RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000291906.4

PKN3-201, Transcript of protein kinase N3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PKN3, Length 3,375 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKN3-201ENST00000291906 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP24.03■■□□□ 1.44
PKN3-201ENST00000291906 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa24.03■■□□□ 1.44
PKN3-201ENST00000291906 KCNH8Q96L42 1107 aa24.02■■□□□ 1.44
PKN3-201ENST00000291906 ABCC5O15440 1437 aa24.02■■□□□ 1.44
PKN3-201ENST00000291906 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa24■■□□□ 1.43
PKN3-201ENST00000291906 KDM6BO15054 1643 aa23.99■■□□□ 1.43
PKN3-201ENST00000291906 KIF14Q15058 1648 aa23.98■■□□□ 1.43
PKN3-201ENST00000291906 ATP10BO94823 1461 aa23.98■■□□□ 1.43
PKN3-201ENST00000291906 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP23.97■■□□□ 1.43
PKN3-201ENST00000291906 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP23.96■■□□□ 1.43
PKN3-201ENST00000291906 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa23.93■■□□□ 1.42
PKN3-201ENST00000291906 CHD1O14646 1710 aa23.93■■□□□ 1.42
PKN3-201ENST00000291906 TSPY4P0CV99 314 aa23.92■■□□□ 1.42
PKN3-201ENST00000291906 TSPY10P0CW01 314 aa23.92■■□□□ 1.42
PKN3-201ENST00000291906 L3MBTL2Q969R5 705 aa23.88■■□□□ 1.41
PKN3-201ENST00000291906 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP23.88■■□□□ 1.41
PKN3-201ENST00000291906 ABCA8O94911 1581 aa23.87■■□□□ 1.41
PKN3-201ENST00000291906 AKNAQ7Z591 1439 aa23.84■■□□□ 1.41
PKN3-201ENST00000291906 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP23.84■■□□□ 1.41
PKN3-201ENST00000291906 ERCC6L2Q5T890 1561 aa23.84■■□□□ 1.41
PKN3-201ENST00000291906 ROCK1Q13464 1354 aa23.83■■□□□ 1.41
PKN3-201ENST00000291906 GCC2Q8IWJ2 1684 aa23.83■■□□□ 1.41
PKN3-201ENST00000291906 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa23.82■■□□□ 1.4
PKN3-201ENST00000291906 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP23.81■■□□□ 1.4
PKN3-201ENST00000291906 PKD2Q13563 968 aa23.81■■□□□ 1.4
PKN3-201ENST00000291906 NCOA1Q15788 1441 aa23.81■■□□□ 1.4
PKN3-201ENST00000291906 ITSN2Q9NZM3 1697 aa23.77■■□□□ 1.4
PKN3-201ENST00000291906 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP23.77■■□□□ 1.4
PKN3-201ENST00000291906 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP23.76■■□□□ 1.39
PKN3-201ENST00000291906 NUP155O75694 1391 aa23.74■■□□□ 1.39
PKN3-201ENST00000291906 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa23.74■■□□□ 1.39
PKN3-201ENST00000291906 ABCC10Q5T3U5 1492 aa23.73■■□□□ 1.39
PKN3-201ENST00000291906 C9orf84Q5VXU9 1444 aa23.73■■□□□ 1.39
PKN3-201ENST00000291906 ANP32CO43423 234 aa23.72■■□□□ 1.39
PKN3-201ENST00000291906 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa23.72■■□□□ 1.39
PKN3-201ENST00000291906 POLR3GLQ9BT43 218 aa23.71■■□□□ 1.39
PKN3-201ENST00000291906 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP23.71■■□□□ 1.39
PKN3-201ENST00000291906 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa23.7■■□□□ 1.38
PKN3-201ENST00000291906 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP23.69■■□□□ 1.38
PKN3-201ENST00000291906 NBPF8Q3BBV2 869 aa23.69■■□□□ 1.38
PKN3-201ENST00000291906 KIF15Q9NS87 1388 aa23.68■■□□□ 1.38
PKN3-201ENST00000291906 ADCY10Q96PN6 1610 aa23.68■■□□□ 1.38
PKN3-201ENST00000291906 MYT1LQ9UL68 1186 aa23.68■■□□□ 1.38
PKN3-201ENST00000291906 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa23.68■■□□□ 1.38
PKN3-201ENST00000291906 ARHGAP5Q13017 1502 aa23.65■■□□□ 1.38
PKN3-201ENST00000291906 PZPP20742 1482 aa23.62■■□□□ 1.37
PKN3-201ENST00000291906 KDM5BQ9UGL1 1544 aa23.6■■□□□ 1.37
PKN3-201ENST00000291906 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP23.58■■□□□ 1.37
PKN3-201ENST00000291906 ABCC2Q92887 1545 aa23.58■■□□□ 1.37
PKN3-201ENST00000291906 ADGRL2O95490 1459 aa23.57■■□□□ 1.36
PKN3-201ENST00000291906 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa23.57■■□□□ 1.36
PKN3-201ENST00000291906 WASHC2AQ641Q2 1341 aa23.57■■□□□ 1.36
PKN3-201ENST00000291906 RGL3Q3MIN7 710 aa23.57■■□□□ 1.36
PKN3-201ENST00000291906 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa23.56■■□□□ 1.36
PKN3-201ENST00000291906 SHROOM2Q13796 1616 aa23.56■■□□□ 1.36
PKN3-201ENST00000291906 ADGBQ8N7X0 1667 aa23.56■■□□□ 1.36
PKN3-201ENST00000291906 CCDC141Q6ZP82 1450 aa23.54■■□□□ 1.36
PKN3-201ENST00000291906 SYCP2Q9BX26 1530 aa23.54■■□□□ 1.36
PKN3-201ENST00000291906 TTC37Q6PGP7 1564 aa23.54■■□□□ 1.36
PKN3-201ENST00000291906 MBD5Q9P267 1494 aa23.54■■□□□ 1.36
PKN3-201ENST00000291906 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP23.54■■□□□ 1.36
PKN3-201ENST00000291906 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa23.53■■□□□ 1.36
PKN3-201ENST00000291906 RSPH4AQ5TD94 716 aa23.53■■□□□ 1.36
PKN3-201ENST00000291906 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP23.53■■□□□ 1.369e-7■■■□□ 17.9
PKN3-201ENST00000291906 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa23.51■■□□□ 1.35
PKN3-201ENST00000291906 DCAF11Q8TEB1 546 aa23.51■■□□□ 1.35
PKN3-201ENST00000291906 CROCC2H7BZ55 1655 aa23.51■■□□□ 1.35
PKN3-201ENST00000291906 AFAP1Q8N556 730 aa23.51■■□□□ 1.35
PKN3-201ENST00000291906 CLASP1Q7Z460 1538 aa23.47■■□□□ 1.35
PKN3-201ENST00000291906 SHANK2Q9UPX8 1470 aa23.47■■□□□ 1.35
PKN3-201ENST00000291906 TEX14Q8IWB6 1497 aa23.46■■□□□ 1.35
PKN3-201ENST00000291906 OSCARQ8IYS5 282 aa23.46■■□□□ 1.35
PKN3-201ENST00000291906 PREX2Q70Z35 1606 aa23.46■■□□□ 1.35
PKN3-201ENST00000291906 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP23.44■■□□□ 1.34
PKN3-201ENST00000291906 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
PKN3-201ENST00000291906 CARD11Q9BXL7 1154 aa23.42■■□□□ 1.34
PKN3-201ENST00000291906 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
PKN3-201ENST00000291906 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa23.41■■□□□ 1.34
PKN3-201ENST00000291906 ARHGEF5Q12774 1597 aa23.4■■□□□ 1.34
PKN3-201ENST00000291906 PLCH2O75038 1416 aa23.39■■□□□ 1.34
PKN3-201ENST00000291906 CCER2I3L3R5 266 aa23.39■■□□□ 1.33
PKN3-201ENST00000291906 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa23.38■■□□□ 1.33
PKN3-201ENST00000291906 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa23.38■■□□□ 1.33
PKN3-201ENST00000291906 CCDC7Q96M83 1385 aa23.38■■□□□ 1.33
PKN3-201ENST00000291906 MYO5CQ9NQX4 1742 aa23.37■■□□□ 1.33
PKN3-201ENST00000291906 KIF7Q2M1P5 1343 aa23.36■■□□□ 1.33
PKN3-201ENST00000291906 USP47Q96K76 1375 aa23.35■■□□□ 1.33
PKN3-201ENST00000291906 CCDC144AA2RUR9 1427 aa23.32■■□□□ 1.32
PKN3-201ENST00000291906 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP23.32■■□□□ 1.32
PKN3-201ENST00000291906 FAM135AQ9P2D6 1515 aa23.32■■□□□ 1.32
PKN3-201ENST00000291906 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa23.31■■□□□ 1.32
PKN3-201ENST00000291906 FAM9BQ8IZU0 186 aa23.31■■□□□ 1.32
PKN3-201ENST00000291906 CCDC184Q52MB2 194 aa23.31■■□□□ 1.32
PKN3-201ENST00000291906 BCANQ96GW7 911 aa23.3■■□□□ 1.32
PKN3-201ENST00000291906 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa23.29■■□□□ 1.32
PKN3-201ENST00000291906 KIF3BO15066 747 aa23.28■■□□□ 1.32
PKN3-201ENST00000291906 CNTLNQ9NXG0 1405 aa23.27■■□□□ 1.32
PKN3-201ENST00000291906 WDR7Q9Y4E6 1490 aa23.26■■□□□ 1.31
PKN3-201ENST00000291906 MRS2Q9HD23 443 aa23.26■■□□□ 1.31
PKN3-201ENST00000291906 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP23.25■■□□□ 1.31
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