RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000407298.7

APOBEC3B-204, Transcript of apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic subunit 3B, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene APOBEC3B, Length 1,282 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3B-204ENST00000407298 MORC4Q8TE76 937 aa14.55□□□□□ -0.08
APOBEC3B-204ENST00000407298 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
APOBEC3B-204ENST00000407298 NAPBQ9H115 298 aa14.55□□□□□ -0.08
APOBEC3B-204ENST00000407298 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
APOBEC3B-204ENST00000407298 PDGFCQ9NRA1 345 aa14.55□□□□□ -0.08
APOBEC3B-204ENST00000407298 PNMA2Q9UL42 364 aa14.55□□□□□ -0.08
APOBEC3B-204ENST00000407298 CCPG1Q9ULG6 757 aa14.55□□□□□ -0.08
APOBEC3B-204ENST00000407298 STX8Q9UNK0 236 aa14.55□□□□□ -0.08
APOBEC3B-204ENST00000407298 RAD50Q92878 1312 aa14.55□□□□□ -0.08
APOBEC3B-204ENST00000407298 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
APOBEC3B-204ENST00000407298 KPNA6O60684 536 aa14.54□□□□□ -0.08
APOBEC3B-204ENST00000407298 PSMC6P62333 389 aa14.54□□□□□ -0.08
APOBEC3B-204ENST00000407298 NSMFQ6X4W1 530 aa14.54□□□□□ -0.08
APOBEC3B-204ENST00000407298 FBXO16Q8IX29 292 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
APOBEC3B-204ENST00000407298 RETREG2Q8NC44 543 aa14.54□□□□□ -0.08
APOBEC3B-204ENST00000407298 SCLYQ96I15 445 aa14.54□□□□□ -0.08
APOBEC3B-204ENST00000407298 SLC9A7Q96T83 725 aa14.54□□□□□ -0.08
APOBEC3B-204ENST00000407298 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
APOBEC3B-204ENST00000407298 WDR11Q9BZH6 1224 aa14.54□□□□□ -0.08
APOBEC3B-204ENST00000407298 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
APOBEC3B-204ENST00000407298 TNKSO95271 1327 aa14.54□□□□□ -0.08
APOBEC3B-204ENST00000407298 TSPY2A6NKD2 308 aa14.53□□□□□ -0.08
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APOBEC3B-204ENST00000407298 MYOGP15173 224 aa14.53□□□□□ -0.08
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APOBEC3B-204ENST00000407298 KCTD1Q719H9 257 aa14.53□□□□□ -0.08
APOBEC3B-204ENST00000407298 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
APOBEC3B-204ENST00000407298 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa14.53□□□□□ -0.08
APOBEC3B-204ENST00000407298 PRR12Q9ULL5 1215 aa14.53□□□□□ -0.08
APOBEC3B-204ENST00000407298 REV3LO60673 3130 aa14.52□□□□□ -0.08
APOBEC3B-204ENST00000407298 B4DLN1 442 aa14.52□□□□□ -0.09
APOBEC3B-204ENST00000407298 PITPNM1O00562 1244 aa14.52□□□□□ -0.09
APOBEC3B-204ENST00000407298 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP14.52□□□□□ -0.09
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APOBEC3B-204ENST00000407298 MYL3P08590 195 aa14.52□□□□□ -0.09
APOBEC3B-204ENST00000407298 CYP2C9P11712 490 aa14.52□□□□□ -0.09
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APOBEC3B-204ENST00000407298 PURAQ00577 322 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
APOBEC3B-204ENST00000407298 TFF2Q03403 129 aa14.52□□□□□ -0.09
APOBEC3B-204ENST00000407298 BFSP2Q13515 415 aa14.52□□□□□ -0.09
APOBEC3B-204ENST00000407298 TTLL4Q14679 1199 aa14.52□□□□□ -0.09
APOBEC3B-204ENST00000407298 MUM1L1Q5H9M0 696 aa14.52□□□□□ -0.09
APOBEC3B-204ENST00000407298 NFRKBQ6P4R8 1299 aa14.52□□□□□ -0.09
APOBEC3B-204ENST00000407298 DEFB128Q7Z7B8 93 aa14.52□□□□□ -0.09
APOBEC3B-204ENST00000407298 DCAF4Q8WV16 495 aa14.52□□□□□ -0.09
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APOBEC3B-204ENST00000407298 MTCH2Q9Y6C9 303 aa14.52□□□□□ -0.09
APOBEC3B-204ENST00000407298 GBF1Q92538 1859 aa14.52□□□□□ -0.09
APOBEC3B-204ENST00000407298 XIRP2A4UGR9 3374 aa14.51□□□□□ -0.09
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APOBEC3B-204ENST00000407298 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
APOBEC3B-204ENST00000407298 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
APOBEC3B-204ENST00000407298 CCDC96Q2M329 555 aa14.51□□□□□ -0.09
APOBEC3B-204ENST00000407298 FAM47CQ5HY64 1035 aa14.51□□□□□ -0.09
APOBEC3B-204ENST00000407298 OR6J1Q8NGC5 347 aa14.51□□□□□ -0.09
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APOBEC3B-204ENST00000407298 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
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APOBEC3B-204ENST00000407298 NBPF20Q3BBV1 942 aa14.5□□□□□ -0.09
APOBEC3B-204ENST00000407298 CCDC155Q8N6L0 562 aa14.5□□□□□ -0.09
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APOBEC3B-204ENST00000407298 DCTPP1Q9H773 170 aa14.5□□□□□ -0.09
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APOBEC3B-204ENST00000407298 PTGS1P23219 599 aa14.49□□□□□ -0.09
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APOBEC3B-204ENST00000407298 TAP1Q03518 808 aa14.48□□□□□ -0.09
APOBEC3B-204ENST00000407298 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa14.48□□□□□ -0.09
APOBEC3B-204ENST00000407298 TMEM63BQ5T3F8 832 aa14.48□□□□□ -0.09
APOBEC3B-204ENST00000407298 SYDE2Q5VT97 1194 aa14.48□□□□□ -0.09
APOBEC3B-204ENST00000407298 DNERQ8NFT8 737 aa14.48□□□□□ -0.09
APOBEC3B-204ENST00000407298 CERS4Q9HA82 394 aa14.48□□□□□ -0.09
APOBEC3B-204ENST00000407298 LMCD1Q9NZU5 365 aa14.48□□□□□ -0.09
APOBEC3B-204ENST00000407298 MTMR7Q9Y216 660 aa14.48□□□□□ -0.09
APOBEC3B-204ENST00000407298 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP14.48□□□□□ -0.09
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