RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567271.1

NME3-210, Transcript of NME/NM23 nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

TSL 2

Gene NME3, Length 752 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3-210ENST00000567271 CALM3P0DP25 149 aa25.17■■□□□ 1.62
NME3-210ENST00000567271 PSMA5P28066 241 aa25.17■■□□□ 1.62
NME3-210ENST00000567271 KIF5BP33176 963 aa25.17■■□□□ 1.62
NME3-210ENST00000567271 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa25.17■■□□□ 1.62
NME3-210ENST00000567271 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
NME3-210ENST00000567271 FAM133AQ8N9E0 248 aa25.17■■□□□ 1.62
NME3-210ENST00000567271 TRPV1Q8NER1 839 aa25.17■■□□□ 1.62
NME3-210ENST00000567271 SHISA4Q96DD7 197 aa25.17■■□□□ 1.62
NME3-210ENST00000567271 CYP39A1Q9NYL5 469 aa25.17■■□□□ 1.62
NME3-210ENST00000567271 NFIBO00712 420 aa25.16■■□□□ 1.62
NME3-210ENST00000567271 CYTH3O43739 400 aa25.16■■□□□ 1.62
NME3-210ENST00000567271 CYBAP13498 195 aa25.16■■□□□ 1.62
NME3-210ENST00000567271 CNTN2Q02246 1040 aa25.16■■□□□ 1.62
NME3-210ENST00000567271 USH1GQ495M9 461 aa25.16■■□□□ 1.62
NME3-210ENST00000567271 NSMFQ6X4W1 530 aa25.16■■□□□ 1.62
NME3-210ENST00000567271 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
NME3-210ENST00000567271 FGD4Q96M96 766 aa25.16■■□□□ 1.62
NME3-210ENST00000567271 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa25.16■■□□□ 1.62
NME3-210ENST00000567271 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa25.16■■□□□ 1.62
NME3-210ENST00000567271 ZBTB5O15062 677 aa25.15■■□□□ 1.62
NME3-210ENST00000567271 CAPN2P17655 700 aa25.15■■□□□ 1.62
NME3-210ENST00000567271 RXRAP19793 462 aa25.15■■□□□ 1.62
NME3-210ENST00000567271 RPS6KB1P23443 525 aa25.15■■□□□ 1.62
NME3-210ENST00000567271 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa25.15■■□□□ 1.62
NME3-210ENST00000567271 FBXO11Q86XK2 927 aa25.15■■□□□ 1.62
NME3-210ENST00000567271 BRPF3Q9ULD4 1205 aa25.15■■□□□ 1.62
NME3-210ENST00000567271 ABCB11O95342 1321 aa25.14■■□□□ 1.62
NME3-210ENST00000567271 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.62
NME3-210ENST00000567271 TFRCP02786 760 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.62
NME3-210ENST00000567271 SMARCA1P28370 1054 aa25.14■■□□□ 1.62
NME3-210ENST00000567271 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa25.14■■□□□ 1.62
NME3-210ENST00000567271 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa25.14■■□□□ 1.62
NME3-210ENST00000567271 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa25.14■■□□□ 1.62
NME3-210ENST00000567271 PIGSQ96S52 555 aa25.14■■□□□ 1.62
NME3-210ENST00000567271 LZTS2Q9BRK4 669 aa25.14■■□□□ 1.62
NME3-210ENST00000567271 AMNQ9BXJ7 453 aa25.14■■□□□ 1.62
NME3-210ENST00000567271 NRBP1Q9UHY1 535 aa25.14■■□□□ 1.62
NME3-210ENST00000567271 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa25.13■■□□□ 1.61
NME3-210ENST00000567271 SOWAHBA6NEL2 793 aa25.13■■□□□ 1.61
NME3-210ENST00000567271 CASTP20810 708 aaKnown RBP25.13■■□□□ 1.61
NME3-210ENST00000567271 GNAQP50148 359 aa25.13■■□□□ 1.61
NME3-210ENST00000567271 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP25.13■■□□□ 1.61
NME3-210ENST00000567271 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP25.13■■□□□ 1.61
NME3-210ENST00000567271 LHX8Q68G74 356 aa25.13■■□□□ 1.61
NME3-210ENST00000567271 APOA5Q6Q788 366 aa25.13■■□□□ 1.61
NME3-210ENST00000567271 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa25.13■■□□□ 1.61
NME3-210ENST00000567271 FBXL16Q8N461 479 aa25.13■■□□□ 1.61
NME3-210ENST00000567271 FANCBQ8NB91 859 aa25.13■■□□□ 1.61
NME3-210ENST00000567271 RGS22Q8NE09 1264 aa25.13■■□□□ 1.61
NME3-210ENST00000567271 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP25.12■■□□□ 1.61
NME3-210ENST00000567271 CNGA1P29973 690 aa25.12■■□□□ 1.61
NME3-210ENST00000567271 FGD1P98174 961 aa25.12■■□□□ 1.61
NME3-210ENST00000567271 RNF207Q6ZRF8 634 aa25.12■■□□□ 1.61
NME3-210ENST00000567271 Q6ZUG5 572 aa25.12■■□□□ 1.61
NME3-210ENST00000567271 MICU3Q86XE3 530 aa25.12■■□□□ 1.61
NME3-210ENST00000567271 HOMER1Q86YM7 354 aa25.12■■□□□ 1.61
NME3-210ENST00000567271 SPZ1Q9BXG8 430 aa25.12■■□□□ 1.61
NME3-210ENST00000567271 TM6SF1Q9BZW5 370 aa25.12■■□□□ 1.61
NME3-210ENST00000567271 MAF1Q9H063 256 aa25.12■■□□□ 1.61
NME3-210ENST00000567271 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa25.12■■□□□ 1.61
NME3-210ENST00000567271 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa25.11■■□□□ 1.61
NME3-210ENST00000567271 PTPDC1A2A3K4 754 aa25.11■■□□□ 1.61
NME3-210ENST00000567271 PLEKHA8P1O95397 391 aa25.11■■□□□ 1.61
NME3-210ENST00000567271 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP25.11■■□□□ 1.61
NME3-210ENST00000567271 SLC30A10Q6XR72 485 aa25.11■■□□□ 1.61
NME3-210ENST00000567271 RUFY3Q7L099 469 aa25.11■■□□□ 1.61
NME3-210ENST00000567271 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP25.11■■□□□ 1.61
NME3-210ENST00000567271 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP25.11■■□□□ 1.61
NME3-210ENST00000567271 OGDHLQ9ULD0 1010 aa25.11■■□□□ 1.61
NME3-210ENST00000567271 CNPY2Q9Y2B0 182 aa25.11■■□□□ 1.61
NME3-210ENST00000567271 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP25.11■■□□□ 1.61
NME3-210ENST00000567271 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP25.1■■□□□ 1.61
NME3-210ENST00000567271 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa25.1■■□□□ 1.61
NME3-210ENST00000567271 SEPT4O43236 478 aa25.1■■□□□ 1.61
NME3-210ENST00000567271 ZBTB43O43298 467 aa25.1■■□□□ 1.61
NME3-210ENST00000567271 SEC24BO95487 1268 aa25.1■■□□□ 1.61
NME3-210ENST00000567271 RPS6P62753 249 aaKnown RBP25.1■■□□□ 1.61
NME3-210ENST00000567271 BRF1Q92994 677 aa25.1■■□□□ 1.61
NME3-210ENST00000567271 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP25.1■■□□□ 1.61
NME3-210ENST00000567271 AGXT2Q9BYV1 514 aa25.1■■□□□ 1.61
NME3-210ENST00000567271 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa25.1■■□□□ 1.61
NME3-210ENST00000567271 ASTN1O14525 1302 aa25.1■■□□□ 1.61
NME3-210ENST00000567271 MSCO60682 206 aa25.09■■□□□ 1.61
NME3-210ENST00000567271 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP25.09■■□□□ 1.61
NME3-210ENST00000567271 CALML3P27482 149 aa25.09■■□□□ 1.61
NME3-210ENST00000567271 TMTC3Q6ZXV5 915 aa25.09■■□□□ 1.61
NME3-210ENST00000567271 ARMCX2Q7L311 632 aa25.09■■□□□ 1.61
NME3-210ENST00000567271 MCF2L2Q86YR7 1114 aa25.09■■□□□ 1.61
NME3-210ENST00000567271 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
NME3-210ENST00000567271 TBC1D5Q92609 795 aa25.09■■□□□ 1.61
NME3-210ENST00000567271 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP25.09■■□□□ 1.61
NME3-210ENST00000567271 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa25.09■■□□□ 1.61
NME3-210ENST00000567271 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
NME3-210ENST00000567271 MYH6P13533 1939 aa25.08■■□□□ 1.61
NME3-210ENST00000567271 ASB14A6NK59 587 aa25.08■■□□□ 1.61
NME3-210ENST00000567271 RCAN1P53805 252 aa25.08■■□□□ 1.61
NME3-210ENST00000567271 APOBRQ0VD83 1088 aa25.08■■□□□ 1.61
NME3-210ENST00000567271 TRAF1Q13077 416 aa25.08■■□□□ 1.61
NME3-210ENST00000567271 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa25.08■■□□□ 1.61
NME3-210ENST00000567271 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP25.08■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.2 ms