RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563874.5

CLN3-210, Transcript of CLN3, battenin, humanhuman

TSL 2

Gene CLN3, Length 3,081 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3-210ENST00000563874 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
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CLN3-210ENST00000563874 SPA17Q15506 151 aa14.72□□□□□ -0.05
CLN3-210ENST00000563874 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
CLN3-210ENST00000563874 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
CLN3-210ENST00000563874 MAD2L2Q9UI95 211 aa14.72□□□□□ -0.05
CLN3-210ENST00000563874 TARSL2A2RTX5 802 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
CLN3-210ENST00000563874 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP14.72□□□□□ -0.051e-7■■■□□ 15.8
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CLN3-210ENST00000563874 GOLGA6AQ9NYA3 693 aa14.7□□□□□ -0.06
CLN3-210ENST00000563874 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa14.7□□□□□ -0.06
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CLN3-210ENST00000563874 NAPAP54920 295 aa14.69□□□□□ -0.06
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CLN3-210ENST00000563874 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
CLN3-210ENST00000563874 A0A1B0GUL6 1792 aa14.68□□□□□ -0.06
CLN3-210ENST00000563874 KLRF2D3W0D1 207 aa14.68□□□□□ -0.06
CLN3-210ENST00000563874 ZPR1O75312 459 aa14.68□□□□□ -0.06
CLN3-210ENST00000563874 TXKP42681 527 aa14.68□□□□□ -0.06
CLN3-210ENST00000563874 MAGEA9P43362 315 aa14.68□□□□□ -0.06
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