RNA–Protein interactions for RNA: YBR103W

SIF2, Transcript of WD40 repeat-containing subunit of Set3C histone deacetylase complex, yeast

Gene SIF2, Length 1,608 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SIF2	YBR103W	GLO2	Q05584	274 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SIF2	YBR103W	CRN1	Q06440	651 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SIF2	YBR103W	CDD1	Q06549	142 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SIF2	YBR103W	IWR1	Q07532	353 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SIF2	YBR103W	SGO1	Q08490	590 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SIF2	YBR103W	HRK1	Q08732	759 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SIF2	YBR103W	BAG7	Q12128	409 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SIF2	YBR103W	DBP10	Q12389	995 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SIF2	YBR103W	APM4	Q99186	491 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SIF2	YBR103W	CHS1	P08004	1131 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SIF2	YBR103W	KIN2	P13186	1147 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SIF2	YBR103W	KSS1	P14681	368 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SIF2	YBR103W	ILV6	P25605	309 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SIF2	YBR103W	SEC65	P29478	273 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SIF2	YBR103W	LRG1	P35688	1017 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SIF2	YBR103W	HSL7	P38274	827 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SIF2	YBR103W	TSL1	P38427	1098 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SIF2	YBR103W	AVT6	P40074	448 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SIF2	YBR103W	YER158C	P40095	573 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SIF2	YBR103W	YIR016W	P40572	265 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SIF2	YBR103W	CCH1	P50077	2039 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SIF2	YBR103W	RMR1	P53060	241 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SIF2	YBR103W	PEF1	P53238	335 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SIF2	YBR103W	NGL3	Q03210	505 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SIF2	YBR103W	URC2	Q04411	772 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SIF2	YBR103W	SPE3	Q12074	293 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SIF2	YBR103W	RIB2	Q12362	591 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SIF2	YBR103W	ITR1	P30605	584 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SIF2	YBR103W	YBL010C	P32788	280 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SIF2	YBR103W	RPT5	P33297	434 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SIF2	YBR103W	AST1	P35183	429 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SIF2	YBR103W	YKL151C	P36059	337 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SIF2	YBR103W	PXL1	P36166	706 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SIF2	YBR103W	SDH8	P38345	138 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SIF2	YBR103W	YTA12	P40341	825 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SIF2	YBR103W	SHQ1	P40486	507 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SIF2	YBR103W	TED1	P40533	473 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SIF2	YBR103W	MAF1	P41910	395 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SIF2	YBR103W	CPR7	P47103	393 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SIF2	YBR103W	CUZ1	P53899	274 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SIF2	YBR103W	MAP1	Q01662	387 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.93	□□□□□ -1.62	not detected
SIF2	YBR103W	FMP42	Q04991	504 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SIF2	YBR103W	YLR297W	Q05899	129 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SIF2	YBR103W	OPT2	Q06593	877 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SIF2	YBR103W	YDL114W	Q07530	308 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SIF2	YBR103W	YDL109C	Q12103	647 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SIF2	YBR103W	RRP36	Q12481	300 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SIF2	YBR103W	GAL10	P04397	699 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SIF2	YBR103W	ERS1	P17261	260 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SIF2	YBR103W	SRV2	P17555	526 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SIF2	YBR103W	RNR1	P21524	888 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SIF2	YBR103W	MRPL8	P22353	238 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SIF2	YBR103W	PGS1	P25578	521 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SIF2	YBR103W	KRR1	P25586	316 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SIF2	YBR103W	CCR4	P31384	837 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SIF2	YBR103W	XRS2	P33301	854 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SIF2	YBR103W	YET1	P35723	206 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SIF2	YBR103W	NNK1	P36003	928 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SIF2	YBR103W	NAT2	P37293	288 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SIF2	YBR103W	AGP2	P38090	596 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SIF2	YBR103W	MAK5	P38112	773 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SIF2	YBR103W	SHE3	P38272	425 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SIF2	YBR103W	SSP120	P39931	234 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SIF2	YBR103W	RPH1	P39956	796 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SIF2	YBR103W	DSE1	P40077	573 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SIF2	YBR103W	DDI1	P40087	428 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SIF2	YBR103W	MOB1	P40484	314 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SIF2	YBR103W	TRF5	P48561	642 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SIF2	YBR103W	SCW11	P53189	542 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SIF2	YBR103W	YGR016W	P53209	190 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SIF2	YBR103W	YGR111W	P53265	400 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SIF2	YBR103W	ZRG17	P53735	605 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SIF2	YBR103W	YHM2	Q04013	314 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SIF2	YBR103W	BUD22	Q04347	519 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SIF2	YBR103W	ADE13	Q05911	482 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SIF2	YBR103W	RGA2	Q06407	1009 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SIF2	YBR103W	YPR196W	Q06595	470 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SIF2	YBR103W	NEW1	Q08972	1196 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SIF2	YBR103W	SNF1	P06782	633 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SIF2	YBR103W	SPE1	P08432	466 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SIF2	YBR103W	HMG2	P12684	1045 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SIF2	YBR103W	YAK1	P14680	807 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SIF2	YBR103W	APE1	P14904	514 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SIF2	YBR103W	SPO11	P23179	398 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SIF2	YBR103W	URE2	P23202	354 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SIF2	YBR103W	RVS161	P25343	265 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SIF2	YBR103W	RRT12	P25381	491 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SIF2	YBR103W	GAC1	P28006	793 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SIF2	YBR103W	PMT1	P33775	817 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SIF2	YBR103W	MAE1	P36013	669 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SIF2	YBR103W	SET3	P36124	751 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SIF2	YBR103W	GLY1	P37303	387 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SIF2	YBR103W	YMC2	P38087	329 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SIF2	YBR103W	LSM1	P47017	172 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SIF2	YBR103W	ZAP1	P47043	880 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SIF2	YBR103W	LYS5	P50113	272 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SIF2	YBR103W	UBC9	P50623	157 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SIF2	YBR103W	PSP1	P50896	841 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SIF2	YBR103W	TAF6	P53040	516 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SIF2	YBR103W	TAD1	P53065	400 aa		4.91	□□□□□ -1.62

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