RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000285679.10

USP25-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 25, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP25, Length 3,973 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP25-201ENST00000285679 EFCAB5A4FU69 1503 aa20.34■□□□□ 0.85
USP25-201ENST00000285679 FMN1Q68DA7 1419 aa20.34■□□□□ 0.85
USP25-201ENST00000285679 TIAM1Q13009 1591 aa20.34■□□□□ 0.85
USP25-201ENST00000285679 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
USP25-201ENST00000285679 SLC4A3P48751 1232 aa20.33■□□□□ 0.85
USP25-201ENST00000285679 IFT140Q96RY7 1462 aa20.33■□□□□ 0.84
USP25-201ENST00000285679 FBLN2P98095 1184 aa20.32■□□□□ 0.84
USP25-201ENST00000285679 EXOC6Q8TAG9 804 aa20.32■□□□□ 0.84
USP25-201ENST00000285679 CARD11Q9BXL7 1154 aa20.32■□□□□ 0.84
USP25-201ENST00000285679 FGD6Q6ZV73 1430 aa20.3■□□□□ 0.84
USP25-201ENST00000285679 GRIN2BQ13224 1484 aa20.3■□□□□ 0.84
USP25-201ENST00000285679 KIF7Q2M1P5 1343 aa20.29■□□□□ 0.84
USP25-201ENST00000285679 UACAQ9BZF9 1416 aa20.29■□□□□ 0.84
USP25-201ENST00000285679 PLIN1O60240 522 aa20.28■□□□□ 0.84
USP25-201ENST00000285679 CCDC7Q96M83 1385 aa20.28■□□□□ 0.84
USP25-201ENST00000285679 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
USP25-201ENST00000285679 RGS3P49796 1198 aa20.28■□□□□ 0.84
USP25-201ENST00000285679 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa20.28■□□□□ 0.84
USP25-201ENST00000285679 RGL3Q3MIN7 710 aa20.27■□□□□ 0.84
USP25-201ENST00000285679 CNTLNQ9NXG0 1405 aa20.27■□□□□ 0.84
USP25-201ENST00000285679 WDR62O43379 1518 aa20.27■□□□□ 0.83
USP25-201ENST00000285679 NBPF8Q3BBV2 869 aa20.25■□□□□ 0.83
USP25-201ENST00000285679 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
USP25-201ENST00000285679 MAP3K1Q13233 1512 aa20.25■□□□□ 0.83
USP25-201ENST00000285679 RCAN3Q9UKA8 241 aa20.25■□□□□ 0.83
USP25-201ENST00000285679 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
USP25-201ENST00000285679 PDE4AP27815 886 aa20.24■□□□□ 0.83
USP25-201ENST00000285679 SKAP1Q86WV1 359 aa20.23■□□□□ 0.83
USP25-201ENST00000285679 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa20.23■□□□□ 0.83
USP25-201ENST00000285679 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
USP25-201ENST00000285679 FYCO1Q9BQS8 1478 aa20.22■□□□□ 0.83
USP25-201ENST00000285679 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
USP25-201ENST00000285679 CANXP27824 592 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
USP25-201ENST00000285679 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
USP25-201ENST00000285679 PBRM1Q86U86 1689 aa20.19■□□□□ 0.82
USP25-201ENST00000285679 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP20.19■□□□□ 0.827e-9■■■□□ 15.8
USP25-201ENST00000285679 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
USP25-201ENST00000285679 PKD2Q13563 968 aa20.17■□□□□ 0.82
USP25-201ENST00000285679 DCAF11Q8TEB1 546 aa20.16■□□□□ 0.82
USP25-201ENST00000285679 ADAMTS12P58397 1594 aa20.16■□□□□ 0.82
USP25-201ENST00000285679 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
USP25-201ENST00000285679 DDRGK1Q96HY6 314 aa20.15■□□□□ 0.82
USP25-201ENST00000285679 RRP1P56182 461 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
USP25-201ENST00000285679 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
USP25-201ENST00000285679 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa20.13■□□□□ 0.81
USP25-201ENST00000285679 BRPF3Q9ULD4 1205 aa20.13■□□□□ 0.81
USP25-201ENST00000285679 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
USP25-201ENST00000285679 NAIPQ13075 1403 aa20.12■□□□□ 0.81
USP25-201ENST00000285679 PTPRKQ15262 1439 aa20.12■□□□□ 0.81
USP25-201ENST00000285679 IQGAP2Q13576 1575 aa20.11■□□□□ 0.81
USP25-201ENST00000285679 HFM1A2PYH4 1435 aa20.11■□□□□ 0.81
USP25-201ENST00000285679 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa20.1■□□□□ 0.81
USP25-201ENST00000285679 CDCA7LQ96GN5 454 aa20.1■□□□□ 0.81
USP25-201ENST00000285679 SAMD9Q5K651 1589 aa20.09■□□□□ 0.81
USP25-201ENST00000285679 MYOM3Q5VTT5 1437 aa20.09■□□□□ 0.81
USP25-201ENST00000285679 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP20.09■□□□□ 0.81
USP25-201ENST00000285679 NCOA2Q15596 1464 aa20.08■□□□□ 0.81
USP25-201ENST00000285679 CFAP43Q8NDM7 1665 aa20.08■□□□□ 0.8
USP25-201ENST00000285679 USP47Q96K76 1375 aa20.07■□□□□ 0.8
USP25-201ENST00000285679 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
USP25-201ENST00000285679 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa20.06■□□□□ 0.8
USP25-201ENST00000285679 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
USP25-201ENST00000285679 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
USP25-201ENST00000285679 CRBNQ96SW2 442 aa20.05■□□□□ 0.8
USP25-201ENST00000285679 GRIN2AQ12879 1464 aa20.03■□□□□ 0.8
USP25-201ENST00000285679 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa20.03■□□□□ 0.8
USP25-201ENST00000285679 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP20.03■□□□□ 0.8
USP25-201ENST00000285679 TSPY4P0CV99 314 aa20.02■□□□□ 0.8
USP25-201ENST00000285679 TSPY10P0CW01 314 aa20.02■□□□□ 0.8
USP25-201ENST00000285679 GSE1Q14687 1217 aa20.02■□□□□ 0.79
USP25-201ENST00000285679 NEUROD2Q15784 382 aa20.02■□□□□ 0.79
USP25-201ENST00000285679 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP20.02■□□□□ 0.79
USP25-201ENST00000285679 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP20.01■□□□□ 0.79
USP25-201ENST00000285679 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP19.99■□□□□ 0.79
USP25-201ENST00000285679 NFKBIBQ15653 356 aa19.98■□□□□ 0.79
USP25-201ENST00000285679 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP19.98■□□□□ 0.79
USP25-201ENST00000285679 SYNJ2O15056 1496 aa19.98■□□□□ 0.79
USP25-201ENST00000285679 BACH2Q9BYV9 841 aa19.96■□□□□ 0.79
USP25-201ENST00000285679 USP35Q9P2H5 1018 aa19.96■□□□□ 0.79
USP25-201ENST00000285679 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP19.96■□□□□ 0.79
USP25-201ENST00000285679 UGGT2Q9NYU1 1516 aa19.95■□□□□ 0.78
USP25-201ENST00000285679 NLRP13Q86W25 1043 aa19.95■□□□□ 0.78
USP25-201ENST00000285679 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP19.95■□□□□ 0.78
USP25-201ENST00000285679 RALBP1Q15311 655 aa19.94■□□□□ 0.78
USP25-201ENST00000285679 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP19.94■□□□□ 0.78
USP25-201ENST00000285679 HECW1Q76N89 1606 aa19.93■□□□□ 0.78
USP25-201ENST00000285679 NCOA1Q15788 1441 aa19.93■□□□□ 0.78
USP25-201ENST00000285679 PTPN23Q9H3S7 1636 aa19.92■□□□□ 0.78
USP25-201ENST00000285679 NUP155O75694 1391 aa19.92■□□□□ 0.78
USP25-201ENST00000285679 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa19.92■□□□□ 0.78
USP25-201ENST00000285679 KIF15Q9NS87 1388 aa19.92■□□□□ 0.78
USP25-201ENST00000285679 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP19.91■□□□□ 0.78
USP25-201ENST00000285679 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP19.9■□□□□ 0.78
USP25-201ENST00000285679 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP19.9■□□□□ 0.78
USP25-201ENST00000285679 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa19.9■□□□□ 0.78
USP25-201ENST00000285679 JPH4Q96JJ6 628 aa19.9■□□□□ 0.78
USP25-201ENST00000285679 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP19.9■□□□□ 0.78
USP25-201ENST00000285679 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP19.89■□□□□ 0.78
USP25-201ENST00000285679 CCDC146Q8IYE0 955 aa19.89■□□□□ 0.77
USP25-201ENST00000285679 KNSTRNQ9Y448 316 aa19.89■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.2 ms