RNA–Protein interactions for RNA: YKR080W

MTD1, Transcript of NAD-dependent 5,10-methylenetetrahydrafolate dehydrogenase, yeast

Gene MTD1, Length 963 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MTD1	YKR080W	NUP133	P36161	1157 aa		4.24	□□□□□ -1.73
MTD1	YKR080W	UBA4	P38820	440 aa		4.24	□□□□□ -1.73
MTD1	YKR080W	PCL6	P40038	420 aa		4.24	□□□□□ -1.73
MTD1	YKR080W	MAF1	P41910	395 aa		4.24	□□□□□ -1.73
MTD1	YKR080W	RMD8	P43620	662 aa		4.24	□□□□□ -1.73
MTD1	YKR080W	RPS10B	P46784	105 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
MTD1	YKR080W	APT1	P49435	187 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
MTD1	YKR080W	BOP3	P53958	396 aa		4.24	□□□□□ -1.73
MTD1	YKR080W	DSE3	Q08729	430 aa		4.24	□□□□□ -1.73
MTD1	YKR080W	BUD7	Q08754	746 aa		4.24	□□□□□ -1.73
MTD1	YKR080W	TAH18	Q12181	623 aa		4.24	□□□□□ -1.73
MTD1	YKR080W	PMD1	P32634	1753 aa		4.24	□□□□□ -1.73
MTD1	YKR080W	SEF1	P34228	1148 aa		4.23	□□□□□ -1.73
MTD1	YKR080W	SRO77	P38163	1010 aa		4.23	□□□□□ -1.73
MTD1	YKR080W	PHO90	P39535	881 aa		4.23	□□□□□ -1.73
MTD1	YKR080W	ESBP6	P53918	673 aa		4.23	□□□□□ -1.73
MTD1	YKR080W	EKI1	Q03764	534 aa		4.23	□□□□□ -1.73
MTD1	YKR080W	TDA9	Q04545	1251 aa		4.23	□□□□□ -1.73
MTD1	YKR080W	MLH2	Q07980	695 aa		4.23	□□□□□ -1.73
MTD1	YKR080W	RDR1	Q08904	546 aa		4.23	□□□□□ -1.73
MTD1	YKR080W	MRP13	P12686	339 aa		4.22	□□□□□ -1.73
MTD1	YKR080W	ATO2	P32907	282 aa		4.22	□□□□□ -1.73
MTD1	YKR080W	TIF3	P34167	436 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
MTD1	YKR080W	RPL32	P38061	130 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
MTD1	YKR080W	YPK3	P38070	525 aa		4.22	□□□□□ -1.73
MTD1	YKR080W	ROT2	P38138	954 aa		4.22	□□□□□ -1.73
MTD1	YKR080W	ALG5	P40350	334 aa		4.22	□□□□□ -1.73
MTD1	YKR080W	SGN1	P40561	250 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.22	□□□□□ -1.73	not detected
MTD1	YKR080W	ARF3	P40994	183 aa	RIP-Chip data	4.22	□□□□□ -1.73	not detected
MTD1	YKR080W	IAH1	P41734	238 aa		4.22	□□□□□ -1.73
MTD1	YKR080W	IRC6	P43615	237 aa		4.22	□□□□□ -1.73
MTD1	YKR080W	HOS2	P53096	452 aa	Predicted RBP	4.22	□□□□□ -1.73
MTD1	YKR080W	PKP2	P53170	491 aa		4.22	□□□□□ -1.73
MTD1	YKR080W	SOL4	P53315	255 aa		4.22	□□□□□ -1.73
MTD1	YKR080W	IPI3	P53877	555 aa		4.22	□□□□□ -1.73
MTD1	YKR080W	SEC5	P89102	971 aa		4.22	□□□□□ -1.73
MTD1	YKR080W	SPT7	P35177	1332 aa		4.21	□□□□□ -1.73
MTD1	YKR080W	CDC31	P06704	161 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
MTD1	YKR080W	DFR1	P07807	211 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.21	□□□□□ -1.74	not detected
MTD1	YKR080W	ART10	P18634	518 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
MTD1	YKR080W	TMT1	P32643	299 aa		4.21	□□□□□ -1.74
MTD1	YKR080W	PDR3	P33200	976 aa		4.21	□□□□□ -1.74
MTD1	YKR080W	TCD2	P36101	447 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
MTD1	YKR080W	JNM1	P36224	373 aa		4.21	□□□□□ -1.74
MTD1	YKR080W	YIL152W	P40455	235 aa		4.21	□□□□□ -1.74
MTD1	YKR080W	SPO22	P40511	975 aa		4.21	□□□□□ -1.74
MTD1	YKR080W	RTS2	P40962	232 aa		4.21	□□□□□ -1.74
MTD1	YKR080W	IMD4	P50094	524 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
MTD1	YKR080W	PYK2	P52489	506 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
MTD1	YKR080W	YMR034C	Q05131	434 aa	Predicted RBP	4.21	□□□□□ -1.74
MTD1	YKR080W	VPS38	Q05919	439 aa		4.21	□□□□□ -1.74
MTD1	YKR080W	ICT1	Q12385	394 aa		4.21	□□□□□ -1.74
MTD1	YKR080W	AVL9	Q12500	764 aa		4.21	□□□□□ -1.74
MTD1	YKR080W	ARG3	P05150	338 aa		4.2	□□□□□ -1.74
MTD1	YKR080W	PDA1	P16387	420 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
MTD1	YKR080W	GID7	P25569	745 aa		4.2	□□□□□ -1.74
MTD1	YKR080W	MTR2	P34232	184 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
MTD1	YKR080W	CIN4	P39110	191 aa		4.2	□□□□□ -1.74
MTD1	YKR080W	DUG3	P53871	357 aa		4.2	□□□□□ -1.74
MTD1	YKR080W	MRPL19	P53875	158 aa		4.2	□□□□□ -1.74
MTD1	YKR080W	MPS1	P54199	764 aa		4.2	□□□□□ -1.74
MTD1	YKR080W	BET4	Q00618	327 aa		4.2	□□□□□ -1.74
MTD1	YKR080W	NUP100	Q02629	959 aa		4.2	□□□□□ -1.74
MTD1	YKR080W	MSC1	Q03104	513 aa		4.2	□□□□□ -1.74
MTD1	YKR080W	SNA4	Q07549	140 aa		4.2	□□□□□ -1.74
MTD1	YKR080W	CDC45	Q08032	650 aa		4.2	□□□□□ -1.74
MTD1	YKR080W	BUG1	Q12191	341 aa		4.2	□□□□□ -1.74
MTD1	YKR080W	MLP1	Q02455	1875 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
MTD1	YKR080W	FOB1	O13329	566 aa		4.19	□□□□□ -1.74
MTD1	YKR080W	GAL80	P04387	435 aa		4.19	□□□□□ -1.74
MTD1	YKR080W	YFL068W	P0CX99	160 aa		4.19	□□□□□ -1.74
MTD1	YKR080W	YLL066W-A	P0CY00	160 aa		4.19	□□□□□ -1.74
MTD1	YKR080W	YLL067W-A	P0CY01	160 aa		4.19	□□□□□ -1.74
MTD1	YKR080W	SUI2	P20459	304 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
MTD1	YKR080W	MGR1	P25573	417 aa		4.19	□□□□□ -1.74
MTD1	YKR080W	ARC40	P38328	384 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
MTD1	YKR080W	YEL057C	P39983	233 aa		4.19	□□□□□ -1.74
MTD1	YKR080W	MET28	P40573	187 aa		4.19	□□□□□ -1.74
MTD1	YKR080W	SRB7	P47822	140 aa		4.19	□□□□□ -1.74
MTD1	YKR080W	YGR126W	P53274	230 aa		4.19	□□□□□ -1.74
MTD1	YKR080W	SMM1	P53720	384 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
MTD1	YKR080W	YMR160W	Q03823	816 aa		4.19	□□□□□ -1.74
MTD1	YKR080W	FIN1	Q03898	291 aa		4.19	□□□□□ -1.74
MTD1	YKR080W	RSF1	Q05043	376 aa		4.19	□□□□□ -1.74
MTD1	YKR080W	RLM1	Q12224	676 aa		4.19	□□□□□ -1.74
MTD1	YKR080W	VPS13	Q07878	3144 aa		4.18	□□□□□ -1.74
MTD1	YKR080W	MCM4	P30665	933 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
MTD1	YKR080W	SNC1	P31109	117 aa		4.18	□□□□□ -1.74
MTD1	YKR080W	ERG7	P38604	731 aa		4.18	□□□□□ -1.74
MTD1	YKR080W	LAG1	P38703	411 aa		4.18	□□□□□ -1.74
MTD1	YKR080W	UTP9	P38882	575 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
MTD1	YKR080W	NOC2	P39744	710 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
MTD1	YKR080W	YVH1	Q02256	364 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
MTD1	YKR080W	YPL068C	Q02749	293 aa		4.18	□□□□□ -1.74
MTD1	YKR080W	RPC11	Q04307	110 aa	Predicted RBP	4.18	□□□□□ -1.74
MTD1	YKR080W	YMR254C	Q04838	102 aa		4.18	□□□□□ -1.74
MTD1	YKR080W	SSK1	Q07084	712 aa		4.18	□□□□□ -1.74
MTD1	YKR080W	YAP7	Q08182	245 aa		4.18	□□□□□ -1.74
MTD1	YKR080W	OSM1	P21375	501 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
MTD1	YKR080W	WBP1	P33767	430 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 58.6 ms