RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428858.1

TTC28-AS1-209, TTC28 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 4

Gene TTC28-AS1, Length 565 nt, Biotype retained intron.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-AS1-209ENST00000428858 NAPAP54920 295 aa9.4□□□□□ -0.9
TTC28-AS1-209ENST00000428858 PRKCZQ05513 592 aa9.4□□□□□ -0.9
TTC28-AS1-209ENST00000428858 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP9.4□□□□□ -0.9
TTC28-AS1-209ENST00000428858 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP9.4□□□□□ -0.9
TTC28-AS1-209ENST00000428858 SLC30A10Q6XR72 485 aa9.4□□□□□ -0.9
TTC28-AS1-209ENST00000428858 RNF207Q6ZRF8 634 aa9.4□□□□□ -0.9
TTC28-AS1-209ENST00000428858 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP9.4□□□□□ -0.9
TTC28-AS1-209ENST00000428858 HSCBQ8IWL3 235 aa9.4□□□□□ -0.9
TTC28-AS1-209ENST00000428858 TNS4Q8IZW8 715 aa9.4□□□□□ -0.9
TTC28-AS1-209ENST00000428858 FAM133AQ8N9E0 248 aa9.4□□□□□ -0.9
TTC28-AS1-209ENST00000428858 CCDC148Q8NFR7 591 aa9.4□□□□□ -0.9
TTC28-AS1-209ENST00000428858 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP9.4□□□□□ -0.9
TTC28-AS1-209ENST00000428858 SHISA4Q96DD7 197 aa9.4□□□□□ -0.9
TTC28-AS1-209ENST00000428858 APBA2Q99767 749 aa9.4□□□□□ -0.9
TTC28-AS1-209ENST00000428858 ZMYND12Q9H0C1 365 aa9.4□□□□□ -0.9
TTC28-AS1-209ENST00000428858 GLT8D2Q9H1C3 349 aa9.4□□□□□ -0.9
TTC28-AS1-209ENST00000428858 PSTPIP2Q9H939 334 aa9.4□□□□□ -0.9
TTC28-AS1-209ENST00000428858 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP9.4□□□□□ -0.9
TTC28-AS1-209ENST00000428858 SLC5A4Q9NY91 659 aa9.4□□□□□ -0.9
TTC28-AS1-209ENST00000428858 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP9.4□□□□□ -0.9
TTC28-AS1-209ENST00000428858 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP9.4□□□□□ -0.9
TTC28-AS1-209ENST00000428858 PARP14Q460N5 1801 aa9.4□□□□□ -0.91
TTC28-AS1-209ENST00000428858 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa9.39□□□□□ -0.91
TTC28-AS1-209ENST00000428858 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP9.39□□□□□ -0.91
TTC28-AS1-209ENST00000428858 MEIS2O14770 477 aa9.39□□□□□ -0.91
TTC28-AS1-209ENST00000428858 COBLO75128 1261 aa9.39□□□□□ -0.91
TTC28-AS1-209ENST00000428858 PGK2P07205 417 aa9.39□□□□□ -0.91
TTC28-AS1-209ENST00000428858 POLR2MP0CAP2 368 aa9.39□□□□□ -0.91
TTC28-AS1-209ENST00000428858 XBP1P17861 261 aa9.39□□□□□ -0.91
TTC28-AS1-209ENST00000428858 FLT3LGP49771 235 aa9.39□□□□□ -0.91
TTC28-AS1-209ENST00000428858 ADCY7P51828 1080 aa9.39□□□□□ -0.91
TTC28-AS1-209ENST00000428858 RPS6P62753 249 aaKnown RBP9.39□□□□□ -0.91
TTC28-AS1-209ENST00000428858 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP9.39□□□□□ -0.91
TTC28-AS1-209ENST00000428858 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP9.39□□□□□ -0.91
TTC28-AS1-209ENST00000428858 ZNF792Q3KQV3 632 aa9.39□□□□□ -0.91
TTC28-AS1-209ENST00000428858 GALNT17Q6IS24 598 aa9.39□□□□□ -0.91
TTC28-AS1-209ENST00000428858 NSMFQ6X4W1 530 aa9.39□□□□□ -0.91
TTC28-AS1-209ENST00000428858 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP9.39□□□□□ -0.91
TTC28-AS1-209ENST00000428858 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP9.39□□□□□ -0.91
TTC28-AS1-209ENST00000428858 PXYLP1Q8TE99 480 aa9.39□□□□□ -0.91
TTC28-AS1-209ENST00000428858 DDX11Q96FC9 970 aa9.39□□□□□ -0.91
TTC28-AS1-209ENST00000428858 FGD4Q96M96 766 aa9.39□□□□□ -0.91
TTC28-AS1-209ENST00000428858 AIFM3Q96NN9 605 aa9.39□□□□□ -0.91
TTC28-AS1-209ENST00000428858 ALG1Q9BT22 464 aa9.39□□□□□ -0.91
TTC28-AS1-209ENST00000428858 RIC8AQ9NPQ8 531 aa9.39□□□□□ -0.91
TTC28-AS1-209ENST00000428858 VPS54Q9P1Q0 977 aa9.39□□□□□ -0.91
TTC28-AS1-209ENST00000428858 GABRQQ9UN88 632 aa9.39□□□□□ -0.91
TTC28-AS1-209ENST00000428858 TRIM17Q9Y577 477 aa9.39□□□□□ -0.91
TTC28-AS1-209ENST00000428858 ASTN1O14525 1302 aa9.38□□□□□ -0.91
TTC28-AS1-209ENST00000428858 SMCO2A6NFE2 343 aa9.38□□□□□ -0.91
TTC28-AS1-209ENST00000428858 POTEB2H3BUK9 544 aa9.38□□□□□ -0.91
TTC28-AS1-209ENST00000428858 CAPN15O75808 1086 aa9.38□□□□□ -0.91
TTC28-AS1-209ENST00000428858 CFBP00751 764 aa9.38□□□□□ -0.91
TTC28-AS1-209ENST00000428858 GNA11P29992 359 aa9.38□□□□□ -0.91
TTC28-AS1-209ENST00000428858 CLK2P49760 499 aaKnown RBP9.38□□□□□ -0.91
TTC28-AS1-209ENST00000428858 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP9.38□□□□□ -0.91
TTC28-AS1-209ENST00000428858 CNTN2Q02246 1040 aa9.38□□□□□ -0.91
TTC28-AS1-209ENST00000428858 NPY5RQ15761 445 aa9.38□□□□□ -0.91
TTC28-AS1-209ENST00000428858 OLFML2BQ68BL8 750 aa9.38□□□□□ -0.91
TTC28-AS1-209ENST00000428858 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa9.38□□□□□ -0.91
TTC28-AS1-209ENST00000428858 DPP9Q86TI2 863 aa9.38□□□□□ -0.91
TTC28-AS1-209ENST00000428858 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP9.38□□□□□ -0.91
TTC28-AS1-209ENST00000428858 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP9.38□□□□□ -0.91
TTC28-AS1-209ENST00000428858 DAGLBQ8NCG7 672 aa9.38□□□□□ -0.91
TTC28-AS1-209ENST00000428858 DNERQ8NFT8 737 aa9.38□□□□□ -0.91
TTC28-AS1-209ENST00000428858 TBC1D5Q92609 795 aa9.38□□□□□ -0.91
TTC28-AS1-209ENST00000428858 CUL5Q93034 780 aa9.38□□□□□ -0.91
TTC28-AS1-209ENST00000428858 MAML3Q96JK9 1138 aa9.38□□□□□ -0.91
TTC28-AS1-209ENST00000428858 PKNOX2Q96KN3 472 aa9.38□□□□□ -0.91
TTC28-AS1-209ENST00000428858 PHF20Q9BVI0 1012 aa9.38□□□□□ -0.91
TTC28-AS1-209ENST00000428858 C6orf50Q9HD87 102 aa9.38□□□□□ -0.91
TTC28-AS1-209ENST00000428858 COL20A1Q9P218 1284 aa9.38□□□□□ -0.91
TTC28-AS1-209ENST00000428858 PTPN22Q9Y2R2 807 aa9.38□□□□□ -0.91
TTC28-AS1-209ENST00000428858 ZNF236Q9UL36 1845 aa9.38□□□□□ -0.91
TTC28-AS1-209ENST00000428858 FRMPD4Q14CM0 1322 aa9.37□□□□□ -0.91
TTC28-AS1-209ENST00000428858 RPTORQ8N122 1335 aa9.37□□□□□ -0.91
TTC28-AS1-209ENST00000428858 SOWAHBA6NEL2 793 aa9.37□□□□□ -0.91
TTC28-AS1-209ENST00000428858 M0R2N6 131 aa9.37□□□□□ -0.91
TTC28-AS1-209ENST00000428858 DTNBO60941 627 aa9.37□□□□□ -0.91
TTC28-AS1-209ENST00000428858 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP9.37□□□□□ -0.91
TTC28-AS1-209ENST00000428858 CYP2B6P20813 491 aa9.37□□□□□ -0.91
TTC28-AS1-209ENST00000428858 EDNRBP24530 442 aa9.37□□□□□ -0.91
TTC28-AS1-209ENST00000428858 CALML3P27482 149 aa9.37□□□□□ -0.91
TTC28-AS1-209ENST00000428858 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP9.37□□□□□ -0.91
TTC28-AS1-209ENST00000428858 NLRP5P59047 1200 aa9.37□□□□□ -0.91
TTC28-AS1-209ENST00000428858 AP3B2Q13367 1082 aa9.37□□□□□ -0.91
TTC28-AS1-209ENST00000428858 MCTP2Q6DN12 878 aa9.37□□□□□ -0.91
TTC28-AS1-209ENST00000428858 USP17L6PQ6QN14 398 aa9.37□□□□□ -0.91
TTC28-AS1-209ENST00000428858 SLAIN1Q8ND83 568 aa9.37□□□□□ -0.91
TTC28-AS1-209ENST00000428858 NPLOC4Q8TAT6 608 aa9.37□□□□□ -0.91
TTC28-AS1-209ENST00000428858 RAET1EQ8TD07 263 aa9.37□□□□□ -0.91
TTC28-AS1-209ENST00000428858 BICD2Q8TD16 824 aa9.37□□□□□ -0.91
TTC28-AS1-209ENST00000428858 MORC4Q8TE76 937 aa9.37□□□□□ -0.91
TTC28-AS1-209ENST00000428858 TRIB2Q92519 343 aa9.37□□□□□ -0.91
TTC28-AS1-209ENST00000428858 ADD3Q9UEY8 706 aaKnown RBP9.37□□□□□ -0.91
TTC28-AS1-209ENST00000428858 SMC3Q9UQE7 1217 aa9.37□□□□□ -0.91
TTC28-AS1-209ENST00000428858 KIF3AQ9Y496 699 aa9.37□□□□□ -0.91
TTC28-AS1-209ENST00000428858 PCNTO95613 3336 aa9.37□□□□□ -0.91
TTC28-AS1-209ENST00000428858 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa9.36□□□□□ -0.91
TTC28-AS1-209ENST00000428858 ASB14A6NK59 587 aa9.36□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.8 ms