RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548122.2

PTPRB-206, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRB, Length 4,237 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-206ENST00000548122 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
PTPRB-206ENST00000548122 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRB-206ENST00000548122 NT5C2P49902 561 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRB-206ENST00000548122 TERF1P54274 439 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRB-206ENST00000548122 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
PTPRB-206ENST00000548122 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
PTPRB-206ENST00000548122 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
PTPRB-206ENST00000548122 DGKHQ86XP1 1220 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRB-206ENST00000548122 ZNF654Q8IZM8 581 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRB-206ENST00000548122 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
PTPRB-206ENST00000548122 LZTS2Q9BRK4 669 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRB-206ENST00000548122 MCOLN1Q9GZU1 580 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRB-206ENST00000548122 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
PTPRB-206ENST00000548122 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
PTPRB-206ENST00000548122 NRXN2Q9P2S2 1712 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRB-206ENST00000548122 ORC4O43929 436 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRB-206ENST00000548122 TM4SF4P48230 202 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRB-206ENST00000548122 Q6ZUG5 572 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRB-206ENST00000548122 CKAP2LQ8IYA6 745 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRB-206ENST00000548122 CCDC148Q8NFR7 591 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRB-206ENST00000548122 SPATC1LQ9H0A9 340 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRB-206ENST00000548122 PKD2L1Q9P0L9 805 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRB-206ENST00000548122 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRB-206ENST00000548122 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
PTPRB-206ENST00000548122 TPD52L2O43399 206 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
PTPRB-206ENST00000548122 GNRH1P01148 92 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRB-206ENST00000548122 ELNP15502 786 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRB-206ENST00000548122 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
PTPRB-206ENST00000548122 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
PTPRB-206ENST00000548122 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
PTPRB-206ENST00000548122 GNPTABQ3T906 1256 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRB-206ENST00000548122 RNF207Q6ZRF8 634 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRB-206ENST00000548122 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
PTPRB-206ENST00000548122 SH3TC2Q8TF17 1288 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRB-206ENST00000548122 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
PTPRB-206ENST00000548122 C6orf50Q9HD87 102 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRB-206ENST00000548122 ZSWIM5Q9P217 1185 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRB-206ENST00000548122 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
PTPRB-206ENST00000548122 RFX7Q2KHR2 1363 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRB-206ENST00000548122 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
PTPRB-206ENST00000548122 POLR2MP0CAP2 368 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRB-206ENST00000548122 RARBP10826 455 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRB-206ENST00000548122 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
PTPRB-206ENST00000548122 ANO1Q5XXA6 986 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRB-206ENST00000548122 EGFL6Q8IUX8 553 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRB-206ENST00000548122 TBC1D10CQ8IV04 446 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRB-206ENST00000548122 SLAIN1Q8ND83 568 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRB-206ENST00000548122 HTATIP2Q9BUP3 242 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRB-206ENST00000548122 MLXIPQ9HAP2 919 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRB-206ENST00000548122 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
PTPRB-206ENST00000548122 STRNO43815 780 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRB-206ENST00000548122 GPS2Q13227 327 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRB-206ENST00000548122 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
PTPRB-206ENST00000548122 DEFB118Q96PH6 123 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRB-206ENST00000548122 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
PTPRB-206ENST00000548122 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRB-206ENST00000548122 SMC3Q9UQE7 1217 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRB-206ENST00000548122 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRB-206ENST00000548122 ASB14A6NK59 587 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRB-206ENST00000548122 STK10O94804 968 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
PTPRB-206ENST00000548122 CYP21A2P08686 494 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRB-206ENST00000548122 DSG3P32926 999 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRB-206ENST00000548122 APOBRQ0VD83 1088 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRB-206ENST00000548122 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRB-206ENST00000548122 SEPT14Q6ZU15 432 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRB-206ENST00000548122 SRRDQ9UH36 339 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRB-206ENST00000548122 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRB-206ENST00000548122 DYTNA2CJ06 578 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRB-206ENST00000548122 TULP2O00295 520 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRB-206ENST00000548122 BACH1O14867 736 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRB-206ENST00000548122 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
PTPRB-206ENST00000548122 PRKCZQ05513 592 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRB-206ENST00000548122 LCA5Q86VQ0 697 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRB-206ENST00000548122 ARRDC4Q8NCT1 418 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRB-206ENST00000548122 ZNF384Q8TF68 577 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRB-206ENST00000548122 EMILIN3Q9NT22 766 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRB-206ENST00000548122 ZNF112Q9UJU3 913 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRB-206ENST00000548122 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRB-206ENST00000548122 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRB-206ENST00000548122 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRB-206ENST00000548122 ATRNL1Q5VV63 1379 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRB-206ENST00000548122 NEDD4P46934 1319 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRB-206ENST00000548122 IRS2Q9Y4H2 1338 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRB-206ENST00000548122 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRB-206ENST00000548122 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRB-206ENST00000548122 PGK2P07205 417 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRB-206ENST00000548122 GNA11P29992 359 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRB-206ENST00000548122 CCDC173Q0VFZ6 552 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRB-206ENST00000548122 TATDN1Q6P1N9 297 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRB-206ENST00000548122 OTOP1Q7RTM1 612 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRB-206ENST00000548122 ABHD8Q96I13 439 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRB-206ENST00000548122 V9GY48 417 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
PTPRB-206ENST00000548122 SCN4AP35499 1836 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRB-206ENST00000548122 COL4A5P29400 1685 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRB-206ENST00000548122 SORBS3O60504 671 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRB-206ENST00000548122 ABCB7O75027 752 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRB-206ENST00000548122 HMGCRP04035 888 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRB-206ENST00000548122 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
PTPRB-206ENST00000548122 ADORA2AP29274 412 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRB-206ENST00000548122 CBX1P83916 185 aa6.27□□□□□ -1.41
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