RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551473.5

CS-228, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 3

Gene CS, Length 797 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-228ENST00000551473 IQCF3P0C7M6 154 aa14.17□□□□□ -0.14
CS-228ENST00000551473 TSPY3P0CV98 308 aa14.17□□□□□ -0.14
CS-228ENST00000551473 TSPY8P0CW00 308 aa14.17□□□□□ -0.14
CS-228ENST00000551473 MS4A1P11836 297 aa14.17□□□□□ -0.14
CS-228ENST00000551473 TDO2P48775 406 aa14.17□□□□□ -0.14
CS-228ENST00000551473 NFRKBQ6P4R8 1299 aa14.17□□□□□ -0.14
CS-228ENST00000551473 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP14.17□□□□□ -0.14
CS-228ENST00000551473 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP14.17□□□□□ -0.14
CS-228ENST00000551473 C11orf16Q9NQ32 467 aa14.17□□□□□ -0.14
CS-228ENST00000551473 CYP39A1Q9NYL5 469 aa14.17□□□□□ -0.14
CS-228ENST00000551473 NOD1Q9Y239 953 aa14.17□□□□□ -0.14
CS-228ENST00000551473 PLIN4Q96Q06 1357 aa14.17□□□□□ -0.14
CS-228ENST00000551473 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP14.17□□□□□ -0.14
CS-228ENST00000551473 ZNF536O15090 1300 aa14.16□□□□□ -0.14
CS-228ENST00000551473 BDP1A6H8Y1 2624 aa14.16□□□□□ -0.14
CS-228ENST00000551473 XIRP2A4UGR9 3374 aa14.16□□□□□ -0.14
CS-228ENST00000551473 FAM86C2PA6NEL3 165 aa14.16□□□□□ -0.14
CS-228ENST00000551473 CCER2I3L3R5 266 aa14.16□□□□□ -0.14
CS-228ENST00000551473 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP14.16□□□□□ -0.14
CS-228ENST00000551473 PARNO95453 639 aaKnown RBP14.16□□□□□ -0.14
CS-228ENST00000551473 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP14.16□□□□□ -0.14
CS-228ENST00000551473 ALADP13716 330 aa14.16□□□□□ -0.14
CS-228ENST00000551473 PDE4BQ07343 736 aa14.16□□□□□ -0.14
CS-228ENST00000551473 KRT40Q6A162 431 aa14.16□□□□□ -0.14
CS-228ENST00000551473 NSMFQ6X4W1 530 aa14.16□□□□□ -0.14
CS-228ENST00000551473 OR6J1Q8NGC5 347 aa14.16□□□□□ -0.14
CS-228ENST00000551473 NEDD1Q8NHV4 660 aa14.16□□□□□ -0.14
CS-228ENST00000551473 ZBED2Q9BTP6 218 aa14.16□□□□□ -0.14
CS-228ENST00000551473 WDR11Q9BZH6 1224 aa14.16□□□□□ -0.14
CS-228ENST00000551473 KCNH6Q9H252 994 aa14.16□□□□□ -0.14
CS-228ENST00000551473 CHD7Q9P2D1 2997 aa14.16□□□□□ -0.14
CS-228ENST00000551473 PRDM1O75626 825 aa14.15□□□□□ -0.14
CS-228ENST00000551473 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa14.15□□□□□ -0.14
CS-228ENST00000551473 NBPF20Q3BBV1 942 aa14.15□□□□□ -0.14
CS-228ENST00000551473 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP14.15□□□□□ -0.14
CS-228ENST00000551473 GJD3Q8N144 294 aa14.15□□□□□ -0.14
CS-228ENST00000551473 CAGE1Q8TC20 777 aa14.15□□□□□ -0.14
CS-228ENST00000551473 APPBP2Q92624 585 aa14.15□□□□□ -0.14
CS-228ENST00000551473 NACAP1Q9BZK3 213 aa14.15□□□□□ -0.14
CS-228ENST00000551473 UBE2ZQ9H832 354 aaPredicted RBP14.15□□□□□ -0.14
CS-228ENST00000551473 CCPG1Q9ULG6 757 aa14.15□□□□□ -0.14
CS-228ENST00000551473 LPXNO60711 386 aa14.14□□□□□ -0.15
CS-228ENST00000551473 CHGBP05060 677 aa14.14□□□□□ -0.15
CS-228ENST00000551473 APPP05067 770 aa14.14□□□□□ -0.15
CS-228ENST00000551473 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP14.14□□□□□ -0.15
CS-228ENST00000551473 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP14.14□□□□□ -0.15
CS-228ENST00000551473 LEXMQ3ZCV2 418 aa14.14□□□□□ -0.15
CS-228ENST00000551473 AFAP1L1Q8TED9 768 aa14.14□□□□□ -0.15
CS-228ENST00000551473 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP14.14□□□□□ -0.15
CS-228ENST00000551473 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP14.14□□□□□ -0.15
CS-228ENST00000551473 MYH4Q9Y623 1939 aa14.13□□□□□ -0.15
CS-228ENST00000551473 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP14.13□□□□□ -0.15
CS-228ENST00000551473 B4DLN1 442 aa14.13□□□□□ -0.15
CS-228ENST00000551473 GPAA1O43292 621 aa14.13□□□□□ -0.15
CS-228ENST00000551473 EFCAB14O75071 495 aa14.13□□□□□ -0.15
CS-228ENST00000551473 ICAM1P05362 532 aa14.13□□□□□ -0.15
CS-228ENST00000551473 PTGS1P23219 599 aa14.13□□□□□ -0.15
CS-228ENST00000551473 MCCP23508 829 aa14.13□□□□□ -0.15
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CS-228ENST00000551473 PNMA2Q9UL42 364 aa14.13□□□□□ -0.15
CS-228ENST00000551473 MYH7P12883 1935 aa14.12□□□□□ -0.15
CS-228ENST00000551473 PPAN-P2RY11A0A0B4J1V8 794 aaPredicted RBP14.12□□□□□ -0.15
CS-228ENST00000551473 ARHGEF15O94989 841 aa14.12□□□□□ -0.15
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CS-228ENST00000551473 TFAP4Q01664 338 aa14.12□□□□□ -0.15
CS-228ENST00000551473 CNKSR3Q6P9H4 555 aa14.12□□□□□ -0.15
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CS-228ENST00000551473 KBTBD3Q8NAB2 608 aa14.12□□□□□ -0.15
CS-228ENST00000551473 SCFD2Q8WU76 684 aa14.12□□□□□ -0.15
CS-228ENST00000551473 UIMC1Q96RL1 719 aa14.12□□□□□ -0.15
CS-228ENST00000551473 CRBNQ96SW2 442 aa14.12□□□□□ -0.15
CS-228ENST00000551473 RAD9AQ99638 391 aa14.12□□□□□ -0.15
CS-228ENST00000551473 PRR12Q9ULL5 1215 aa14.12□□□□□ -0.15
CS-228ENST00000551473 A6NJR5 290 aa14.11□□□□□ -0.15
CS-228ENST00000551473 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP14.11□□□□□ -0.15
CS-228ENST00000551473 MRE11P49959 708 aa14.11□□□□□ -0.15
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CS-228ENST00000551473 PDE4DQ08499 809 aa14.11□□□□□ -0.15
CS-228ENST00000551473 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP14.11□□□□□ -0.15
CS-228ENST00000551473 TMEM63BQ5T3F8 832 aa14.11□□□□□ -0.15
CS-228ENST00000551473 KCTD1Q719H9 257 aa14.11□□□□□ -0.15
CS-228ENST00000551473 OSBP2Q969R2 916 aa14.11□□□□□ -0.15
CS-228ENST00000551473 GPATCH3Q96I76 525 aa14.11□□□□□ -0.15
CS-228ENST00000551473 LRRCC1Q9C099 1032 aa14.11□□□□□ -0.15
CS-228ENST00000551473 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP14.11□□□□□ -0.15
CS-228ENST00000551473 CD320Q9NPF0 282 aa14.11□□□□□ -0.15
CS-228ENST00000551473 ECHDC1Q9NTX5 307 aa14.11□□□□□ -0.15
CS-228ENST00000551473 CTNNA3Q9UI47 895 aa14.11□□□□□ -0.15
CS-228ENST00000551473 DDX19BQ9UMR2 479 aa14.11□□□□□ -0.15
CS-228ENST00000551473 STX8Q9UNK0 236 aa14.11□□□□□ -0.15
CS-228ENST00000551473 FAM50BQ9Y247 325 aa14.11□□□□□ -0.15
CS-228ENST00000551473 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa14.1□□□□□ -0.15
CS-228ENST00000551473 PTPDC1A2A3K4 754 aa14.1□□□□□ -0.15
CS-228ENST00000551473 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP14.1□□□□□ -0.15
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