RNA–Protein interactions for RNA: YDR416W

SYF1, Transcript of Member of the NineTeen Complex (NTC), yeast

Gene SYF1, Length 2,580 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SYF1	YDR416W	FRE5	Q08908	694 aa		4.13	□□□□□ -1.75
SYF1	YDR416W	YBR255C-A	Q3E776	120 aa		4.13	□□□□□ -1.75
SYF1	YDR416W	HRP1	Q99383	534 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
SYF1	YDR416W	ILV2	P07342	687 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
SYF1	YDR416W	TUB3	P09734	445 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
SYF1	YDR416W	CLN1	P20437	546 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SYF1	YDR416W	HSP104	P31539	908 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
SYF1	YDR416W	CBF5	P33322	483 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.12	□□□□□ -1.75	not detected
SYF1	YDR416W	TCD1	P38756	429 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SYF1	YDR416W	GET2	P40056	285 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SYF1	YDR416W	NET1	P47035	1189 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SYF1	YDR416W	REX2	P54964	269 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
SYF1	YDR416W	ECM7	Q06200	448 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SYF1	YDR416W	WHI4	Q07655	649 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
SYF1	YDR416W	MED2	Q12124	431 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SYF1	YDR416W	TAF3	Q12297	353 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SYF1	YDR416W	NTO1	Q12311	748 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SYF1	YDR416W	TY1A-NL1	Q12391	440 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
SYF1	YDR416W	DFG16	Q99234	619 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SYF1	YDR416W	SAM1	P10659	382 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
SYF1	YDR416W	SCH9	P11792	824 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
SYF1	YDR416W	URA4	P20051	364 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SYF1	YDR416W	YCR015C	P25616	317 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SYF1	YDR416W	MGM101	P32787	269 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
SYF1	YDR416W	UGP1	P32861	499 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
SYF1	YDR416W	KKQ8	P36004	724 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SYF1	YDR416W	YBR139W	P38109	508 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SYF1	YDR416W	PET100	P38958	111 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SYF1	YDR416W	MSS4	P38994	779 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SYF1	YDR416W	EMC2	P47133	292 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
SYF1	YDR416W	GTO1	P48239	356 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SYF1	YDR416W	EFM5	P53200	248 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
SYF1	YDR416W	PNG1	Q02890	363 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SYF1	YDR416W	SPO19	Q03029	223 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SYF1	YDR416W	USA1	Q03714	838 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SYF1	YDR416W	YMR130W	Q04223	302 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SYF1	YDR416W	PDS5	Q04264	1277 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SYF1	YDR416W	TY1A-BL	Q12266	440 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SYF1	YDR416W	AHC1	Q12433	566 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SYF1	YDR416W	YDL007C-A	Q2V2Q0	85 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SYF1	YDR416W	SSA3	P09435	649 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
SYF1	YDR416W	PEX1	P24004	1043 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SYF1	YDR416W	ZTA1	P38230	334 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
SYF1	YDR416W	URM1	P40554	99 aa	Predicted RBP	4.11	□□□□□ -1.75
SYF1	YDR416W	FKH2	P41813	862 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SYF1	YDR416W	MPS2	P53159	387 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SYF1	YDR416W	IPI3	P53877	555 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SYF1	YDR416W	URC2	Q04411	772 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SYF1	YDR416W	SMA2	Q04658	369 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SYF1	YDR416W	YLR346C	Q06139	101 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SYF1	YDR416W	NDL1	Q06568	189 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SYF1	YDR416W	YFT2	Q06676	274 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SYF1	YDR416W	ARG80	P07249	177 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SYF1	YDR416W	UGA1	P17649	471 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SYF1	YDR416W	GLY1	P37303	387 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
SYF1	YDR416W	SIP3	P38717	1229 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SYF1	YDR416W	MNL1	P38888	796 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SYF1	YDR416W	CIN1	P40987	1014 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SYF1	YDR416W	MSS2	P40990	351 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SYF1	YDR416W	MMM1	P41800	426 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SYF1	YDR416W	SWP82	P43554	623 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SYF1	YDR416W	NMD5	P46970	1048 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SYF1	YDR416W	RPS7B	P48164	190 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
SYF1	YDR416W	MSE1	P48525	536 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SYF1	YDR416W	RFX1	P48743	811 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SYF1	YDR416W	MND1	P53102	219 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SYF1	YDR416W	EFM6	P53970	246 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SYF1	YDR416W	YAT1	P80235	687 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SYF1	YDR416W	RSM24	Q03976	319 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SYF1	YDR416W	UFO1	Q04511	668 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SYF1	YDR416W	ERV41	Q04651	352 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SYF1	YDR416W	SSQ1	Q05931	657 aa	Predicted RBP	4.11	□□□□□ -1.75
SYF1	YDR416W	STE23	Q06010	1027 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SYF1	YDR416W	DIB1	Q06819	143 aa	Predicted RBP	4.11	□□□□□ -1.75
SYF1	YDR416W	SIL1	Q08199	421 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SYF1	YDR416W	MED4	Q12343	284 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SYF1	YDR416W	SWM1	Q12379	170 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SYF1	YDR416W	MRP13	P12686	339 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SYF1	YDR416W	RSR1	P13856	272 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SYF1	YDR416W	KSS1	P14681	368 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SYF1	YDR416W	PDE1	P22434	369 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SYF1	YDR416W	ADH7	P25377	361 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SYF1	YDR416W	RFA2	P26754	273 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
SYF1	YDR416W	MEI5	P32489	222 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SYF1	YDR416W	AIM26	P32858	118 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SYF1	YDR416W	YBR144C	P34215	104 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SYF1	YDR416W	YKR015C	P36111	568 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SYF1	YDR416W	ECM4	P36156	370 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SYF1	YDR416W	SCC4	P40090	624 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SYF1	YDR416W	BUR6	P40096	142 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SYF1	YDR416W	AIM20	P40451	204 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SYF1	YDR416W	VHS2	P40463	436 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SYF1	YDR416W	MND2	P40577	368 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SYF1	YDR416W	BRO1	P48582	844 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SYF1	YDR416W	TEX1	P53851	422 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
SYF1	YDR416W	PGA2	P53903	129 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SYF1	YDR416W	MRPS17	Q03246	237 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
SYF1	YDR416W	TY1A-MR1	Q04215	440 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SYF1	YDR416W	CRN1	Q06440	651 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SYF1	YDR416W	HXK2	P04807	486 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75

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