RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366687.5

CCSAP-203, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,089 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-203ENST00000366687 RABEP2Q9H5N1 569 aa22.21■■□□□ 1.15
CCSAP-203ENST00000366687 MYL1P05976 194 aa22.2■■□□□ 1.15
CCSAP-203ENST00000366687 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.15
CCSAP-203ENST00000366687 RETREG2Q8NC44 543 aa22.2■■□□□ 1.14
CCSAP-203ENST00000366687 HAUS1Q96CS2 278 aa22.2■■□□□ 1.14
CCSAP-203ENST00000366687 EEF2KMTQ96G04 330 aa22.2■■□□□ 1.14
CCSAP-203ENST00000366687 WDR11Q9BZH6 1224 aa22.2■■□□□ 1.14
CCSAP-203ENST00000366687 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
CCSAP-203ENST00000366687 NT5C2P49902 561 aa22.2■■□□□ 1.14
CCSAP-203ENST00000366687 PI16Q6UXB8 463 aa22.2■■□□□ 1.14
CCSAP-203ENST00000366687 GAS2L3Q86XJ1 694 aa22.2■■□□□ 1.14
CCSAP-203ENST00000366687 LCORLQ8N3X6 602 aa22.2■■□□□ 1.14
CCSAP-203ENST00000366687 POMGNT1Q8WZA1 660 aa22.2■■□□□ 1.14
CCSAP-203ENST00000366687 HGSO14964 777 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
CCSAP-203ENST00000366687 MMP1P03956 469 aa22.2■■□□□ 1.14
CCSAP-203ENST00000366687 STX2P32856 288 aa22.2■■□□□ 1.14
CCSAP-203ENST00000366687 ADCY8P40145 1251 aa22.2■■□□□ 1.14
CCSAP-203ENST00000366687 FKBP3Q00688 224 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
CCSAP-203ENST00000366687 ERFEQ4G0M1 354 aa22.2■■□□□ 1.14
CCSAP-203ENST00000366687 PALM2Q8IXS6 379 aa22.2■■□□□ 1.14
CCSAP-203ENST00000366687 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa22.2■■□□□ 1.14
CCSAP-203ENST00000366687 TTC37Q6PGP7 1564 aa22.19■■□□□ 1.14
CCSAP-203ENST00000366687 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
CCSAP-203ENST00000366687 NR2F2P24468 414 aa22.19■■□□□ 1.14
CCSAP-203ENST00000366687 CASP14P31944 242 aa22.19■■□□□ 1.14
CCSAP-203ENST00000366687 PPP2R5AQ15172 486 aa22.19■■□□□ 1.14
CCSAP-203ENST00000366687 NSFP46459 744 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
CCSAP-203ENST00000366687 KRT81Q14533 505 aa22.19■■□□□ 1.14
CCSAP-203ENST00000366687 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
CCSAP-203ENST00000366687 RASGRP4Q8TDF6 673 aa22.19■■□□□ 1.14
CCSAP-203ENST00000366687 MMS19Q96T76 1030 aa22.19■■□□□ 1.14
CCSAP-203ENST00000366687 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
CCSAP-203ENST00000366687 STK17AQ9UEE5 414 aa22.19■■□□□ 1.14
CCSAP-203ENST00000366687 ABCC12Q96J65 1359 aa22.19■■□□□ 1.14
CCSAP-203ENST00000366687 PRKAB2O43741 272 aa22.19■■□□□ 1.14
CCSAP-203ENST00000366687 GAP43P17677 238 aa22.19■■□□□ 1.14
CCSAP-203ENST00000366687 FAM47CQ5HY64 1035 aa22.19■■□□□ 1.14
CCSAP-203ENST00000366687 BSPRYQ5W0U4 402 aa22.19■■□□□ 1.14
CCSAP-203ENST00000366687 FAM160B1Q5W0V3 765 aa22.19■■□□□ 1.14
CCSAP-203ENST00000366687 NCAPG2Q86XI2 1143 aa22.19■■□□□ 1.14
CCSAP-203ENST00000366687 SPICE1Q8N0Z3 855 aa22.19■■□□□ 1.14
CCSAP-203ENST00000366687 RNF8O76064 485 aa22.19■■□□□ 1.14
CCSAP-203ENST00000366687 PTK2Q05397 1052 aa22.19■■□□□ 1.14
CCSAP-203ENST00000366687 GABPAQ06546 454 aa22.19■■□□□ 1.14
CCSAP-203ENST00000366687 SCYL2Q6P3W7 929 aa22.19■■□□□ 1.14
CCSAP-203ENST00000366687 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
CCSAP-203ENST00000366687 SIRT2Q8IXJ6 389 aa22.19■■□□□ 1.14
CCSAP-203ENST00000366687 ARHGEF2Q92974 986 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
CCSAP-203ENST00000366687 P2RX5Q93086 422 aa22.19■■□□□ 1.14
CCSAP-203ENST00000366687 CAPN9O14815 690 aa22.18■■□□□ 1.14
CCSAP-203ENST00000366687 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
CCSAP-203ENST00000366687 STAM2O75886 525 aa22.18■■□□□ 1.14
CCSAP-203ENST00000366687 SASH1O94885 1247 aa22.18■■□□□ 1.14
CCSAP-203ENST00000366687 DPCR1Q3MIW9 517 aa22.18■■□□□ 1.14
CCSAP-203ENST00000366687 GADL1Q6ZQY3 521 aa22.18■■□□□ 1.14
CCSAP-203ENST00000366687 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
CCSAP-203ENST00000366687 CFAP74Q9C0B2 1584 aa22.18■■□□□ 1.14
CCSAP-203ENST00000366687 PHBP35232 272 aa22.18■■□□□ 1.14
CCSAP-203ENST00000366687 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa22.18■■□□□ 1.14
CCSAP-203ENST00000366687 TBCKQ8TEA7 893 aa22.18■■□□□ 1.14
CCSAP-203ENST00000366687 KRT12Q99456 494 aa22.18■■□□□ 1.14
CCSAP-203ENST00000366687 ZSWIM5Q9P217 1185 aa22.18■■□□□ 1.14
CCSAP-203ENST00000366687 TRIM50Q86XT4 487 aa22.18■■□□□ 1.14
CCSAP-203ENST00000366687 TSC1Q92574 1164 aa22.18■■□□□ 1.14
CCSAP-203ENST00000366687 CDC25BP30305 580 aa22.17■■□□□ 1.14
CCSAP-203ENST00000366687 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
CCSAP-203ENST00000366687 NT5C1BQ96P26 610 aa22.17■■□□□ 1.14
CCSAP-203ENST00000366687 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
CCSAP-203ENST00000366687 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
CCSAP-203ENST00000366687 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
CCSAP-203ENST00000366687 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
CCSAP-203ENST00000366687 VPS41P49754 854 aa22.17■■□□□ 1.14
CCSAP-203ENST00000366687 NR5A1Q13285 461 aa22.17■■□□□ 1.14
CCSAP-203ENST00000366687 SLC7A3Q8WY07 619 aa22.17■■□□□ 1.14
CCSAP-203ENST00000366687 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF577Q9BSK1 485 aa22.17■■□□□ 1.14
CCSAP-203ENST00000366687 BEGAINQ9BUH8 593 aa22.17■■□□□ 1.14
CCSAP-203ENST00000366687 VCX3BQ9H321 246 aa22.17■■□□□ 1.14
CCSAP-203ENST00000366687 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
CCSAP-203ENST00000366687 LMNB1P20700 586 aa22.16■■□□□ 1.14
CCSAP-203ENST00000366687 MAN1A1P33908 653 aa22.16■■□□□ 1.14
CCSAP-203ENST00000366687 PCK1P35558 622 aa22.16■■□□□ 1.14
CCSAP-203ENST00000366687 KCTD2Q14681 263 aa22.16■■□□□ 1.14
CCSAP-203ENST00000366687 CLRN2A0PK11 232 aa22.16■■□□□ 1.14
CCSAP-203ENST00000366687 BMP3P12645 472 aa22.16■■□□□ 1.14
CCSAP-203ENST00000366687 ANKRD42Q8N9B4 389 aa22.16■■□□□ 1.14
CCSAP-203ENST00000366687 CDC23Q9UJX2 597 aa22.16■■□□□ 1.14
CCSAP-203ENST00000366687 TACC3Q9Y6A5 838 aa22.16■■□□□ 1.14
CCSAP-203ENST00000366687 NECTIN1Q15223 517 aa22.16■■□□□ 1.14
CCSAP-203ENST00000366687 RNF169Q8NCN4 708 aa22.16■■□□□ 1.14
CCSAP-203ENST00000366687 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa22.16■■□□□ 1.14
CCSAP-203ENST00000366687 CD2APQ9Y5K6 639 aa22.16■■□□□ 1.14
CCSAP-203ENST00000366687 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
CCSAP-203ENST00000366687 A0A1B0GUA9 196 aa22.16■■□□□ 1.14
CCSAP-203ENST00000366687 MYO1FO00160 1098 aa22.16■■□□□ 1.14
CCSAP-203ENST00000366687 TROVE2P10155 538 aaKnown RBP eCLIP22.16■■□□□ 1.14
CCSAP-203ENST00000366687 MFAP3P55082 362 aa22.16■■□□□ 1.14
CCSAP-203ENST00000366687 MAN2A1Q16706 1144 aa22.16■■□□□ 1.14
CCSAP-203ENST00000366687 BBOF1Q8ND07 529 aa22.16■■□□□ 1.14
CCSAP-203ENST00000366687 FAM170AA1A519 330 aa22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 105.4 ms