RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000171737.2

Odc1-201, Transcript of Ornithine decarboxylase, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Odc1, Length 2,208 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Exosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odc1-201ENSMUST00000171737 Mia2Q91ZV0 1396 aa36,27■■■■□ 3,4
Odc1-201ENSMUST00000171737 Abcc5Q9R1X5 1436 aa36,26■■■■□ 3,4
Odc1-201ENSMUST00000171737 Mlh3A0A1Y7VMP7 1443 aa36,23■■■■□ 3,39
Odc1-201ENSMUST00000171737 Vps8Q0P5W1 1427 aa36,23■■■■□ 3,39
Odc1-201ENSMUST00000171737 Znf608Q56A10 1511 aa36,21■■■■□ 3,39
Odc1-201ENSMUST00000171737 Chic2Q9D9G3 165 aa36,21■■■■□ 3,39
Odc1-201ENSMUST00000171737 Abca8bQ8K440 1620 aa36,2■■■■□ 3,39
Odc1-201ENSMUST00000171737 Wdr7Q920I9 1489 aa36,2■■■■□ 3,39
Odc1-201ENSMUST00000171737 Plekhh2Q8C115 1491 aa36,19■■■■□ 3,38
Odc1-201ENSMUST00000171737 UacaQ8CGB3 1411 aa36,17■■■■□ 3,38
Odc1-201ENSMUST00000171737 Atp10dQ8K2X1 1416 aa36,17■■■■□ 3,38
Odc1-201ENSMUST00000171737 Dennd4bQ3U1Y4 1499 aa36,15■■■■□ 3,38
Odc1-201ENSMUST00000171737 Rnf17Q99MV7 1640 aa36,15■■■■□ 3,38
Odc1-201ENSMUST00000171737 Tdrd9Q14BI7 1383 aa36,15■■■■□ 3,38
Odc1-201ENSMUST00000171737 Caskin1Q6P9K8 1431 aa36,15■■■■□ 3,38
Odc1-201ENSMUST00000171737 AI481877A2ALV5 1481 aa36,14■■■■□ 3,38
Odc1-201ENSMUST00000171737 Lrrc9Q8CDN9 1456 aa36,14■■■■□ 3,38
Odc1-201ENSMUST00000171737 Igf1rQ60751 1373 aa36,13■■■■□ 3,37
Odc1-201ENSMUST00000171737 Cabp1Q9JLK7 227 aa36,1■■■■□ 3,37
Odc1-201ENSMUST00000171737 Mtus2Q3UHD3 1353 aa36,07■■■■□ 3,37
Odc1-201ENSMUST00000171737 SphkapQ6NSW3 1687 aa36,07■■■■□ 3,37
Odc1-201ENSMUST00000171737 Rfx7F8VPJ6 1459 aa36,07■■■■□ 3,36
Odc1-201ENSMUST00000171737 Ifnlr1Q8CGK5 535 aa36,06■■■■□ 3,36
Odc1-201ENSMUST00000171737 Gm32742A0A1B0GT42 1604 aa36,06■■■■□ 3,36
Odc1-201ENSMUST00000171737 Arhgap5P97393 1501 aa36,05■■■■□ 3,36
Odc1-201ENSMUST00000171737 Kdm3bQ6ZPY7 1562 aa36,01■■■■□ 3,35
Odc1-201ENSMUST00000171737 Pdcd11Q6NS46 1862 aaKnown RBP36■■■■□ 3,35
Odc1-201ENSMUST00000171737 Gm156Q58A37 223 aa35,96■■■■□ 3,35
Odc1-201ENSMUST00000171737 Adgrb2Q8CGM1 1561 aa35,96■■■■□ 3,35
Odc1-201ENSMUST00000171737 Cdk11bP24788 784 aaKnown RBP35,95■■■■□ 3,35
Odc1-201ENSMUST00000171737 Il16O54824 1322 aa35,95■■■■□ 3,35
Odc1-201ENSMUST00000171737 Trappc8E9PWG2 1437 aa35,92■■■■□ 3,34
Odc1-201ENSMUST00000171737 Eid3Q3V124 375 aa35,92■■■■□ 3,34
Odc1-201ENSMUST00000171737 Adgrl3Q80TS3 1537 aa35,89■■■■□ 3,34
Odc1-201ENSMUST00000171737 Cfap74Q3UY96 1578 aa35,89■■■■□ 3,34
Odc1-201ENSMUST00000171737 Fhod3Q76LL6 1578 aa35,85■■■■□ 3,33
Odc1-201ENSMUST00000171737 Setbp1Q9Z180 1582 aa35,84■■■■□ 3,33
Odc1-201ENSMUST00000171737 Arid3cA6PWV5 409 aa35,84■■■■□ 3,33
Odc1-201ENSMUST00000171737 Ak9G3UYQ4 1894 aa35,84■■■■□ 3,33
Odc1-201ENSMUST00000171737 Abcc3B2RX12 1523 aa35,84■■■■□ 3,33
Odc1-201ENSMUST00000171737 Zfyve16Q80U44 1528 aa35,84■■■■□ 3,33
Odc1-201ENSMUST00000171737 Col17a1Q07563 1470 aa35,82■■■■□ 3,33
Odc1-201ENSMUST00000171737 Fmn2Q9JL04 1578 aa35,81■■■■□ 3,32
Odc1-201ENSMUST00000171737 Ccer2J3QPU5 274 aa35,8■■■■□ 3,32
Odc1-201ENSMUST00000171737 Kidins220E9Q9B7 1793 aa35,78■■■■□ 3,32
Odc1-201ENSMUST00000171737 NclP09405 707 aaKnown RBP35,76■■■■□ 3,31
Odc1-201ENSMUST00000171737 Ankrd36D3Z4K0 1415 aa35,75■■■■□ 3,31
Odc1-201ENSMUST00000171737 AlkP97793 1621 aa35,74■■■■□ 3,31
Odc1-201ENSMUST00000171737 Abca9Q8K449 1623 aa35,74■■■■□ 3,31
Odc1-201ENSMUST00000171737 Hecw1Q8K4P8 1604 aa35,74■■■■□ 3,31
Odc1-201ENSMUST00000171737 Cdc42bpbQ7TT50 1713 aa35,74■■■■□ 3,31
Odc1-201ENSMUST00000171737 Zfp644E9QA22 1323 aa35,73■■■■□ 3,31
Odc1-201ENSMUST00000171737 Ube2uB1AUC4 352 aa35,72■■■■□ 3,31
Odc1-201ENSMUST00000171737 Mast1Q9R1L5 1570 aa35,71■■■■□ 3,31
Odc1-201ENSMUST00000171737 TonslQ6NZL6 1363 aa35,71■■■■□ 3,31
Odc1-201ENSMUST00000171737 Pprc1Q6NZN1 1644 aa35,7■■■■□ 3,31
Odc1-201ENSMUST00000171737 Sart1Q9Z315 806 aaKnown RBP35,69■■■■□ 3,3
Odc1-201ENSMUST00000171737 Adgrl2Q8JZZ7 1487 aa35,65■■■■□ 3,3
Odc1-201ENSMUST00000171737 Neurl4Q5NCX5 1563 aa35,64■■■■□ 3,3
Odc1-201ENSMUST00000171737 Mphosph9A6H5Y1 991 aa35,56■■■■□ 3,28
Odc1-201ENSMUST00000171737 Trpm2Q91YD4 1506 aa35,55■■■■□ 3,28
Odc1-201ENSMUST00000171737 Lamc1P02468 1607 aaKnown RBP35,55■■■■□ 3,28
Odc1-201ENSMUST00000171737 Kif21bQ9QXL1 1668 aa35,54■■■■□ 3,28
Odc1-201ENSMUST00000171737 Ssh2Q5SW75 1423 aa35,52■■■■□ 3,28
Odc1-201ENSMUST00000171737 Supt6hQ62383 1726 aaKnown RBP35,51■■■■□ 3,28
Odc1-201ENSMUST00000171737 Rrp7aQ9D1C9 280 aaKnown RBP35,51■■■■□ 3,27
Odc1-201ENSMUST00000171737 Las1lA2BE28 776 aaKnown RBP35,5■■■■□ 3,27
Odc1-201ENSMUST00000171737 Clasp1Q80TV8 1535 aaKnown RBP35,48■■■■□ 3,27
Odc1-201ENSMUST00000171737 Hspa5P20029 655 aaKnown RBP35,45■■■■□ 3,27
Odc1-201ENSMUST00000171737 Depdc5P61460 1591 aa35,45■■■■□ 3,27
Odc1-201ENSMUST00000171737 Map3k5O35099 1380 aa35,42■■■■□ 3,26
Odc1-201ENSMUST00000171737 Xrn1P97789 1719 aaKnown RBP35,4■■■■□ 3,26
Odc1-201ENSMUST00000171737 Ttll5Q8CHB8 1328 aa35,39■■■■□ 3,26
Odc1-201ENSMUST00000171737 Nup155Q99P88 1391 aaKnown RBP35,39■■■■□ 3,26
Odc1-201ENSMUST00000171737 AglF8VPN4 1532 aa35,39■■■■□ 3,26
Odc1-201ENSMUST00000171737 Prdm16A2A935 1275 aa35,36■■■■□ 3,25
Odc1-201ENSMUST00000171737 Ttc37F8VPK0 1563 aa35,35■■■■□ 3,25
Odc1-201ENSMUST00000171737 Abca17E9PX95 1733 aa35,35■■■■□ 3,25
Odc1-201ENSMUST00000171737 Asxl1P59598 1514 aa35,34■■■■□ 3,25
Odc1-201ENSMUST00000171737 Lemd3Q9WU40 921 aa35,33■■■■□ 3,25
Odc1-201ENSMUST00000171737 Pkd2O35245 966 aa35,3■■■■□ 3,24
Odc1-201ENSMUST00000171737 Kdm5cP41230 1554 aa35,3■■■■□ 3,24
Odc1-201ENSMUST00000171737 Map4P27546 1125 aaKnown RBP35,28■■■■□ 3,24
Odc1-201ENSMUST00000171737 OvosQ3UU35 1456 aa35,27■■■■□ 3,24
Odc1-201ENSMUST00000171737 Nos1Q9Z0J4 1429 aa35,26■■■■□ 3,24
Odc1-201ENSMUST00000171737 Ppp1r18Q8BQ30 594 aa35,25■■■■□ 3,23
Odc1-201ENSMUST00000171737 Spag9Q58A65 1321 aaKnown RBP35,25■■■■□ 3,23
Odc1-201ENSMUST00000171737 Usp54Q8BL06 1588 aaKnown RBP35,25■■■■□ 3,23
Odc1-201ENSMUST00000171737 Zbtb7cQ8VCZ7 619 aa35,24■■■■□ 3,23
Odc1-201ENSMUST00000171737 Trak1Q6PD31 939 aa35,22■■■■□ 3,23
Odc1-201ENSMUST00000171737 Kiaa0556Q8C753 1610 aa35,22■■■■□ 3,23
Odc1-201ENSMUST00000171737 Naip5Q9R016 1403 aa35,21■■■■□ 3,23
Odc1-201ENSMUST00000171737 Aebp2Q9Z248 504 aaKnown RBP35,21■■■■□ 3,23
Odc1-201ENSMUST00000171737 ShprhQ7TPQ3 1674 aa35,2■■■■□ 3,23
Odc1-201ENSMUST00000171737 Rprd2Q6NXI6 1469 aaKnown RBP35,2■■■■□ 3,23
Odc1-201ENSMUST00000171737 Dhx9O70133 1380 aaKnown RBP35,2■■■■□ 3,23
Odc1-201ENSMUST00000171737 Ttbk1Q6PCN3 1308 aa35,19■■■■□ 3,22
Odc1-201ENSMUST00000171737 PtprgQ05909 1442 aa35,17■■■■□ 3,22
Odc1-201ENSMUST00000171737 Atp10aO54827 1508 aa35,16■■■■□ 3,22
Odc1-201ENSMUST00000171737 Pik3c2gO70167 1506 aa35,16■■■■□ 3,22
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 25,7 ms