RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331563.6

PKP3-201, Transcript of plakophilin 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PKP3, Length 2,809 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP3-201ENST00000331563 GCKP35557 465 aa20.14■□□□□ 0.81
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PKP3-201ENST00000331563 ICA1Q05084 483 aa20.14■□□□□ 0.81
PKP3-201ENST00000331563 E2F5Q15329 346 aa20.14■□□□□ 0.81
PKP3-201ENST00000331563 CCDC96Q2M329 555 aa20.14■□□□□ 0.81
PKP3-201ENST00000331563 SPATA4Q8NEY3 305 aa20.14■□□□□ 0.81
PKP3-201ENST00000331563 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
PKP3-201ENST00000331563 RASSF9O75901 435 aa20.13■□□□□ 0.81
PKP3-201ENST00000331563 SLC5A1P13866 664 aa20.13■□□□□ 0.81
PKP3-201ENST00000331563 EZRP15311 586 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
PKP3-201ENST00000331563 ADD2P35612 726 aa20.13■□□□□ 0.81
PKP3-201ENST00000331563 MAGEB6Q8N7X4 407 aa20.13■□□□□ 0.81
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PKP3-201ENST00000331563 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa20.13■□□□□ 0.81
PKP3-201ENST00000331563 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa20.13■□□□□ 0.81
PKP3-201ENST00000331563 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
PKP3-201ENST00000331563 VAV2P52735 878 aa20.13■□□□□ 0.81
PKP3-201ENST00000331563 ZC3H12AQ5D1E8 599 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
PKP3-201ENST00000331563 NLRP14Q86W24 1093 aa20.13■□□□□ 0.81
PKP3-201ENST00000331563 MMGT1Q8N4V1 131 aa20.13■□□□□ 0.81
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PKP3-201ENST00000331563 LY9Q9HBG7 655 aa20.13■□□□□ 0.81
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PKP3-201ENST00000331563 RWDD2AQ9UIY3 292 aa20.13■□□□□ 0.81
PKP3-201ENST00000331563 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
PKP3-201ENST00000331563 ABCC12Q96J65 1359 aa20.13■□□□□ 0.81
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PKP3-201ENST00000331563 PPP1R37O75864 691 aa20.12■□□□□ 0.81
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PKP3-201ENST00000331563 NR1D1P20393 614 aa20.12■□□□□ 0.81
PKP3-201ENST00000331563 SEPT12Q8IYM1 358 aa20.12■□□□□ 0.81
PKP3-201ENST00000331563 IFT81Q8WYA0 676 aa20.12■□□□□ 0.81
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PKP3-201ENST00000331563 PTGISQ16647 500 aa20.12■□□□□ 0.81
PKP3-201ENST00000331563 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
PKP3-201ENST00000331563 C8orf74Q6P047 294 aa20.12■□□□□ 0.81
PKP3-201ENST00000331563 CREG2Q8IUH2 290 aa20.12■□□□□ 0.81
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PKP3-201ENST00000331563 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP20.12■□□□□ 0.811e-6■■■■■ 28.3
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PKP3-201ENST00000331563 C4BP0C0L5 1744 aa20.11■□□□□ 0.81
PKP3-201ENST00000331563 STK36Q9NRP7 1315 aa20.11■□□□□ 0.81
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PKP3-201ENST00000331563 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa20.1■□□□□ 0.81
PKP3-201ENST00000331563 LRWD1Q9UFC0 647 aa20.1■□□□□ 0.81
PKP3-201ENST00000331563 CAPN11Q9UMQ6 739 aa20.1■□□□□ 0.81
PKP3-201ENST00000331563 RPS6KA4O75676 772 aa20.09■□□□□ 0.81
PKP3-201ENST00000331563 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
PKP3-201ENST00000331563 GUCY2FP51841 1108 aa20.09■□□□□ 0.81
PKP3-201ENST00000331563 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
PKP3-201ENST00000331563 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
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