RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000291906.4

PKN3-201, Transcript of protein kinase N3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PKN3, Length 3,375 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKN3-201ENST00000291906 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP24.03■■□□□ 1.44
PKN3-201ENST00000291906 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa24.03■■□□□ 1.44
PKN3-201ENST00000291906 KCNH8Q96L42 1107 aa24.02■■□□□ 1.44
PKN3-201ENST00000291906 ABCC5O15440 1437 aa24.02■■□□□ 1.44
PKN3-201ENST00000291906 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa24■■□□□ 1.43
PKN3-201ENST00000291906 KDM6BO15054 1643 aa23.99■■□□□ 1.43
PKN3-201ENST00000291906 KIF14Q15058 1648 aa23.98■■□□□ 1.43
PKN3-201ENST00000291906 ATP10BO94823 1461 aa23.98■■□□□ 1.43
PKN3-201ENST00000291906 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP23.97■■□□□ 1.43
PKN3-201ENST00000291906 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP23.96■■□□□ 1.43
PKN3-201ENST00000291906 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa23.93■■□□□ 1.42
PKN3-201ENST00000291906 CHD1O14646 1710 aa23.93■■□□□ 1.42
PKN3-201ENST00000291906 TSPY4P0CV99 314 aa23.92■■□□□ 1.42
PKN3-201ENST00000291906 TSPY10P0CW01 314 aa23.92■■□□□ 1.42
PKN3-201ENST00000291906 L3MBTL2Q969R5 705 aa23.88■■□□□ 1.41
PKN3-201ENST00000291906 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP23.88■■□□□ 1.41
PKN3-201ENST00000291906 ABCA8O94911 1581 aa23.87■■□□□ 1.41
PKN3-201ENST00000291906 AKNAQ7Z591 1439 aa23.84■■□□□ 1.41
PKN3-201ENST00000291906 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP23.84■■□□□ 1.41
PKN3-201ENST00000291906 ERCC6L2Q5T890 1561 aa23.84■■□□□ 1.41
PKN3-201ENST00000291906 ROCK1Q13464 1354 aa23.83■■□□□ 1.41
PKN3-201ENST00000291906 GCC2Q8IWJ2 1684 aa23.83■■□□□ 1.41
PKN3-201ENST00000291906 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa23.82■■□□□ 1.4
PKN3-201ENST00000291906 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP23.81■■□□□ 1.4
PKN3-201ENST00000291906 PKD2Q13563 968 aa23.81■■□□□ 1.4
PKN3-201ENST00000291906 NCOA1Q15788 1441 aa23.81■■□□□ 1.4
PKN3-201ENST00000291906 ITSN2Q9NZM3 1697 aa23.77■■□□□ 1.4
PKN3-201ENST00000291906 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP23.77■■□□□ 1.4
PKN3-201ENST00000291906 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP23.76■■□□□ 1.39
PKN3-201ENST00000291906 NUP155O75694 1391 aa23.74■■□□□ 1.39
PKN3-201ENST00000291906 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa23.74■■□□□ 1.39
PKN3-201ENST00000291906 ABCC10Q5T3U5 1492 aa23.73■■□□□ 1.39
PKN3-201ENST00000291906 C9orf84Q5VXU9 1444 aa23.73■■□□□ 1.39
PKN3-201ENST00000291906 ANP32CO43423 234 aa23.72■■□□□ 1.39
PKN3-201ENST00000291906 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa23.72■■□□□ 1.39
PKN3-201ENST00000291906 POLR3GLQ9BT43 218 aa23.71■■□□□ 1.39
PKN3-201ENST00000291906 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP23.71■■□□□ 1.39
PKN3-201ENST00000291906 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa23.7■■□□□ 1.38
PKN3-201ENST00000291906 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP23.69■■□□□ 1.38
PKN3-201ENST00000291906 NBPF8Q3BBV2 869 aa23.69■■□□□ 1.38
PKN3-201ENST00000291906 KIF15Q9NS87 1388 aa23.68■■□□□ 1.38
PKN3-201ENST00000291906 ADCY10Q96PN6 1610 aa23.68■■□□□ 1.38
PKN3-201ENST00000291906 MYT1LQ9UL68 1186 aa23.68■■□□□ 1.38
PKN3-201ENST00000291906 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa23.68■■□□□ 1.38
PKN3-201ENST00000291906 ARHGAP5Q13017 1502 aa23.65■■□□□ 1.38
PKN3-201ENST00000291906 PZPP20742 1482 aa23.62■■□□□ 1.37
PKN3-201ENST00000291906 KDM5BQ9UGL1 1544 aa23.6■■□□□ 1.37
PKN3-201ENST00000291906 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP23.58■■□□□ 1.37
PKN3-201ENST00000291906 ABCC2Q92887 1545 aa23.58■■□□□ 1.37
PKN3-201ENST00000291906 ADGRL2O95490 1459 aa23.57■■□□□ 1.36
PKN3-201ENST00000291906 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa23.57■■□□□ 1.36
PKN3-201ENST00000291906 WASHC2AQ641Q2 1341 aa23.57■■□□□ 1.36
PKN3-201ENST00000291906 RGL3Q3MIN7 710 aa23.57■■□□□ 1.36
PKN3-201ENST00000291906 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa23.56■■□□□ 1.36
PKN3-201ENST00000291906 SHROOM2Q13796 1616 aa23.56■■□□□ 1.36
PKN3-201ENST00000291906 ADGBQ8N7X0 1667 aa23.56■■□□□ 1.36
PKN3-201ENST00000291906 CCDC141Q6ZP82 1450 aa23.54■■□□□ 1.36
PKN3-201ENST00000291906 SYCP2Q9BX26 1530 aa23.54■■□□□ 1.36
PKN3-201ENST00000291906 TTC37Q6PGP7 1564 aa23.54■■□□□ 1.36
PKN3-201ENST00000291906 MBD5Q9P267 1494 aa23.54■■□□□ 1.36
PKN3-201ENST00000291906 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP23.54■■□□□ 1.36
PKN3-201ENST00000291906 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa23.53■■□□□ 1.36
PKN3-201ENST00000291906 RSPH4AQ5TD94 716 aa23.53■■□□□ 1.36
PKN3-201ENST00000291906 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP23.53■■□□□ 1.369e-7■■■□□ 17.9
PKN3-201ENST00000291906 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa23.51■■□□□ 1.35
PKN3-201ENST00000291906 DCAF11Q8TEB1 546 aa23.51■■□□□ 1.35
PKN3-201ENST00000291906 CROCC2H7BZ55 1655 aa23.51■■□□□ 1.35
PKN3-201ENST00000291906 AFAP1Q8N556 730 aa23.51■■□□□ 1.35
PKN3-201ENST00000291906 CLASP1Q7Z460 1538 aa23.47■■□□□ 1.35
PKN3-201ENST00000291906 SHANK2Q9UPX8 1470 aa23.47■■□□□ 1.35
PKN3-201ENST00000291906 TEX14Q8IWB6 1497 aa23.46■■□□□ 1.35
PKN3-201ENST00000291906 OSCARQ8IYS5 282 aa23.46■■□□□ 1.35
PKN3-201ENST00000291906 PREX2Q70Z35 1606 aa23.46■■□□□ 1.35
PKN3-201ENST00000291906 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP23.44■■□□□ 1.34
PKN3-201ENST00000291906 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
PKN3-201ENST00000291906 CARD11Q9BXL7 1154 aa23.42■■□□□ 1.34
PKN3-201ENST00000291906 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
PKN3-201ENST00000291906 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa23.41■■□□□ 1.34
PKN3-201ENST00000291906 ARHGEF5Q12774 1597 aa23.4■■□□□ 1.34
PKN3-201ENST00000291906 PLCH2O75038 1416 aa23.39■■□□□ 1.34
PKN3-201ENST00000291906 CCER2I3L3R5 266 aa23.39■■□□□ 1.33
PKN3-201ENST00000291906 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa23.38■■□□□ 1.33
PKN3-201ENST00000291906 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa23.38■■□□□ 1.33
PKN3-201ENST00000291906 CCDC7Q96M83 1385 aa23.38■■□□□ 1.33
PKN3-201ENST00000291906 MYO5CQ9NQX4 1742 aa23.37■■□□□ 1.33
PKN3-201ENST00000291906 KIF7Q2M1P5 1343 aa23.36■■□□□ 1.33
PKN3-201ENST00000291906 USP47Q96K76 1375 aa23.35■■□□□ 1.33
PKN3-201ENST00000291906 CCDC144AA2RUR9 1427 aa23.32■■□□□ 1.32
PKN3-201ENST00000291906 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP23.32■■□□□ 1.32
PKN3-201ENST00000291906 FAM135AQ9P2D6 1515 aa23.32■■□□□ 1.32
PKN3-201ENST00000291906 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa23.31■■□□□ 1.32
PKN3-201ENST00000291906 FAM9BQ8IZU0 186 aa23.31■■□□□ 1.32
PKN3-201ENST00000291906 CCDC184Q52MB2 194 aa23.31■■□□□ 1.32
PKN3-201ENST00000291906 BCANQ96GW7 911 aa23.3■■□□□ 1.32
PKN3-201ENST00000291906 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa23.29■■□□□ 1.32
PKN3-201ENST00000291906 KIF3BO15066 747 aa23.28■■□□□ 1.32
PKN3-201ENST00000291906 CNTLNQ9NXG0 1405 aa23.27■■□□□ 1.32
PKN3-201ENST00000291906 WDR7Q9Y4E6 1490 aa23.26■■□□□ 1.31
PKN3-201ENST00000291906 MRS2Q9HD23 443 aa23.26■■□□□ 1.31
PKN3-201ENST00000291906 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.8 ms