RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000408919.7

SH3BP5-203, Transcript of SH3 domain binding protein 5, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP5, Length 1,880 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP5-203ENST00000408919 MORF4L1Q9UBU8 362 aa20.45■□□□□ 0.86
SH3BP5-203ENST00000408919 CPA4Q9UI42 421 aa20.45■□□□□ 0.86
SH3BP5-203ENST00000408919 HSPA6P17066 643 aa20.44■□□□□ 0.86
SH3BP5-203ENST00000408919 ERCC3P19447 782 aa20.44■□□□□ 0.86
SH3BP5-203ENST00000408919 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP20.44■□□□□ 0.86
SH3BP5-203ENST00000408919 PIK3CDO00329 1044 aa20.43■□□□□ 0.86
SH3BP5-203ENST00000408919 TKFCQ3LXA3 575 aa20.43■□□□□ 0.86
SH3BP5-203ENST00000408919 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa20.43■□□□□ 0.86
SH3BP5-203ENST00000408919 NCAPG2Q86XI2 1143 aa20.43■□□□□ 0.86
SH3BP5-203ENST00000408919 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa20.43■□□□□ 0.86
SH3BP5-203ENST00000408919 BICD2Q8TD16 824 aa20.43■□□□□ 0.86
SH3BP5-203ENST00000408919 ACAD9Q9H845 621 aa20.43■□□□□ 0.86
SH3BP5-203ENST00000408919 PLXNB2O15031 1838 aa20.43■□□□□ 0.86
SH3BP5-203ENST00000408919 TLR2O60603 784 aa20.43■□□□□ 0.86
SH3BP5-203ENST00000408919 BCRP11274 1271 aa20.43■□□□□ 0.86
SH3BP5-203ENST00000408919 HSD17B4P51659 736 aa20.43■□□□□ 0.86
SH3BP5-203ENST00000408919 NSMFQ6X4W1 530 aa20.43■□□□□ 0.86
SH3BP5-203ENST00000408919 COL20A1Q9P218 1284 aa20.43■□□□□ 0.86
SH3BP5-203ENST00000408919 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP20.42■□□□□ 0.86
SH3BP5-203ENST00000408919 POLR2MP0CAP2 368 aa20.42■□□□□ 0.86
SH3BP5-203ENST00000408919 MAP2K2P36507 400 aa20.42■□□□□ 0.86
SH3BP5-203ENST00000408919 GHRHRQ02643 423 aa20.42■□□□□ 0.86
SH3BP5-203ENST00000408919 FAM110CQ1W6H9 321 aa20.42■□□□□ 0.86
SH3BP5-203ENST00000408919 SLC30A10Q6XR72 485 aa20.42■□□□□ 0.86
SH3BP5-203ENST00000408919 BRAPQ7Z569 592 aa20.42■□□□□ 0.86
SH3BP5-203ENST00000408919 CHST13Q8NET6 341 aa20.42■□□□□ 0.86
SH3BP5-203ENST00000408919 GLT8D2Q9H1C3 349 aa20.42■□□□□ 0.86
SH3BP5-203ENST00000408919 EFCC1Q9HA90 598 aa20.42■□□□□ 0.86
SH3BP5-203ENST00000408919 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP20.42■□□□□ 0.86
SH3BP5-203ENST00000408919 WNT7AO00755 349 aa20.41■□□□□ 0.86
SH3BP5-203ENST00000408919 CA12O43570 354 aa20.41■□□□□ 0.86
SH3BP5-203ENST00000408919 RPS6P62753 249 aaKnown RBP20.41■□□□□ 0.86
SH3BP5-203ENST00000408919 MYSM1Q5VVJ2 828 aa20.41■□□□□ 0.86
SH3BP5-203ENST00000408919 C17orf99Q6UX52 265 aa20.41■□□□□ 0.86
SH3BP5-203ENST00000408919 FCHSD1Q86WN1 690 aa20.41■□□□□ 0.86
SH3BP5-203ENST00000408919 MCF2L2Q86YR7 1114 aa20.41■□□□□ 0.86
SH3BP5-203ENST00000408919 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa20.41■□□□□ 0.86
SH3BP5-203ENST00000408919 SLC25A27O95847 323 aa20.41■□□□□ 0.86
SH3BP5-203ENST00000408919 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP20.41■□□□□ 0.86
SH3BP5-203ENST00000408919 RNF207Q6ZRF8 634 aa20.41■□□□□ 0.86
SH3BP5-203ENST00000408919 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP20.41■□□□□ 0.86
SH3BP5-203ENST00000408919 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP20.41■□□□□ 0.86
SH3BP5-203ENST00000408919 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa20.4■□□□□ 0.86
SH3BP5-203ENST00000408919 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP20.4■□□□□ 0.86
SH3BP5-203ENST00000408919 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP20.4■□□□□ 0.86
SH3BP5-203ENST00000408919 INF2Q27J81 1249 aa20.4■□□□□ 0.86
SH3BP5-203ENST00000408919 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP20.4■□□□□ 0.86
SH3BP5-203ENST00000408919 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP20.4■□□□□ 0.86
SH3BP5-203ENST00000408919 CYP39A1Q9NYL5 469 aa20.4■□□□□ 0.86
SH3BP5-203ENST00000408919 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa20.4■□□□□ 0.86
SH3BP5-203ENST00000408919 MGAMO43451 1857 aa20.4■□□□□ 0.86
SH3BP5-203ENST00000408919 EDIL3O43854 480 aa20.39■□□□□ 0.86
SH3BP5-203ENST00000408919 NBR1Q14596 966 aa20.39■□□□□ 0.86
SH3BP5-203ENST00000408919 KRT25Q7Z3Z0 450 aa20.39■□□□□ 0.86
SH3BP5-203ENST00000408919 SHCBP1Q8NEM2 672 aa20.39■□□□□ 0.86
SH3BP5-203ENST00000408919 ANO3Q9BYT9 981 aa20.39■□□□□ 0.86
SH3BP5-203ENST00000408919 ALDH1A1P00352 501 aa20.39■□□□□ 0.85
SH3BP5-203ENST00000408919 AP3B2Q13367 1082 aa20.39■□□□□ 0.85
SH3BP5-203ENST00000408919 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP20.39■□□□□ 0.85
SH3BP5-203ENST00000408919 WDR78Q5VTH9 848 aa20.39■□□□□ 0.85
SH3BP5-203ENST00000408919 TBCKQ8TEA7 893 aa20.39■□□□□ 0.85
SH3BP5-203ENST00000408919 FBXO40Q9UH90 709 aa20.39■□□□□ 0.85
SH3BP5-203ENST00000408919 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa20.38■□□□□ 0.85
SH3BP5-203ENST00000408919 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
SH3BP5-203ENST00000408919 ATP2B1P20020 1258 aa20.38■□□□□ 0.85
SH3BP5-203ENST00000408919 CCNA1P78396 465 aa20.38■□□□□ 0.85
SH3BP5-203ENST00000408919 MROH8Q9H579 483 aa20.38■□□□□ 0.85
SH3BP5-203ENST00000408919 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
SH3BP5-203ENST00000408919 SPDYE3A6NKU9 549 aa20.37■□□□□ 0.85
SH3BP5-203ENST00000408919 COPB2P35606 906 aa20.37■□□□□ 0.85
SH3BP5-203ENST00000408919 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP20.37■□□□□ 0.85
SH3BP5-203ENST00000408919 ANKRD35Q8N283 1001 aa20.37■□□□□ 0.85
SH3BP5-203ENST00000408919 TAAR1Q96RJ0 339 aa20.37■□□□□ 0.85
SH3BP5-203ENST00000408919 USP28Q96RU2 1077 aa20.37■□□□□ 0.85
SH3BP5-203ENST00000408919 MCM3APO60318 1980 aa20.37■□□□□ 0.85
SH3BP5-203ENST00000408919 TRPA1O75762 1119 aa20.37■□□□□ 0.85
SH3BP5-203ENST00000408919 TBC1D8O95759 1140 aa20.37■□□□□ 0.85
SH3BP5-203ENST00000408919 UBXN2AP68543 259 aa20.37■□□□□ 0.85
SH3BP5-203ENST00000408919 TEX2Q8IWB9 1127 aa20.37■□□□□ 0.85
SH3BP5-203ENST00000408919 CRYGNQ8WXF5 182 aa20.37■□□□□ 0.85
SH3BP5-203ENST00000408919 RNF186Q9NXI6 227 aa20.37■□□□□ 0.85
SH3BP5-203ENST00000408919 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
SH3BP5-203ENST00000408919 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa20.37■□□□□ 0.85
SH3BP5-203ENST00000408919 BAG4O95429 457 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
SH3BP5-203ENST00000408919 FOSP01100 380 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
SH3BP5-203ENST00000408919 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
SH3BP5-203ENST00000408919 SAMD3Q8N6K7 520 aa20.36■□□□□ 0.85
SH3BP5-203ENST00000408919 CNPY2Q9Y2B0 182 aa20.36■□□□□ 0.85
SH3BP5-203ENST00000408919 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa20.36■□□□□ 0.85
SH3BP5-203ENST00000408919 CNTN2Q02246 1040 aa20.35■□□□□ 0.85
SH3BP5-203ENST00000408919 RILPL1Q5EBL4 403 aa20.35■□□□□ 0.85
SH3BP5-203ENST00000408919 MMP19Q99542 508 aa20.35■□□□□ 0.85
SH3BP5-203ENST00000408919 CLIC4Q9Y696 253 aa20.35■□□□□ 0.85
SH3BP5-203ENST00000408919 ASTN1O14525 1302 aa20.35■□□□□ 0.85
SH3BP5-203ENST00000408919 PFASO15067 1338 aa20.35■□□□□ 0.85
SH3BP5-203ENST00000408919 PGK2P07205 417 aa20.35■□□□□ 0.85
SH3BP5-203ENST00000408919 SREBF1P36956 1147 aa20.35■□□□□ 0.85
SH3BP5-203ENST00000408919 GPR142Q7Z601 462 aa20.35■□□□□ 0.85
SH3BP5-203ENST00000408919 IL31RAQ8NI17 732 aa20.35■□□□□ 0.85
SH3BP5-203ENST00000408919 GDPD2Q9HCC8 539 aa20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.4 ms