RNA–Protein interactions for RNA: YER104W

RTT105, Transcript of Protein with a role in regulation of Ty1 transposition, yeast

Gene RTT105, Length 627 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RTT105	YER104W	MRK1	P50873	501 aa		3.13	□□□□□ -1.91
RTT105	YER104W	HOT1	Q03213	719 aa		3.13	□□□□□ -1.91
RTT105	YER104W	PDS5	Q04264	1277 aa		3.13	□□□□□ -1.91
RTT105	YER104W	HRD3	Q05787	833 aa		3.13	□□□□□ -1.91
RTT105	YER104W	SLK19	Q08581	821 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
RTT105	YER104W	LEA1	Q08963	238 aa	Predicted RBP	3.13	□□□□□ -1.91
RTT105	YER104W	KEL3	Q08979	651 aa	Predicted RBP	3.13	□□□□□ -1.91
RTT105	YER104W	AHA1	Q12449	350 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
RTT105	YER104W	HIP1	P06775	603 aa		3.12	□□□□□ -1.91
RTT105	YER104W	PET111	P08468	800 aa		3.12	□□□□□ -1.91
RTT105	YER104W	RPL1A	P0CX43	217 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
RTT105	YER104W	RPL1B	P0CX44	217 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
RTT105	YER104W	PTC6	P25646	442 aa		3.12	□□□□□ -1.91
RTT105	YER104W	IDH2	P28241	369 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
RTT105	YER104W	TUL1	P36096	758 aa		3.12	□□□□□ -1.91
RTT105	YER104W	NUP133	P36161	1157 aa		3.12	□□□□□ -1.91
RTT105	YER104W	THI2	P38141	450 aa		3.12	□□□□□ -1.91
RTT105	YER104W	SLM4	P38247	162 aa		3.12	□□□□□ -1.91
RTT105	YER104W	GDT1	P38301	280 aa	Predicted RBP	3.12	□□□□□ -1.91
RTT105	YER104W	NTC20	P38302	140 aa	Predicted RBP	3.12	□□□□□ -1.91
RTT105	YER104W	MSR1	P38714	643 aa		3.12	□□□□□ -1.91
RTT105	YER104W	YGL117W	P53133	265 aa		3.12	□□□□□ -1.91
RTT105	YER104W	TOF1	P53840	1238 aa		3.12	□□□□□ -1.91
RTT105	YER104W	YNL144C	P53907	740 aa		3.12	□□□□□ -1.91
RTT105	YER104W	SKO1	Q02100	647 aa		3.12	□□□□□ -1.91
RTT105	YER104W	SEG1	Q04279	960 aa		3.12	□□□□□ -1.91
RTT105	YER104W	RRP45	Q05636	305 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
RTT105	YER104W	MMR1	Q06324	491 aa		3.12	□□□□□ -1.91
RTT105	YER104W	RTT109	Q07794	436 aa		3.12	□□□□□ -1.91
RTT105	YER104W	DCI1	Q08558	271 aa		3.12	□□□□□ -1.91
RTT105	YER104W	FRE3	Q08905	711 aa		3.12	□□□□□ -1.91
RTT105	YER104W	APL4	Q12028	832 aa		3.12	□□□□□ -1.91
RTT105	YER104W	REX3	Q12090	404 aa		3.12	□□□□□ -1.91
RTT105	YER104W	CFT2	Q12102	859 aa	Predicted RBP	3.12	□□□□□ -1.91
RTT105	YER104W	YMR084W	A2P2R3	262 aa		3.11	□□□□□ -1.91
RTT105	YER104W	RPL7A	P05737	244 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
RTT105	YER104W	MRP2	P10663	115 aa	Predicted RBP	3.11	□□□□□ -1.91
RTT105	YER104W	HOM2	P13663	365 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
RTT105	YER104W	NOP1	P15646	327 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
RTT105	YER104W	YJU2	P28320	278 aa	Predicted RBP	3.11	□□□□□ -1.91
RTT105	YER104W	YEL043W	P32618	956 aa		3.11	□□□□□ -1.91
RTT105	YER104W	SIF2	P38262	535 aa		3.11	□□□□□ -1.91
RTT105	YER104W	ICS2	P38284	255 aa		3.11	□□□□□ -1.91
RTT105	YER104W	TSC10	P38342	320 aa		3.11	□□□□□ -1.91
RTT105	YER104W	CIN4	P39110	191 aa		3.11	□□□□□ -1.91
RTT105	YER104W	TDA10	P42938	290 aa		3.11	□□□□□ -1.91
RTT105	YER104W	YFL015C	P43578	164 aa		3.11	□□□□□ -1.91
RTT105	YER104W	NET1	P47035	1189 aa		3.11	□□□□□ -1.91
RTT105	YER104W	BNA3	P47039	444 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
RTT105	YER104W	MDE1	P47095	244 aa		3.11	□□□□□ -1.91
RTT105	YER104W	YGR149W	P48236	432 aa		3.11	□□□□□ -1.91
RTT105	YER104W	FMS1	P50264	508 aa		3.11	□□□□□ -1.91
RTT105	YER104W	YGL138C	P53122	345 aa		3.11	□□□□□ -1.91
RTT105	YER104W	ERG26	P53199	349 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
RTT105	YER104W	CAF130	P53280	1122 aa	Predicted RBP	3.11	□□□□□ -1.91
RTT105	YER104W	NCS2	P53923	493 aa	Predicted RBP	3.11	□□□□□ -1.91
RTT105	YER104W	YNL058C	P53947	316 aa		3.11	□□□□□ -1.91
RTT105	YER104W	ADA2	Q02336	434 aa		3.11	□□□□□ -1.91
RTT105	YER104W	YMR178W	Q03219	274 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
RTT105	YER104W	VTI1	Q04338	217 aa		3.11	□□□□□ -1.91
RTT105	YER104W	HEL2	Q05580	639 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
RTT105	YER104W	UAF30	Q08747	228 aa		3.11	□□□□□ -1.91
RTT105	YER104W	MED2	Q12124	431 aa		3.11	□□□□□ -1.91
RTT105	YER104W	RPL7B	Q12213	244 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
RTT105	YER104W	RPL6B	P05739	176 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
RTT105	YER104W	RPL31B	P0C2H9	113 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
RTT105	YER104W	RAP1	P11938	827 aa		3.1	□□□□□ -1.91
RTT105	YER104W	GLK1	P17709	500 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
RTT105	YER104W	PPH22	P23595	377 aa		3.1	□□□□□ -1.91
RTT105	YER104W	PTP1	P25044	335 aa		3.1	□□□□□ -1.91
RTT105	YER104W	PHO84	P25297	587 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
RTT105	YER104W	BUD5	P25300	642 aa	Predicted RBP	3.1	□□□□□ -1.91
RTT105	YER104W	GYP6	P32806	458 aa		3.1	□□□□□ -1.91
RTT105	YER104W	DBP8	P38719	431 aa		3.1	□□□□□ -1.91
RTT105	YER104W	GND1	P38720	489 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
RTT105	YER104W	YJL107C	P42947	387 aa		3.1	□□□□□ -1.91
RTT105	YER104W	COS5	P47187	383 aa		3.1	□□□□□ -1.91
RTT105	YER104W	ASN1	P49089	572 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
RTT105	YER104W	MLC1	P53141	149 aa		3.1	□□□□□ -1.91
RTT105	YER104W	RPL6A	Q02326	176 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
RTT105	YER104W	ACL4	Q03771	387 aa		3.1	□□□□□ -1.91
RTT105	YER104W	TAP42	Q04372	366 aa		3.1	□□□□□ -1.91
RTT105	YER104W	MGR3	Q04472	501 aa		3.1	□□□□□ -1.91
RTT105	YER104W	RRP9	Q06506	573 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
RTT105	YER104W	RAD34	Q06665	692 aa		3.1	□□□□□ -1.91
RTT105	YER104W	CYK3	Q07533	885 aa		3.1	□□□□□ -1.91
RTT105	YER104W	COS7	Q07788	383 aa		3.1	□□□□□ -1.91
RTT105	YER104W	TEN1	Q07921	160 aa		3.1	□□□□□ -1.91
RTT105	YER104W	CDC45	Q08032	650 aa		3.1	□□□□□ -1.91
RTT105	YER104W	LPD1	P09624	499 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.91
RTT105	YER104W	SPS4	P09937	338 aa		3.09	□□□□□ -1.91
RTT105	YER104W	KRS1	P15180	591 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.91
RTT105	YER104W	SRV2	P17555	526 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.91
RTT105	YER104W	PMA2	P19657	947 aa		3.09	□□□□□ -1.91
RTT105	YER104W	ELO2	P25358	347 aa		3.09	□□□□□ -1.91
RTT105	YER104W	RPL32	P38061	130 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.91
RTT105	YER104W	ADH5	P38113	351 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.91
RTT105	YER104W	WSS1	P38838	269 aa		3.09	□□□□□ -1.91
RTT105	YER104W	MEP2	P41948	499 aa		3.09	□□□□□ -1.91
RTT105	YER104W	FET5	P43561	622 aa		3.09	□□□□□ -1.91

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