RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000352068.5

SNX15-201, Transcript of sorting nexin 15, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene SNX15, Length 771 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX15-201ENST00000352068 CFAP74Q9C0B2 1584 aa21.4■■□□□ 1.02
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SNX15-201ENST00000352068 KIF14Q15058 1648 aa20.75■□□□□ 0.91
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SNX15-201ENST00000352068 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP20.72■□□□□ 0.91
SNX15-201ENST00000352068 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP20.71■□□□□ 0.91
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SNX15-201ENST00000352068 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa20.7■□□□□ 0.9
SNX15-201ENST00000352068 ABCC1P33527 1531 aa20.7■□□□□ 0.9
SNX15-201ENST00000352068 POTEAQ6S8J7 498 aa20.7■□□□□ 0.9
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SNX15-201ENST00000352068 ITSN2Q9NZM3 1697 aa20.68■□□□□ 0.9
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SNX15-201ENST00000352068 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
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SNX15-201ENST00000352068 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
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SNX15-201ENST00000352068 MED14O60244 1454 aa20.58■□□□□ 0.89
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SNX15-201ENST00000352068 A2MP01023 1474 aa20.55■□□□□ 0.88
SNX15-201ENST00000352068 DEPDC5O75140 1603 aa20.54■□□□□ 0.88
SNX15-201ENST00000352068 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
SNX15-201ENST00000352068 TNRQ92752 1358 aa20.54■□□□□ 0.88
SNX15-201ENST00000352068 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP20.54■□□□□ 0.88
SNX15-201ENST00000352068 SYNMO15061 1565 aa20.54■□□□□ 0.88
SNX15-201ENST00000352068 STRCP1A6NGW2 1772 aa20.52■□□□□ 0.88
SNX15-201ENST00000352068 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP20.51■□□□□ 0.87
SNX15-201ENST00000352068 ATP7AQ04656 1500 aa20.51■□□□□ 0.87
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