RNA–Protein interactions for RNA: YJL209W

CBP1, Transcript of Mitochondrial protein, regulator of COB mRNA stability and translation, yeast

Gene CBP1, Length 1,965 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CBP1	YJL209W	SAG1	P20840	650 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CBP1	YJL209W	MRP4	P32902	394 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CBP1	YJL209W	SOF1	P33750	489 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CBP1	YJL209W	TPO5	P36029	618 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CBP1	YJL209W	YFL066C	P43538	392 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CBP1	YJL209W	UBX6	P47049	396 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CBP1	YJL209W	COQ6	P53318	479 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CBP1	YJL209W	OCA2	P53949	197 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CBP1	YJL209W	SLG1	P54867	378 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CBP1	YJL209W	ADE13	Q05911	482 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CBP1	YJL209W	TDA6	Q06466	467 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CBP1	YJL209W	SLK19	Q08581	821 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CBP1	YJL209W	TRM13	Q12383	476 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CBP1	YJL209W	AAC1	P04710	309 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CBP1	YJL209W	CDC37	P06101	506 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CBP1	YJL209W	PET111	P08468	800 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CBP1	YJL209W	PRP2	P20095	876 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CBP1	YJL209W	PET18	P25362	215 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CBP1	YJL209W	GLG1	P36143	616 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CBP1	YJL209W	GIP4	P39732	760 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CBP1	YJL209W	NMD5	P46970	1048 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CBP1	YJL209W	KEL2	P50090	882 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CBP1	YJL209W	PNC1	P53184	216 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CBP1	YJL209W	KTR5	P53966	522 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CBP1	YJL209W	RXT3	Q07458	294 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CBP1	YJL209W	IRC13	Q08630	104 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CBP1	YJL209W	LEU4	P06208	619 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CBP1	YJL209W	SPS4	P09937	338 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CBP1	YJL209W	UNG1	P12887	359 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CBP1	YJL209W	STE4	P18851	423 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CBP1	YJL209W	MCM4	P30665	933 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CBP1	YJL209W	YKT6	P36015	200 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CBP1	YJL209W	ARA1	P38115	344 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CBP1	YJL209W	PEX32	P38292	413 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CBP1	YJL209W	YGL242C	P53066	181 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CBP1	YJL209W	YIP5	P53108	310 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CBP1	YJL209W	DIP5	P53388	608 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CBP1	YJL209W	YDR132C	Q03900	495 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CBP1	YJL209W	SEG1	Q04279	960 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CBP1	YJL209W	YML053C	Q04978	212 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CBP1	YJL209W	YLR297W	Q05899	129 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CBP1	YJL209W	YLR224W	Q05947	369 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CBP1	YJL209W	YDL086W	Q07505	273 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CBP1	YJL209W	CYK3	Q07533	885 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CBP1	YJL209W	ACK1	Q07622	623 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CBP1	YJL209W	TEN1	Q07921	160 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CBP1	YJL209W	COX3	P00420	269 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CBP1	YJL209W	SPS22	P25380	463 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CBP1	YJL209W	BOS1	P25385	244 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CBP1	YJL209W	GDA1	P32621	518 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CBP1	YJL209W	YBL028C	P38202	106 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CBP1	YJL209W	TSC10	P38342	320 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CBP1	YJL209W	PCA1	P38360	1216 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CBP1	YJL209W	BZZ1	P38822	633 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CBP1	YJL209W	ULP2	P40537	1034 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CBP1	YJL209W	ATG27	P46989	271 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CBP1	YJL209W	YGL108C	P53139	140 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CBP1	YJL209W	GCN5	Q03330	439 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CBP1	YJL209W	ATG38	Q05789	226 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CBP1	YJL209W	DIS3	Q08162	1001 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CBP1	YJL209W	RKI1	Q12189	258 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CBP1	YJL209W	ADF1	Q2V2Q1	113 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CBP1	YJL209W	TRP4	P07285	380 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CBP1	YJL209W	RAD14	P28519	371 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CBP1	YJL209W	TRM2	P33753	639 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CBP1	YJL209W	LHS1	P36016	881 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CBP1	YJL209W	KEL1	P38853	1164 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CBP1	YJL209W	YHR210C	P38893	341 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CBP1	YJL209W	YMR147W	P40218	223 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CBP1	YJL209W	AIM20	P40451	204 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CBP1	YJL209W	INA22	P40576	216 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CBP1	YJL209W	BUL1	P48524	976 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CBP1	YJL209W	SNO2	P53823	222 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CBP1	YJL209W	DLT1	Q04216	342 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CBP1	YJL209W	UFO1	Q04511	668 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CBP1	YJL209W	ENB1	Q08299	606 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CBP1	YJL209W	ETT1	Q08421	412 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CBP1	YJL209W	RKM1	Q08961	583 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CBP1	YJL209W	PUT2	P07275	575 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CBP1	YJL209W	RIP1	P08067	215 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CBP1	YJL209W	GAR1	P28007	205 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CBP1	YJL209W	RRP1	P35178	278 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CBP1	YJL209W	YKL070W	P36087	169 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CBP1	YJL209W	ADE17	P38009	592 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CBP1	YJL209W	VBA2	P38358	474 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CBP1	YJL209W	YJL163C	P46996	555 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CBP1	YJL209W	LIA1	P47120	325 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CBP1	YJL209W	YGR151C	P53287	111 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CBP1	YJL209W	YNL050C	P53952	270 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CBP1	YJL209W	MDM30	Q05930	598 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CBP1	YJL209W	CRT10	Q08226	957 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CBP1	YJL209W	RPS10A	Q08745	105 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CBP1	YJL209W	MRH1	Q12117	320 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CBP1	YJL209W	USV1	Q12132	391 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CBP1	YJL209W	NTO1	Q12311	748 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CBP1	YJL209W	LDB17	Q12342	491 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CBP1	YJL209W	RRD2	Q12461	358 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CBP1	YJL209W	GPH1	P06738	902 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CBP1	YJL209W	COQ2	P32378	372 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CBP1	YJL209W	RIM1	P32445	135 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63

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