RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588780.5

CAPNS1-205, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,035 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-205ENST00000588780 KCNJ6P48051 423 aa25.89■■□□□ 1.74
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CAPNS1-205ENST00000588780 TSPY2A6NKD2 308 aa25.77■■□□□ 1.72
CAPNS1-205ENST00000588780 M0R2C6 588 aa25.77■■□□□ 1.72
CAPNS1-205ENST00000588780 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP25.77■■□□□ 1.72
CAPNS1-205ENST00000588780 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP25.77■■□□□ 1.72
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CAPNS1-205ENST00000588780 DDX19BQ9UMR2 479 aa25.77■■□□□ 1.72
CAPNS1-205ENST00000588780 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP25.77■■□□□ 1.72
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