RNA–Protein interactions for RNA: YMR138W

CIN4, Transcript of GTP-binding protein involved in beta-tubulin (Tub2p) folding, yeast

Gene CIN4, Length 576 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CIN4	YMR138W	GCD10	P41814	478 aa		5.78	□□□□□ -1.48
CIN4	YMR138W	GCV1	P48015	400 aa		5.78	□□□□□ -1.48
CIN4	YMR138W	NAS6	P50086	228 aa		5.78	□□□□□ -1.48
CIN4	YMR138W	RTS3	P53289	263 aa		5.78	□□□□□ -1.48
CIN4	YMR138W	GTR2	P53290	341 aa		5.78	□□□□□ -1.48
CIN4	YMR138W	SUB1	P54000	292 aa	Known RBP	5.78	□□□□□ -1.48
CIN4	YMR138W	MRS2	Q01926	470 aa		5.78	□□□□□ -1.48
CIN4	YMR138W	FMN1	Q03778	218 aa		5.78	□□□□□ -1.48
CIN4	YMR138W	EAF1	Q06337	982 aa		5.78	□□□□□ -1.48
CIN4	YMR138W	YLR413W	Q06689	675 aa		5.78	□□□□□ -1.48
CIN4	YMR138W	ATG34	Q12292	412 aa		5.78	□□□□□ -1.48
CIN4	YMR138W	STB3	Q12427	513 aa		5.78	□□□□□ -1.48
CIN4	YMR138W	YPT6	Q99260	215 aa		5.78	□□□□□ -1.48
CIN4	YMR138W	HRP1	Q99383	534 aa	Known RBP	5.78	□□□□□ -1.48
CIN4	YMR138W	GUK1	P15454	187 aa	Known RBP	5.77	□□□□□ -1.49
CIN4	YMR138W	TRM1	P15565	570 aa	Known RBP	5.77	□□□□□ -1.49
CIN4	YMR138W	FUR1	P18562	216 aa	Known RBP	5.77	□□□□□ -1.49
CIN4	YMR138W	DBR1	P24309	405 aa	Known RBP	5.77	□□□□□ -1.49
CIN4	YMR138W	CLB1	P24868	471 aa		5.77	□□□□□ -1.49
CIN4	YMR138W	RNQ1	P25367	405 aa		5.77	□□□□□ -1.49
CIN4	YMR138W	YBR071W	P38243	211 aa		5.77	□□□□□ -1.49
CIN4	YMR138W	RIM11	P38615	370 aa		5.77	□□□□□ -1.49
CIN4	YMR138W	GIC1	P38785	314 aa		5.77	□□□□□ -1.49
CIN4	YMR138W	MRX1	P40050	688 aa		5.77	□□□□□ -1.49
CIN4	YMR138W	MGS1	P40151	587 aa		5.77	□□□□□ -1.49
CIN4	YMR138W	ZIM17	P42844	174 aa		5.77	□□□□□ -1.49
CIN4	YMR138W	COS12	P53053	380 aa		5.77	□□□□□ -1.49
CIN4	YMR138W	SDH1	Q00711	640 aa		5.77	□□□□□ -1.49
CIN4	YMR138W	AAT1	Q01802	451 aa		5.77	□□□□□ -1.49
CIN4	YMR138W	CTK1	Q03957	528 aa	Known RBP	5.77	□□□□□ -1.49
CIN4	YMR138W	YML096W	Q04489	525 aa		5.77	□□□□□ -1.49
CIN4	YMR138W	RIF2	Q06208	395 aa		5.77	□□□□□ -1.49
CIN4	YMR138W	RAD34	Q06665	692 aa		5.77	□□□□□ -1.49
CIN4	YMR138W	NOB1	Q08444	459 aa	Known RBP	5.77	□□□□□ -1.49
CIN4	YMR138W	ATG29	Q12092	213 aa		5.77	□□□□□ -1.49
CIN4	YMR138W	EXO70	P19658	623 aa		5.76	□□□□□ -1.49
CIN4	YMR138W	CDC13	P32797	924 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
CIN4	YMR138W	MRE11	P32829	692 aa		5.76	□□□□□ -1.49
CIN4	YMR138W	SIP2	P34164	415 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
CIN4	YMR138W	FRE2	P36033	711 aa		5.76	□□□□□ -1.49
CIN4	YMR138W	EMC3	P36039	253 aa		5.76	□□□□□ -1.49
CIN4	YMR138W	TRM7	P38238	310 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
CIN4	YMR138W	BZZ1	P38822	633 aa		5.76	□□□□□ -1.49
CIN4	YMR138W	SEC31	P38968	1273 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
CIN4	YMR138W	PRM2	P40534	656 aa		5.76	□□□□□ -1.49
CIN4	YMR138W	SEC27	P41811	889 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
CIN4	YMR138W	FKH2	P41813	862 aa		5.76	□□□□□ -1.49
CIN4	YMR138W	FET5	P43561	622 aa		5.76	□□□□□ -1.49
CIN4	YMR138W	MET12	P46151	657 aa		5.76	□□□□□ -1.49
CIN4	YMR138W	CIS3	P47001	227 aa		5.76	□□□□□ -1.49
CIN4	YMR138W	YJR030C	P47101	745 aa		5.76	□□□□□ -1.49
CIN4	YMR138W	YJR154W	P47181	346 aa		5.76	□□□□□ -1.49
CIN4	YMR138W	HXT16	P47185	567 aa		5.76	□□□□□ -1.49
CIN4	YMR138W	MRM2	P53123	320 aa		5.76	□□□□□ -1.49
CIN4	YMR138W	HXT15	P54854	567 aa		5.76	□□□□□ -1.49
CIN4	YMR138W	EGD1	Q02642	157 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
CIN4	YMR138W	GIP3	Q03016	1276 aa		5.76	□□□□□ -1.49
CIN4	YMR138W	YMR111C	Q04461	462 aa	Predicted RBP	5.76	□□□□□ -1.49
CIN4	YMR138W	GLO2	Q05584	274 aa		5.76	□□□□□ -1.49
CIN4	YMR138W	TFB4	Q12004	338 aa		5.76	□□□□□ -1.49
CIN4	YMR138W	PIN2	Q12057	282 aa		5.76	□□□□□ -1.49
CIN4	YMR138W	MHT1	Q12525	324 aa		5.76	□□□□□ -1.49
CIN4	YMR138W	PRT1	P06103	763 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
CIN4	YMR138W	PRP2	P20095	876 aa	Predicted RBP	5.75	□□□□□ -1.49
CIN4	YMR138W	BAS1	P22035	811 aa		5.75	□□□□□ -1.49
CIN4	YMR138W	PHO87	P25360	923 aa		5.75	□□□□□ -1.49
CIN4	YMR138W	OCA4	P25366	362 aa		5.75	□□□□□ -1.49
CIN4	YMR138W	BUB2	P26448	306 aa	Predicted RBP	5.75	□□□□□ -1.49
CIN4	YMR138W	COX13	P32799	129 aa		5.75	□□□□□ -1.49
CIN4	YMR138W	CBF5	P33322	483 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.75	□□□□□ -1.49	not detected
CIN4	YMR138W	SDH3	P33421	198 aa		5.75	□□□□□ -1.49
CIN4	YMR138W	DEF1	P35732	738 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
CIN4	YMR138W	YHR033W	P38690	423 aa		5.75	□□□□□ -1.49
CIN4	YMR138W	ARN1	P38731	627 aa		5.75	□□□□□ -1.49
CIN4	YMR138W	MET18	P40469	1032 aa		5.75	□□□□□ -1.49
CIN4	YMR138W	YPS6	P40583	537 aa		5.75	□□□□□ -1.49
CIN4	YMR138W	YGL176C	P46945	554 aa		5.75	□□□□□ -1.49
CIN4	YMR138W	NOP19	P53317	196 aa	Predicted RBP	5.75	□□□□□ -1.49
CIN4	YMR138W	MPS1	P54199	764 aa		5.75	□□□□□ -1.49
CIN4	YMR138W	OPT2	Q06593	877 aa		5.75	□□□□□ -1.49
CIN4	YMR138W	IOC2	Q12072	812 aa		5.75	□□□□□ -1.49
CIN4	YMR138W	RTK1	Q12100	620 aa	Predicted RBP	5.75	□□□□□ -1.49
CIN4	YMR138W	YLR049C	Q12110	428 aa		5.75	□□□□□ -1.49
CIN4	YMR138W	BRR1	Q99177	341 aa	Predicted RBP	5.75	□□□□□ -1.49
CIN4	YMR138W	RPL40A	P0CH08	128 aa	Known RBP	5.74	□□□□□ -1.49
CIN4	YMR138W	RPL40B	P0CH09	128 aa	Known RBP	5.74	□□□□□ -1.49
CIN4	YMR138W	ART10	P18634	518 aa	Known RBP	5.74	□□□□□ -1.49
CIN4	YMR138W	SLM5	P25345	492 aa	Known RBP	5.74	□□□□□ -1.49
CIN4	YMR138W	PHO91	P27514	894 aa		5.74	□□□□□ -1.49
CIN4	YMR138W	HXT4	P32467	576 aa		5.74	□□□□□ -1.49
CIN4	YMR138W	KKQ8	P36004	724 aa		5.74	□□□□□ -1.49
CIN4	YMR138W	ARA1	P38115	344 aa		5.74	□□□□□ -1.49
CIN4	YMR138W	HEK2	P38199	381 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.74	□□□□□ -1.49	RIP-Chip
CIN4	YMR138W	INM1	P38710	295 aa		5.74	□□□□□ -1.49
CIN4	YMR138W	HXT6	P39003	570 aa	Known RBP	5.74	□□□□□ -1.49
CIN4	YMR138W	HXT7	P39004	570 aa		5.74	□□□□□ -1.49
CIN4	YMR138W	YEN1	P40028	759 aa		5.74	□□□□□ -1.49
CIN4	YMR138W	LRO1	P40345	661 aa		5.74	□□□□□ -1.49
CIN4	YMR138W	YRB1	P41920	201 aa	Known RBP	5.74	□□□□□ -1.49
CIN4	YMR138W	CUS2	P53830	285 aa	Predicted RBP	5.74	□□□□□ -1.49

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