RNA–Protein interactions for RNA: YJL011C

RPC17, Transcript of RNA polymerase III subunit C17, yeast

Gene RPC17, Length 486 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RPC17	YJL011C	RPA49	Q01080	415 aa	Predicted RBP	4.31	□□□□□ -1.72
RPC17	YJL011C	SMA1	Q02651	245 aa		4.31	□□□□□ -1.72
RPC17	YJL011C	SHR3	Q02774	210 aa		4.31	□□□□□ -1.72
RPC17	YJL011C	DIG1	Q03063	452 aa	Known RBP	4.31	□□□□□ -1.72
RPC17	YJL011C	YMR254C	Q04838	102 aa		4.31	□□□□□ -1.72
RPC17	YJL011C	RBS1	Q05672	457 aa	Known RBP	4.31	□□□□□ -1.72
RPC17	YJL011C	THP1	Q08231	455 aa		4.31	□□□□□ -1.72
RPC17	YJL011C	PEP5	P12868	1029 aa		4.3	□□□□□ -1.72
RPC17	YJL011C	YCR043C	P25361	127 aa		4.3	□□□□□ -1.72
RPC17	YJL011C	SHP1	P34223	423 aa		4.3	□□□□□ -1.72
RPC17	YJL011C	GUF1	P46943	645 aa		4.3	□□□□□ -1.72
RPC17	YJL011C	YJR154W	P47181	346 aa		4.3	□□□□□ -1.72
RPC17	YJL011C	HEF3	P53978	1044 aa	Known RBP	4.3	□□□□□ -1.72
RPC17	YJL011C	MSS11	Q03825	758 aa		4.3	□□□□□ -1.72
RPC17	YJL011C	TAP42	Q04372	366 aa		4.3	□□□□□ -1.72
RPC17	YJL011C	RPL31B	P0C2H9	113 aa	Known RBP	4.29	□□□□□ -1.72
RPC17	YJL011C	BAR1	P12630	587 aa		4.29	□□□□□ -1.72
RPC17	YJL011C	TYR1	P20049	452 aa		4.29	□□□□□ -1.72
RPC17	YJL011C	PAP1	P29468	568 aa	Known RBP	4.29	□□□□□ -1.72
RPC17	YJL011C	HXT3	P32466	567 aa	Known RBP	4.29	□□□□□ -1.72
RPC17	YJL011C	MSN2	P33748	704 aa		4.29	□□□□□ -1.72
RPC17	YJL011C	MBB1	P39534	108 aa		4.29	□□□□□ -1.72
RPC17	YJL011C	AZF1	P41696	914 aa		4.29	□□□□□ -1.72
RPC17	YJL011C	SLG1	P54867	378 aa		4.29	□□□□□ -1.72
RPC17	YJL011C	YDR131C	Q03899	556 aa		4.29	□□□□□ -1.72
RPC17	YJL011C	SNA4	Q07549	140 aa		4.29	□□□□□ -1.72
RPC17	YJL011C	FMP45	Q07651	309 aa		4.29	□□□□□ -1.72
RPC17	YJL011C	YRF1-4	O13559	1382 aa		4.28	□□□□□ -1.72
RPC17	YJL011C	RAV1	P47104	1357 aa		4.28	□□□□□ -1.72
RPC17	YJL011C	RPL3	P14126	387 aa	Known RBP	4.28	□□□□□ -1.72
RPC17	YJL011C	CLB3	P24870	427 aa		4.28	□□□□□ -1.72
RPC17	YJL011C	BNA4	P38169	460 aa		4.28	□□□□□ -1.72
RPC17	YJL011C	TCM62	P38228	572 aa	Known RBP	4.28	□□□□□ -1.72
RPC17	YJL011C	OTU2	P38747	307 aa	Known RBP	4.28	□□□□□ -1.72
RPC17	YJL011C	VMA13	P41807	478 aa	Known RBP	4.28	□□□□□ -1.72
RPC17	YJL011C	ATG27	P46989	271 aa		4.28	□□□□□ -1.72
RPC17	YJL011C	KTR5	P53966	522 aa	Predicted RBP	4.28	□□□□□ -1.72
RPC17	YJL011C	ARX1	Q03862	593 aa	Known RBP	4.28	□□□□□ -1.72
RPC17	YJL011C	YMR087W	Q04299	284 aa		4.28	□□□□□ -1.72
RPC17	YJL011C	ISN1	Q99312	450 aa		4.28	□□□□□ -1.72
RPC17	YJL011C	SUC2	P00724	532 aa		4.27	□□□□□ -1.73
RPC17	YJL011C	PDX1	P16451	410 aa		4.27	□□□□□ -1.73
RPC17	YJL011C	PPZ1	P26570	692 aa		4.27	□□□□□ -1.73
RPC17	YJL011C	ACH1	P32316	526 aa		4.27	□□□□□ -1.73
RPC17	YJL011C	YMR147W	P40218	223 aa	Known RBP	4.27	□□□□□ -1.73
RPC17	YJL011C	YIL169C	P40442	995 aa		4.27	□□□□□ -1.73
RPC17	YJL011C	TES1	P41903	349 aa	Known RBP	4.27	□□□□□ -1.73
RPC17	YJL011C	ALT2	P52892	507 aa		4.27	□□□□□ -1.73
RPC17	YJL011C	YGL108C	P53139	140 aa		4.27	□□□□□ -1.73
RPC17	YJL011C	YPL068C	Q02749	293 aa		4.27	□□□□□ -1.73
RPC17	YJL011C	RBA50	Q04418	439 aa		4.27	□□□□□ -1.73
RPC17	YJL011C	THI20	Q08224	551 aa		4.27	□□□□□ -1.73
RPC17	YJL011C	ARP6	Q12509	438 aa		4.27	□□□□□ -1.73
RPC17	YJL011C	HNM1	P19807	563 aa		4.26	□□□□□ -1.73
RPC17	YJL011C	SPB1	P25582	841 aa	Predicted RBP	4.26	□□□□□ -1.73
RPC17	YJL011C	ATP11	P32453	318 aa		4.26	□□□□□ -1.73
RPC17	YJL011C	ERG1	P32476	496 aa	Known RBP	4.26	□□□□□ -1.73
RPC17	YJL011C	TMT1	P32643	299 aa		4.26	□□□□□ -1.73
RPC17	YJL011C	ECM15	P35195	104 aa		4.26	□□□□□ -1.73
RPC17	YJL011C	DUG2	P38149	878 aa		4.26	□□□□□ -1.73
RPC17	YJL011C	MET30	P39014	640 aa		4.26	□□□□□ -1.73
RPC17	YJL011C	YND1	P40009	630 aa		4.26	□□□□□ -1.73
RPC17	YJL011C	DLD2	P46681	530 aa	Known RBP	4.26	□□□□□ -1.73
RPC17	YJL011C	ZPR1	P53303	486 aa	Known RBP	4.26	□□□□□ -1.73
RPC17	YJL011C	TDA7	P53882	636 aa	Predicted RBP	4.26	□□□□□ -1.73
RPC17	YJL011C	SAM50	P53969	484 aa		4.26	□□□□□ -1.73
RPC17	YJL011C	YDR415C	Q04033	374 aa	Predicted RBP	4.26	□□□□□ -1.73
RPC17	YJL011C	YLR352W	Q06479	807 aa		4.26	□□□□□ -1.73
RPC17	YJL011C	PDH1	Q12428	516 aa	Known RBP	4.26	□□□□□ -1.73
RPC17	YJL011C	ERP4	Q12450	207 aa		4.26	□□□□□ -1.73
RPC17	YJL011C	RRD2	Q12461	358 aa		4.26	□□□□□ -1.73
RPC17	YJL011C	CSR2	Q12734	1121 aa		4.26	□□□□□ -1.73
RPC17	YJL011C	GLN3	P18494	730 aa		4.25	□□□□□ -1.73
RPC17	YJL011C	PPH22	P23595	377 aa		4.25	□□□□□ -1.73
RPC17	YJL011C	YIM1	P28625	365 aa		4.25	□□□□□ -1.73
RPC17	YJL011C	RAD24	P32641	659 aa		4.25	□□□□□ -1.73
RPC17	YJL011C	STB6	P36085	766 aa		4.25	□□□□□ -1.73
RPC17	YJL011C	MIC60	P36112	540 aa		4.25	□□□□□ -1.73
RPC17	YJL011C	YIR014W	P40570	242 aa		4.25	□□□□□ -1.73
RPC17	YJL011C	SCD6	P45978	349 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.25	□□□□□ -1.73	not detected
RPC17	YJL011C	BNI5	P53890	448 aa	Known RBP	4.25	□□□□□ -1.73
RPC17	YJL011C	MPS1	P54199	764 aa		4.25	□□□□□ -1.73
RPC17	YJL011C	MES1	P00958	751 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
RPC17	YJL011C	APE1	P14904	514 aa		4.24	□□□□□ -1.73
RPC17	YJL011C	YCR007C	P25354	239 aa		4.24	□□□□□ -1.73
RPC17	YJL011C	SNT1	P25357	1226 aa		4.24	□□□□□ -1.73
RPC17	YJL011C	ADK2	P26364	225 aa		4.24	□□□□□ -1.73
RPC17	YJL011C	TUL1	P36096	758 aa		4.24	□□□□□ -1.73
RPC17	YJL011C	OCA1	P50946	238 aa	Predicted RBP	4.24	□□□□□ -1.73
RPC17	YJL011C	MNP1	P53163	194 aa	Predicted RBP	4.24	□□□□□ -1.73
RPC17	YJL011C	SLD5	Q03406	294 aa		4.24	□□□□□ -1.73
RPC17	YJL011C	GLO2	Q05584	274 aa		4.24	□□□□□ -1.73
RPC17	YJL011C	YLR345W	Q06137	509 aa		4.24	□□□□□ -1.73
RPC17	YJL011C	VTA1	Q06263	330 aa		4.24	□□□□□ -1.73
RPC17	YJL011C	PHO92	Q06390	306 aa		4.24	□□□□□ -1.73
RPC17	YJL011C	SRL1	Q08673	210 aa		4.24	□□□□□ -1.73
RPC17	YJL011C	CFT2	Q12102	859 aa	Predicted RBP	4.24	□□□□□ -1.73
RPC17	YJL011C	RAD14	P28519	371 aa		4.23	□□□□□ -1.73
RPC17	YJL011C	RML2	P32611	393 aa		4.23	□□□□□ -1.73
RPC17	YJL011C	FRE1	P32791	686 aa		4.23	□□□□□ -1.73

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