RNA–Protein interactions for RNA: YML035C

AMD1, Transcript of AMP deaminase, yeast

Gene AMD1, Length 2,433 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
AMD1	YML035C	ATP11	P32453	318 aa		5.58	□□□□□ -1.52
AMD1	YML035C	DSF2	P38213	736 aa		5.58	□□□□□ -1.52
AMD1	YML035C	LSM5	P40089	93 aa	Known RBP	5.58	□□□□□ -1.52
AMD1	YML035C	YGR015C	P53208	328 aa		5.58	□□□□□ -1.52
AMD1	YML035C	SNO2	P53823	222 aa		5.58	□□□□□ -1.52
AMD1	YML035C	NAN1	Q02931	896 aa	Known RBP	5.58	□□□□□ -1.52
AMD1	YML035C	VHS1	Q03785	461 aa		5.58	□□□□□ -1.52
AMD1	YML035C	YLL032C	Q07834	825 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.58	□□□□□ -1.52	not detected
AMD1	YML035C	TRM8	Q12009	286 aa		5.58	□□□□□ -1.52
AMD1	YML035C	CMR1	Q12510	522 aa	Known RBP	5.58	□□□□□ -1.52
AMD1	YML035C	HSH49	Q99181	213 aa	Predicted RBP	5.58	□□□□□ -1.52
AMD1	YML035C	COS2	P0CX12	379 aa		5.58	□□□□□ -1.52
AMD1	YML035C	COS3	P0CX13	379 aa		5.58	□□□□□ -1.52
AMD1	YML035C	SPT15	P13393	240 aa	Known RBP	5.58	□□□□□ -1.52
AMD1	YML035C	CLN2	P20438	545 aa		5.58	□□□□□ -1.52
AMD1	YML035C	YCK2	P23292	546 aa	Known RBP	5.58	□□□□□ -1.52
AMD1	YML035C	CIN8	P27895	1000 aa		5.58	□□□□□ -1.52
AMD1	YML035C	SLX5	P32828	619 aa	Known RBP	5.58	□□□□□ -1.52
AMD1	YML035C	RMA1	P36001	430 aa	Known RBP	5.58	□□□□□ -1.52
AMD1	YML035C	TCD2	P36101	447 aa	Known RBP	5.58	□□□□□ -1.52
AMD1	YML035C	MRPL37	P36532	105 aa		5.58	□□□□□ -1.52
AMD1	YML035C	WSC4	P38739	605 aa		5.58	□□□□□ -1.52
AMD1	YML035C	GIC1	P38785	314 aa		5.58	□□□□□ -1.52
AMD1	YML035C	PCF11	P39081	626 aa	Predicted RBP	5.58	□□□□□ -1.52
AMD1	YML035C	GIM4	P40005	111 aa	Known RBP	5.58	□□□□□ -1.52
AMD1	YML035C	MET18	P40469	1032 aa		5.58	□□□□□ -1.52
AMD1	YML035C	MPH1	P40562	993 aa		5.58	□□□□□ -1.52
AMD1	YML035C	COS4	P43542	379 aa		5.58	□□□□□ -1.52
AMD1	YML035C	YJR149W	P47177	404 aa		5.58	□□□□□ -1.52
AMD1	YML035C	MIG2	P53035	382 aa		5.58	□□□□□ -1.52
AMD1	YML035C	IMA1	P53051	589 aa		5.58	□□□□□ -1.52
AMD1	YML035C	HST3	P53687	447 aa		5.58	□□□□□ -1.52
AMD1	YML035C	PRO2	P54885	456 aa	Known RBP	5.58	□□□□□ -1.52
AMD1	YML035C	CDA1	Q06702	301 aa		5.58	□□□□□ -1.52
AMD1	YML035C	YEH2	Q07950	538 aa		5.58	□□□□□ -1.52
AMD1	YML035C	YIG1	Q08956	461 aa		5.58	□□□□□ -1.52
AMD1	YML035C	YLR049C	Q12110	428 aa		5.58	□□□□□ -1.52
AMD1	YML035C	SCL1	P21243	252 aa	Known RBP	5.57	□□□□□ -1.52
AMD1	YML035C	URE2	P23202	354 aa	Known RBP	5.57	□□□□□ -1.52
AMD1	YML035C	PHO91	P27514	894 aa		5.57	□□□□□ -1.52
AMD1	YML035C	FRE2	P36033	711 aa		5.57	□□□□□ -1.52
AMD1	YML035C	YHR127W	P38833	243 aa	Known RBP	5.57	□□□□□ -1.52
AMD1	YML035C	PFA3	P42836	336 aa		5.57	□□□□□ -1.52
AMD1	YML035C	NOP9	P47077	666 aa	Known RBP	5.57	□□□□□ -1.52
AMD1	YML035C	MDM34	P53083	459 aa		5.57	□□□□□ -1.52
AMD1	YML035C	DCP2	P53550	970 aa	Known RBP	5.57	□□□□□ -1.52
AMD1	YML035C	UAF30	Q08747	228 aa		5.57	□□□□□ -1.52
AMD1	YML035C	MSB2	P32334	1306 aa		5.57	□□□□□ -1.52
AMD1	YML035C	MDM35	O60200	86 aa		5.57	□□□□□ -1.52
AMD1	YML035C	TRP3	P00937	484 aa		5.57	□□□□□ -1.52
AMD1	YML035C	SRX1	P36077	127 aa		5.57	□□□□□ -1.52
AMD1	YML035C	CAF4	P36130	643 aa		5.57	□□□□□ -1.52
AMD1	YML035C	PFS1	P38872	237 aa		5.57	□□□□□ -1.52
AMD1	YML035C	BEM4	P39011	633 aa		5.57	□□□□□ -1.52
AMD1	YML035C	IAH1	P41734	238 aa		5.57	□□□□□ -1.52
AMD1	YML035C	YMR111C	Q04461	462 aa	Predicted RBP	5.57	□□□□□ -1.52
AMD1	YML035C	RAD34	Q06665	692 aa		5.57	□□□□□ -1.52
AMD1	YML035C	SNX3	Q08826	162 aa	Known RBP	5.57	□□□□□ -1.52
AMD1	YML035C	RDS2	P19541	446 aa	Known RBP	5.56	□□□□□ -1.52
AMD1	YML035C	CDC3	P32457	520 aa	Known RBP	5.56	□□□□□ -1.52
AMD1	YML035C	NGG1	P32494	702 aa		5.56	□□□□□ -1.52
AMD1	YML035C	ECM4	P36156	370 aa		5.56	□□□□□ -1.52
AMD1	YML035C	RRP3	P38712	501 aa	Known RBP	5.56	□□□□□ -1.52
AMD1	YML035C	YPT35	P38815	214 aa	Known RBP	5.56	□□□□□ -1.52
AMD1	YML035C	MET12	P46151	657 aa		5.56	□□□□□ -1.52
AMD1	YML035C	MTR3	P48240	250 aa	Predicted RBP	5.56	□□□□□ -1.52
AMD1	YML035C	YML053C	Q04978	212 aa		5.56	□□□□□ -1.52
AMD1	YML035C	YMR034C	Q05131	434 aa	Predicted RBP	5.56	□□□□□ -1.52
AMD1	YML035C	IOC2	Q12072	812 aa		5.56	□□□□□ -1.52
AMD1	YML035C	SAS5	Q99314	248 aa		5.56	□□□□□ -1.52
AMD1	YML035C	FAB1	P34756	2278 aa		5.56	□□□□□ -1.52
AMD1	YML035C	COX3	P00420	269 aa		5.56	□□□□□ -1.52
AMD1	YML035C	HXK2	P04807	486 aa	Known RBP	5.56	□□□□□ -1.52
AMD1	YML035C	PRT1	P06103	763 aa	Known RBP	5.56	□□□□□ -1.52
AMD1	YML035C	SUI3	P09064	285 aa	Known RBP	5.56	□□□□□ -1.52
AMD1	YML035C	OCA4	P25366	362 aa		5.56	□□□□□ -1.52
AMD1	YML035C	SDH3	P33421	198 aa		5.56	□□□□□ -1.52
AMD1	YML035C	SPC42	P36094	363 aa		5.56	□□□□□ -1.52
AMD1	YML035C	TDP1	P38319	544 aa		5.56	□□□□□ -1.52
AMD1	YML035C	AXL2	P38928	823 aa		5.56	□□□□□ -1.52
AMD1	YML035C	SIT1	P39980	628 aa		5.56	□□□□□ -1.52
AMD1	YML035C	YNL260C	P53846	198 aa		5.56	□□□□□ -1.52
AMD1	YML035C	PRP38	Q00723	242 aa	Predicted RBP	5.56	□□□□□ -1.52
AMD1	YML035C	MCH5	Q08777	521 aa		5.56	□□□□□ -1.52
AMD1	YML035C	ATG29	Q12092	213 aa		5.56	□□□□□ -1.52
AMD1	YML035C	NTO1	Q12311	748 aa		5.56	□□□□□ -1.52
AMD1	YML035C	YCL012C	Q8J0M4	134 aa		5.56	□□□□□ -1.52
AMD1	YML035C	YBR071W	P38243	211 aa		5.55	□□□□□ -1.52
AMD1	YML035C	BMT2	P38278	337 aa		5.55	□□□□□ -1.52
AMD1	YML035C	APE4	P38821	490 aa		5.55	□□□□□ -1.52
AMD1	YML035C	NDE1	P40215	560 aa		5.55	□□□□□ -1.52
AMD1	YML035C	DIM1	P41819	318 aa	Known RBP	5.55	□□□□□ -1.52
AMD1	YML035C	YFR020W	P43600	232 aa		5.55	□□□□□ -1.52
AMD1	YML035C	YJR030C	P47101	745 aa		5.55	□□□□□ -1.52
AMD1	YML035C	GCV1	P48015	400 aa		5.55	□□□□□ -1.52
AMD1	YML035C	YGR053C	P53234	283 aa		5.55	□□□□□ -1.52
AMD1	YML035C	ARC35	P53731	342 aa	Known RBP	5.55	□□□□□ -1.52
AMD1	YML035C	AAT1	Q01802	451 aa		5.55	□□□□□ -1.52
AMD1	YML035C	ECM9	Q02202	377 aa		5.55	□□□□□ -1.52
AMD1	YML035C	ROT1	Q03691	256 aa		5.55	□□□□□ -1.52

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