RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567434.5

CCNDBP1-211, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene CCNDBP1, Length 713 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-211ENST00000567434 MTA3Q9BTC8 594 aa19.97■□□□□ 0.79
CCNDBP1-211ENST00000567434 ADD3Q9UEY8 706 aaKnown RBP19.97■□□□□ 0.79
CCNDBP1-211ENST00000567434 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP19.97■□□□□ 0.79
CCNDBP1-211ENST00000567434 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP19.96■□□□□ 0.79
CCNDBP1-211ENST00000567434 C7orf61Q8IZ16 206 aa19.96■□□□□ 0.79
CCNDBP1-211ENST00000567434 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP19.96■□□□□ 0.79
CCNDBP1-211ENST00000567434 UBA5Q9GZZ9 404 aa19.96■□□□□ 0.79
CCNDBP1-211ENST00000567434 SOWAHBA6NEL2 793 aa19.95■□□□□ 0.78
CCNDBP1-211ENST00000567434 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP19.95■□□□□ 0.78
CCNDBP1-211ENST00000567434 WTAPQ15007 396 aa19.95■□□□□ 0.78
CCNDBP1-211ENST00000567434 ADGRF4Q8IZF3 695 aa19.95■□□□□ 0.78
CCNDBP1-211ENST00000567434 RGS22Q8NE09 1264 aa19.95■□□□□ 0.78
CCNDBP1-211ENST00000567434 ANO2Q9NQ90 1003 aa19.95■□□□□ 0.78
CCNDBP1-211ENST00000567434 SMCHD1A6NHR9 2005 aa19.95■□□□□ 0.78
CCNDBP1-211ENST00000567434 A0A1W2PPC1 479 aa19.94■□□□□ 0.78
CCNDBP1-211ENST00000567434 NFIBO00712 420 aa19.94■□□□□ 0.78
CCNDBP1-211ENST00000567434 CDC45O75419 566 aa19.94■□□□□ 0.78
CCNDBP1-211ENST00000567434 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP19.94■□□□□ 0.78
CCNDBP1-211ENST00000567434 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP19.94■□□□□ 0.78
CCNDBP1-211ENST00000567434 LRRC26Q2I0M4 334 aa19.94■□□□□ 0.78
CCNDBP1-211ENST00000567434 STOX1Q6ZVD7 989 aa19.94■□□□□ 0.78
CCNDBP1-211ENST00000567434 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP19.94■□□□□ 0.78
CCNDBP1-211ENST00000567434 MORC4Q8TE76 937 aa19.94■□□□□ 0.78
CCNDBP1-211ENST00000567434 CLEC4DQ8WXI8 215 aa19.94■□□□□ 0.78
CCNDBP1-211ENST00000567434 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP19.94■□□□□ 0.78
CCNDBP1-211ENST00000567434 PHF24Q9UPV7 400 aa19.94■□□□□ 0.78
CCNDBP1-211ENST00000567434 TAF6LQ9Y6J9 622 aa19.94■□□□□ 0.78
CCNDBP1-211ENST00000567434 ABCB11O95342 1321 aa19.94■□□□□ 0.78
CCNDBP1-211ENST00000567434 PTPDC1A2A3K4 754 aa19.93■□□□□ 0.78
CCNDBP1-211ENST00000567434 ADAMTS4O75173 837 aa19.93■□□□□ 0.78
CCNDBP1-211ENST00000567434 CCDC144BQ3MJ40 725 aa19.93■□□□□ 0.78
CCNDBP1-211ENST00000567434 TMEM67Q5HYA8 995 aa19.93■□□□□ 0.78
CCNDBP1-211ENST00000567434 RNF20Q5VTR2 975 aa19.93■□□□□ 0.78
CCNDBP1-211ENST00000567434 RNF207Q6ZRF8 634 aa19.93■□□□□ 0.78
CCNDBP1-211ENST00000567434 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP19.93■□□□□ 0.78
CCNDBP1-211ENST00000567434 KATNBL1Q9H079 304 aa19.93■□□□□ 0.78
CCNDBP1-211ENST00000567434 SPC25Q9HBM1 224 aa19.93■□□□□ 0.78
CCNDBP1-211ENST00000567434 MCM3APO60318 1980 aa19.93■□□□□ 0.78
CCNDBP1-211ENST00000567434 DNAH12Q6ZR08 3092 aa19.93■□□□□ 0.78
CCNDBP1-211ENST00000567434 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP19.92■□□□□ 0.78
CCNDBP1-211ENST00000567434 KLRF2D3W0D1 207 aa19.92■□□□□ 0.78
CCNDBP1-211ENST00000567434 SLC27A2O14975 620 aa19.92■□□□□ 0.78
CCNDBP1-211ENST00000567434 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP19.92■□□□□ 0.78
CCNDBP1-211ENST00000567434 PGK1P00558 417 aa19.92■□□□□ 0.78
CCNDBP1-211ENST00000567434 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP19.92■□□□□ 0.78
CCNDBP1-211ENST00000567434 CST5P28325 142 aaPredicted RBP19.92■□□□□ 0.78
CCNDBP1-211ENST00000567434 MCM5P33992 734 aa19.92■□□□□ 0.78
CCNDBP1-211ENST00000567434 ADCYAP1R1P41586 468 aa19.92■□□□□ 0.78
CCNDBP1-211ENST00000567434 TRAF1Q13077 416 aa19.92■□□□□ 0.78
CCNDBP1-211ENST00000567434 NECTIN1Q15223 517 aa19.92■□□□□ 0.78
CCNDBP1-211ENST00000567434 C1orf53Q5VUE5 145 aa19.92■□□□□ 0.78
CCNDBP1-211ENST00000567434 CATIPQ7Z7H3 387 aa19.92■□□□□ 0.78
CCNDBP1-211ENST00000567434 SKAP1Q86WV1 359 aa19.92■□□□□ 0.78
CCNDBP1-211ENST00000567434 DNERQ8NFT8 737 aa19.92■□□□□ 0.78
CCNDBP1-211ENST00000567434 CPVLQ9H3G5 476 aa19.92■□□□□ 0.78
CCNDBP1-211ENST00000567434 JMJD4Q9H9V9 463 aa19.92■□□□□ 0.78
CCNDBP1-211ENST00000567434 VTA1Q9NP79 307 aa19.92■□□□□ 0.78
CCNDBP1-211ENST00000567434 MAD2L2Q9UI95 211 aa19.92■□□□□ 0.78
CCNDBP1-211ENST00000567434 ASTN1O14525 1302 aa19.92■□□□□ 0.78
CCNDBP1-211ENST00000567434 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa19.92■□□□□ 0.78
CCNDBP1-211ENST00000567434 MOXD2PA6NHM9 499 aa19.91■□□□□ 0.78
CCNDBP1-211ENST00000567434 B4DLN1 442 aa19.91■□□□□ 0.78
CCNDBP1-211ENST00000567434 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP19.91■□□□□ 0.78
CCNDBP1-211ENST00000567434 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP19.91■□□□□ 0.78
CCNDBP1-211ENST00000567434 ANTXR2P58335 489 aa19.91■□□□□ 0.78
CCNDBP1-211ENST00000567434 GRM4Q14833 912 aa19.91■□□□□ 0.78
CCNDBP1-211ENST00000567434 SNX17Q15036 470 aa19.91■□□□□ 0.78
CCNDBP1-211ENST00000567434 QRICH1Q2TAL8 776 aa19.91■□□□□ 0.78
CCNDBP1-211ENST00000567434 USH1GQ495M9 461 aa19.91■□□□□ 0.78
CCNDBP1-211ENST00000567434 ERICH6BQ5W0A0 696 aa19.91■□□□□ 0.78
CCNDBP1-211ENST00000567434 CREB3L3Q68CJ9 461 aa19.91■□□□□ 0.78
CCNDBP1-211ENST00000567434 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa19.91■□□□□ 0.78
CCNDBP1-211ENST00000567434 FBXO11Q86XK2 927 aa19.91■□□□□ 0.78
CCNDBP1-211ENST00000567434 MCF2L2Q86YR7 1114 aa19.91■□□□□ 0.78
CCNDBP1-211ENST00000567434 TMTC2Q8N394 836 aa19.91■□□□□ 0.78
CCNDBP1-211ENST00000567434 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa19.91■□□□□ 0.78
CCNDBP1-211ENST00000567434 TMEM87BQ96K49 555 aa19.91■□□□□ 0.78
CCNDBP1-211ENST00000567434 MAP3K14Q99558 947 aa19.91■□□□□ 0.78
CCNDBP1-211ENST00000567434 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP19.91■□□□□ 0.78
CCNDBP1-211ENST00000567434 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP19.91■□□□□ 0.78
CCNDBP1-211ENST00000567434 LCTP09848 1927 aa19.91■□□□□ 0.78
CCNDBP1-211ENST00000567434 LRRC37A2A6NM11 1700 aa19.9■□□□□ 0.78
CCNDBP1-211ENST00000567434 GJA9P57773 515 aa19.9■□□□□ 0.78
CCNDBP1-211ENST00000567434 RPS6P62753 249 aaKnown RBP19.9■□□□□ 0.78
CCNDBP1-211ENST00000567434 NKX3-2P78367 333 aa19.9■□□□□ 0.78
CCNDBP1-211ENST00000567434 TROAPQ12815 778 aa19.9■□□□□ 0.78
CCNDBP1-211ENST00000567434 SLC30A10Q6XR72 485 aa19.9■□□□□ 0.78
CCNDBP1-211ENST00000567434 STAG2Q8N3U4 1231 aa19.9■□□□□ 0.78
CCNDBP1-211ENST00000567434 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP19.9■□□□□ 0.78
CCNDBP1-211ENST00000567434 KLHDC9Q8NEP7 349 aa19.9■□□□□ 0.78
CCNDBP1-211ENST00000567434 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP19.9■□□□□ 0.78
CCNDBP1-211ENST00000567434 MTMR8Q96EF0 704 aa19.9■□□□□ 0.78
CCNDBP1-211ENST00000567434 LAMA3Q16787 3333 aa19.9■□□□□ 0.78
CCNDBP1-211ENST00000567434 PRC1O43663 620 aa19.89■□□□□ 0.77
CCNDBP1-211ENST00000567434 CALML3P27482 149 aa19.89■□□□□ 0.77
CCNDBP1-211ENST00000567434 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP19.89■□□□□ 0.77
CCNDBP1-211ENST00000567434 RTP1P59025 263 aa19.89■□□□□ 0.77
CCNDBP1-211ENST00000567434 TNFAIP2Q03169 654 aa19.89■□□□□ 0.77
CCNDBP1-211ENST00000567434 IQSEC1Q6DN90 963 aa19.89■□□□□ 0.77
CCNDBP1-211ENST00000567434 CHST3Q7LGC8 479 aa19.89■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.4 ms