RNA–Protein interactions for RNA: YOR115C

TRS33, Transcript of Core component of transport protein particle (TRAPP) complexes I-III, yeast

Gene TRS33, Length 807 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TRS33	YOR115C	SWC7	Q06707	132 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TRS33	YOR115C	GPM2	Q12008	311 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TRS33	YOR115C	SUT2	Q12286	268 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TRS33	YOR115C	ADF1	Q2V2Q1	113 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TRS33	YOR115C	ATP2	P00830	511 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
TRS33	YOR115C	SPE1	P08432	466 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TRS33	YOR115C	MSS18	P08593	268 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TRS33	YOR115C	ART10	P18634	518 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
TRS33	YOR115C	ATP12	P22135	325 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TRS33	YOR115C	SEC15	P22224	910 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TRS33	YOR115C	STE14	P32584	239 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TRS33	YOR115C	URA8	P38627	578 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
TRS33	YOR115C	YHL041W	P38730	149 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TRS33	YOR115C	YHR182W	P38870	785 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TRS33	YOR115C	EDC3	P39998	551 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
TRS33	YOR115C	SCS2	P40075	244 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
TRS33	YOR115C	GID8	P40208	455 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TRS33	YOR115C	SHR5	P41912	237 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TRS33	YOR115C	YJL132W	P47014	750 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TRS33	YOR115C	NMA2	P53204	395 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TRS33	YOR115C	CUS2	P53830	285 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
TRS33	YOR115C	SSY1	Q03770	852 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TRS33	YOR115C	ECM38	Q05902	660 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
TRS33	YOR115C	ICL2	Q12031	575 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TRS33	YOR115C	PKH2	Q12236	1081 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
TRS33	YOR115C	NOP56	Q12460	504 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.85	□□□□□ -1.63	not detected
TRS33	YOR115C	RRP36	Q12481	300 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
TRS33	YOR115C	HIS1	P00498	297 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
TRS33	YOR115C	NSP1	P14907	823 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
TRS33	YOR115C	URA4	P20051	364 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TRS33	YOR115C	BUD2	P33314	1104 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TRS33	YOR115C	TSA1	P34760	196 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
TRS33	YOR115C	SLM4	P38247	162 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TRS33	YOR115C	YHR131C	P38835	850 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TRS33	YOR115C	FHL1	P39521	936 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TRS33	YOR115C	NPT1	P39683	429 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
TRS33	YOR115C	SEO1	P39709	593 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TRS33	YOR115C	ALD5	P40047	520 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
TRS33	YOR115C	SDP1	P40479	209 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TRS33	YOR115C	URM1	P40554	99 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
TRS33	YOR115C	ROK1	P45818	564 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
TRS33	YOR115C	SNG1	P46950	547 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TRS33	YOR115C	ASI2	P53895	289 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TRS33	YOR115C	YNL010W	P53981	241 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
TRS33	YOR115C	REG1	Q00816	1014 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TRS33	YOR115C	CEG1	Q01159	459 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
TRS33	YOR115C	RLI1	Q03195	608 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
TRS33	YOR115C	TRS31	Q03337	283 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TRS33	YOR115C	ENT5	Q03769	411 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
TRS33	YOR115C	RSM24	Q03976	319 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TRS33	YOR115C	HPT1	Q04178	221 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
TRS33	YOR115C	SEC10	Q06245	871 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TRS33	YOR115C	YEH2	Q07950	538 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TRS33	YOR115C	ESA1	Q08649	445 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TRS33	YOR115C	APC5	Q08683	685 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TRS33	YOR115C	UBX3	Q12229	455 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TRS33	YOR115C	HRT3	Q12347	344 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TRS33	YOR115C	MDM20	Q12387	796 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
TRS33	YOR115C	YPL247C	Q12523	523 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TRS33	YOR115C	UBR2	Q07963	1872 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TRS33	YOR115C	MIS1	P09440	975 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
TRS33	YOR115C	HOP1	P20050	605 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TRS33	YOR115C	TFC1	P32367	649 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TRS33	YOR115C	AEP1	P32493	518 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TRS33	YOR115C	PTH2	P34222	208 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TRS33	YOR115C	MRP21	P38175	177 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TRS33	YOR115C	YBL029W	P38201	376 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TRS33	YOR115C	PDS1	P40316	373 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
TRS33	YOR115C	YJR061W	P40355	935 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TRS33	YOR115C	ESL1	P40456	1118 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TRS33	YOR115C	YIL108W	P40483	696 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
TRS33	YOR115C	CCT7	P42943	550 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
TRS33	YOR115C	QRI7	P43122	407 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TRS33	YOR115C	YFL052W	P43551	465 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TRS33	YOR115C	YJR154W	P47181	346 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TRS33	YOR115C	TRM112	P53738	135 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
TRS33	YOR115C	YNL058C	P53947	316 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TRS33	YOR115C	MTD1	Q02046	320 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
TRS33	YOR115C	SKI8	Q02793	397 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
TRS33	YOR115C	FMP30	Q02883	468 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TRS33	YOR115C	INP2	Q03824	705 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TRS33	YOR115C	SPC2	Q04969	178 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TRS33	YOR115C	CRR1	Q05790	422 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TRS33	YOR115C	YDL073W	Q07454	984 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TRS33	YOR115C	MCH5	Q08777	521 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TRS33	YOR115C	TAF3	Q12297	353 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TRS33	YOR115C	DBP10	Q12389	995 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
TRS33	YOR115C	RMD5	Q12508	421 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TRS33	YOR115C	HSH49	Q99181	213 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
TRS33	YOR115C	AFI1	Q99222	893 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TRS33	YOR115C	HAP2	P06774	265 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TRS33	YOR115C	SUI3	P09064	285 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
TRS33	YOR115C	ABF1	P14164	731 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TRS33	YOR115C	CDC26	P14724	124 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TRS33	YOR115C	ACO1	P19414	778 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.82	□□□□□ -1.64	not detected
TRS33	YOR115C	YSP3	P25036	478 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TRS33	YOR115C	DSS4	P32601	143 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TRS33	YOR115C	PTM1	P32857	523 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TRS33	YOR115C	KTR4	P38131	464 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TRS33	YOR115C	ZRG8	P40021	1076 aa		4.82	□□□□□ -1.64

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