RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362825.1

RNU6-1128P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1128, pseudogene, humanhuman

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Gene RNU6-1128P, Length 109 nt, Biotype snRNA, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CHD8Q9HCK8 2581 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-1128P-201ENST00000362825 TMEM79Q9BSE2 394 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-1128P-201ENST00000362825 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CUL9Q8IWT3 2517 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-1128P-201ENST00000362825 MAST4O15021 2626 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ITGB7P26010 798 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-1128P-201ENST00000362825 KRT13P13646 458 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-1128P-201ENST00000362825 COL6A5A8TX70 2615 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-1128P-201ENST00000362825 FLNAP21333 2647 aaKnown RBP-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-1128P-201ENST00000362825 HERC2O95714 4834 aa-0.66□□□□□ -2.51
RNU6-1128P-201ENST00000362825 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP-0.66□□□□□ -2.52
RNU6-1128P-201ENST00000362825 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP-0.67□□□□□ -2.52
RNU6-1128P-201ENST00000362825 UBXN11Q5T124 520 aa-0.67□□□□□ -2.52
RNU6-1128P-201ENST00000362825 LCE1AQ5T7P2 110 aa-0.67□□□□□ -2.52
RNU6-1128P-201ENST00000362825 FRAS1Q86XX4 4008 aa-0.68□□□□□ -2.52
RNU6-1128P-201ENST00000362825 PTPN13Q12923 2485 aa-0.68□□□□□ -2.52
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP-0.68□□□□□ -2.52
RNU6-1128P-201ENST00000362825 WFDC1Q9HC57 220 aa-0.68□□□□□ -2.52
RNU6-1128P-201ENST00000362825 NAV2Q8IVL1 2488 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-1128P-201ENST00000362825 LCE5AQ5TCM9 118 aa-0.7□□□□□ -2.52
RNU6-1128P-201ENST00000362825 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP-0.7□□□□□ -2.52
RNU6-1128P-201ENST00000362825 COL12A1Q99715 3063 aa-0.71□□□□□ -2.52
RNU6-1128P-201ENST00000362825 PIEZO1Q92508 2521 aa-0.72□□□□□ -2.52
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ZNF462Q96JM2 2506 aa-0.72□□□□□ -2.52
RNU6-1128P-201ENST00000362825 HELZ2Q9BYK8 2649 aaKnown RBP-0.72□□□□□ -2.52
RNU6-1128P-201ENST00000362825 KRTAP10-5P60370 271 aa-0.72□□□□□ -2.52
RNU6-1128P-201ENST00000362825 LAMC2Q13753 1193 aa-0.72□□□□□ -2.52
RNU6-1128P-201ENST00000362825 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa-0.72□□□□□ -2.52
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ERBB3P21860 1342 aa-0.72□□□□□ -2.52
RNU6-1128P-201ENST00000362825 FASNP49327 2511 aaKnown RBP-0.72□□□□□ -2.53
RNU6-1128P-201ENST00000362825 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ZFYVE26Q68DK2 2539 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-1128P-201ENST00000362825 GDF7Q7Z4P5 450 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-1128P-201ENST00000362825 PRB3Q04118 309 aaPredicted RBP-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-1128P-201ENST00000362825 COL9A2Q14055 689 aaPredicted RBP-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-1128P-201ENST00000362825 BMPERQ8N8U9 685 aa-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-1128P-201ENST00000362825 DNHD1Q96M86 4753 aa-0.77□□□□□ -2.53
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RNU6-1128P-201ENST00000362825 ZNF843Q8N446 348 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SSUH2Q9Y2M2 353 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-1128P-201ENST00000362825 DLL1O00548 723 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-1128P-201ENST00000362825 RPS2P15880 293 aaKnown RBP-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-1128P-201ENST00000362825 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-1128P-201ENST00000362825 EGFL7Q9UHF1 273 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-1128P-201ENST00000362825 FAT1Q14517 4588 aa-0.79□□□□□ -2.54
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RNU6-1128P-201ENST00000362825 PSMG3-AS1Q96PY0 264 aa-0.8□□□□□ -2.54
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RNU6-1128P-201ENST00000362825 STARD9Q9P2P6 4700 aa-0.81□□□□□ -2.54
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RNU6-1128P-201ENST00000362825 HRNRQ86YZ3 2850 aaPredicted RBP-0.82□□□□□ -2.54
RNU6-1128P-201ENST00000362825 JMJD1CQ15652 2540 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-1128P-201ENST00000362825 DSPP15924 2871 aaKnown RBP-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-1128P-201ENST00000362825 KRTAP10-1P60331 282 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-1128P-201ENST00000362825 COL10A1Q03692 680 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-1128P-201ENST00000362825 EVX2Q03828 476 aa-0.83□□□□□ -2.54
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RNU6-1128P-201ENST00000362825 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP-0.84□□□□□ -2.54
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RNU6-1128P-201ENST00000362825 EDAQ92838 391 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-1128P-201ENST00000362825 USP9XQ93008 2570 aaPredicted RBP-0.86□□□□□ -2.55
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RNU6-1128P-201ENST00000362825 COL26A1Q96A83 441 aa-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-1128P-201ENST00000362825 WBP11Q9Y2W2 641 aaKnown RBP-0.86□□□□□ -2.55
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RNU6-1128P-201ENST00000362825 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-1128P-201ENST00000362825 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-1128P-201ENST00000362825 PDZD2O15018 2839 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-1128P-201ENST00000362825 MGAM2Q2M2H8 2515 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ABCA12Q86UK0 2595 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-1128P-201ENST00000362825 MYO18BQ8IUG5 2567 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-1128P-201ENST00000362825 LAMA3Q16787 3333 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-1128P-201ENST00000362825 KRT9P35527 623 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-1128P-201ENST00000362825 GPR179Q6PRD1 2367 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ACACBO00763 2458 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-1128P-201ENST00000362825 UBR5O95071 2799 aaPredicted RBP-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-1128P-201ENST00000362825 IGSF10Q6WRI0 2623 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-1128P-201ENST00000362825 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-1128P-201ENST00000362825 EPG5Q9HCE0 2579 aa-0.91□□□□□ -2.56
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ZNF318Q5VUA4 2279 aa-0.91□□□□□ -2.56
RNU6-1128P-201ENST00000362825 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-1128P-201ENST00000362825 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-1128P-201ENST00000362825 LCE2CQ5TA81 110 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-1128P-201ENST00000362825 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-1128P-201ENST00000362825 PKD1L2Q7Z442 2459 aa-0.93□□□□□ -2.56
RNU6-1128P-201ENST00000362825 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa-0.93□□□□□ -2.56
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ANKRD11Q6UB99 2663 aaPredicted RBP-0.93□□□□□ -2.56
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa-0.94□□□□□ -2.56
RNU6-1128P-201ENST00000362825 DRD4P21917 467 aa-0.94□□□□□ -2.56
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP-0.94□□□□□ -2.56
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