RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552985.5

TPCN1-223, Transcript of two pore segment channel 1, human

TSL 3

Gene TPCN1, Length 762 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TPCN1-223	ENST00000552985	TSGA10IP	Q3SY00	556 aa		13.12	□□□□□ -0.31
TPCN1-223	ENST00000552985	USH1G	Q495M9	461 aa		13.12	□□□□□ -0.31
TPCN1-223	ENST00000552985	MAMDC4	Q6UXC1	1216 aa		13.12	□□□□□ -0.31
TPCN1-223	ENST00000552985	NSMF	Q6X4W1	530 aa		13.12	□□□□□ -0.31
TPCN1-223	ENST00000552985	ZNF467	Q7Z7K2	595 aa	Predicted RBP	13.12	□□□□□ -0.31
TPCN1-223	ENST00000552985	ZNF654	Q8IZM8	581 aa		13.12	□□□□□ -0.31
TPCN1-223	ENST00000552985	PAWR	Q96IZ0	340 aa	Known RBP	13.12	□□□□□ -0.31
TPCN1-223	ENST00000552985	TCEANC2	Q96MN5	208 aa		13.12	□□□□□ -0.31
TPCN1-223	ENST00000552985	CYP39A1	Q9NYL5	469 aa		13.12	□□□□□ -0.31
TPCN1-223	ENST00000552985	PFAS	O15067	1338 aa		13.12	□□□□□ -0.31
TPCN1-223	ENST00000552985	SEPT4	O43236	478 aa		13.11	□□□□□ -0.31
TPCN1-223	ENST00000552985	DHX16	O60231	1041 aa	Known RBP	13.11	□□□□□ -0.31
TPCN1-223	ENST00000552985	ZNF865	P0CJ78	1059 aa	Predicted RBP	13.11	□□□□□ -0.31
TPCN1-223	ENST00000552985	BAAT	Q14032	418 aa	Predicted RBP	13.11	□□□□□ -0.31
TPCN1-223	ENST00000552985	CATIP	Q7Z7H3	387 aa		13.11	□□□□□ -0.31
TPCN1-223	ENST00000552985	KCNB2	Q92953	911 aa		13.11	□□□□□ -0.31
TPCN1-223	ENST00000552985	MTMR8	Q96EF0	704 aa		13.11	□□□□□ -0.31
TPCN1-223	ENST00000552985	TMEM87B	Q96K49	555 aa		13.11	□□□□□ -0.31
TPCN1-223	ENST00000552985	NEK1	Q96PY6	1258 aa		13.11	□□□□□ -0.31
TPCN1-223	ENST00000552985	MTA3	Q9BTC8	594 aa		13.11	□□□□□ -0.31
TPCN1-223	ENST00000552985	SYNGAP1	Q96PV0	1343 aa		13.11	□□□□□ -0.31
TPCN1-223	ENST00000552985	CYTH3	O43739	400 aa		13.1	□□□□□ -0.31
TPCN1-223	ENST00000552985	PPP1R11	O60927	126 aa	Predicted RBP	13.1	□□□□□ -0.31
TPCN1-223	ENST00000552985	CPA1	P15085	419 aa		13.1	□□□□□ -0.31
TPCN1-223	ENST00000552985	RXRA	P19793	462 aa		13.1	□□□□□ -0.31
TPCN1-223	ENST00000552985	HSPA4	P34932	840 aa		13.1	□□□□□ -0.31
TPCN1-223	ENST00000552985	EXOSC10	Q01780	885 aa	Known RBP	13.1	□□□□□ -0.31
TPCN1-223	ENST00000552985	SLC30A10	Q6XR72	485 aa		13.1	□□□□□ -0.31
TPCN1-223	ENST00000552985	NFXL1	Q6ZNB6	911 aa		13.1	□□□□□ -0.31
TPCN1-223	ENST00000552985	ARMCX2	Q7L311	632 aa		13.1	□□□□□ -0.31
TPCN1-223	ENST00000552985	RAB11FIP4	Q86YS3	637 aa		13.1	□□□□□ -0.31
TPCN1-223	ENST00000552985	CCDC144CP	Q8IYA2	1237 aa		13.1	□□□□□ -0.31
TPCN1-223	ENST00000552985	MSL3	Q8N5Y2	521 aa	Known RBP	13.1	□□□□□ -0.31
TPCN1-223	ENST00000552985	ANKLE1	Q8NAG6	615 aa		13.1	□□□□□ -0.31
TPCN1-223	ENST00000552985	NUP133	Q8WUM0	1156 aa		13.1	□□□□□ -0.31
TPCN1-223	ENST00000552985	LENG1	Q96BZ8	264 aa	Predicted RBP	13.1	□□□□□ -0.31
TPCN1-223	ENST00000552985	CDKN2AIP	Q9NXV6	580 aa	Predicted RBP	13.1	□□□□□ -0.31
TPCN1-223	ENST00000552985	NRBP1	Q9UHY1	535 aa		13.1	□□□□□ -0.31
TPCN1-223	ENST00000552985	SNX14	Q9Y5W7	946 aa		13.1	□□□□□ -0.31
TPCN1-223	ENST00000552985	LRRC37A2	A6NM11	1700 aa		13.1	□□□□□ -0.31
TPCN1-223	ENST00000552985	PTPDC1	A2A3K4	754 aa		13.09	□□□□□ -0.31
TPCN1-223	ENST00000552985	MSC	O60682	206 aa		13.09	□□□□□ -0.31
TPCN1-223	ENST00000552985	DDAH1	O94760	285 aa		13.09	□□□□□ -0.31
TPCN1-223	ENST00000552985	REC8	O95072	547 aa		13.09	□□□□□ -0.31
TPCN1-223	ENST00000552985	CAPN2	P17655	700 aa		13.09	□□□□□ -0.31
TPCN1-223	ENST00000552985	LIFR	P42702	1097 aa		13.09	□□□□□ -0.31
TPCN1-223	ENST00000552985	RPS6	P62753	249 aa	Known RBP	13.09	□□□□□ -0.31
TPCN1-223	ENST00000552985	DHX32	Q7L7V1	743 aa	Known RBP	13.09	□□□□□ -0.31
TPCN1-223	ENST00000552985	TBC1D5	Q92609	795 aa		13.09	□□□□□ -0.31
TPCN1-223	ENST00000552985	KATNBL1	Q9H079	304 aa		13.09	□□□□□ -0.31
TPCN1-223	ENST00000552985	RIOX1	Q9H6W3	641 aa		13.09	□□□□□ -0.31
TPCN1-223	ENST00000552985	ZHX1	Q9UKY1	873 aa	Predicted RBP	13.09	□□□□□ -0.31
TPCN1-223	ENST00000552985	PNMA2	Q9UL42	364 aa		13.09	□□□□□ -0.31
TPCN1-223	ENST00000552985	CNPY2	Q9Y2B0	182 aa		13.09	□□□□□ -0.31
TPCN1-223	ENST00000552985	CCDC69	A6NI79	296 aa		13.08	□□□□□ -0.32
TPCN1-223	ENST00000552985	OPLAH	O14841	1288 aa		13.08	□□□□□ -0.32
TPCN1-223	ENST00000552985	ADCY6	O43306	1168 aa		13.08	□□□□□ -0.32
TPCN1-223	ENST00000552985	CALML3	P27482	149 aa		13.08	□□□□□ -0.32
TPCN1-223	ENST00000552985	ACVR2B	Q13705	512 aa		13.08	□□□□□ -0.32
TPCN1-223	ENST00000552985	GJC2	Q5T442	439 aa	Predicted RBP	13.08	□□□□□ -0.32
TPCN1-223	ENST00000552985	RNF207	Q6ZRF8	634 aa		13.08	□□□□□ -0.32
TPCN1-223	ENST00000552985	NECAB2	Q7Z6G3	386 aa		13.08	□□□□□ -0.32
TPCN1-223	ENST00000552985	FBXO11	Q86XK2	927 aa		13.08	□□□□□ -0.32
TPCN1-223	ENST00000552985	TMTC2	Q8N394	836 aa		13.08	□□□□□ -0.32
TPCN1-223	ENST00000552985	PIBF1	Q8WXW3	757 aa		13.08	□□□□□ -0.32
TPCN1-223	ENST00000552985	PIGS	Q96S52	555 aa		13.08	□□□□□ -0.32
TPCN1-223	ENST00000552985	ABCB11	O95342	1321 aa		13.08	□□□□□ -0.32
TPCN1-223	ENST00000552985	DNAH12	Q6ZR08	3092 aa		13.07	□□□□□ -0.32
TPCN1-223	ENST00000552985	ZBTB5	O15062	677 aa		13.07	□□□□□ -0.32
TPCN1-223	ENST00000552985	PLEKHA8P1	O95397	391 aa		13.07	□□□□□ -0.32
TPCN1-223	ENST00000552985	PGK1	P00558	417 aa		13.07	□□□□□ -0.32
TPCN1-223	ENST00000552985	COL6A1	P12109	1028 aa		13.07	□□□□□ -0.32
TPCN1-223	ENST00000552985	AKR1A1	P14550	325 aa		13.07	□□□□□ -0.32
TPCN1-223	ENST00000552985	ALDH5A1	P51649	535 aa	Predicted RBP	13.07	□□□□□ -0.32
TPCN1-223	ENST00000552985	KRT32	Q14532	448 aa		13.07	□□□□□ -0.32
TPCN1-223	ENST00000552985	CCDC144B	Q3MJ40	725 aa		13.07	□□□□□ -0.32
TPCN1-223	ENST00000552985	SGMS1	Q86VZ5	419 aa		13.07	□□□□□ -0.32
TPCN1-223	ENST00000552985	HOMER1	Q86YM7	354 aa		13.07	□□□□□ -0.32
TPCN1-223	ENST00000552985	CMTR1	Q8N1G2	835 aa	Known RBP	13.07	□□□□□ -0.32
TPCN1-223	ENST00000552985	CTCFL	Q8NI51	663 aa	Predicted RBP	13.07	□□□□□ -0.32
TPCN1-223	ENST00000552985	JAKMIP1	Q96N16	626 aa	Known RBP	13.07	□□□□□ -0.32
TPCN1-223	ENST00000552985	MAP3K14	Q99558	947 aa		13.07	□□□□□ -0.32
TPCN1-223	ENST00000552985	AMN	Q9BXJ7	453 aa		13.07	□□□□□ -0.32
TPCN1-223	ENST00000552985	USP26	Q9BXU7	913 aa		13.07	□□□□□ -0.32
TPCN1-223	ENST00000552985	ABHD16B	Q9H3Z7	469 aa		13.07	□□□□□ -0.32
TPCN1-223	ENST00000552985	C11orf49	Q9H6J7	331 aa		13.07	□□□□□ -0.32
TPCN1-223	ENST00000552985	COL20A1	Q9P218	1284 aa		13.07	□□□□□ -0.32
TPCN1-223	ENST00000552985	BRPF3	Q9ULD4	1205 aa		13.07	□□□□□ -0.32
TPCN1-223	ENST00000552985	ASB14	A6NK59	587 aa		13.06	□□□□□ -0.32
TPCN1-223	ENST00000552985	MYCN	P04198	464 aa	Predicted RBP	13.06	□□□□□ -0.32
TPCN1-223	ENST00000552985	RARB	P10826	455 aa		13.06	□□□□□ -0.32
TPCN1-223	ENST00000552985	PTGS1	P23219	599 aa		13.06	□□□□□ -0.32
TPCN1-223	ENST00000552985	LRRC41	Q15345	812 aa		13.06	□□□□□ -0.32
TPCN1-223	ENST00000552985	APOA5	Q6Q788	366 aa		13.06	□□□□□ -0.32
TPCN1-223	ENST00000552985	EEPD1	Q7L9B9	569 aa		13.06	□□□□□ -0.32
TPCN1-223	ENST00000552985	MICU3	Q86XE3	530 aa		13.06	□□□□□ -0.32
TPCN1-223	ENST00000552985	FBXO16	Q8IX29	292 aa	Predicted RBP	13.06	□□□□□ -0.32
TPCN1-223	ENST00000552985	SRBD1	Q8N5C6	995 aa	Known RBP	13.06	□□□□□ -0.32
TPCN1-223	ENST00000552985	RGS22	Q8NE09	1264 aa		13.06	□□□□□ -0.32
TPCN1-223	ENST00000552985	MORC4	Q8TE76	937 aa		13.06	□□□□□ -0.32

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