RNA–Protein interactions for RNA: YGR129W

SYF2, Transcript of Member of the NineTeen Complex (NTC), yeast

Gene SYF2, Length 648 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SYF2	YGR129W	LAT1	P12695	482 aa	Known RBP	5.6	□□□□□ -1.51
SYF2	YGR129W	PMS1	P14242	873 aa		5.6	□□□□□ -1.51
SYF2	YGR129W	SPO12	P17123	173 aa		5.6	□□□□□ -1.51
SYF2	YGR129W	MKK1	P32490	508 aa		5.6	□□□□□ -1.51
SYF2	YGR129W	MKK2	P32491	506 aa		5.6	□□□□□ -1.51
SYF2	YGR129W	SRP101	P32916	621 aa		5.6	□□□□□ -1.51
SYF2	YGR129W	YBL055C	P34220	418 aa	Predicted RBP	5.6	□□□□□ -1.51
SYF2	YGR129W	EHT1	P38295	451 aa		5.6	□□□□□ -1.51
SYF2	YGR129W	RRT2	P38332	387 aa		5.6	□□□□□ -1.51
SYF2	YGR129W	YHR045W	P38775	560 aa		5.6	□□□□□ -1.51
SYF2	YGR129W	YAR028W	P39548	234 aa		5.6	□□□□□ -1.51
SYF2	YGR129W	GID8	P40208	455 aa		5.6	□□□□□ -1.51
SYF2	YGR129W	JHD2	P47156	728 aa	Predicted RBP	5.6	□□□□□ -1.51
SYF2	YGR129W	NUP53	Q03790	475 aa		5.6	□□□□□ -1.51
SYF2	YGR129W	RSC3	Q06639	885 aa		5.6	□□□□□ -1.51
SYF2	YGR129W	YDR018C	Q12185	396 aa		5.6	□□□□□ -1.51
SYF2	YGR129W	AMD1	P15274	810 aa	Known RBP	5.59	□□□□□ -1.51
SYF2	YGR129W	TYR1	P20049	452 aa		5.59	□□□□□ -1.51
SYF2	YGR129W	NDI1	P32340	513 aa		5.59	□□□□□ -1.51
SYF2	YGR129W	ATP11	P32453	318 aa		5.59	□□□□□ -1.51
SYF2	YGR129W	MGM101	P32787	269 aa	Known RBP	5.59	□□□□□ -1.51
SYF2	YGR129W	DSS1	P39112	969 aa		5.59	□□□□□ -1.51
SYF2	YGR129W	TAH11	P47112	604 aa		5.59	□□□□□ -1.51
SYF2	YGR129W	PAN2	P53010	1115 aa	Predicted RBP	5.59	□□□□□ -1.51
SYF2	YGR129W	ERG26	P53199	349 aa	Known RBP	5.59	□□□□□ -1.51
SYF2	YGR129W	TRS31	Q03337	283 aa		5.59	□□□□□ -1.51
SYF2	YGR129W	LSP1	Q12230	341 aa	Known RBP	5.59	□□□□□ -1.51
SYF2	YGR129W	TPO4	Q12256	659 aa		5.59	□□□□□ -1.51
SYF2	YGR129W	UGP1	P32861	499 aa	Known RBP	5.58	□□□□□ -1.52
SYF2	YGR129W	SKT5	P34226	696 aa		5.58	□□□□□ -1.52
SYF2	YGR129W	MAK5	P38112	773 aa	Predicted RBP	5.58	□□□□□ -1.52
SYF2	YGR129W	YSW1	P38280	609 aa		5.58	□□□□□ -1.52
SYF2	YGR129W	MMS21	P38632	267 aa		5.58	□□□□□ -1.52
SYF2	YGR129W	YHR020W	P38708	688 aa	Known RBP	5.58	□□□□□ -1.52
SYF2	YGR129W	RTT107	P38850	1070 aa		5.58	□□□□□ -1.52
SYF2	YGR129W	MNL1	P38888	796 aa		5.58	□□□□□ -1.52
SYF2	YGR129W	SEO1	P39709	593 aa		5.58	□□□□□ -1.52
SYF2	YGR129W	BRO1	P48582	844 aa		5.58	□□□□□ -1.52
SYF2	YGR129W	OCA1	P50946	238 aa	Predicted RBP	5.58	□□□□□ -1.52
SYF2	YGR129W	YML6	P51998	286 aa		5.58	□□□□□ -1.52
SYF2	YGR129W	COS12	P53053	380 aa		5.58	□□□□□ -1.52
SYF2	YGR129W	LCL3	P53153	274 aa		5.58	□□□□□ -1.52
SYF2	YGR129W	RPN9	Q04062	393 aa	Known RBP	5.58	□□□□□ -1.52
SYF2	YGR129W	OPY2	Q06810	360 aa		5.58	□□□□□ -1.52
SYF2	YGR129W	ATE1	P16639	503 aa		5.57	□□□□□ -1.52
SYF2	YGR129W	FAA1	P30624	700 aa	Known RBP	5.57	□□□□□ -1.52
SYF2	YGR129W	SRB5	P32585	307 aa		5.57	□□□□□ -1.52
SYF2	YGR129W	ATO2	P32907	282 aa		5.57	□□□□□ -1.52
SYF2	YGR129W	CNS1	P33313	385 aa		5.57	□□□□□ -1.52
SYF2	YGR129W	YPT52	P36018	234 aa	Known RBP	5.57	□□□□□ -1.52
SYF2	YGR129W	SOL2	P37262	315 aa		5.57	□□□□□ -1.52
SYF2	YGR129W	SET5	P38890	526 aa	Known RBP	5.57	□□□□□ -1.52
SYF2	YGR129W	CKB2	P38930	258 aa		5.57	□□□□□ -1.52
SYF2	YGR129W	AAT1	Q01802	451 aa		5.57	□□□□□ -1.52
SYF2	YGR129W	SLU7	Q02775	382 aa	Known RBP	5.57	□□□□□ -1.52
SYF2	YGR129W	NOG1	Q02892	647 aa	Known RBP	5.57	□□□□□ -1.52
SYF2	YGR129W	YLR049C	Q12110	428 aa		5.57	□□□□□ -1.52
SYF2	YGR129W	YOR114W	Q12219	294 aa		5.57	□□□□□ -1.52
SYF2	YGR129W	RMD5	Q12508	421 aa		5.57	□□□□□ -1.52
SYF2	YGR129W	PHO5	P00635	467 aa		5.56	□□□□□ -1.52
SYF2	YGR129W	ERG11	P10614	530 aa		5.56	□□□□□ -1.52
SYF2	YGR129W	BAS1	P22035	811 aa		5.56	□□□□□ -1.52
SYF2	YGR129W	GID7	P25569	745 aa		5.56	□□□□□ -1.52
SYF2	YGR129W	TIP20	P33891	701 aa		5.56	□□□□□ -1.52
SYF2	YGR129W	MRP21	P38175	177 aa		5.56	□□□□□ -1.52
SYF2	YGR129W	ATG14	P38270	344 aa		5.56	□□□□□ -1.52
SYF2	YGR129W	YHL012W	P38709	493 aa		5.56	□□□□□ -1.52
SYF2	YGR129W	HSE1	P38753	452 aa		5.56	□□□□□ -1.52
SYF2	YGR129W	SAP1	P39955	897 aa	Known RBP	5.56	□□□□□ -1.52
SYF2	YGR129W	UTP18	P40362	594 aa	Predicted RBP	5.56	□□□□□ -1.52
SYF2	YGR129W	CUP9	P41817	306 aa		5.56	□□□□□ -1.52
SYF2	YGR129W	PXA1	P41909	870 aa		5.56	□□□□□ -1.52
SYF2	YGR129W	BNA3	P47039	444 aa	Known RBP	5.56	□□□□□ -1.52
SYF2	YGR129W	YGR012W	P53206	393 aa		5.56	□□□□□ -1.52
SYF2	YGR129W	PET117	Q02771	107 aa		5.56	□□□□□ -1.52
SYF2	YGR129W	UTP5	Q04177	643 aa	Known RBP	5.56	□□□□□ -1.52
SYF2	YGR129W	FAP7	Q12055	197 aa	Predicted RBP	5.56	□□□□□ -1.52
SYF2	YGR129W	HOS1	Q12214	470 aa		5.56	□□□□□ -1.52
SYF2	YGR129W	ERR1	P0CX10	437 aa		5.55	□□□□□ -1.52
SYF2	YGR129W	ERR2	P0CX11	437 aa		5.55	□□□□□ -1.52
SYF2	YGR129W	CDC24	P11433	854 aa	Predicted RBP	5.55	□□□□□ -1.52
SYF2	YGR129W	KAR1	P11927	433 aa		5.55	□□□□□ -1.52
SYF2	YGR129W	INO1	P11986	533 aa		5.55	□□□□□ -1.52
SYF2	YGR129W	KIN2	P13186	1147 aa	Known RBP	5.55	□□□□□ -1.52
SYF2	YGR129W	PRP16	P15938	1071 aa	Predicted RBP	5.55	□□□□□ -1.52
SYF2	YGR129W	PRP6	P19735	899 aa	Predicted RBP	5.55	□□□□□ -1.52
SYF2	YGR129W	PHO13	P19881	312 aa		5.55	□□□□□ -1.52
SYF2	YGR129W	CLN2	P20438	545 aa		5.55	□□□□□ -1.52
SYF2	YGR129W	CLB1	P24868	471 aa		5.55	□□□□□ -1.52
SYF2	YGR129W	TSR4	P25040	408 aa		5.55	□□□□□ -1.52
SYF2	YGR129W	AGP1	P25376	633 aa		5.55	□□□□□ -1.52
SYF2	YGR129W	YCR099C	P25657	155 aa		5.55	□□□□□ -1.52
SYF2	YGR129W	SBA1	P28707	216 aa	Known RBP	5.55	□□□□□ -1.52
SYF2	YGR129W	THI80	P35202	319 aa		5.55	□□□□□ -1.52
SYF2	YGR129W	MCM7	P38132	845 aa		5.55	□□□□□ -1.52
SYF2	YGR129W	AIM3	P38266	947 aa	Known RBP	5.55	□□□□□ -1.52
SYF2	YGR129W	YHR127W	P38833	243 aa	Known RBP	5.55	□□□□□ -1.52
SYF2	YGR129W	YIL152W	P40455	235 aa		5.55	□□□□□ -1.52
SYF2	YGR129W	TFG2	P41896	400 aa	Predicted RBP	5.55	□□□□□ -1.52
SYF2	YGR129W	ERR3	P42222	437 aa		5.55	□□□□□ -1.52

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