RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602548.2

CENPVL1-201, Transcript of centromere protein V like 1, humanhuman

APPRIS P1 BASIC

Gene CENPVL1, Length 1,620 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPVL1-201ENST00000602548 SAMD3Q8N6K7 520 aa27.36■■□□□ 1.97
CENPVL1-201ENST00000602548 CCDC148Q8NFR7 591 aa27.36■■□□□ 1.97
CENPVL1-201ENST00000602548 TBC1D5Q92609 795 aa27.36■■□□□ 1.97
CENPVL1-201ENST00000602548 AIFM3Q96NN9 605 aa27.36■■□□□ 1.97
CENPVL1-201ENST00000602548 PSTPIP2Q9H939 334 aa27.36■■□□□ 1.97
CENPVL1-201ENST00000602548 SH3GLB2Q9NR46 395 aa27.36■■□□□ 1.97
CENPVL1-201ENST00000602548 SLC5A4Q9NY91 659 aa27.36■■□□□ 1.97
CENPVL1-201ENST00000602548 VPS54Q9P1Q0 977 aa27.36■■□□□ 1.97
CENPVL1-201ENST00000602548 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa27.35■■□□□ 1.97
CENPVL1-201ENST00000602548 COBLO75128 1261 aa27.35■■□□□ 1.97
CENPVL1-201ENST00000602548 GHRHRQ02643 423 aa27.35■■□□□ 1.97
CENPVL1-201ENST00000602548 SLC30A10Q6XR72 485 aa27.35■■□□□ 1.97
CENPVL1-201ENST00000602548 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP27.35■■□□□ 1.97
CENPVL1-201ENST00000602548 POTEB2H3BUK9 544 aa27.34■■□□□ 1.97
CENPVL1-201ENST00000602548 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP27.34■■□□□ 1.97
CENPVL1-201ENST00000602548 HOXC6P09630 235 aa27.34■■□□□ 1.97
CENPVL1-201ENST00000602548 POLR2MP0CAP2 368 aa27.34■■□□□ 1.97
CENPVL1-201ENST00000602548 XBP1P17861 261 aa27.34■■□□□ 1.97
CENPVL1-201ENST00000602548 CYP2B6P20813 491 aa27.34■■□□□ 1.97
CENPVL1-201ENST00000602548 CALML3P27482 149 aa27.34■■□□□ 1.97
CENPVL1-201ENST00000602548 HSD17B4P51659 736 aa27.34■■□□□ 1.97
CENPVL1-201ENST00000602548 APBA2Q99767 749 aa27.34■■□□□ 1.97
CENPVL1-201ENST00000602548 ALG1Q9BT22 464 aa27.34■■□□□ 1.97
CENPVL1-201ENST00000602548 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP27.34■■□□□ 1.97
CENPVL1-201ENST00000602548 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP27.34■■□□□ 1.97
CENPVL1-201ENST00000602548 SMCO2A6NFE2 343 aa27.34■■□□□ 1.97
CENPVL1-201ENST00000602548 CUL5Q93034 780 aa27.34■■□□□ 1.97
CENPVL1-201ENST00000602548 ESYT2A0FGR8 921 aa27.33■■□□□ 1.97
CENPVL1-201ENST00000602548 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP27.33■■□□□ 1.97
CENPVL1-201ENST00000602548 IRF5Q13568 498 aa27.33■■□□□ 1.97
CENPVL1-201ENST00000602548 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP27.33■■□□□ 1.97
CENPVL1-201ENST00000602548 FAM133AQ8N9E0 248 aa27.33■■□□□ 1.97
CENPVL1-201ENST00000602548 FAM184AQ8NB25 1140 aa27.33■■□□□ 1.97
CENPVL1-201ENST00000602548 RAET1EQ8TD07 263 aa27.33■■□□□ 1.97
CENPVL1-201ENST00000602548 ZMYND12Q9H0C1 365 aa27.33■■□□□ 1.97
CENPVL1-201ENST00000602548 RIC8AQ9NPQ8 531 aa27.33■■□□□ 1.97
CENPVL1-201ENST00000602548 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP27.32■■□□□ 1.96
CENPVL1-201ENST00000602548 ADCY7P51828 1080 aa27.32■■□□□ 1.96
CENPVL1-201ENST00000602548 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP27.32■■□□□ 1.96
CENPVL1-201ENST00000602548 CNTN2Q02246 1040 aa27.32■■□□□ 1.96
CENPVL1-201ENST00000602548 ZNF792Q3KQV3 632 aa27.32■■□□□ 1.96
CENPVL1-201ENST00000602548 TEX2Q8IWB9 1127 aa27.32■■□□□ 1.96
CENPVL1-201ENST00000602548 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP27.32■■□□□ 1.96
CENPVL1-201ENST00000602548 GLT8D2Q9H1C3 349 aa27.32■■□□□ 1.96
CENPVL1-201ENST00000602548 C6orf50Q9HD87 102 aa27.32■■□□□ 1.96
CENPVL1-201ENST00000602548 SMC3Q9UQE7 1217 aa27.32■■□□□ 1.96
CENPVL1-201ENST00000602548 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP27.32■■□□□ 1.96
CENPVL1-201ENST00000602548 KIF3AQ9Y496 699 aa27.32■■□□□ 1.96
CENPVL1-201ENST00000602548 PIK3CDO00329 1044 aa27.31■■□□□ 1.96
CENPVL1-201ENST00000602548 MEIS2O14770 477 aa27.31■■□□□ 1.96
CENPVL1-201ENST00000602548 GNA11P29992 359 aa27.31■■□□□ 1.96
CENPVL1-201ENST00000602548 USP17L6PQ6QN14 398 aa27.31■■□□□ 1.96
CENPVL1-201ENST00000602548 NPLOC4Q8TAT6 608 aa27.31■■□□□ 1.96
CENPVL1-201ENST00000602548 SHISA4Q96DD7 197 aa27.31■■□□□ 1.96
CENPVL1-201ENST00000602548 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP27.31■■□□□ 1.96
CENPVL1-201ENST00000602548 PTPN22Q9Y2R2 807 aa27.31■■□□□ 1.96
CENPVL1-201ENST00000602548 NLRP5P59047 1200 aa27.3■■□□□ 1.96
CENPVL1-201ENST00000602548 HTTP42858 3142 aa27.3■■□□□ 1.96
CENPVL1-201ENST00000602548 BECN1Q14457 450 aa27.3■■□□□ 1.96
CENPVL1-201ENST00000602548 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP27.3■■□□□ 1.96
CENPVL1-201ENST00000602548 MAML3Q96JK9 1138 aa27.3■■□□□ 1.96
CENPVL1-201ENST00000602548 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP27.3■■□□□ 1.96
CENPVL1-201ENST00000602548 COL20A1Q9P218 1284 aa27.3■■□□□ 1.96
CENPVL1-201ENST00000602548 ADD3Q9UEY8 706 aaKnown RBP27.3■■□□□ 1.96
CENPVL1-201ENST00000602548 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa27.3■■□□□ 1.96
CENPVL1-201ENST00000602548 GJB2P29033 226 aa27.29■■□□□ 1.96
CENPVL1-201ENST00000602548 GJB4Q9NTQ9 266 aa27.29■■□□□ 1.96
CENPVL1-201ENST00000602548 TRIM29Q14134 588 aa27.28■■□□□ 1.96
CENPVL1-201ENST00000602548 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP27.28■■□□□ 1.96
CENPVL1-201ENST00000602548 FCHSD1Q86WN1 690 aa27.28■■□□□ 1.96
CENPVL1-201ENST00000602548 DNERQ8NFT8 737 aa27.28■■□□□ 1.96
CENPVL1-201ENST00000602548 BICD2Q8TD16 824 aa27.28■■□□□ 1.96
CENPVL1-201ENST00000602548 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa27.28■■□□□ 1.96
CENPVL1-201ENST00000602548 SOWAHBA6NEL2 793 aa27.27■■□□□ 1.96
CENPVL1-201ENST00000602548 ADCY3O60266 1144 aa27.27■■□□□ 1.96
CENPVL1-201ENST00000602548 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP27.27■■□□□ 1.96
CENPVL1-201ENST00000602548 CCL14Q16627 93 aa27.27■■□□□ 1.96
CENPVL1-201ENST00000602548 UBE2SQ16763 222 aa27.27■■□□□ 1.96
CENPVL1-201ENST00000602548 GALNT17Q6IS24 598 aa27.27■■□□□ 1.96
CENPVL1-201ENST00000602548 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP27.27■■□□□ 1.96
CENPVL1-201ENST00000602548 PXYLP1Q8TE99 480 aa27.27■■□□□ 1.96
CENPVL1-201ENST00000602548 FGD4Q96M96 766 aa27.27■■□□□ 1.96
CENPVL1-201ENST00000602548 PHF20Q9BVI0 1012 aa27.27■■□□□ 1.96
CENPVL1-201ENST00000602548 KCNJ14Q9UNX9 436 aa27.27■■□□□ 1.96
CENPVL1-201ENST00000602548 C8orf76Q96K31 380 aa27.27■■□□□ 1.96
CENPVL1-201ENST00000602548 TAAR1Q96RJ0 339 aa27.27■■□□□ 1.96
CENPVL1-201ENST00000602548 RMDN3Q96TC7 470 aa27.27■■□□□ 1.96
CENPVL1-201ENST00000602548 PCDHA4Q9UN74 947 aa27.27■■□□□ 1.96
CENPVL1-201ENST00000602548 ASTN1O14525 1302 aa27.26■■□□□ 1.95
CENPVL1-201ENST00000602548 OLFML2BQ68BL8 750 aa27.26■■□□□ 1.95
CENPVL1-201ENST00000602548 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP27.26■■□□□ 1.95
CENPVL1-201ENST00000602548 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP27.26■■□□□ 1.95
CENPVL1-201ENST00000602548 SLAIN1Q8ND83 568 aa27.26■■□□□ 1.95
CENPVL1-201ENST00000602548 LCTP09848 1927 aa27.26■■□□□ 1.95
CENPVL1-201ENST00000602548 CENPFP49454 3210 aa27.25■■□□□ 1.95
CENPVL1-201ENST00000602548 SPDYE3A6NKU9 549 aa27.25■■□□□ 1.95
CENPVL1-201ENST00000602548 ELNP15502 786 aa27.25■■□□□ 1.95
CENPVL1-201ENST00000602548 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP27.25■■□□□ 1.95
CENPVL1-201ENST00000602548 FOSBP53539 338 aa27.25■■□□□ 1.95
CENPVL1-201ENST00000602548 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP27.25■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.4 ms