RNA–Protein interactions for RNA: YOR316C

COT1, Transcript of Vacuolar transporter that mediates zinc transport into the vacuole, yeast

Gene COT1, Length 1,320 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
COT1	YOR316C	OLA1	P38219	394 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
COT1	YOR316C	MMS21	P38632	267 aa		4.95	□□□□□ -1.62
COT1	YOR316C	LRP1	P38801	184 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
COT1	YOR316C	FLC2	P39719	783 aa		4.95	□□□□□ -1.62
COT1	YOR316C	RRT5	P43607	289 aa		4.95	□□□□□ -1.62
COT1	YOR316C	ROK1	P45818	564 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
COT1	YOR316C	DLD2	P46681	530 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
COT1	YOR316C	MAL13	P53338	473 aa		4.95	□□□□□ -1.62
COT1	YOR316C	BET4	Q00618	327 aa		4.95	□□□□□ -1.62
COT1	YOR316C	PEX25	Q02969	394 aa		4.95	□□□□□ -1.62
COT1	YOR316C	ENT5	Q03769	411 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
COT1	YOR316C	RIO1	Q12196	484 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
COT1	YOR316C	YOR097C	Q12274	175 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
COT1	YOR316C	YDR262W	Q12331	272 aa		4.95	□□□□□ -1.62
COT1	YOR316C	YOR338W	Q99326	363 aa		4.95	□□□□□ -1.62
COT1	YOR316C	CDC9	P04819	755 aa		4.94	□□□□□ -1.62
COT1	YOR316C	TUB1	P09733	447 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
COT1	YOR316C	TOP3	P13099	656 aa		4.94	□□□□□ -1.62
COT1	YOR316C	ENA1	P13587	1091 aa		4.94	□□□□□ -1.62
COT1	YOR316C	PMA2	P19657	947 aa		4.94	□□□□□ -1.62
COT1	YOR316C	PRP19	P32523	503 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
COT1	YOR316C	GCG1	P32656	232 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
COT1	YOR316C	HBS1	P32769	611 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
COT1	YOR316C	ARA1	P38115	344 aa		4.94	□□□□□ -1.62
COT1	YOR316C	POP4	P38336	279 aa		4.94	□□□□□ -1.62
COT1	YOR316C	SRP72	P38688	640 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
COT1	YOR316C	MSR1	P38714	643 aa		4.94	□□□□□ -1.62
COT1	YOR316C	OTU2	P38747	307 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
COT1	YOR316C	CKB2	P38930	258 aa		4.94	□□□□□ -1.62
COT1	YOR316C	ZRG8	P40021	1076 aa		4.94	□□□□□ -1.62
COT1	YOR316C	MKT1	P40850	830 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
COT1	YOR316C	NIT2	P47016	307 aa		4.94	□□□□□ -1.62
COT1	YOR316C	YJR096W	P47137	282 aa		4.94	□□□□□ -1.62
COT1	YOR316C	NNF2	P53253	936 aa		4.94	□□□□□ -1.62
COT1	YOR316C	YGR127W	P53275	312 aa		4.94	□□□□□ -1.62
COT1	YOR316C	ENA2	Q01896	1091 aa		4.94	□□□□□ -1.62
COT1	YOR316C	INA17	Q02888	182 aa		4.94	□□□□□ -1.62
COT1	YOR316C	RLI1	Q03195	608 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
COT1	YOR316C	YMR160W	Q03823	816 aa		4.94	□□□□□ -1.62
COT1	YOR316C	VTI1	Q04338	217 aa		4.94	□□□□□ -1.62
COT1	YOR316C	TDA9	Q04545	1251 aa		4.94	□□□□□ -1.62
COT1	YOR316C	YLR352W	Q06479	807 aa		4.94	□□□□□ -1.62
COT1	YOR316C	SWC7	Q06707	132 aa		4.94	□□□□□ -1.62
COT1	YOR316C	PLB3	Q08108	686 aa		4.94	□□□□□ -1.62
COT1	YOR316C	NRT1	Q08485	598 aa		4.94	□□□□□ -1.62
COT1	YOR316C	YDR056C	Q12025	205 aa		4.94	□□□□□ -1.62
COT1	YOR316C	YLL056C	Q12177	298 aa		4.94	□□□□□ -1.62
COT1	YOR316C	HOS1	Q12214	470 aa		4.94	□□□□□ -1.62
COT1	YOR316C	ENA5	Q12691	1091 aa		4.94	□□□□□ -1.62
COT1	YOR316C	YPR089W	O13585	888 aa		4.93	□□□□□ -1.62
COT1	YOR316C	QCR6	P00127	147 aa		4.93	□□□□□ -1.62
COT1	YOR316C	CDC8	P00572	216 aa		4.93	□□□□□ -1.62
COT1	YOR316C	RPL7A	P05737	244 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
COT1	YOR316C	PHO81	P17442	1178 aa		4.93	□□□□□ -1.62
COT1	YOR316C	YCR006C	P25350	157 aa		4.93	□□□□□ -1.62
COT1	YOR316C	FUN30	P31380	1131 aa		4.93	□□□□□ -1.62
COT1	YOR316C	SIN4	P32259	974 aa		4.93	□□□□□ -1.62
COT1	YOR316C	HOG1	P32485	435 aa		4.93	□□□□□ -1.62
COT1	YOR316C	CDC13	P32797	924 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
COT1	YOR316C	PEX5	P35056	612 aa		4.93	□□□□□ -1.62
COT1	YOR316C	APE4	P38821	490 aa		4.93	□□□□□ -1.62
COT1	YOR316C	GPP2	P40106	250 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
COT1	YOR316C	PAN6	P40459	309 aa		4.93	□□□□□ -1.62
COT1	YOR316C	HIS6	P40545	261 aa		4.93	□□□□□ -1.62
COT1	YOR316C	UBP6	P43593	499 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
COT1	YOR316C	YNL143C	P53908	130 aa		4.93	□□□□□ -1.62
COT1	YOR316C	UTP6	Q02354	440 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
COT1	YOR316C	RSF1	Q05043	376 aa		4.93	□□□□□ -1.62
COT1	YOR316C	YLR030W	Q07967	263 aa		4.93	□□□□□ -1.62
COT1	YOR316C	PGC1	Q08959	321 aa		4.93	□□□□□ -1.62
COT1	YOR316C	RPL7B	Q12213	244 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
COT1	YOR316C	AVL9	Q12500	764 aa		4.93	□□□□□ -1.62
COT1	YOR316C	AFI1	Q99222	893 aa		4.93	□□□□□ -1.62
COT1	YOR316C	AI5_ALPHA	Q9ZZX1	630 aa		4.93	□□□□□ -1.62
COT1	YOR316C	HOM3	P10869	527 aa		4.92	□□□□□ -1.62
COT1	YOR316C	GLN4	P13188	809 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
COT1	YOR316C	SPO16	P17122	198 aa		4.92	□□□□□ -1.62
COT1	YOR316C	ADH7	P25377	361 aa		4.92	□□□□□ -1.62
COT1	YOR316C	PAP1	P29468	568 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
COT1	YOR316C	HEM12	P32347	362 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
COT1	YOR316C	SRP101	P32916	621 aa		4.92	□□□□□ -1.62
COT1	YOR316C	DOM34	P33309	386 aa		4.92	□□□□□ -1.62
COT1	YOR316C	RPC37	P36121	282 aa		4.92	□□□□□ -1.62
COT1	YOR316C	YRO2	P38079	344 aa		4.92	□□□□□ -1.62
COT1	YOR316C	CTP1	P38152	299 aa		4.92	□□□□□ -1.62
COT1	YOR316C	MSG5	P38590	489 aa		4.92	□□□□□ -1.62
COT1	YOR316C	SAW1	P39735	261 aa		4.92	□□□□□ -1.62
COT1	YOR316C	YAT2	P40017	923 aa		4.92	□□□□□ -1.62
COT1	YOR316C	IST3	P40565	148 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
COT1	YOR316C	CEP3	P40969	608 aa		4.92	□□□□□ -1.62
COT1	YOR316C	YFR018C	P43599	363 aa		4.92	□□□□□ -1.62
COT1	YOR316C	BNA1	P47096	177 aa		4.92	□□□□□ -1.62
COT1	YOR316C	YGL108C	P53139	140 aa		4.92	□□□□□ -1.62
COT1	YOR316C	GTR1	Q00582	310 aa		4.92	□□□□□ -1.62
COT1	YOR316C	CDC14	Q00684	551 aa		4.92	□□□□□ -1.62
COT1	YOR316C	URH1	Q04179	340 aa		4.92	□□□□□ -1.62
COT1	YOR316C	YDR338C	Q05497	695 aa		4.92	□□□□□ -1.62
COT1	YOR316C	YDR278C	Q05612	105 aa		4.92	□□□□□ -1.62
COT1	YOR316C	YPR196W	Q06595	470 aa		4.92	□□□□□ -1.62
COT1	YOR316C	RXT3	Q07458	294 aa		4.92	□□□□□ -1.62

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