RNA–Protein interactions for RNA: Q0050

AI1, Reverse transcriptase required for splicing of the COX1 pre-mRNA, yeast

Gene AI1, Length 2,505 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
AI1	Q0050	ARP6	Q12509	438 aa		0.47	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	PAR32	Q12515	295 aa	Known RBP	0.47	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	HBN1	Q96VH4	193 aa		0.47	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	MET2	P08465	486 aa		0.47	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	CDC16	P09798	840 aa		0.47	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	DAP2	P18962	818 aa		0.47	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	YAP1	P19880	650 aa	Known RBP	0.47	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	RPO26	P20435	155 aa		0.47	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	DAL7	P21826	554 aa		0.47	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	MRC1	P25588	1096 aa		0.47	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	NGG1	P32494	702 aa		0.47	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	EMC3	P36039	253 aa		0.47	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	MRPL36	P36531	177 aa		0.47	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	APL3	P38065	1025 aa		0.47	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	MTC4	P38335	694 aa	Known RBP	0.47	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	YMR262W	P38430	313 aa		0.47	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	STN1	P38960	494 aa		0.47	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	STT3	P39007	718 aa	Known RBP	0.47	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	YMR124W	P39523	943 aa	Known RBP	0.47	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	RCY1	P39531	840 aa		0.47	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	PRM9	P39551	298 aa		0.47	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	KAP123	P40069	1113 aa	Known RBP	0.47	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	YIL086C	P40503	102 aa		0.47	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	SSU1	P41930	458 aa		0.47	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	SAD1	P43589	448 aa		0.47	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	SAE2	P46946	345 aa		0.47	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	RTT101	P47050	842 aa		0.47	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	RFX1	P48743	811 aa		0.47	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	SBH2	P52871	88 aa		0.47	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	YGL108C	P53139	140 aa		0.47	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	CAF130	P53280	1122 aa	Predicted RBP	0.47	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	PRM1	P53835	661 aa		0.47	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	DUG3	P53871	357 aa		0.47	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	IPI3	P53877	555 aa		0.47	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	MFM1	Q02783	413 aa		0.47	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	YMR317W	Q04893	1140 aa		0.47	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	SVF1	Q05515	481 aa		0.47	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	COG4	Q06096	861 aa		0.47	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	SPN1	Q06505	410 aa	Predicted RBP	0.47	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	YEH1	Q07804	573 aa		0.47	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	IZH3	Q07959	543 aa		0.47	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	DIS3	Q08162	1001 aa	Known RBP	0.47	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	MSA1	Q08471	629 aa		0.47	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	IES4	Q08561	116 aa		0.47	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	YOR387C	Q08910	206 aa		0.47	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	NOP14	Q99207	810 aa	Known RBP	0.47	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	YOR338W	Q99326	363 aa		0.47	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	NAT1	P12945	854 aa	Known RBP	0.46	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	CDC23	P16522	626 aa		0.46	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	CLB2	P24869	491 aa		0.46	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	RRT12	P25381	491 aa		0.46	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	NAM9	P27929	486 aa		0.46	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	AFG1	P32317	509 aa		0.46	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	ASF1	P32447	279 aa		0.46	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	YME1	P32795	747 aa		0.46	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	LOT5	P34234	306 aa		0.46	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	HCS1	P34243	683 aa		0.46	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	MNN4	P36044	1178 aa		0.46	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	YBR071W	P38243	211 aa		0.46	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	YHR033W	P38690	423 aa		0.46	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	YHL037C	P38733	133 aa		0.46	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	RRP8	P38961	392 aa	Known RBP	0.46	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	BEM4	P39011	633 aa		0.46	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	BUD6	P41697	788 aa		0.46	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	TES1	P41903	349 aa	Known RBP	0.46	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	PMT6	P42934	759 aa		0.46	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	YFR035C	P43608	114 aa		0.46	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	MPS3	P47069	682 aa		0.46	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	YJR079W	P47126	109 aa		0.46	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	PRP31	P49704	494 aa	Predicted RBP	0.46	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	TRM9	P49957	279 aa		0.46	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	SEH1	P53011	349 aa	Known RBP	0.46	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	RTT102	P53330	157 aa		0.46	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	IDP3	P53982	420 aa	Known RBP	0.46	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	ATP25	Q03153	612 aa		0.46	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	SPO20	Q04359	397 aa		0.46	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	AIM32	Q04689	311 aa		0.46	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	YMR034C	Q05131	434 aa	Predicted RBP	0.46	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	FUS2	Q05670	677 aa		0.46	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	PIN3	Q06449	215 aa		0.46	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	TEN1	Q07921	160 aa		0.46	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	NTG2	Q08214	380 aa		0.46	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	TRE2	Q08693	809 aa		0.46	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	RIM20	Q12033	661 aa		0.46	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	PER33	Q12144	273 aa		0.46	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	CRC1	Q12289	327 aa		0.46	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	BLM10	P43583	2143 aa		0.46	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	ADE8	P04161	214 aa		0.46	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	RPS19A	P07280	144 aa	Known RBP	0.46	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	RPS19B	P07281	144 aa	Predicted RBP	0.46	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	SRD1	P09007	221 aa		0.46	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	SUI3	P09064	285 aa	Known RBP	0.46	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	CLN3	P13365	580 aa		0.46	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	AMD1	P15274	810 aa	Known RBP	0.46	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	STI1	P15705	589 aa	Known RBP RIP-Chip data	0.46	□□□□□ -2.34	not detected
AI1	Q0050	FUR1	P18562	216 aa	Known RBP	0.46	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	PRP28	P23394	588 aa		0.46	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	YCR006C	P25350	157 aa		0.46	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	SEC1	P30619	724 aa	Known RBP	0.46	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	SPR1	P32603	445 aa		0.46	□□□□□ -2.34

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