RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000027878.13

Prrx1-201, Transcript of Paired mesoderm homeobox protein 1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Prrx1, Length 4,952 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Kcnn1Q9EQR3 537 aa14.65□□□□□ -0.06
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Wdr62Q3U3T8 1523 aa14.65□□□□□ -0.06
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Fyb1O35601 819 aa14.64□□□□□ -0.07
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Kdm2bQ6P1G2 1309 aa14.64□□□□□ -0.07
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Shq1Q7TMX5 569 aa14.62□□□□□ -0.07
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Rangap1P46061 589 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Eif5bQ05D44 1216 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Gimap5Q8BWF2 308 aa14.61□□□□□ -0.07
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Gtf2e1Q9D0D5 440 aa14.61□□□□□ -0.07
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Trak1Q6PD31 939 aa14.6□□□□□ -0.07
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Arhgap31A6X8Z5 1425 aa14.6□□□□□ -0.07
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Tdrd9Q14BI7 1383 aa14.6□□□□□ -0.07
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Cnga1P29974 684 aa14.6□□□□□ -0.07
Prrx1-201ENSMUST00000027878 BicraF8VPZ9 1578 aa14.57□□□□□ -0.08
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Nup155Q99P88 1391 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Prdm16A2A935 1275 aa14.57□□□□□ -0.08
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Znf326O88291 580 aa14.57□□□□□ -0.08
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Cep162Q6ZQ06 1403 aa14.57□□□□□ -0.08
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Ythdc2B2RR83 1445 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Card11Q8CIS0 1159 aa14.55□□□□□ -0.08
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Mia2Q91ZV0 1396 aa14.55□□□□□ -0.08
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Ifit1bl1D3Z6F0 470 aa14.55□□□□□ -0.08
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Fgd1P52734 960 aa14.54□□□□□ -0.08
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Ccdc88bQ4QRL3 1481 aa14.54□□□□□ -0.08
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Top2bQ64511 1612 aa14.53□□□□□ -0.08
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Plekhh2Q8C115 1491 aa14.53□□□□□ -0.08
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Hmgb2P30681 210 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.08
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Neo1P97798 1493 aa14.52□□□□□ -0.08
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Mapk8ip3Q9ESN9 1337 aa14.52□□□□□ -0.08
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Cabp4Q8VHC5 271 aa14.52□□□□□ -0.09
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Gapvd1Q6PAR5 1458 aa14.5□□□□□ -0.09
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Crocc2F6XLV1 1638 aa14.5□□□□□ -0.09
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Birc3O08863 600 aa14.5□□□□□ -0.09
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Rtf1A2AQ19 715 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Ppargc1bQ8VHJ7 1014 aa14.48□□□□□ -0.09
Prrx1-201ENSMUST00000027878 ZgpatQ8VDM1 511 aa14.47□□□□□ -0.09
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Fan1Q69ZT1 1020 aa14.46□□□□□ -0.1
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Arhgap5P97393 1501 aa14.45□□□□□ -0.1
Prrx1-201ENSMUST00000027878 CenpjQ569L8 1344 aa14.45□□□□□ -0.1
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Pkd2O35245 966 aa14.44□□□□□ -0.1
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Map3k5O35099 1380 aa14.44□□□□□ -0.1
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Emilin2Q8K482 1074 aa14.44□□□□□ -0.1
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Zeb2Q9R0G7 1215 aa14.43□□□□□ -0.1
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Stard8Q8K031 1019 aa14.43□□□□□ -0.1
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Gm7298A0A0N4SVU1 1476 aa14.42□□□□□ -0.1
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Gm21190A0A0G2JGJ6 266 aa14.42□□□□□ -0.1
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Fam135aQ6NS59 1506 aa14.42□□□□□ -0.1
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Polr1aO35134 1717 aaKnown RBP14.42□□□□□ -0.1
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Zpr1Q62384 459 aa14.42□□□□□ -0.1
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Ccdc141E9Q8Q6 1531 aa14.41□□□□□ -0.1
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Adgrl3Q80TS3 1537 aa14.41□□□□□ -0.1
Prrx1-201ENSMUST00000027878 1700019A02RikA0A087WPV9 146 aa14.41□□□□□ -0.1
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Q9D9H8 365 aa14.41□□□□□ -0.1
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Nsd2Q8BVE8 1365 aa14.4□□□□□ -0.1
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Nol10Q5RJG1 687 aaKnown RBP14.4□□□□□ -0.1
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Fam163aQ8CAA5 168 aa14.4□□□□□ -0.1
Prrx1-201ENSMUST00000027878 ErbinQ80TH2 1402 aa14.4□□□□□ -0.1
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Rtl5Q5DTT4 599 aa14.39□□□□□ -0.11
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Ythdc1E9Q5K9 736 aaKnown RBP14.39□□□□□ -0.11
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Cwc22Q8C5N3 908 aaKnown RBP14.38□□□□□ -0.11
Prrx1-201ENSMUST00000027878 ArsiQ32KI9 573 aa14.38□□□□□ -0.11
Prrx1-201ENSMUST00000027878 A2mQ6GQT1 1474 aa14.38□□□□□ -0.11
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Plin1Q8CGN5 517 aa14.37□□□□□ -0.11
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Top2aQ01320 1528 aaKnown RBP14.37□□□□□ -0.11
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Grin2bQ01097 1482 aa14.37□□□□□ -0.11
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Lamc3Q9R0B6 1581 aa14.36□□□□□ -0.11
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Pde4cQ3UEI1 686 aa14.36□□□□□ -0.11
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Mink1Q9JM52 1308 aa14.35□□□□□ -0.11
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Fhad1A6PWD2 1420 aa14.35□□□□□ -0.11
Prrx1-201ENSMUST00000027878 TatQ8QZR1 454 aa14.35□□□□□ -0.11
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Srcin1Q9QWI6 1250 aa14.34□□□□□ -0.11
Prrx1-201ENSMUST00000027878 OvosQ3UU35 1456 aa14.33□□□□□ -0.12
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Chmp7Q8R1T1 451 aa14.33□□□□□ -0.12
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Trim26Q99PN3 545 aa14.33□□□□□ -0.12
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Aebp2Q9Z248 504 aaKnown RBP14.32□□□□□ -0.12
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Gm6268A2A3U9 297 aa14.32□□□□□ -0.12
Prrx1-201ENSMUST00000027878 EprsQ8CGC7 1512 aaKnown RBP14.32□□□□□ -0.12
Prrx1-201ENSMUST00000027878 NrkQ9R0G8 1455 aa14.32□□□□□ -0.12
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Gm21698A0A087WQP8 267 aa14.31□□□□□ -0.12
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Gm21671G3UY31 267 aa14.31□□□□□ -0.12
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Mapk8ip2Q9ERE9 830 aa14.31□□□□□ -0.12
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Atp10dQ8K2X1 1416 aa14.31□□□□□ -0.12
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Rad21Q61550 635 aaKnown RBP14.31□□□□□ -0.12
Prrx1-201ENSMUST00000027878 AqrQ8CFQ3 1481 aaKnown RBP14.29□□□□□ -0.12
Prrx1-201ENSMUST00000027878 TchhA0A0B4J1F9 1599 aa14.29□□□□□ -0.12
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Grin2aP35436 1464 aa14.29□□□□□ -0.12
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Mphosph9A6H5Y1 991 aa14.28□□□□□ -0.12
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Gimap6Q8K349 305 aa14.28□□□□□ -0.12
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Zranb1Q7M760 708 aa14.27□□□□□ -0.12
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Rapgef2Q8CHG7 1496 aa14.27□□□□□ -0.12
Prrx1-201ENSMUST00000027878 NudcO35685 332 aaKnown RBP14.27□□□□□ -0.13
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Zranb3Q6NZP1 1069 aa14.27□□□□□ -0.13
Prrx1-201ENSMUST00000027878 UacaQ8CGB3 1411 aa14.27□□□□□ -0.13
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Plekhd1B2RPU2 505 aa14.26□□□□□ -0.13
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Zcwpw1Q6IR42 630 aa14.26□□□□□ -0.13
Prrx1-201ENSMUST00000027878 HnrnpmQ9D0E1 729 aaKnown RBP14.26□□□□□ -0.13
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Q3TQI7 289 aaKnown RBP14.25□□□□□ -0.13
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Vsig10D3YX43 558 aa14.24□□□□□ -0.13
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Atp2b2Q9R0K7 1198 aa14.24□□□□□ -0.13
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Fmnl2A2APV2 1086 aa14.24□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 38 ms