RNA–Protein interactions for RNA: YBR069C

TAT1, Transcript of Amino acid transporter for valine, leucine, isoleucine, and tyrosine, yeast

Gene TAT1, Length 1,860 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TAT1	YBR069C	NHX1	Q04121	633 aa		11.95	□□□□□ -0.5
TAT1	YBR069C	DUS3	Q06053	668 aa	Known RBP	11.95	□□□□□ -0.5
TAT1	YBR069C	COS7	Q07788	383 aa		11.95	□□□□□ -0.5
TAT1	YBR069C	YCL049C	P25577	312 aa		11.95	□□□□□ -0.5
TAT1	YBR069C	TOD6	P34219	525 aa		11.95	□□□□□ -0.5
TAT1	YBR069C	YHR131C	P38835	850 aa		11.95	□□□□□ -0.5
TAT1	YBR069C	YAR028W	P39548	234 aa		11.95	□□□□□ -0.5
TAT1	YBR069C	MTW1	P39731	289 aa		11.95	□□□□□ -0.5
TAT1	YBR069C	MNN11	P46985	422 aa	Known RBP	11.95	□□□□□ -0.5
TAT1	YBR069C	MTC3	P53077	123 aa		11.95	□□□□□ -0.5
TAT1	YBR069C	ALG11	P53954	548 aa	Known RBP	11.95	□□□□□ -0.5
TAT1	YBR069C	PRP38	Q00723	242 aa	Predicted RBP	11.95	□□□□□ -0.5
TAT1	YBR069C	SUB2	Q07478	446 aa	Known RBP	11.95	□□□□□ -0.5
TAT1	YBR069C	YPL119C-A	Q3E751	87 aa		11.95	□□□□□ -0.5
TAT1	YBR069C	ATP1	P07251	545 aa	Known RBP	11.94	□□□□□ -0.5
TAT1	YBR069C	COS2	P0CX12	379 aa		11.94	□□□□□ -0.5
TAT1	YBR069C	COS3	P0CX13	379 aa		11.94	□□□□□ -0.5
TAT1	YBR069C	DIT1	P21623	536 aa		11.94	□□□□□ -0.5
TAT1	YBR069C	VBA3	P25594	458 aa		11.94	□□□□□ -0.5
TAT1	YBR069C	LRG1	P35688	1017 aa		11.94	□□□□□ -0.5
TAT1	YBR069C	VBA5	P36172	582 aa		11.94	□□□□□ -0.5
TAT1	YBR069C	NAB3	P38996	802 aa	Known RBP RIP-Chip data	11.94	□□□□□ -0.5	not detected
TAT1	YBR069C	UPF3	P48412	387 aa	Known RBP	11.94	□□□□□ -0.5
TAT1	YBR069C	ALT2	P52892	507 aa		11.94	□□□□□ -0.5
TAT1	YBR069C	NUP49	Q02199	472 aa		11.94	□□□□□ -0.5
TAT1	YBR069C	HER2	Q03557	464 aa		11.94	□□□□□ -0.5
TAT1	YBR069C	GAS3	Q03655	524 aa		11.94	□□□□□ -0.5
TAT1	YBR069C	ENT5	Q03769	411 aa	Known RBP	11.94	□□□□□ -0.5
TAT1	YBR069C	SWA2	Q06677	668 aa		11.94	□□□□□ -0.5
TAT1	YBR069C	GUD1	Q07729	489 aa		11.94	□□□□□ -0.5
TAT1	YBR069C	BUD20	Q08004	166 aa	Predicted RBP	11.94	□□□□□ -0.5
TAT1	YBR069C	YNG1	Q08465	219 aa		11.94	□□□□□ -0.5
TAT1	YBR069C	YLL058W	Q12198	575 aa		11.94	□□□□□ -0.5
TAT1	YBR069C	ATG22	P25568	528 aa		11.93	□□□□□ -0.5
TAT1	YBR069C	FMP23	P38231	175 aa		11.93	□□□□□ -0.5
TAT1	YBR069C	KEL1	P38853	1164 aa	Known RBP	11.93	□□□□□ -0.5
TAT1	YBR069C	PHM8	P40025	321 aa		11.93	□□□□□ -0.5
TAT1	YBR069C	LYS4	P49367	693 aa	Predicted RBP	11.93	□□□□□ -0.5
TAT1	YBR069C	GTR2	P53290	341 aa		11.93	□□□□□ -0.5
TAT1	YBR069C	YNR068C	P53754	272 aa		11.93	□□□□□ -0.5
TAT1	YBR069C	YOL019W	Q08157	551 aa		11.93	□□□□□ -0.5
TAT1	YBR069C	PEX27	Q08580	376 aa		11.93	□□□□□ -0.5
TAT1	YBR069C	UBX3	Q12229	455 aa		11.93	□□□□□ -0.5
TAT1	YBR069C	LAA1	P39526	2014 aa		11.93	□□□□□ -0.5
TAT1	YBR069C	CDC5	P32562	705 aa		11.93	□□□□□ -0.5
TAT1	YBR069C	VRP1	P37370	817 aa		11.93	□□□□□ -0.5
TAT1	YBR069C	AHP1	P38013	176 aa	Known RBP	11.93	□□□□□ -0.5
TAT1	YBR069C	MMS4	P38257	691 aa		11.93	□□□□□ -0.5
TAT1	YBR069C	BIT2	P38346	545 aa		11.93	□□□□□ -0.5
TAT1	YBR069C	ALD5	P40047	520 aa	Known RBP	11.93	□□□□□ -0.5
TAT1	YBR069C	MNN5	P46982	586 aa		11.93	□□□□□ -0.5
TAT1	YBR069C	SMA1	Q02651	245 aa		11.93	□□□□□ -0.5
TAT1	YBR069C	HEH2	Q03281	663 aa		11.93	□□□□□ -0.5
TAT1	YBR069C	YML037C	Q03703	340 aa		11.93	□□□□□ -0.5
TAT1	YBR069C	SYT1	Q06836	1226 aa		11.93	□□□□□ -0.5
TAT1	YBR069C	PST2	Q12335	198 aa	Known RBP	11.93	□□□□□ -0.5
TAT1	YBR069C	MRPL6	P32904	214 aa		11.92	□□□□□ -0.5
TAT1	YBR069C	RIM4	P38741	713 aa		11.92	□□□□□ -0.5
TAT1	YBR069C	GEM1	P39722	662 aa		11.92	□□□□□ -0.5
TAT1	YBR069C	ATM1	P40416	690 aa		11.92	□□□□□ -0.5
TAT1	YBR069C	IRC18	P47056	224 aa		11.92	□□□□□ -0.5
TAT1	YBR069C	COG1	P53079	417 aa		11.92	□□□□□ -0.5
TAT1	YBR069C	RSC4	Q02206	625 aa		11.92	□□□□□ -0.5
TAT1	YBR069C	TAF12	Q03761	539 aa		11.92	□□□□□ -0.5
TAT1	YBR069C	YLR413W	Q06689	675 aa		11.92	□□□□□ -0.5
TAT1	YBR069C	HRK1	Q08732	759 aa	Known RBP	11.92	□□□□□ -0.5
TAT1	YBR069C	CFT2	Q12102	859 aa	Predicted RBP	11.92	□□□□□ -0.5
TAT1	YBR069C	YDR061W	Q12298	539 aa		11.92	□□□□□ -0.5
TAT1	YBR069C	EFG1	Q3E705	233 aa	Known RBP	11.92	□□□□□ -0.5
TAT1	YBR069C	RIB3	Q99258	208 aa		11.92	□□□□□ -0.5
TAT1	YBR069C	GLN4	P13188	809 aa	Known RBP	11.91	□□□□□ -0.5
TAT1	YBR069C	RHB1	P25378	209 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TAT1	YBR069C	GLN1	P32288	370 aa	Known RBP	11.91	□□□□□ -0.5
TAT1	YBR069C	LEU5	P38702	357 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TAT1	YBR069C	ALR2	P43553	858 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TAT1	YBR069C	RPS12	P48589	143 aa	Known RBP	11.91	□□□□□ -0.5
TAT1	YBR069C	ALT1	P52893	592 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TAT1	YBR069C	NCS6	P53088	359 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TAT1	YBR069C	VAC7	P53950	1165 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TAT1	YBR069C	CEG1	Q01159	459 aa	Predicted RBP	11.91	□□□□□ -0.5
TAT1	YBR069C	BSC2	Q05611	235 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TAT1	YBR069C	TRE2	Q08693	809 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TAT1	YBR069C	MDM32	Q12171	622 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TAT1	YBR069C	RPN6	Q12377	434 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TAT1	YBR069C	ZPS1	Q12512	249 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TAT1	YBR069C	UTP7	P40055	554 aa	Known RBP	11.91	□□□□□ -0.5
TAT1	YBR069C	DDI1	P40087	428 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TAT1	YBR069C	BST1	P43571	1029 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TAT1	YBR069C	TPN1	P53099	579 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TAT1	YBR069C	MRH4	P53166	561 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TAT1	YBR069C	DAM1	P53267	343 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TAT1	YBR069C	PEX13	P80667	386 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TAT1	YBR069C	ARX1	Q03862	593 aa	Known RBP	11.91	□□□□□ -0.5
TAT1	YBR069C	PDR8	Q06149	701 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TAT1	YBR069C	YLR049C	Q12110	428 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TAT1	YBR069C	YOR214C	Q12282	236 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TAT1	YBR069C	PEX1	P24004	1043 aa		11.9	□□□□□ -0.5
TAT1	YBR069C	SAT4	P25333	603 aa	Known RBP	11.9	□□□□□ -0.5
TAT1	YBR069C	EMC1	P25574	760 aa		11.9	□□□□□ -0.5
TAT1	YBR069C	MCR1	P36060	302 aa	Known RBP	11.9	□□□□□ -0.5

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