RNA–Protein interactions for RNA: YNL207W

RIO2, Essential serine kinase involved in the processing of 20S pre-rRNA, yeast

Gene RIO2, Length 1,278 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RIO2	YNL207W	PRO3	P32263	286 aa	Known RBP	2.7	□□□□□ -1.98
RIO2	YNL207W	TCD2	P36101	447 aa	Known RBP	2.7	□□□□□ -1.98
RIO2	YNL207W	YBR225W	P38321	900 aa		2.7	□□□□□ -1.98
RIO2	YNL207W	MSR1	P38714	643 aa		2.7	□□□□□ -1.98
RIO2	YNL207W	OTU2	P38747	307 aa	Known RBP	2.7	□□□□□ -1.98
RIO2	YNL207W	ROK1	P45818	564 aa	Predicted RBP	2.7	□□□□□ -1.98
RIO2	YNL207W	YDL186W	P48568	277 aa		2.7	□□□□□ -1.98
RIO2	YNL207W	APT1	P49435	187 aa	Known RBP	2.7	□□□□□ -1.98
RIO2	YNL207W	YPL014W	Q02606	381 aa		2.7	□□□□□ -1.98
RIO2	YNL207W	YDR239C	Q03780	787 aa		2.7	□□□□□ -1.98
RIO2	YNL207W	THI20	Q08224	551 aa		2.7	□□□□□ -1.98
RIO2	YNL207W	RIM20	Q12033	661 aa		2.7	□□□□□ -1.98
RIO2	YNL207W	PPT2	Q12036	173 aa		2.7	□□□□□ -1.98
RIO2	YNL207W	PDH1	Q12428	516 aa	Known RBP	2.7	□□□□□ -1.98
RIO2	YNL207W	CPR3	P25719	182 aa		2.69	□□□□□ -1.98
RIO2	YNL207W	SHP1	P34223	423 aa		2.69	□□□□□ -1.98
RIO2	YNL207W	MTR2	P34232	184 aa	Known RBP	2.69	□□□□□ -1.98
RIO2	YNL207W	CBP4	P37267	147 aa		2.69	□□□□□ -1.98
RIO2	YNL207W	YBR139W	P38109	508 aa		2.69	□□□□□ -1.98
RIO2	YNL207W	CST26	P38226	397 aa		2.69	□□□□□ -1.98
RIO2	YNL207W	MDM31	P38880	579 aa		2.69	□□□□□ -1.98
RIO2	YNL207W	IKS1	P47042	667 aa		2.69	□□□□□ -1.98
RIO2	YNL207W	SRB7	P47822	140 aa		2.69	□□□□□ -1.98
RIO2	YNL207W	IMD4	P50094	524 aa	Known RBP	2.69	□□□□□ -1.98
RIO2	YNL207W	COS10	P52924	374 aa		2.69	□□□□□ -1.98
RIO2	YNL207W	SAM50	P53969	484 aa		2.69	□□□□□ -1.98
RIO2	YNL207W	RHO4	Q00246	291 aa		2.69	□□□□□ -1.98
RIO2	YNL207W	MFB1	Q04922	465 aa		2.69	□□□□□ -1.98
RIO2	YNL207W	IMH1	Q06704	911 aa	Known RBP	2.69	□□□□□ -1.98
RIO2	YNL207W	THP1	Q08231	455 aa		2.69	□□□□□ -1.98
RIO2	YNL207W	YPL272C	Q08984	517 aa		2.69	□□□□□ -1.98
RIO2	YNL207W	HSH49	Q99181	213 aa	Predicted RBP	2.69	□□□□□ -1.98
RIO2	YNL207W	YML133C	Q03099	1374 aa		2.69	□□□□□ -1.98
RIO2	YNL207W	YLL067C	Q07888	1374 aa		2.69	□□□□□ -1.98
RIO2	YNL207W	YLL066C	Q99208	1374 aa		2.69	□□□□□ -1.98
RIO2	YNL207W	CYB2	P00175	591 aa		2.68	□□□□□ -1.98
RIO2	YNL207W	MRP13	P12686	339 aa		2.68	□□□□□ -1.98
RIO2	YNL207W	BUD14	P27637	709 aa		2.68	□□□□□ -1.98
RIO2	YNL207W	AGA1	P32323	725 aa		2.68	□□□□□ -1.98
RIO2	YNL207W	ECM15	P35195	104 aa		2.68	□□□□□ -1.98
RIO2	YNL207W	AVT5	P38176	459 aa		2.68	□□□□□ -1.98
RIO2	YNL207W	VID24	P38263	362 aa		2.68	□□□□□ -1.98
RIO2	YNL207W	YBP1	P38315	674 aa		2.68	□□□□□ -1.98
RIO2	YNL207W	YHR210C	P38893	341 aa		2.68	□□□□□ -1.98
RIO2	YNL207W	NDE1	P40215	560 aa		2.68	□□□□□ -1.98
RIO2	YNL207W	CSM2	P40465	213 aa		2.68	□□□□□ -1.98
RIO2	YNL207W	RPR2	P40571	144 aa		2.68	□□□□□ -1.98
RIO2	YNL207W	YJR154W	P47181	346 aa		2.68	□□□□□ -1.98
RIO2	YNL207W	TWF1	P53250	332 aa		2.68	□□□□□ -1.98
RIO2	YNL207W	BOR1	P53838	576 aa		2.68	□□□□□ -1.98
RIO2	YNL207W	MDM1	Q01846	1127 aa		2.68	□□□□□ -1.98
RIO2	YNL207W	MSC1	Q03104	513 aa		2.68	□□□□□ -1.98
RIO2	YNL207W	SPC19	Q03954	165 aa		2.68	□□□□□ -1.98
RIO2	YNL207W	RSA1	Q08932	381 aa		2.68	□□□□□ -1.98
RIO2	YNL207W	RLM1	Q12224	676 aa		2.68	□□□□□ -1.98
RIO2	YNL207W	RAV1	P47104	1357 aa		2.67	□□□□□ -1.98
RIO2	YNL207W	MET8	P15807	274 aa		2.67	□□□□□ -1.98
RIO2	YNL207W	SIP2	P34164	415 aa	Known RBP	2.67	□□□□□ -1.98
RIO2	YNL207W	CMC1	P36064	111 aa		2.67	□□□□□ -1.98
RIO2	YNL207W	SRO77	P38163	1010 aa		2.67	□□□□□ -1.98
RIO2	YNL207W	BNA4	P38169	460 aa		2.67	□□□□□ -1.98
RIO2	YNL207W	DED81	P38707	554 aa	Known RBP	2.67	□□□□□ -1.98
RIO2	YNL207W	CCT6	P39079	546 aa		2.67	□□□□□ -1.98
RIO2	YNL207W	NOC2	P39744	710 aa	Known RBP	2.67	□□□□□ -1.98
RIO2	YNL207W	SPO22	P40511	975 aa		2.67	□□□□□ -1.98
RIO2	YNL207W	ELP2	P42935	788 aa		2.67	□□□□□ -1.98
RIO2	YNL207W	RTT101	P47050	842 aa		2.67	□□□□□ -1.98
RIO2	YNL207W	MRPL19	P53875	158 aa		2.67	□□□□□ -1.98
RIO2	YNL207W	ERP1	Q05359	219 aa	Known RBP	2.67	□□□□□ -1.98
RIO2	YNL207W	ATG29	Q12092	213 aa		2.67	□□□□□ -1.98
RIO2	YNL207W	LSP1	Q12230	341 aa	Known RBP	2.67	□□□□□ -1.98
RIO2	YNL207W	SFI1	Q12369	946 aa		2.67	□□□□□ -1.98
RIO2	YNL207W	SEC39	Q12745	709 aa		2.67	□□□□□ -1.98
RIO2	YNL207W	ARG3	P05150	338 aa		2.66	□□□□□ -1.98
RIO2	YNL207W	GDH1	P07262	454 aa	Known RBP	2.66	□□□□□ -1.98
RIO2	YNL207W	APE1	P14904	514 aa		2.66	□□□□□ -1.98
RIO2	YNL207W	MTF1	P14908	341 aa	Known RBP	2.66	□□□□□ -1.98
RIO2	YNL207W	AMD1	P15274	810 aa	Known RBP	2.66	□□□□□ -1.98
RIO2	YNL207W	MCK1	P21965	375 aa	Known RBP	2.66	□□□□□ -1.98
RIO2	YNL207W	NDC1	P32500	655 aa		2.66	□□□□□ -1.98
RIO2	YNL207W	MRE11	P32829	692 aa		2.66	□□□□□ -1.98
RIO2	YNL207W	REC114	P32841	428 aa		2.66	□□□□□ -1.98
RIO2	YNL207W	PTR2	P32901	601 aa		2.66	□□□□□ -1.98
RIO2	YNL207W	WBP1	P33767	430 aa	Known RBP	2.66	□□□□□ -1.98
RIO2	YNL207W	TIF3	P34167	436 aa	Known RBP	2.66	□□□□□ -1.98
RIO2	YNL207W	RSM22	P36056	628 aa		2.66	□□□□□ -1.98
RIO2	YNL207W	RPH1	P39956	796 aa		2.66	□□□□□ -1.98
RIO2	YNL207W	MET28	P40573	187 aa		2.66	□□□□□ -1.98
RIO2	YNL207W	PET130	P47065	347 aa		2.66	□□□□□ -1.98
RIO2	YNL207W	URB2	P47108	1174 aa		2.66	□□□□□ -1.98
RIO2	YNL207W	DRN1	P53255	507 aa	Known RBP	2.66	□□□□□ -1.98
RIO2	YNL207W	CAF130	P53280	1122 aa	Predicted RBP	2.66	□□□□□ -1.98
RIO2	YNL207W	ARE2	P53629	642 aa	Known RBP	2.66	□□□□□ -1.98
RIO2	YNL207W	PDS5	Q04264	1277 aa		2.66	□□□□□ -1.98
RIO2	YNL207W	IVY1	Q04934	453 aa		2.66	□□□□□ -1.98
RIO2	YNL207W	VPS74	Q06385	345 aa		2.66	□□□□□ -1.98
RIO2	YNL207W	CKA1	P15790	372 aa		2.65	□□□□□ -1.99
RIO2	YNL207W	CLB3	P24870	427 aa		2.65	□□□□□ -1.99
RIO2	YNL207W	PRD1	P25375	712 aa		2.65	□□□□□ -1.99
RIO2	YNL207W	SPC110	P32380	944 aa		2.65	□□□□□ -1.99

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 51.5 ms