RNA–Protein interactions for RNA: YKR081C

RPF2, Transcript of Essential protein involved in rRNA maturation and ribosomal assembly, yeast

Gene RPF2, Length 1,035 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RPF2	YKR081C	PEP5	P12868	1029 aa		4.14	□□□□□ -1.75
RPF2	YKR081C	MTF1	P14908	341 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
RPF2	YKR081C	SUI2	P20459	304 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
RPF2	YKR081C	CHS3	P29465	1165 aa		4.14	□□□□□ -1.75
RPF2	YKR081C	SSH4	P32343	579 aa		4.14	□□□□□ -1.75
RPF2	YKR081C	NDC1	P32500	655 aa		4.14	□□□□□ -1.75
RPF2	YKR081C	SSE2	P32590	693 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
RPF2	YKR081C	PTR2	P32901	601 aa		4.14	□□□□□ -1.75
RPF2	YKR081C	SIP2	P34164	415 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
RPF2	YKR081C	RPL32	P38061	130 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
RPF2	YKR081C	YBL029W	P38201	376 aa		4.14	□□□□□ -1.75
RPF2	YKR081C	YHR218W	P38899	603 aa		4.14	□□□□□ -1.75
RPF2	YKR081C	SNG1	P46950	547 aa		4.14	□□□□□ -1.75
RPF2	YKR081C	ALT2	P52892	507 aa		4.14	□□□□□ -1.75
RPF2	YKR081C	MEP3	P53390	489 aa		4.14	□□□□□ -1.75
RPF2	YKR081C	YML037C	Q03703	340 aa		4.14	□□□□□ -1.75
RPF2	YKR081C	YMR087W	Q04299	284 aa		4.14	□□□□□ -1.75
RPF2	YKR081C	LUC7	Q07508	261 aa	Predicted RBP	4.14	□□□□□ -1.75
RPF2	YKR081C	SET6	Q12529	373 aa		4.14	□□□□□ -1.75
RPF2	YKR081C	KAR3	P17119	729 aa		4.13	□□□□□ -1.75
RPF2	YKR081C	SGF29	P25554	259 aa		4.13	□□□□□ -1.75
RPF2	YKR081C	YBR144C	P34215	104 aa		4.13	□□□□□ -1.75
RPF2	YKR081C	RPH1	P39956	796 aa		4.13	□□□□□ -1.75
RPF2	YKR081C	YJL213W	P40896	331 aa		4.13	□□□□□ -1.75
RPF2	YKR081C	YGR126W	P53274	230 aa		4.13	□□□□□ -1.75
RPF2	YKR081C	MSC1	Q03104	513 aa		4.13	□□□□□ -1.75
RPF2	YKR081C	GDH1	P07262	454 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
RPF2	YKR081C	YCK1	P23291	538 aa		4.12	□□□□□ -1.75
RPF2	YKR081C	CIN4	P39110	191 aa		4.12	□□□□□ -1.75
RPF2	YKR081C	YKU80	Q04437	629 aa		4.12	□□□□□ -1.75
RPF2	YKR081C	FMP40	Q08968	688 aa	Predicted RBP	4.12	□□□□□ -1.75
RPF2	YKR081C	CAR1	P00812	333 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
RPF2	YKR081C	CDC16	P09798	840 aa		4.11	□□□□□ -1.75
RPF2	YKR081C	APE1	P14904	514 aa		4.11	□□□□□ -1.75
RPF2	YKR081C	SGV1	P23293	657 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
RPF2	YKR081C	SPC110	P32380	944 aa		4.11	□□□□□ -1.75
RPF2	YKR081C	YBR139W	P38109	508 aa		4.11	□□□□□ -1.75
RPF2	YKR081C	OSH3	P38713	996 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
RPF2	YKR081C	AFG3	P39925	761 aa		4.11	□□□□□ -1.75
RPF2	YKR081C	RPR2	P40571	144 aa		4.11	□□□□□ -1.75
RPF2	YKR081C	LYS14	P40971	790 aa		4.11	□□□□□ -1.75
RPF2	YKR081C	YFR016C	P43597	1233 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
RPF2	YKR081C	YJR154W	P47181	346 aa		4.11	□□□□□ -1.75
RPF2	YKR081C	COS10	P52924	374 aa		4.11	□□□□□ -1.75
RPF2	YKR081C	DSD1	P53095	428 aa		4.11	□□□□□ -1.75
RPF2	YKR081C	SPE4	Q12455	300 aa		4.11	□□□□□ -1.75
RPF2	YKR081C	NOP58	Q12499	511 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
RPF2	YKR081C	YBR126W-A	Q8TGU7	68 aa		4.11	□□□□□ -1.75
RPF2	YKR081C	AMD1	P15274	810 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
RPF2	YKR081C	POL4	P25615	582 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RPF2	YKR081C	ATS1	P31386	333 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RPF2	YKR081C	YHR210C	P38893	341 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RPF2	YKR081C	VPS52	P39904	641 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RPF2	YKR081C	YJL132W	P47014	750 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RPF2	YKR081C	BUD32	P53323	261 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RPF2	YKR081C	TLG2	Q08144	397 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RPF2	YKR081C	NCE102	Q12207	173 aa	RIP-Chip data	4.1	□□□□□ -1.75	not detected
RPF2	YKR081C	CBS2	P14905	389 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RPF2	YKR081C	MCK1	P21965	375 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
RPF2	YKR081C	MCM10	P32354	571 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RPF2	YKR081C	YOX1	P34161	385 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RPF2	YKR081C	UBP11	P36026	717 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RPF2	YKR081C	YBP1	P38315	674 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RPF2	YKR081C	SYO1	Q07395	620 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RPF2	YKR081C	YOR365C	Q08844	703 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RPF2	YKR081C	HUA2	Q12134	243 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RPF2	YKR081C	YDL009C	Q12210	107 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RPF2	YKR081C	RPL20A	P0CX23	172 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
RPF2	YKR081C	RPL20B	P0CX24	172 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
RPF2	YKR081C	AGA1	P32323	725 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RPF2	YKR081C	SAC6	P32599	642 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
RPF2	YKR081C	MTC4	P38335	694 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
RPF2	YKR081C	YEL068C	P39977	110 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RPF2	YKR081C	DUO1	P53168	247 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
RPF2	YKR081C	BNA5	Q05979	453 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RPF2	YKR081C	YDL057W	Q07379	328 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RPF2	YKR081C	RSA1	Q08932	381 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RPF2	YKR081C	AYT1	Q12226	474 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RPF2	YKR081C	ART10	P18634	518 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
RPF2	YKR081C	YCR007C	P25354	239 aa		4.07	□□□□□ -1.76
RPF2	YKR081C	SDS24	P38314	527 aa		4.07	□□□□□ -1.76
RPF2	YKR081C	CCT6	P39079	546 aa		4.07	□□□□□ -1.76
RPF2	YKR081C	NPR2	P39923	615 aa		4.07	□□□□□ -1.76
RPF2	YKR081C	SCD6	P45978	349 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.07	□□□□□ -1.76	not detected
RPF2	YKR081C	LCL3	P53153	274 aa		4.07	□□□□□ -1.76
RPF2	YKR081C	BOR1	P53838	576 aa		4.07	□□□□□ -1.76
RPF2	YKR081C	RLI1	Q03195	608 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
RPF2	YKR081C	MRPL51	Q06090	140 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
RPF2	YKR081C	SGS1	P35187	1447 aa		4.06	□□□□□ -1.76
RPF2	YKR081C	PEP4	P07267	405 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
RPF2	YKR081C	ATR1	P13090	542 aa		4.06	□□□□□ -1.76
RPF2	YKR081C	MUD2	P36084	527 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
RPF2	YKR081C	AVT5	P38176	459 aa		4.06	□□□□□ -1.76
RPF2	YKR081C	FLC2	P39719	783 aa		4.06	□□□□□ -1.76
RPF2	YKR081C	ALK1	P43633	760 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
RPF2	YKR081C	VID30	P53076	958 aa		4.06	□□□□□ -1.76
RPF2	YKR081C	DRN1	P53255	507 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
RPF2	YKR081C	NGL3	Q03210	505 aa		4.06	□□□□□ -1.76
RPF2	YKR081C	SLD5	Q03406	294 aa		4.06	□□□□□ -1.76
RPF2	YKR081C	NMD4	Q12129	218 aa		4.06	□□□□□ -1.76

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 14.4 ms