RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000539804.1

PITX3-202, Transcript of paired like homeodomain 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene PITX3, Length 1,187 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX3-202ENST00000539804 KLRF2D3W0D1 207 aa28.22■■■□□ 2.11
PITX3-202ENST00000539804 PRC1O43663 620 aa28.22■■■□□ 2.11
PITX3-202ENST00000539804 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP28.22■■■□□ 2.11
PITX3-202ENST00000539804 DDAH1O94760 285 aa28.22■■■□□ 2.11
PITX3-202ENST00000539804 CALM1P0DP23 149 aa28.22■■■□□ 2.11
PITX3-202ENST00000539804 CALM2P0DP24 149 aa28.22■■■□□ 2.11
PITX3-202ENST00000539804 CALM3P0DP25 149 aa28.22■■■□□ 2.11
PITX3-202ENST00000539804 TSGA10IPQ3SY00 556 aa28.22■■■□□ 2.11
PITX3-202ENST00000539804 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa28.22■■■□□ 2.11
PITX3-202ENST00000539804 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP28.22■■■□□ 2.11
PITX3-202ENST00000539804 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP28.22■■■□□ 2.11
PITX3-202ENST00000539804 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP28.21■■■□□ 2.11
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PITX3-202ENST00000539804 LIFRP42702 1097 aa28.21■■■□□ 2.11
PITX3-202ENST00000539804 GNAQP50148 359 aa28.21■■■□□ 2.11
PITX3-202ENST00000539804 GRM4Q14833 912 aa28.21■■■□□ 2.11
PITX3-202ENST00000539804 NFXL1Q6ZNB6 911 aa28.21■■■□□ 2.11
PITX3-202ENST00000539804 RNF207Q6ZRF8 634 aa28.21■■■□□ 2.11
PITX3-202ENST00000539804 ARMCX2Q7L311 632 aa28.21■■■□□ 2.11
PITX3-202ENST00000539804 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP28.21■■■□□ 2.11
PITX3-202ENST00000539804 LZTS2Q9BRK4 669 aa28.21■■■□□ 2.11
PITX3-202ENST00000539804 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP28.21■■■□□ 2.11
PITX3-202ENST00000539804 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa28.21■■■□□ 2.11
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PITX3-202ENST00000539804 EVI5O60447 810 aa28.2■■■□□ 2.1
PITX3-202ENST00000539804 ACVR2BQ13705 512 aa28.2■■■□□ 2.1
PITX3-202ENST00000539804 MUM1L1Q5H9M0 696 aa28.2■■■□□ 2.1
PITX3-202ENST00000539804 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa28.2■■■□□ 2.1
PITX3-202ENST00000539804 RNF180Q86T96 592 aa28.2■■■□□ 2.1
PITX3-202ENST00000539804 FBXO11Q86XK2 927 aa28.2■■■□□ 2.1
PITX3-202ENST00000539804 SAMD3Q8N6K7 520 aa28.2■■■□□ 2.1
PITX3-202ENST00000539804 NEK1Q96PY6 1258 aa28.2■■■□□ 2.1
PITX3-202ENST00000539804 AMNQ9BXJ7 453 aa28.2■■■□□ 2.1
PITX3-202ENST00000539804 SPC25Q9HBM1 224 aa28.2■■■□□ 2.1
PITX3-202ENST00000539804 MAD2L2Q9UI95 211 aa28.2■■■□□ 2.1
PITX3-202ENST00000539804 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP28.19■■■□□ 2.1
PITX3-202ENST00000539804 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa28.19■■■□□ 2.1
PITX3-202ENST00000539804 DNERQ8NFT8 737 aa28.19■■■□□ 2.1
PITX3-202ENST00000539804 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP28.19■■■□□ 2.1
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PITX3-202ENST00000539804 CHST3Q7LGC8 479 aa28.18■■■□□ 2.1
PITX3-202ENST00000539804 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa28.18■■■□□ 2.1
PITX3-202ENST00000539804 JMJD4Q9H9V9 463 aa28.18■■■□□ 2.1
PITX3-202ENST00000539804 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa28.18■■■□□ 2.1
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PITX3-202ENST00000539804 TAF6LQ9Y6J9 622 aa28.18■■■□□ 2.1
PITX3-202ENST00000539804 ZBTB5O15062 677 aa28.17■■■□□ 2.1
PITX3-202ENST00000539804 ANTXR2P58335 489 aa28.17■■■□□ 2.1
PITX3-202ENST00000539804 CNTN2Q02246 1040 aa28.17■■■□□ 2.1
PITX3-202ENST00000539804 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP28.17■■■□□ 2.1
PITX3-202ENST00000539804 USH1GQ495M9 461 aa28.17■■■□□ 2.1
PITX3-202ENST00000539804 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP28.17■■■□□ 2.1
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PITX3-202ENST00000539804 VAT1LQ9HCJ6 419 aa28.17■■■□□ 2.1
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PITX3-202ENST00000539804 CLEC4DQ8WXI8 215 aa28.16■■■□□ 2.1
PITX3-202ENST00000539804 SLC12A7Q9Y666 1083 aa28.16■■■□□ 2.1
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PITX3-202ENST00000539804 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP28.15■■■□□ 2.1
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PITX3-202ENST00000539804 VTA1Q9NP79 307 aa28.15■■■□□ 2.1
PITX3-202ENST00000539804 FRMPD3Q5JV73 1810 aa28.15■■■□□ 2.1
PITX3-202ENST00000539804 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP28.15■■■□□ 2.1
PITX3-202ENST00000539804 SOWAHBA6NEL2 793 aa28.14■■■□□ 2.1
PITX3-202ENST00000539804 CALML3P27482 149 aa28.14■■■□□ 2.1
PITX3-202ENST00000539804 STAG2Q8N3U4 1231 aa28.14■■■□□ 2.1
PITX3-202ENST00000539804 MORC4Q8TE76 937 aa28.14■■■□□ 2.1
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PITX3-202ENST00000539804 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP28.13■■■□□ 2.09
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PITX3-202ENST00000539804 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP28.12■■■□□ 2.09
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PITX3-202ENST00000539804 LRRC41Q15345 812 aa28.12■■■□□ 2.09
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PITX3-202ENST00000539804 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP28.12■■■□□ 2.09
PITX3-202ENST00000539804 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP28.12■■■□□ 2.09
PITX3-202ENST00000539804 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa28.11■■■□□ 2.09
PITX3-202ENST00000539804 HSPA4P34932 840 aa28.11■■■□□ 2.09
PITX3-202ENST00000539804 FGD1P98174 961 aa28.11■■■□□ 2.09
PITX3-202ENST00000539804 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP28.11■■■□□ 2.09
PITX3-202ENST00000539804 SPZ1Q9BXG8 430 aa28.11■■■□□ 2.09
PITX3-202ENST00000539804 Q9Y3F1 56 aa28.11■■■□□ 2.09
PITX3-202ENST00000539804 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa28.11■■■□□ 2.09
PITX3-202ENST00000539804 MOXD2PA6NHM9 499 aa28.1■■■□□ 2.09
PITX3-202ENST00000539804 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP28.1■■■□□ 2.09
PITX3-202ENST00000539804 PDE4DQ08499 809 aa28.1■■■□□ 2.09
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