RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555855.5

FOXN3-211, Transcript of forkhead box N3, humanhuman

TSL 5

Gene FOXN3, Length 851 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXN3-211ENST00000555855 SCLYQ96I15 445 aa22.93■■□□□ 1.26
FOXN3-211ENST00000555855 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
FOXN3-211ENST00000555855 WNT8AQ9H1J5 351 aa22.93■■□□□ 1.26
FOXN3-211ENST00000555855 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
FOXN3-211ENST00000555855 TOMM22Q9NS69 142 aa22.93■■□□□ 1.26
FOXN3-211ENST00000555855 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa22.93■■□□□ 1.26
FOXN3-211ENST00000555855 PTPDC1A2A3K4 754 aa22.92■■□□□ 1.26
FOXN3-211ENST00000555855 PFKMP08237 780 aa22.92■■□□□ 1.26
FOXN3-211ENST00000555855 MYL3P08590 195 aa22.92■■□□□ 1.26
FOXN3-211ENST00000555855 RABGGTBP53611 331 aa22.92■■□□□ 1.26
FOXN3-211ENST00000555855 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
FOXN3-211ENST00000555855 ANAPC4Q9UJX5 808 aa22.92■■□□□ 1.26
FOXN3-211ENST00000555855 PNMA2Q9UL42 364 aa22.92■■□□□ 1.26
FOXN3-211ENST00000555855 ACTN1P12814 892 aa22.91■■□□□ 1.26
FOXN3-211ENST00000555855 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
FOXN3-211ENST00000555855 MX1P20591 662 aa22.91■■□□□ 1.26
FOXN3-211ENST00000555855 COL9A1P20849 921 aa22.91■■□□□ 1.26
FOXN3-211ENST00000555855 SLC16A2P36021 539 aa22.91■■□□□ 1.26
FOXN3-211ENST00000555855 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
FOXN3-211ENST00000555855 SYDE2Q5VT97 1194 aa22.91■■□□□ 1.26
FOXN3-211ENST00000555855 TTBK2Q6IQ55 1244 aa22.91■■□□□ 1.26
FOXN3-211ENST00000555855 BTNL9Q6UXG8 535 aa22.91■■□□□ 1.26
FOXN3-211ENST00000555855 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa22.91■■□□□ 1.26
FOXN3-211ENST00000555855 TNKSO95271 1327 aa22.9■■□□□ 1.26
FOXN3-211ENST00000555855 ORC4O43929 436 aa22.9■■□□□ 1.26
FOXN3-211ENST00000555855 CYP2C9P11712 490 aa22.9■■□□□ 1.26
FOXN3-211ENST00000555855 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
FOXN3-211ENST00000555855 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
FOXN3-211ENST00000555855 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
FOXN3-211ENST00000555855 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
FOXN3-211ENST00000555855 B4DLN1 442 aa22.89■■□□□ 1.25
FOXN3-211ENST00000555855 TOP1P11387 765 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.25
FOXN3-211ENST00000555855 CALML3P27482 149 aa22.89■■□□□ 1.25
FOXN3-211ENST00000555855 NOVP48745 357 aa22.89■■□□□ 1.25
FOXN3-211ENST00000555855 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.25
FOXN3-211ENST00000555855 PURAQ00577 322 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.25
FOXN3-211ENST00000555855 FAM47CQ5HY64 1035 aa22.89■■□□□ 1.25
FOXN3-211ENST00000555855 TMEM67Q5HYA8 995 aa22.89■■□□□ 1.25
FOXN3-211ENST00000555855 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.25
FOXN3-211ENST00000555855 DEFB128Q7Z7B8 93 aa22.89■■□□□ 1.25
FOXN3-211ENST00000555855 MICALL1Q8N3F8 863 aa22.89■■□□□ 1.25
FOXN3-211ENST00000555855 RETREG2Q8NC44 543 aa22.89■■□□□ 1.25
FOXN3-211ENST00000555855 OR6J1Q8NGC5 347 aa22.89■■□□□ 1.25
FOXN3-211ENST00000555855 GPCPD1Q9NPB8 672 aa22.89■■□□□ 1.25
FOXN3-211ENST00000555855 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.25
FOXN3-211ENST00000555855 RAD50Q92878 1312 aa22.88■■□□□ 1.25
FOXN3-211ENST00000555855 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
FOXN3-211ENST00000555855 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP22.88■■□□□ 1.252e-6■■■■□ 21.8
FOXN3-211ENST00000555855 KPNA6O60684 536 aa22.88■■□□□ 1.25
FOXN3-211ENST00000555855 MYOGP15173 224 aa22.88■■□□□ 1.25
FOXN3-211ENST00000555855 PDE4DQ08499 809 aa22.88■■□□□ 1.25
FOXN3-211ENST00000555855 ALX1Q15699 326 aa22.88■■□□□ 1.25
FOXN3-211ENST00000555855 RNF207Q6ZRF8 634 aa22.88■■□□□ 1.25
FOXN3-211ENST00000555855 RASGRP2Q7LDG7 609 aa22.88■■□□□ 1.25
FOXN3-211ENST00000555855 GBF1Q92538 1859 aa22.88■■□□□ 1.25
FOXN3-211ENST00000555855 NFIBO00712 420 aa22.87■■□□□ 1.25
FOXN3-211ENST00000555855 FOXP2O15409 715 aa22.87■■□□□ 1.25
FOXN3-211ENST00000555855 FGRP09769 529 aa22.87■■□□□ 1.25
FOXN3-211ENST00000555855 RFC2P35250 354 aa22.87■■□□□ 1.25
FOXN3-211ENST00000555855 TTLL4Q14679 1199 aa22.87■■□□□ 1.25
FOXN3-211ENST00000555855 AAK1Q2M2I8 961 aa22.87■■□□□ 1.25
FOXN3-211ENST00000555855 EVI5LQ96CN4 794 aa22.87■■□□□ 1.25
FOXN3-211ENST00000555855 TMEM47Q9BQJ4 181 aa22.87■■□□□ 1.25
FOXN3-211ENST00000555855 HELLSQ9NRZ9 838 aa22.87■■□□□ 1.25
FOXN3-211ENST00000555855 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa22.87■■□□□ 1.25
FOXN3-211ENST00000555855 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
FOXN3-211ENST00000555855 NCOR1O75376 2440 aa22.86■■□□□ 1.25
FOXN3-211ENST00000555855 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
FOXN3-211ENST00000555855 PPP2R5BQ15173 497 aa22.86■■□□□ 1.25
FOXN3-211ENST00000555855 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP22.86■■□□□ 1.25
FOXN3-211ENST00000555855 NBPF20Q3BBV1 942 aa22.86■■□□□ 1.25
FOXN3-211ENST00000555855 VPS53Q5VIR6 699 aa22.86■■□□□ 1.25
FOXN3-211ENST00000555855 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa22.86■■□□□ 1.25
FOXN3-211ENST00000555855 KIF28PB7ZC32 967 aa22.85■■□□□ 1.25
FOXN3-211ENST00000555855 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa22.85■■□□□ 1.25
FOXN3-211ENST00000555855 SCFD2Q8WU76 684 aa22.85■■□□□ 1.25
FOXN3-211ENST00000555855 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP22.85■■□□□ 1.256e-7■■■■■ 30.4
FOXN3-211ENST00000555855 NOD1Q9Y239 953 aa22.85■■□□□ 1.25
FOXN3-211ENST00000555855 FGAP02671 866 aa22.84■■□□□ 1.25
FOXN3-211ENST00000555855 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
FOXN3-211ENST00000555855 NFRKBQ6P4R8 1299 aa22.84■■□□□ 1.25
FOXN3-211ENST00000555855 DNERQ8NFT8 737 aa22.84■■□□□ 1.25
FOXN3-211ENST00000555855 CLEC4DQ8WXI8 215 aa22.84■■□□□ 1.25
FOXN3-211ENST00000555855 VWCEQ96DN2 955 aa22.84■■□□□ 1.25
FOXN3-211ENST00000555855 TTC14Q96N46 770 aa22.84■■□□□ 1.25
FOXN3-211ENST00000555855 SLC9A7Q96T83 725 aa22.84■■□□□ 1.25
FOXN3-211ENST00000555855 LRRC37A2A6NM11 1700 aa22.84■■□□□ 1.25
FOXN3-211ENST00000555855 TXNP10599 105 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.25
FOXN3-211ENST00000555855 RPS6P62753 249 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.25
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FOXN3-211ENST00000555855 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa22.83■■□□□ 1.25
FOXN3-211ENST00000555855 ANKRD45Q5TZF3 282 aa22.83■■□□□ 1.25
FOXN3-211ENST00000555855 SLC30A10Q6XR72 485 aa22.83■■□□□ 1.25
FOXN3-211ENST00000555855 A6NJR5 290 aa22.82■■□□□ 1.24
FOXN3-211ENST00000555855 PITPNM1O00562 1244 aa22.82■■□□□ 1.24
FOXN3-211ENST00000555855 CA3P07451 260 aa22.82■■□□□ 1.24
FOXN3-211ENST00000555855 IQCF3P0C7M6 154 aa22.82■■□□□ 1.24
FOXN3-211ENST00000555855 PDHBP11177 359 aa22.82■■□□□ 1.24
FOXN3-211ENST00000555855 LCTP09848 1927 aa22.81■■□□□ 1.24
FOXN3-211ENST00000555855 BMP1P13497 986 aa22.81■■□□□ 1.24
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