RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000258428.7

REV1-201, Transcript of REV1, DNA directed polymerase, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene REV1, Length 4,751 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REV1-201ENST00000258428 L3MBTL2Q969R5 705 aa27.16■■□□□ 1.94
REV1-201ENST00000258428 MORC1Q86VD1 984 aa27.12■■□□□ 1.93
REV1-201ENST00000258428 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP27.12■■□□□ 1.93
REV1-201ENST00000258428 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP27.12■■□□□ 1.93
REV1-201ENST00000258428 SOX12O15370 315 aa27.11■■□□□ 1.93
REV1-201ENST00000258428 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa27.1■■□□□ 1.93
REV1-201ENST00000258428 OSCARQ8IYS5 282 aa27.1■■□□□ 1.93
REV1-201ENST00000258428 CYB5RLQ6IPT4 315 aa27.08■■□□□ 1.93
REV1-201ENST00000258428 CCER2I3L3R5 266 aa27.06■■□□□ 1.92
REV1-201ENST00000258428 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP27.05■■□□□ 1.92
REV1-201ENST00000258428 ARXQ96QS3 562 aa27.05■■□□□ 1.92
REV1-201ENST00000258428 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP27.04■■□□□ 1.924e-8■■■□□ 16.7
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REV1-201ENST00000258428 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP27■■□□□ 1.91
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REV1-201ENST00000258428 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP26.98■■□□□ 1.91
REV1-201ENST00000258428 CFTRP13569 1480 aa26.96■■□□□ 1.91
REV1-201ENST00000258428 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP26.94■■□□□ 1.9
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REV1-201ENST00000258428 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP26.92■■□□□ 1.9
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REV1-201ENST00000258428 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP26.88■■□□□ 1.89
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REV1-201ENST00000258428 MS4A1P11836 297 aa26.87■■□□□ 1.89
REV1-201ENST00000258428 CCDC144AA2RUR9 1427 aa26.86■■□□□ 1.89
REV1-201ENST00000258428 EID1Q9Y6B2 187 aa26.85■■□□□ 1.89
REV1-201ENST00000258428 RGS3P49796 1198 aa26.85■■□□□ 1.89
REV1-201ENST00000258428 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP26.84■■□□□ 1.89
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REV1-201ENST00000258428 BECN1Q14457 450 aa26.82■■□□□ 1.88
REV1-201ENST00000258428 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP26.82■■□□□ 1.88
REV1-201ENST00000258428 GRIN2BQ13224 1484 aa26.82■■□□□ 1.88
REV1-201ENST00000258428 TRAK1Q9UPV9 953 aa26.81■■□□□ 1.88
REV1-201ENST00000258428 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa26.81■■□□□ 1.88
REV1-201ENST00000258428 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa26.79■■□□□ 1.88
REV1-201ENST00000258428 MYOM3Q5VTT5 1437 aa26.79■■□□□ 1.88
REV1-201ENST00000258428 TERF2IPQ9NYB0 399 aa26.79■■□□□ 1.88
REV1-201ENST00000258428 DDRGK1Q96HY6 314 aa26.78■■□□□ 1.88
REV1-201ENST00000258428 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP26.76■■□□□ 1.87
REV1-201ENST00000258428 KIF21BO75037 1637 aa26.76■■□□□ 1.87
REV1-201ENST00000258428 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa26.75■■□□□ 1.87
REV1-201ENST00000258428 FGD6Q6ZV73 1430 aa26.75■■□□□ 1.87
REV1-201ENST00000258428 SYNJ1O43426 1573 aa26.74■■□□□ 1.87
REV1-201ENST00000258428 PHLDB1Q86UU1 1377 aa26.72■■□□□ 1.87
REV1-201ENST00000258428 CASC1Q6TDU7 716 aa26.72■■□□□ 1.87
REV1-201ENST00000258428 HMGXB3Q12766 1538 aa26.71■■□□□ 1.87
REV1-201ENST00000258428 NLRP13Q86W25 1043 aa26.71■■□□□ 1.87
REV1-201ENST00000258428 VGFO15240 615 aaPredicted RBP26.7■■□□□ 1.87
REV1-201ENST00000258428 FAM69CQ0P6D2 419 aa26.69■■□□□ 1.86
REV1-201ENST00000258428 NUTM2FA1L443 756 aa26.68■■□□□ 1.86
REV1-201ENST00000258428 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP26.67■■□□□ 1.86
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REV1-201ENST00000258428 MRC2Q9UBG0 1479 aa26.67■■□□□ 1.86
REV1-201ENST00000258428 TOPBP1Q92547 1522 aa26.66■■□□□ 1.86
REV1-201ENST00000258428 KIF15Q9NS87 1388 aa26.65■■□□□ 1.86
REV1-201ENST00000258428 UACAQ9BZF9 1416 aa26.65■■□□□ 1.86
REV1-201ENST00000258428 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa26.63■■□□□ 1.85
REV1-201ENST00000258428 NPHP1O15259 732 aa26.63■■□□□ 1.85
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REV1-201ENST00000258428 ARAP1Q96P48 1450 aa26.63■■□□□ 1.85
REV1-201ENST00000258428 ERICH3Q5RHP9 1530 aa26.63■■□□□ 1.85
REV1-201ENST00000258428 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP26.62■■□□□ 1.85
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REV1-201ENST00000258428 PANK3Q9H999 370 aa26.6■■□□□ 1.85
REV1-201ENST00000258428 CUX1P39880 1505 aa26.6■■□□□ 1.85
REV1-201ENST00000258428 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP26.59■■□□□ 1.855e-7■■□□□ 13.3
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REV1-201ENST00000258428 NCOA2Q15596 1464 aa26.58■■□□□ 1.85
REV1-201ENST00000258428 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP26.58■■□□□ 1.85
REV1-201ENST00000258428 PRDM2Q13029 1718 aa26.57■■□□□ 1.84
REV1-201ENST00000258428 PRXQ9BXM0 1461 aa26.57■■□□□ 1.84
REV1-201ENST00000258428 USP47Q96K76 1375 aa26.56■■□□□ 1.84
REV1-201ENST00000258428 AFAP1Q8N556 730 aa26.55■■□□□ 1.84
REV1-201ENST00000258428 GOLGA6L22H0YM25 854 aa26.55■■□□□ 1.84
REV1-201ENST00000258428 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa26.54■■□□□ 1.84
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REV1-201ENST00000258428 FYCO1Q9BQS8 1478 aa26.54■■□□□ 1.84
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REV1-201ENST00000258428 GOLGA2Q08379 1002 aa26.52■■□□□ 1.84
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REV1-201ENST00000258428 EVC2Q86UK5 1308 aa26.5■■□□□ 1.83
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REV1-201ENST00000258428 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP26.49■■□□□ 1.83
REV1-201ENST00000258428 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP26.48■■□□□ 1.83
REV1-201ENST00000258428 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP26.48■■□□□ 1.83
REV1-201ENST00000258428 DNAJC5BQ9UF47 199 aa26.47■■□□□ 1.83
REV1-201ENST00000258428 BICRAQ9NZM4 1560 aa26.46■■□□□ 1.83
REV1-201ENST00000258428 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP26.45■■□□□ 1.83
REV1-201ENST00000258428 KCNJ4P48050 445 aa26.45■■□□□ 1.82
REV1-201ENST00000258428 PDE3BQ13370 1112 aa26.43■■□□□ 1.82
REV1-201ENST00000258428 ITPRIPQ8IWB1 547 aa26.43■■□□□ 1.82
REV1-201ENST00000258428 ERICH6BQ5W0A0 696 aa26.42■■□□□ 1.82
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