2-201ENST00000366672 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa23.7■■□□□ 1.38
GALNT2-201ENST00000366672 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP23.69■■□□□ 1.38
GALNT2-201ENST00000366672 AFAP1Q8N556 730 aa23.69■■□□□ 1.38
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