RNA–Protein interactions for RNA: YHR135C

YCK1, Transcript of Palmitoylated plasma membrane-bound casein kinase I (CK1) isoform, yeast

Gene YCK1, Length 1,617 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YCK1	YHR135C	FRE4	P53746	719 aa		6.07	□□□□□ -1.44
YCK1	YHR135C	IPI3	P53877	555 aa		6.07	□□□□□ -1.44
YCK1	YHR135C	SLM2	P53955	656 aa		6.07	□□□□□ -1.44
YCK1	YHR135C	PRO2	P54885	456 aa	Known RBP	6.07	□□□□□ -1.44
YCK1	YHR135C	TOF2	Q02208	771 aa		6.07	□□□□□ -1.44
YCK1	YHR135C	SEG1	Q04279	960 aa		6.07	□□□□□ -1.44
YCK1	YHR135C	HFD1	Q04458	532 aa		6.07	□□□□□ -1.44
YCK1	YHR135C	RCO1	Q04779	684 aa		6.07	□□□□□ -1.44
YCK1	YHR135C	ASA1	Q06822	443 aa		6.07	□□□□□ -1.44
YCK1	YHR135C	HRK1	Q08732	759 aa	Known RBP	6.07	□□□□□ -1.44
YCK1	YHR135C	SLF1	Q12034	447 aa	Known RBP	6.07	□□□□□ -1.44
YCK1	YHR135C	AHC1	Q12433	566 aa		6.07	□□□□□ -1.44
YCK1	YHR135C	GUK1	P15454	187 aa	Known RBP	6.06	□□□□□ -1.44
YCK1	YHR135C	PMA2	P19657	947 aa		6.06	□□□□□ -1.44
YCK1	YHR135C	BUB2	P26448	306 aa	Predicted RBP	6.06	□□□□□ -1.44
YCK1	YHR135C	LRG1	P35688	1017 aa		6.06	□□□□□ -1.44
YCK1	YHR135C	ARN1	P38731	627 aa		6.06	□□□□□ -1.44
YCK1	YHR135C	TIM17	P39515	158 aa		6.06	□□□□□ -1.44
YCK1	YHR135C	EXO1	P39875	702 aa		6.06	□□□□□ -1.44
YCK1	YHR135C	SCS2	P40075	244 aa	Known RBP	6.06	□□□□□ -1.44
YCK1	YHR135C	RLP7	P40693	322 aa	Known RBP	6.06	□□□□□ -1.44
YCK1	YHR135C	GTS1	P40956	396 aa		6.06	□□□□□ -1.44
YCK1	YHR135C	SIP4	P46954	829 aa		6.06	□□□□□ -1.44
YCK1	YHR135C	VEL1	P53058	206 aa		6.06	□□□□□ -1.44
YCK1	YHR135C	EMC4	P53073	190 aa		6.06	□□□□□ -1.44
YCK1	YHR135C	CLD1	P53264	445 aa		6.06	□□□□□ -1.44
YCK1	YHR135C	NOP19	P53317	196 aa	Predicted RBP	6.06	□□□□□ -1.44
YCK1	YHR135C	YPL014W	Q02606	381 aa		6.06	□□□□□ -1.44
YCK1	YHR135C	NHP10	Q03435	203 aa		6.06	□□□□□ -1.44
YCK1	YHR135C	TRM12	Q04235	462 aa		6.06	□□□□□ -1.44
YCK1	YHR135C	YPR114W	Q06107	315 aa		6.06	□□□□□ -1.44
YCK1	YHR135C	IRC10	Q08118	586 aa		6.06	□□□□□ -1.44
YCK1	YHR135C	YOL019W	Q08157	551 aa		6.06	□□□□□ -1.44
YCK1	YHR135C	HUA2	Q12134	243 aa		6.06	□□□□□ -1.44
YCK1	YHR135C	YVC1	Q12324	675 aa		6.06	□□□□□ -1.44
YCK1	YHR135C	CMR1	Q12510	522 aa	Known RBP	6.06	□□□□□ -1.44
YCK1	YHR135C	HSH49	Q99181	213 aa	Predicted RBP	6.06	□□□□□ -1.44
YCK1	YHR135C	ATP2	P00830	511 aa	Known RBP	6.05	□□□□□ -1.44
YCK1	YHR135C	HEM2	P05373	342 aa		6.05	□□□□□ -1.44
YCK1	YHR135C	SGF29	P25554	259 aa		6.05	□□□□□ -1.44
YCK1	YHR135C	DPH5	P32469	300 aa	Predicted RBP	6.05	□□□□□ -1.44
YCK1	YHR135C	PEX28	P38848	579 aa		6.05	□□□□□ -1.44
YCK1	YHR135C	DHH1	P39517	506 aa	Known RBP	6.05	□□□□□ -1.44
YCK1	YHR135C	ARB1	P40024	610 aa	Known RBP	6.05	□□□□□ -1.44
YCK1	YHR135C	CCT7	P42943	550 aa	Known RBP	6.05	□□□□□ -1.44
YCK1	YHR135C	GCD14	P46959	383 aa	Predicted RBP	6.05	□□□□□ -1.44
YCK1	YHR135C	AIM23	P47015	356 aa		6.05	□□□□□ -1.44
YCK1	YHR135C	EFM5	P53200	248 aa	Known RBP	6.05	□□□□□ -1.44
YCK1	YHR135C	NMA2	P53204	395 aa		6.05	□□□□□ -1.44
YCK1	YHR135C	GTR2	P53290	341 aa		6.05	□□□□□ -1.44
YCK1	YHR135C	TMN2	Q04562	672 aa		6.05	□□□□□ -1.44
YCK1	YHR135C	NUT2	Q06213	157 aa		6.05	□□□□□ -1.44
YCK1	YHR135C	CDA1	Q06702	301 aa		6.05	□□□□□ -1.44
YCK1	YHR135C	VAM6	Q07468	1049 aa		6.05	□□□□□ -1.44
YCK1	YHR135C	YAK1	P14680	807 aa		6.04	□□□□□ -1.44
YCK1	YHR135C	PDX3	P38075	228 aa	Known RBP	6.04	□□□□□ -1.44
YCK1	YHR135C	YBR259W	P38338	688 aa		6.04	□□□□□ -1.44
YCK1	YHR135C	SAF1	P38352	637 aa		6.04	□□□□□ -1.44
YCK1	YHR135C	HEM14	P40012	539 aa		6.04	□□□□□ -1.44
YCK1	YHR135C	RMD8	P43620	662 aa		6.04	□□□□□ -1.44
YCK1	YHR135C	PET130	P47065	347 aa		6.04	□□□□□ -1.44
YCK1	YHR135C	MNT2	P53059	558 aa		6.04	□□□□□ -1.44
YCK1	YHR135C	YGR016W	P53209	190 aa		6.04	□□□□□ -1.44
YCK1	YHR135C	YGR053C	P53234	283 aa		6.04	□□□□□ -1.44
YCK1	YHR135C	ARC35	P53731	342 aa	Known RBP	6.04	□□□□□ -1.44
YCK1	YHR135C	PEX13	P80667	386 aa		6.04	□□□□□ -1.44
YCK1	YHR135C	YML131W	Q03102	365 aa		6.04	□□□□□ -1.44
YCK1	YHR135C	NSE5	Q03718	556 aa		6.04	□□□□□ -1.44
YCK1	YHR135C	ATG26	Q06321	1198 aa		6.04	□□□□□ -1.44
YCK1	YHR135C	RSB1	Q08417	382 aa		6.04	□□□□□ -1.44
YCK1	YHR135C	GPB1	Q08886	897 aa		6.04	□□□□□ -1.44
YCK1	YHR135C	YLR049C	Q12110	428 aa		6.04	□□□□□ -1.44
YCK1	YHR135C	PER33	Q12144	273 aa		6.04	□□□□□ -1.44
YCK1	YHR135C	TUB1	P09733	447 aa	Known RBP	6.03	□□□□□ -1.44
YCK1	YHR135C	COS2	P0CX12	379 aa		6.03	□□□□□ -1.44
YCK1	YHR135C	COS3	P0CX13	379 aa		6.03	□□□□□ -1.44
YCK1	YHR135C	REV1	P12689	985 aa		6.03	□□□□□ -1.44
YCK1	YHR135C	BUD14	P27637	709 aa		6.03	□□□□□ -1.44
YCK1	YHR135C	COQ2	P32378	372 aa		6.03	□□□□□ -1.44
YCK1	YHR135C	MPT5	P39016	859 aa	Known RBP RIP-Chip data	6.03	□□□□□ -1.44	not detected
YCK1	YHR135C	MET18	P40469	1032 aa		6.03	□□□□□ -1.44
YCK1	YHR135C	IRR1	P40541	1150 aa		6.03	□□□□□ -1.44
YCK1	YHR135C	YIL001W	P40560	513 aa		6.03	□□□□□ -1.44
YCK1	YHR135C	FKH2	P41813	862 aa		6.03	□□□□□ -1.44
YCK1	YHR135C	IME4	P41833	600 aa		6.03	□□□□□ -1.44
YCK1	YHR135C	COS4	P43542	379 aa		6.03	□□□□□ -1.44
YCK1	YHR135C	NOP9	P47077	666 aa	Known RBP	6.03	□□□□□ -1.44
YCK1	YHR135C	YJR124C	P47159	448 aa		6.03	□□□□□ -1.44
YCK1	YHR135C	PRM1	P53835	661 aa		6.03	□□□□□ -1.44
YCK1	YHR135C	ORC3	P54790	616 aa		6.03	□□□□□ -1.44
YCK1	YHR135C	RPM2	Q02773	1202 aa		6.03	□□□□□ -1.44
YCK1	YHR135C	SSL1	Q04673	461 aa	Predicted RBP	6.03	□□□□□ -1.44
YCK1	YHR135C	DYN3	Q04949	312 aa		6.03	□□□□□ -1.44
YCK1	YHR135C	RUP1	Q12242	671 aa		6.03	□□□□□ -1.44
YCK1	YHR135C	ADF1	Q2V2Q1	113 aa		6.03	□□□□□ -1.44
YCK1	YHR135C	PHO5	P00635	467 aa		6.03	□□□□□ -1.44
YCK1	YHR135C	GCD2	P12754	651 aa	Predicted RBP	6.03	□□□□□ -1.44
YCK1	YHR135C	SEC63	P14906	663 aa		6.03	□□□□□ -1.44
YCK1	YHR135C	CCA1	P21269	546 aa		6.03	□□□□□ -1.44
YCK1	YHR135C	DBR1	P24309	405 aa	Known RBP	6.03	□□□□□ -1.44

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